MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 52565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_014638	CTC	2	6	2211952	2211957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311065162
52502	NC_014638	CAT	2	6	2211966	2211971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065162
52503	NC_014638	CGAA	2	8	2211987	2211994	50 %	0 %	25 %	25 %	311065162
52504	NC_014638	TCA	2	6	2212037	2212042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065162
52505	NC_014638	GACGCT	2	12	2212068	2212079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311065162
52506	NC_014638	TCAACA	2	12	2212097	2212108	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	311065162
52507	NC_014638	TCT	2	6	2212131	2212136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065162
52508	NC_014638	GCT	2	6	2212158	2212163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065162
52509	NC_014638	TCA	2	6	2212220	2212225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065162
52510	NC_014638	CGA	2	6	2212227	2212232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065162
52511	NC_014638	GAC	2	6	2212245	2212250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065162
52512	NC_014638	AGT	2	6	2212311	2212316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065162
52513	NC_014638	CGG	2	6	2212317	2212322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065162
52514	NC_014638	CTT	2	6	2212332	2212337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065162
52515	NC_014638	GATC	2	8	2212347	2212354	25 %	25 %	25 %	25 %	311065162
52516	NC_014638	TCC	2	6	2212364	2212369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311065162
52517	NC_014638	CAC	2	6	2212380	2212385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52518	NC_014638	A	6	6	2212416	2212421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52519	NC_014638	CTT	3	9	2212460	2212468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065163
52520	NC_014638	TTC	2	6	2212473	2212478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311065163
52521	NC_014638	GCT	2	6	2212486	2212491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065163
52522	NC_014638	AGC	2	6	2212517	2212522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065163
52523	NC_014638	TTCCTC	2	12	2212547	2212558	0 %	50 %	0 %	50 %	311065163
52524	NC_014638	CGA	2	6	2212584	2212589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065163
52525	NC_014638	GAT	2	6	2212603	2212608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065163
52526	NC_014638	GTT	2	6	2212694	2212699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065163
52527	NC_014638	ATG	2	6	2212734	2212739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311065163
52528	NC_014638	CTG	2	6	2212781	2212786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065163
52529	NC_014638	TGT	2	6	2212837	2212842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065163
52530	NC_014638	CATG	2	8	2212859	2212866	25 %	25 %	25 %	25 %	311065163
52531	NC_014638	GAA	2	6	2212883	2212888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311065163
52532	NC_014638	GAC	2	6	2212895	2212900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065163
52533	NC_014638	TTG	2	6	2212911	2212916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065163
52534	NC_014638	CGG	2	6	2213083	2213088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065163
52535	NC_014638	TCA	2	6	2213134	2213139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065163
52536	NC_014638	TGC	2	6	2213202	2213207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311065163
52537	NC_014638	CAC	2	6	2213282	2213287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065163
52538	NC_014638	CAG	2	6	2213405	2213410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52539	NC_014638	CAGC	2	8	2213417	2213424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52540	NC_014638	AAG	2	6	2213441	2213446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52541	NC_014638	TCA	2	6	2213464	2213469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52542	NC_014638	ATC	2	6	2213483	2213488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52543	NC_014638	CAT	2	6	2213566	2213571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52544	NC_014638	GCC	2	6	2213576	2213581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52545	NC_014638	GAA	2	6	2213602	2213607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52546	NC_014638	GCA	2	6	2213696	2213701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52547	NC_014638	GGC	2	6	2213703	2213708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52548	NC_014638	CCGAT	2	10	2213758	2213767	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52549	NC_014638	ACG	2	6	2213885	2213890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065164
52550	NC_014638	CAC	2	6	2214055	2214060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311065164
52551	NC_014638	ACG	2	6	2214068	2214073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311065164
52552	NC_014638	CGG	3	9	2214201	2214209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065165
52553	NC_014638	ATC	2	6	2214213	2214218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311065165
52554	NC_014638	TGCGCA	2	12	2214235	2214246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311065165
52555	NC_014638	CGG	2	6	2214273	2214278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311065165
52556	NC_014638	TTG	2	6	2214279	2214284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311065165
52557	NC_014638	TTC	2	6	2214405	2214410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52558	NC_014638	GT	3	6	2214422	2214427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52559	NC_014638	AGC	2	6	2214442	2214447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52560	NC_014638	ACA	2	6	2214527	2214532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52561	NC_014638	AT	3	6	2214569	2214574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52562	NC_014638	TGT	4	12	2214577	2214588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52563	NC_014638	TTA	2	6	2214591	2214596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52564	NC_014638	CA	3	6	2214633	2214638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52565	NC_014638	AGG	2	6	2214646	2214651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.