MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 52565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014638	AGAA	2	8	153906	153913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014638	TGT	2	6	154050	154055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063576
3503	NC_014638	ACGG	2	8	154069	154076	25 %	0 %	50 %	25 %	311063576
3504	NC_014638	GAC	2	6	154102	154107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3505	NC_014638	GAT	2	6	154161	154166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063576
3506	NC_014638	CG	3	6	154198	154203	0 %	0 %	50 %	50 %	311063576
3507	NC_014638	TGG	2	6	154208	154213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063576
3508	NC_014638	GTG	2	6	154261	154266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063576
3509	NC_014638	GCG	2	6	154290	154295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063576
3510	NC_014638	ATG	2	6	154297	154302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063576
3511	NC_014638	ACT	2	6	154382	154387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063576
3512	NC_014638	GGA	2	6	154416	154421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063576
3513	NC_014638	ATC	2	6	154456	154461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063576
3514	NC_014638	TCT	2	6	154488	154493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063576
3515	NC_014638	CGG	2	6	154541	154546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063576
3516	NC_014638	TTG	2	6	154576	154581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063576
3517	NC_014638	GAG	2	6	154594	154599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063576
3518	NC_014638	GGC	2	6	154629	154634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063576
3519	NC_014638	GCT	2	6	154689	154694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3520	NC_014638	GAACT	2	10	154742	154751	40 %	20 %	20 %	20 %	311063576
3521	NC_014638	GTTT	2	8	154760	154767	0 %	75 %	25 %	0 %	311063576
3522	NC_014638	GGT	2	6	154773	154778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063576
3523	NC_014638	CGA	2	6	154788	154793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3524	NC_014638	CGTGTG	2	12	154855	154866	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	311063576
3525	NC_014638	TGG	2	6	154868	154873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063576
3526	NC_014638	GGA	2	6	154903	154908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063576
3527	NC_014638	ATCG	2	8	155023	155030	25 %	25 %	25 %	25 %	311063576
3528	NC_014638	CGGG	2	8	155088	155095	0 %	0 %	75 %	25 %	311063576
3529	NC_014638	TGC	3	9	155105	155113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3530	NC_014638	GC	3	6	155120	155125	0 %	0 %	50 %	50 %	311063576
3531	NC_014638	CGA	2	6	155127	155132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3532	NC_014638	ATT	2	6	155145	155150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311063576
3533	NC_014638	GA	4	8	155222	155229	50 %	0 %	50 %	0 %	311063576
3534	NC_014638	TCG	2	6	155318	155323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3535	NC_014638	TCG	2	6	155343	155348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3536	NC_014638	TACA	2	8	155349	155356	50 %	25 %	0 %	25 %	311063576
3537	NC_014638	ACG	2	6	155486	155491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3538	NC_014638	CGA	2	6	155511	155516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3539	NC_014638	TGGT	2	8	155546	155553	0 %	50 %	50 %	0 %	311063576
3540	NC_014638	GGTG	2	8	155571	155578	0 %	25 %	75 %	0 %	311063576
3541	NC_014638	GAC	2	6	155614	155619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063576
3542	NC_014638	CAGCA	2	10	155683	155692	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3543	NC_014638	TCGT	2	8	155711	155718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_014638	AT	3	6	155877	155882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014638	GATATG	2	12	155934	155945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014638	TG	3	6	155963	155968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_014638	CA	3	6	155971	155976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_014638	GCTC	2	8	155978	155985	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_014638	GGA	2	6	156158	156163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063577
3550	NC_014638	GAG	2	6	156176	156181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063577
3551	NC_014638	CATG	2	8	156251	156258	25 %	25 %	25 %	25 %	311063577
3552	NC_014638	TGA	2	6	156265	156270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063577
3553	NC_014638	GCGA	2	8	156288	156295	25 %	0 %	50 %	25 %	311063577
3554	NC_014638	CCA	2	6	156320	156325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063577
3555	NC_014638	CGTGAA	2	12	156332	156343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	311063577
3556	NC_014638	TGG	2	6	156371	156376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063577
3557	NC_014638	CCA	2	6	156390	156395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063577
3558	NC_014638	CTG	2	6	156410	156415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063577
3559	NC_014638	TCA	2	6	156441	156446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_014638	GGC	2	6	156449	156454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_014638	TTC	2	6	156516	156521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_014638	TTC	2	6	156529	156534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063578
3563	NC_014638	ATG	2	6	156618	156623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063578
3564	NC_014638	CAG	3	9	156641	156649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063578
3565	NC_014638	TGG	2	6	156730	156735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063578
3566	NC_014638	GGAA	2	8	156749	156756	50 %	0 %	50 %	0 %	311063578
3567	NC_014638	AGC	2	6	156855	156860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063578
3568	NC_014638	CTG	2	6	156869	156874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063578
3569	NC_014638	GTC	2	6	156950	156955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063578
3570	NC_014638	ATG	2	6	157183	157188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063578
3571	NC_014638	GCC	2	6	157205	157210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063579
3572	NC_014638	TCGCA	2	10	157259	157268	20 %	20 %	20 %	40 %	311063579
3573	NC_014638	CTG	2	6	157306	157311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063579
3574	NC_014638	TCG	2	6	157343	157348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063579
3575	NC_014638	GCCGC	2	10	157441	157450	0 %	0 %	40 %	60 %	311063579
3576	NC_014638	ACAG	2	8	157467	157474	50 %	0 %	25 %	25 %	311063579
3577	NC_014638	CGG	2	6	157533	157538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063579
3578	NC_014638	TTG	2	6	157639	157644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063580
3579	NC_014638	CGA	2	6	157652	157657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063580
3580	NC_014638	GCC	2	6	157703	157708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063580
3581	NC_014638	AGT	2	6	157751	157756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063580
3582	NC_014638	GAG	2	6	157821	157826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063580
3583	NC_014638	GTA	2	6	157902	157907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063580
3584	NC_014638	TTG	2	6	157989	157994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063581
3585	NC_014638	TTC	2	6	158025	158030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063581
3586	NC_014638	CCA	2	6	158062	158067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063581
3587	NC_014638	CCTCG	2	10	158201	158210	0 %	20 %	20 %	60 %	311063581
3588	NC_014638	CCA	2	6	158242	158247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063581
3589	NC_014638	CGT	2	6	158260	158265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063581
3590	NC_014638	GCT	2	6	158299	158304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063581
3591	NC_014638	GCG	2	6	158337	158342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_014638	GCG	2	6	158387	158392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_014638	GTGG	2	8	158413	158420	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014638	T	8	8	158509	158516	0 %	100 %	0 %	0 %	311063582
3595	NC_014638	CCT	2	6	158554	158559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063582
3596	NC_014638	ATGGCG	2	12	158620	158631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311063582
3597	NC_014638	GA	3	6	158694	158699	50 %	0 %	50 %	0 %	311063582
3598	NC_014638	TTC	2	6	158725	158730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063582
3599	NC_014638	GT	3	6	158819	158824	0 %	50 %	50 %	0 %	311063582
3600	NC_014638	TTC	2	6	158853	158858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_014638	TCA	2	6	158952	158957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_014638	CCA	2	6	159081	159086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_014638	ACG	2	6	159111	159116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_014638	GTC	2	6	159118	159123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_014638	TCC	2	6	159143	159148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063583
3606	NC_014638	ATG	2	6	159174	159179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063583
3607	NC_014638	CGC	2	6	159208	159213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063583
3608	NC_014638	CAG	2	6	159278	159283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063583
3609	NC_014638	CG	3	6	159393	159398	0 %	0 %	50 %	50 %	311063583
3610	NC_014638	TGAT	2	8	159411	159418	25 %	50 %	25 %	0 %	311063583
3611	NC_014638	TGC	2	6	159423	159428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063583
3612	NC_014638	GCC	2	6	159459	159464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063583
3613	NC_014638	ATG	2	6	159470	159475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014638	CAAT	2	8	159522	159529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_014638	ATT	2	6	159538	159543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014638	AAT	2	6	159552	159557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014638	GTG	2	6	159559	159564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014638	CAA	2	6	159565	159570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_014638	TGC	2	6	159577	159582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_014638	TTG	2	6	159616	159621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_014638	TGT	2	6	159628	159633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_014638	TAAA	2	8	159654	159661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_014638	CCA	2	6	159732	159737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_014638	GGT	2	6	159785	159790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_014638	G	6	6	159829	159834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_014638	C	6	6	159850	159855	0 %	0 %	0 %	100 %	311063584
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3733	NC_014638	TGG	2	6	164314	164319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063587
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3737	NC_014638	GCT	2	6	164366	164371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063587
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3741	NC_014638	GGCATG	2	12	164535	164546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311063587
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3743	NC_014638	GAT	3	9	164573	164581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063587
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3745	NC_014638	GCT	2	6	164636	164641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063587
3746	NC_014638	ATC	2	6	164661	164666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063587
3747	NC_014638	GC	3	6	164715	164720	0 %	0 %	50 %	50 %	311063587
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3803	NC_014638	ACGCG	2	10	166961	166970	20 %	0 %	40 %	40 %	311063590
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3854	NC_014638	CGC	2	6	168920	168925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3855	NC_014638	TGT	2	6	168929	168934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3858	NC_014638	AGG	2	6	169046	169051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3863	NC_014638	CTG	2	6	169115	169120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3865	NC_014638	T	6	6	169244	169249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3866	NC_014638	GA	4	8	169291	169298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3991	NC_014638	TGCC	2	8	174734	174741	0 %	25 %	25 %	50 %	311063595
3992	NC_014638	CGT	2	6	174822	174827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063595
3993	NC_014638	GC	3	6	174849	174854	0 %	0 %	50 %	50 %	311063595
3994	NC_014638	GTT	2	6	174861	174866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063595
3995	NC_014638	GCC	2	6	174954	174959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3996	NC_014638	TGC	2	6	175037	175042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3997	NC_014638	GTG	2	6	175045	175050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_014638	GGA	2	6	175064	175069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_014638	TG	3	6	175079	175084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_014638	CA	3	6	175112	175117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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