MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 52565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_014638	TCG	2	6	1645313	1645318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064743
39003	NC_014638	AGC	2	6	1645319	1645324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064743
39004	NC_014638	CAG	2	6	1645360	1645365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064743
39005	NC_014638	CCAT	2	8	1645370	1645377	25 %	25 %	0 %	50 %	311064743
39006	NC_014638	CG	3	6	1645401	1645406	0 %	0 %	50 %	50 %	311064743
39007	NC_014638	CGTG	2	8	1645464	1645471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39008	NC_014638	CAG	2	6	1645509	1645514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064744
39009	NC_014638	TGG	2	6	1645517	1645522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064744
39010	NC_014638	CGA	2	6	1645523	1645528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064744
39011	NC_014638	GTA	2	6	1645596	1645601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064744
39012	NC_014638	GAT	2	6	1645623	1645628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064744
39013	NC_014638	CCG	2	6	1645648	1645653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064744
39014	NC_014638	GGCGG	2	10	1645659	1645668	0 %	0 %	80 %	20 %	311064744
39015	NC_014638	GCG	2	6	1645692	1645697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064744
39016	NC_014638	CG	3	6	1645696	1645701	0 %	0 %	50 %	50 %	311064744
39017	NC_014638	AGC	2	6	1645810	1645815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064744
39018	NC_014638	TCCG	2	8	1645824	1645831	0 %	25 %	25 %	50 %	311064744
39019	NC_014638	GCA	2	6	1645841	1645846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064744
39020	NC_014638	TGA	2	6	1645904	1645909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064744
39021	NC_014638	GC	3	6	1645930	1645935	0 %	0 %	50 %	50 %	311064744
39022	NC_014638	CGG	2	6	1645958	1645963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064744
39023	NC_014638	TGA	2	6	1645976	1645981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064744
39024	NC_014638	CAC	2	6	1646028	1646033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064744
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39027	NC_014638	CAAT	2	8	1646086	1646093	50 %	25 %	0 %	25 %	311064744
39028	NC_014638	CAT	2	6	1646132	1646137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064744
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39030	NC_014638	CTG	2	6	1646166	1646171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39031	NC_014638	AG	3	6	1646235	1646240	50 %	0 %	50 %	0 %	311064745
39032	NC_014638	GC	3	6	1646343	1646348	0 %	0 %	50 %	50 %	311064745
39033	NC_014638	GCG	2	6	1646373	1646378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064745
39034	NC_014638	CGC	2	6	1646396	1646401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064745
39035	NC_014638	CG	3	6	1646452	1646457	0 %	0 %	50 %	50 %	311064745
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39040	NC_014638	GAT	2	6	1646721	1646726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064745
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39043	NC_014638	GCA	2	6	1646792	1646797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064745
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39050	NC_014638	AAG	2	6	1647049	1647054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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39052	NC_014638	CGC	2	6	1647100	1647105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39053	NC_014638	CGGC	2	8	1647149	1647156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39054	NC_014638	CG	3	6	1647157	1647162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39055	NC_014638	AGG	2	6	1647207	1647212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39056	NC_014638	ACG	2	6	1647242	1647247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064746
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39070	NC_014638	GAC	2	6	1647734	1647739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064746
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39074	NC_014638	CGA	2	6	1647904	1647909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064746
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39080	NC_014638	CCGG	2	8	1648069	1648076	0 %	0 %	50 %	50 %	311064746
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39088	NC_014638	GAG	2	6	1648433	1648438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311064746
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39098	NC_014638	CGTC	2	8	1648983	1648990	0 %	25 %	25 %	50 %	311064746
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39101	NC_014638	GCG	2	6	1649035	1649040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39102	NC_014638	CAT	2	6	1649113	1649118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39103	NC_014638	ATCGGC	2	12	1649147	1649158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39104	NC_014638	GGT	2	6	1649195	1649200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064747
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39106	NC_014638	GC	3	6	1649290	1649295	0 %	0 %	50 %	50 %	311064747
39107	NC_014638	GCC	2	6	1649321	1649326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064747
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39109	NC_014638	CG	3	6	1649458	1649463	0 %	0 %	50 %	50 %	311064747
39110	NC_014638	GCA	2	6	1649518	1649523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064747
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39112	NC_014638	GCC	2	6	1649564	1649569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064747
39113	NC_014638	CGA	2	6	1649593	1649598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064747
39114	NC_014638	AGT	2	6	1649620	1649625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064747
39115	NC_014638	GCACG	2	10	1649645	1649654	20 %	0 %	40 %	40 %	311064747
39116	NC_014638	CGG	2	6	1649656	1649661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064747
39117	NC_014638	GCG	2	6	1649676	1649681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064747
39118	NC_014638	CGG	2	6	1649689	1649694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064747
39119	NC_014638	GTG	2	6	1649730	1649735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064747
39120	NC_014638	GCC	2	6	1649822	1649827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064747
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39122	NC_014638	CGA	3	9	1649914	1649922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064747
39123	NC_014638	GC	3	6	1649955	1649960	0 %	0 %	50 %	50 %	311064747
39124	NC_014638	CGG	2	6	1649989	1649994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064747
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39126	NC_014638	GTC	2	6	1650092	1650097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064747
39127	NC_014638	TGA	2	6	1650175	1650180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064747
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39129	NC_014638	CCTTGA	2	12	1650202	1650213	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	311064747
39130	NC_014638	GGT	2	6	1650214	1650219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064747
39131	NC_014638	TGA	2	6	1650259	1650264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064747
39132	NC_014638	CGA	2	6	1650268	1650273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064747
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39139	NC_014638	GTG	3	9	1650567	1650575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064747
39140	NC_014638	CGTC	2	8	1650595	1650602	0 %	25 %	25 %	50 %	311064747
39141	NC_014638	GCA	4	12	1650610	1650621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064747
39142	NC_014638	G	6	6	1650657	1650662	0 %	0 %	100 %	0 %	311064747
39143	NC_014638	CGA	2	6	1650730	1650735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39144	NC_014638	CAT	3	9	1650760	1650768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39145	NC_014638	T	6	6	1650788	1650793	0 %	100 %	0 %	0 %	311064748
39146	NC_014638	CGC	2	6	1650831	1650836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064748
39147	NC_014638	TCG	2	6	1650901	1650906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064748
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39149	NC_014638	GCC	2	6	1650999	1651004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064748
39150	NC_014638	GCA	2	6	1651051	1651056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064748
39151	NC_014638	GATGCA	2	12	1651063	1651074	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	311064748
39152	NC_014638	GCA	2	6	1651168	1651173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064748
39153	NC_014638	TCA	2	6	1651237	1651242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064748
39154	NC_014638	TGA	2	6	1651258	1651263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064748
39155	NC_014638	AGC	2	6	1651272	1651277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064748
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39173	NC_014638	ATGG	2	8	1651874	1651881	25 %	25 %	50 %	0 %	311064748
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39199	NC_014638	TAT	2	6	1652691	1652696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39200	NC_014638	CG	3	6	1652766	1652771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39201	NC_014638	GGCC	2	8	1652772	1652779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39202	NC_014638	GCCGGC	2	12	1652825	1652836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39203	NC_014638	GAC	2	6	1652837	1652842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39205	NC_014638	GC	3	6	1652926	1652931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39206	NC_014638	GCCG	2	8	1652978	1652985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39207	NC_014638	GCT	2	6	1653004	1653009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39208	NC_014638	GCC	2	6	1653010	1653015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39209	NC_014638	ATCCG	2	10	1653021	1653030	20 %	20 %	20 %	40 %	311064750
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39211	NC_014638	CTG	2	6	1653115	1653120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064750
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39216	NC_014638	GCCG	2	8	1653246	1653253	0 %	0 %	50 %	50 %	311064750
39217	NC_014638	GTC	2	6	1653259	1653264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064750
39218	NC_014638	GA	3	6	1653324	1653329	50 %	0 %	50 %	0 %	311064751
39219	NC_014638	CGC	2	6	1653351	1653356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064751
39220	NC_014638	GCA	2	6	1653363	1653368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311064751
39221	NC_014638	CGC	2	6	1653373	1653378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064751
39222	NC_014638	CGG	2	6	1653414	1653419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064751
39223	NC_014638	GCC	2	6	1653421	1653426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064751
39224	NC_014638	GCC	2	6	1653434	1653439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311064751
39225	NC_014638	CGG	2	6	1653496	1653501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064751
39226	NC_014638	ACC	2	6	1653509	1653514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311064751
39227	NC_014638	CGT	2	6	1653544	1653549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311064751
39228	NC_014638	TGG	2	6	1653555	1653560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311064751
39229	NC_014638	GAT	2	6	1653576	1653581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311064751
39230	NC_014638	CGG	2	6	1653588	1653593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311064751
39231	NC_014638	TCC	2	6	1653615	1653620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311064751
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39353	NC_014638	CAA	2	6	1658503	1658508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39354	NC_014638	CAA	2	6	1658511	1658516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39438	NC_014638	AT	3	6	1662297	1662302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39439	NC_014638	AGCGC	2	10	1662324	1662333	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39440	NC_014638	CTT	3	9	1662334	1662342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39442	NC_014638	GAT	2	6	1662445	1662450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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39444	NC_014638	GAC	2	6	1662581	1662586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39449	NC_014638	GCTT	2	8	1662822	1662829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39450	NC_014638	TCA	2	6	1662847	1662852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39451	NC_014638	TA	3	6	1662881	1662886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39452	NC_014638	A	6	6	1662886	1662891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39453	NC_014638	TAC	2	6	1662953	1662958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311064759
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39466	NC_014638	ATTC	2	8	1663822	1663829	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39467	NC_014638	GCC	2	6	1663835	1663840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39468	NC_014638	CGG	2	6	1663849	1663854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39469	NC_014638	CGG	2	6	1663868	1663873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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