MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014718	AAG	2	6	208788	208793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602291
4502	NC_014718	GGCGA	2	10	208878	208887	20 %	0 %	60 %	20 %	312602292
4503	NC_014718	AGCG	2	8	208965	208972	25 %	0 %	50 %	25 %	312602292
4504	NC_014718	CCAA	2	8	209048	209055	50 %	0 %	0 %	50 %	312602292
4505	NC_014718	GTGC	2	8	209056	209063	0 %	25 %	50 %	25 %	312602292
4506	NC_014718	AAT	2	6	209097	209102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602292
4507	NC_014718	CGG	2	6	209136	209141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602292
4508	NC_014718	GCG	2	6	209153	209158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602292
4509	NC_014718	GCT	3	9	209163	209171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602292
4510	NC_014718	GC	3	6	209181	209186	0 %	0 %	50 %	50 %	312602292
4511	NC_014718	GTG	2	6	209197	209202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602292
4512	NC_014718	CGTGT	2	10	209203	209212	0 %	40 %	40 %	20 %	312602292
4513	NC_014718	CGG	2	6	209277	209282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602292
4514	NC_014718	ACA	2	6	209310	209315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602292
4515	NC_014718	CGA	2	6	209334	209339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602292
4516	NC_014718	CGT	2	6	209341	209346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602292
4517	NC_014718	G	6	6	209362	209367	0 %	0 %	100 %	0 %	312602292
4518	NC_014718	CAT	2	6	209410	209415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602292
4519	NC_014718	CGG	2	6	209470	209475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602292
4520	NC_014718	GC	3	6	209479	209484	0 %	0 %	50 %	50 %	312602292
4521	NC_014718	AGT	2	6	209559	209564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602292
4522	NC_014718	CG	3	6	209660	209665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_014718	GCA	2	6	209786	209791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4524	NC_014718	GC	3	6	209792	209797	0 %	0 %	50 %	50 %	312602293
4525	NC_014718	CGGCC	2	10	209814	209823	0 %	0 %	40 %	60 %	312602293
4526	NC_014718	CACCAG	2	12	209943	209954	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	312602293
4527	NC_014718	CACGG	2	10	209977	209986	20 %	0 %	40 %	40 %	312602293
4528	NC_014718	GCCG	2	8	210012	210019	0 %	0 %	50 %	50 %	312602293
4529	NC_014718	GC	3	6	210030	210035	0 %	0 %	50 %	50 %	312602293
4530	NC_014718	CAG	2	6	210078	210083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4531	NC_014718	TCG	2	6	210107	210112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4532	NC_014718	GGC	2	6	210144	210149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602293
4533	NC_014718	ACC	2	6	210154	210159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602293
4534	NC_014718	GCC	2	6	210180	210185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602293
4535	NC_014718	CAC	2	6	210276	210281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602293
4536	NC_014718	TG	3	6	210305	210310	0 %	50 %	50 %	0 %	312602293
4537	NC_014718	CGA	2	6	210338	210343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4538	NC_014718	GCCGC	2	10	210349	210358	0 %	0 %	40 %	60 %	312602293
4539	NC_014718	AGC	2	6	210382	210387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4540	NC_014718	CCA	2	6	210426	210431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602293
4541	NC_014718	CGA	2	6	210452	210457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4542	NC_014718	ACG	2	6	210460	210465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4543	NC_014718	A	6	6	210525	210530	100 %	0 %	0 %	0 %	312602293
4544	NC_014718	GCA	2	6	210545	210550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4545	NC_014718	GC	3	6	210555	210560	0 %	0 %	50 %	50 %	312602293
4546	NC_014718	CGG	2	6	210575	210580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602293
4547	NC_014718	ACCGC	2	10	210622	210631	20 %	0 %	20 %	60 %	312602293
4548	NC_014718	GGC	2	6	210676	210681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602293
4549	NC_014718	TG	3	6	210694	210699	0 %	50 %	50 %	0 %	312602293
4550	NC_014718	CGA	2	6	210719	210724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4551	NC_014718	AGC	2	6	210739	210744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602293
4552	NC_014718	CCGCGC	2	12	210758	210769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602293
4553	NC_014718	AT	3	6	210867	210872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014718	GCC	2	6	210959	210964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602294
4555	NC_014718	GGC	2	6	210991	210996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602294
4556	NC_014718	GCT	2	6	211042	211047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602294
4557	NC_014718	GCCG	2	8	211109	211116	0 %	0 %	50 %	50 %	312602294
4558	NC_014718	CG	3	6	211135	211140	0 %	0 %	50 %	50 %	312602294
4559	NC_014718	TGCGC	2	10	211168	211177	0 %	20 %	40 %	40 %	312602294
4560	NC_014718	ACG	2	6	211226	211231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602294
4561	NC_014718	CCAG	2	8	211232	211239	25 %	0 %	25 %	50 %	312602294
4562	NC_014718	CTG	2	6	211244	211249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602294
4563	NC_014718	ACG	3	9	211416	211424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602294
4564	NC_014718	TCCGGC	2	12	211520	211531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312602294
4565	NC_014718	GC	3	6	211549	211554	0 %	0 %	50 %	50 %	312602294
4566	NC_014718	CG	3	6	211558	211563	0 %	0 %	50 %	50 %	312602294
4567	NC_014718	GC	3	6	211575	211580	0 %	0 %	50 %	50 %	312602294
4568	NC_014718	AGG	2	6	211617	211622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602294
4569	NC_014718	GC	3	6	211627	211632	0 %	0 %	50 %	50 %	312602294
4570	NC_014718	GGCGAT	2	12	211657	211668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312602294
4571	NC_014718	GC	3	6	211682	211687	0 %	0 %	50 %	50 %	312602294
4572	NC_014718	CGG	2	6	211755	211760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602294
4573	NC_014718	CG	4	8	211764	211771	0 %	0 %	50 %	50 %	312602294
4574	NC_014718	ACGA	2	8	211942	211949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4575	NC_014718	CG	3	6	212098	212103	0 %	0 %	50 %	50 %	312602295
4576	NC_014718	TCG	2	6	212287	212292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602295
4577	NC_014718	CGG	2	6	212298	212303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602295
4578	NC_014718	CGA	2	6	212320	212325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602295
4579	NC_014718	GC	3	6	212349	212354	0 %	0 %	50 %	50 %	312602295
4580	NC_014718	CGC	2	6	212377	212382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602295
4581	NC_014718	CG	3	6	212493	212498	0 %	0 %	50 %	50 %	312602295
4582	NC_014718	GGC	2	6	212527	212532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602295
4583	NC_014718	GCG	2	6	212586	212591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602295
4584	NC_014718	CG	3	6	212605	212610	0 %	0 %	50 %	50 %	312602295
4585	NC_014718	GC	3	6	212628	212633	0 %	0 %	50 %	50 %	312602295
4586	NC_014718	GTG	2	6	212639	212644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602295
4587	NC_014718	GAT	2	6	212684	212689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602295
4588	NC_014718	GTG	2	6	212723	212728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602295
4589	NC_014718	GCT	2	6	212776	212781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602295
4590	NC_014718	AATCG	2	10	212819	212828	40 %	20 %	20 %	20 %	312602295
4591	NC_014718	GCG	2	6	212879	212884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602295
4592	NC_014718	AGTG	2	8	212901	212908	25 %	25 %	50 %	0 %	312602295
4593	NC_014718	AGGC	2	8	213032	213039	25 %	0 %	50 %	25 %	312602296
4594	NC_014718	CAGG	2	8	213042	213049	25 %	0 %	50 %	25 %	312602296
4595	NC_014718	CG	3	6	213064	213069	0 %	0 %	50 %	50 %	312602296
4596	NC_014718	CAG	2	6	213076	213081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602296
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4598	NC_014718	GCG	2	6	213159	213164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602297
4599	NC_014718	GGC	2	6	213172	213177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602297
4600	NC_014718	GAGC	2	8	213200	213207	25 %	0 %	50 %	25 %	312602297
4601	NC_014718	AGC	2	6	213226	213231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602297
4602	NC_014718	CAG	2	6	213291	213296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602297
4603	NC_014718	GCA	2	6	213341	213346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602297
4604	NC_014718	CGT	2	6	213401	213406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602297
4605	NC_014718	GAT	2	6	213474	213479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602297
4606	NC_014718	GCG	2	6	213502	213507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602297
4607	NC_014718	CGA	2	6	213521	213526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602297
4608	NC_014718	CGGC	2	8	213550	213557	0 %	0 %	50 %	50 %	312602297
4609	NC_014718	GT	3	6	213579	213584	0 %	50 %	50 %	0 %	312602297
4610	NC_014718	CGA	2	6	213620	213625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602297
4611	NC_014718	GC	3	6	213695	213700	0 %	0 %	50 %	50 %	312602297
4612	NC_014718	GGC	2	6	213751	213756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602297
4613	NC_014718	CGG	3	9	213840	213848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_014718	CCAT	2	8	213924	213931	25 %	25 %	0 %	50 %	312602298
4615	NC_014718	CTTTT	2	10	213943	213952	0 %	80 %	0 %	20 %	312602298
4616	NC_014718	CGT	2	6	213983	213988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602298
4617	NC_014718	GGCC	2	8	214037	214044	0 %	0 %	50 %	50 %	312602298
4618	NC_014718	CGG	2	6	214086	214091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602298
4619	NC_014718	TCG	2	6	214120	214125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602298
4620	NC_014718	GC	3	6	214137	214142	0 %	0 %	50 %	50 %	312602298
4621	NC_014718	GCCGC	2	10	214149	214158	0 %	0 %	40 %	60 %	312602298
4622	NC_014718	GC	3	6	214166	214171	0 %	0 %	50 %	50 %	312602298
4623	NC_014718	TGC	2	6	214186	214191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602298
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4746	NC_014718	CGT	2	6	219361	219366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602304
4747	NC_014718	GCCC	2	8	219386	219393	0 %	0 %	25 %	75 %	312602304
4748	NC_014718	GGC	2	6	219428	219433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602304
4749	NC_014718	CGG	2	6	219443	219448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602304
4750	NC_014718	CTCGA	2	10	219471	219480	20 %	20 %	20 %	40 %	312602304
4751	NC_014718	T	6	6	219557	219562	0 %	100 %	0 %	0 %	312602304
4752	NC_014718	GC	3	6	219568	219573	0 %	0 %	50 %	50 %	312602304
4753	NC_014718	CG	3	6	219599	219604	0 %	0 %	50 %	50 %	312602304
4754	NC_014718	CGAA	2	8	219613	219620	50 %	0 %	25 %	25 %	312602304
4755	NC_014718	CAC	2	6	219626	219631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602304
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4765	NC_014718	GC	3	6	220070	220075	0 %	0 %	50 %	50 %	312602304
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4767	NC_014718	TGA	2	6	220156	220161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602304
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4769	NC_014718	GCC	2	6	220275	220280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4770	NC_014718	TTG	2	6	220330	220335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4771	NC_014718	GGC	2	6	220392	220397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4772	NC_014718	CGG	2	6	220424	220429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4773	NC_014718	TGC	2	6	220433	220438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4778	NC_014718	TTGA	2	8	220691	220698	25 %	50 %	25 %	0 %	312602305
4779	NC_014718	CAT	2	6	220725	220730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602305
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4785	NC_014718	AGC	2	6	221084	221089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602305
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4787	NC_014718	TGT	2	6	221142	221147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4804	NC_014718	CTGC	2	8	222326	222333	0 %	25 %	25 %	50 %	312602307
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4810	NC_014718	ATAA	2	8	222542	222549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4813	NC_014718	CGT	2	6	222696	222701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602308
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4836	NC_014718	CGA	2	6	223748	223753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602309
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4857	NC_014718	TGA	2	6	225027	225032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602309
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4861	NC_014718	TG	3	6	225254	225259	0 %	50 %	50 %	0 %	312602310
4862	NC_014718	ATGG	2	8	225288	225295	25 %	25 %	50 %	0 %	312602310
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4871	NC_014718	GC	3	6	226064	226069	0 %	0 %	50 %	50 %	312602310
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4903	NC_014718	CTG	2	6	227466	227471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602311
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4954	NC_014718	CTG	2	6	230013	230018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602314
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4971	NC_014718	ATCC	2	8	230901	230908	25 %	25 %	0 %	50 %	312602315
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4982	NC_014718	TC	3	6	231484	231489	0 %	50 %	0 %	50 %	312602317
4983	NC_014718	GAA	2	6	231515	231520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602317
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4985	NC_014718	TAT	2	6	231618	231623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602318
4986	NC_014718	GTATTG	2	12	231645	231656	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312602318
4987	NC_014718	GGA	2	6	231673	231678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602318
4988	NC_014718	GAG	2	6	231856	231861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4989	NC_014718	CG	3	6	231923	231928	0 %	0 %	50 %	50 %	312602319
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4991	NC_014718	CGCGGG	2	12	232016	232027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602319
4992	NC_014718	CGC	2	6	232085	232090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602319
4993	NC_014718	AGCG	2	8	232096	232103	25 %	0 %	50 %	25 %	312602319
4994	NC_014718	CAT	2	6	232109	232114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602319
4995	NC_014718	GCG	2	6	232200	232205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4996	NC_014718	T	6	6	232234	232239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_014718	ACT	2	6	232266	232271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602320
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4999	NC_014718	TCGA	2	8	232326	232333	25 %	25 %	25 %	25 %	312602320
5000	NC_014718	CAC	2	6	232385	232390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602320

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