MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 52565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014638	CTCG	2	8	44158	44165	0 %	25 %	25 %	50 %	311063491
1002	NC_014638	CCGA	2	8	44204	44211	25 %	0 %	25 %	50 %	311063491
1003	NC_014638	GCA	2	6	44214	44219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063491
1004	NC_014638	CAA	2	6	44278	44283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063491
1005	NC_014638	GTT	2	6	44325	44330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063491
1006	NC_014638	CCATGA	2	12	44367	44378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	311063491
1007	NC_014638	GAT	2	6	44394	44399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063491
1008	NC_014638	CGT	2	6	44430	44435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063491
1009	NC_014638	GAT	2	6	44437	44442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063491
1010	NC_014638	GAT	2	6	44491	44496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063491
1011	NC_014638	CGG	2	6	44500	44505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063491
1012	NC_014638	CG	3	6	44508	44513	0 %	0 %	50 %	50 %	311063491
1013	NC_014638	CCG	2	6	44532	44537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063491
1014	NC_014638	GTCGG	2	10	44721	44730	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_014638	TG	3	6	44747	44752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014638	TCA	2	6	44800	44805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014638	TGA	2	6	44871	44876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014638	GAA	2	6	44884	44889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014638	TG	3	6	44955	44960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014638	GAT	2	6	44970	44975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063492
1021	NC_014638	AAC	2	6	45025	45030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063492
1022	NC_014638	TTC	3	9	45079	45087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063492
1023	NC_014638	CGG	2	6	45092	45097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063492
1024	NC_014638	GGA	2	6	45126	45131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063492
1025	NC_014638	AAG	2	6	45157	45162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063492
1026	NC_014638	ACG	2	6	45221	45226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063492
1027	NC_014638	TCC	2	6	45385	45390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063492
1028	NC_014638	CGA	2	6	45408	45413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063492
1029	NC_014638	GCT	2	6	45414	45419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063492
1030	NC_014638	GAG	2	6	45493	45498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063492
1031	NC_014638	CGAGC	2	10	45504	45513	20 %	0 %	40 %	40 %	311063492
1032	NC_014638	TCG	2	6	45521	45526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063492
1033	NC_014638	CAG	2	6	45575	45580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014638	AGGCGA	2	12	45591	45602	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1035	NC_014638	CT	3	6	45702	45707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_014638	G	7	7	45763	45769	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014638	GGC	2	6	45772	45777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_014638	GGT	2	6	45792	45797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014638	CCG	2	6	45839	45844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_014638	GCATAT	2	12	45851	45862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1041	NC_014638	GTT	2	6	45913	45918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063493
1042	NC_014638	GGC	2	6	45928	45933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063493
1043	NC_014638	CCG	2	6	45947	45952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1044	NC_014638	TCGC	2	8	45962	45969	0 %	25 %	25 %	50 %	311063493
1045	NC_014638	GAT	2	6	46000	46005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063493
1046	NC_014638	CGG	2	6	46008	46013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063493
1047	NC_014638	ATCACC	2	12	46018	46029	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	311063493
1048	NC_014638	GTC	2	6	46036	46041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1049	NC_014638	CG	3	6	46184	46189	0 %	0 %	50 %	50 %	311063493
1050	NC_014638	TTC	2	6	46312	46317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063493
1051	NC_014638	GTC	2	6	46336	46341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1052	NC_014638	GGC	2	6	46342	46347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063493
1053	NC_014638	CGC	2	6	46353	46358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1054	NC_014638	CGG	2	6	46439	46444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063493
1055	NC_014638	AAC	2	6	46462	46467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063493
1056	NC_014638	CCG	2	6	46511	46516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1057	NC_014638	CGA	2	6	46538	46543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1058	NC_014638	CCG	2	6	46551	46556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1059	NC_014638	CGA	2	6	46587	46592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1060	NC_014638	GTC	2	6	46654	46659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1061	NC_014638	GAC	2	6	46666	46671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1062	NC_014638	CG	3	6	46688	46693	0 %	0 %	50 %	50 %	311063493
1063	NC_014638	GTC	2	6	46762	46767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1064	NC_014638	ACCGCC	2	12	46768	46779	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	311063493
1065	NC_014638	CGC	2	6	46791	46796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1066	NC_014638	GCC	2	6	46848	46853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1067	NC_014638	CCGCAT	2	12	46862	46873	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	311063493
1068	NC_014638	GCC	2	6	46903	46908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1069	NC_014638	TGC	2	6	46914	46919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1070	NC_014638	CAC	2	6	46929	46934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063493
1071	NC_014638	GCCC	2	8	46935	46942	0 %	0 %	25 %	75 %	311063493
1072	NC_014638	AGCGC	2	10	46955	46964	20 %	0 %	40 %	40 %	311063493
1073	NC_014638	CCG	3	9	46970	46978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1074	NC_014638	CCG	2	6	47015	47020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1075	NC_014638	AGC	3	9	47027	47035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1076	NC_014638	CCCG	2	8	47060	47067	0 %	0 %	25 %	75 %	311063493
1077	NC_014638	TGG	2	6	47135	47140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063493
1078	NC_014638	GCG	2	6	47179	47184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063493
1079	NC_014638	GC	3	6	47213	47218	0 %	0 %	50 %	50 %	311063493
1080	NC_014638	CGT	2	6	47222	47227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1081	NC_014638	GAT	2	6	47296	47301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063493
1082	NC_014638	CG	3	6	47308	47313	0 %	0 %	50 %	50 %	311063493
1083	NC_014638	TGC	2	6	47333	47338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1084	NC_014638	GCCG	2	8	47370	47377	0 %	0 %	50 %	50 %	311063493
1085	NC_014638	TTCG	2	8	47451	47458	0 %	50 %	25 %	25 %	311063493
1086	NC_014638	CGC	2	6	47475	47480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063493
1087	NC_014638	TGA	2	6	47549	47554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063493
1088	NC_014638	CGTG	2	8	47631	47638	0 %	25 %	50 %	25 %	311063493
1089	NC_014638	ACG	2	6	47648	47653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063493
1090	NC_014638	TCA	2	6	47711	47716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063493
1091	NC_014638	CGG	2	6	47724	47729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063493
1092	NC_014638	AAG	2	6	47752	47757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063493
1093	NC_014638	AAT	2	6	47832	47837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014638	CGG	2	6	47890	47895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_014638	GCC	2	6	48122	48127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063494
1096	NC_014638	GCTGAT	2	12	48143	48154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	311063494
1097	NC_014638	GCG	2	6	48195	48200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063494
1098	NC_014638	ACGA	2	8	48234	48241	50 %	0 %	25 %	25 %	311063494
1099	NC_014638	CGTG	2	8	48295	48302	0 %	25 %	50 %	25 %	311063494
1100	NC_014638	AGC	2	6	48336	48341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063494
1101	NC_014638	ACC	2	6	48359	48364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063494
1102	NC_014638	TGA	2	6	48379	48384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063494
1103	NC_014638	TTG	2	6	48420	48425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063494
1104	NC_014638	GCA	2	6	48445	48450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063494
1105	NC_014638	ATG	2	6	48468	48473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063494
1106	NC_014638	GCG	2	6	48497	48502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063494
1107	NC_014638	GGT	2	6	48508	48513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063494
1108	NC_014638	CGGC	2	8	48537	48544	0 %	0 %	50 %	50 %	311063494
1109	NC_014638	GAT	2	6	48581	48586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063494
1110	NC_014638	GGC	3	9	48596	48604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063494
1111	NC_014638	CG	3	6	48758	48763	0 %	0 %	50 %	50 %	311063494
1112	NC_014638	TGA	2	6	48811	48816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063494
1113	NC_014638	GAA	2	6	48827	48832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063494
1114	NC_014638	CAT	2	6	48833	48838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063494
1115	NC_014638	GAA	2	6	48863	48868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063494
1116	NC_014638	CGGCGA	2	12	48943	48954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	311063494
1117	NC_014638	AC	3	6	49063	49068	50 %	0 %	0 %	50 %	311063494
1118	NC_014638	TTC	2	6	49158	49163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063494
1119	NC_014638	CCA	2	6	49165	49170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063494
1120	NC_014638	GAA	2	6	49202	49207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063494
1121	NC_014638	GCGA	2	8	49212	49219	25 %	0 %	50 %	25 %	311063494
1122	NC_014638	GCT	2	6	49270	49275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063494
1123	NC_014638	GAT	2	6	49331	49336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063494
1124	NC_014638	CTCA	2	8	49436	49443	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_014638	CAT	2	6	49449	49454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_014638	CTA	2	6	49545	49550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_014638	TGG	2	6	49565	49570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014638	GAT	2	6	49578	49583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014638	TGAT	2	8	49642	49649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014638	G	8	8	49651	49658	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014638	AGGGC	2	10	49680	49689	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_014638	TCG	2	6	49727	49732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014638	TGC	2	6	49744	49749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_014638	CGG	2	6	49891	49896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063495
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1252	NC_014638	GC	3	6	54746	54751	0 %	0 %	50 %	50 %	311063496
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1371	NC_014638	GCG	2	6	60524	60529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1372	NC_014638	GTC	2	6	60548	60553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1373	NC_014638	GAC	2	6	60572	60577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1375	NC_014638	CGGC	2	8	60657	60664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1376	NC_014638	AGG	2	6	60709	60714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1377	NC_014638	GGC	2	6	60833	60838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063500
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1380	NC_014638	AGC	2	6	60995	61000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063500
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1383	NC_014638	AGC	2	6	61163	61168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063500
1384	NC_014638	CGA	2	6	61203	61208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063500
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1422	NC_014638	GCCA	2	8	62782	62789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1495	NC_014638	CTT	2	6	66470	66475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063503
1496	NC_014638	ACG	2	6	66490	66495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063503
1497	NC_014638	ATC	2	6	66550	66555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_014638	CTT	2	6	66565	66570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1499	NC_014638	TCTTG	2	10	66595	66604	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1500	NC_014638	GA	4	8	66614	66621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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