MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 52047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014616	TCG	2	6	90756	90761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286597
2003	NC_014616	GGCA	2	8	90772	90779	25 %	0 %	50 %	25 %	310286597
2004	NC_014616	CTG	2	6	90797	90802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286597
2005	NC_014616	ACTTC	2	10	90823	90832	20 %	40 %	0 %	40 %	310286597
2006	NC_014616	ACCG	2	8	90973	90980	25 %	0 %	25 %	50 %	310286598
2007	NC_014616	CCG	2	6	91020	91025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286598
2008	NC_014616	TCG	2	6	91175	91180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286598
2009	NC_014616	GCT	2	6	91266	91271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286598
2010	NC_014616	ATC	2	6	91321	91326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286598
2011	NC_014616	CAAC	2	8	91331	91338	50 %	0 %	0 %	50 %	310286598
2012	NC_014616	CCG	2	6	91406	91411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286599
2013	NC_014616	GGC	2	6	91416	91421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286599
2014	NC_014616	CGC	2	6	91452	91457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286599
2015	NC_014616	AGA	2	6	91496	91501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286599
2016	NC_014616	TCG	2	6	91526	91531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286599
2017	NC_014616	CGT	2	6	91557	91562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286599
2018	NC_014616	AAGG	2	8	91564	91571	50 %	0 %	50 %	0 %	310286599
2019	NC_014616	GCC	2	6	91583	91588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286599
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2021	NC_014616	CCGG	2	8	91600	91607	0 %	0 %	50 %	50 %	310286599
2022	NC_014616	CAT	2	6	91608	91613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286599
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2089	NC_014616	CAG	2	6	94252	94257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286603
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2091	NC_014616	A	6	6	94401	94406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_014616	TTA	2	6	94449	94454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2094	NC_014616	ACC	2	6	94501	94506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2095	NC_014616	GGAA	2	8	94518	94525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_014616	CCG	2	6	94565	94570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286604
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2103	NC_014616	TGCG	2	8	95047	95054	0 %	25 %	50 %	25 %	310286604
2104	NC_014616	GAC	2	6	95155	95160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286604
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2106	NC_014616	AGC	2	6	95216	95221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286604
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2108	NC_014616	GCT	2	6	95262	95267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286604
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2111	NC_014616	ACG	3	9	95405	95413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286604
2112	NC_014616	TGC	2	6	95438	95443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286604
2113	NC_014616	GTG	2	6	95488	95493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286604
2114	NC_014616	GGC	2	6	95494	95499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286604
2115	NC_014616	TAT	2	6	95503	95508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310286604
2116	NC_014616	CGA	2	6	95631	95636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286604
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2118	NC_014616	GC	4	8	95746	95753	0 %	0 %	50 %	50 %	310286604
2119	NC_014616	ATC	2	6	95776	95781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286604
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2121	NC_014616	ATGTC	2	10	95873	95882	20 %	40 %	20 %	20 %	310286604
2122	NC_014616	CTT	2	6	95884	95889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286604
2123	NC_014616	GGT	2	6	95920	95925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286604
2124	NC_014616	GTT	2	6	95935	95940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286604
2125	NC_014616	GGA	2	6	95991	95996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286604
2126	NC_014616	CGA	2	6	96000	96005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286604
2127	NC_014616	GGT	2	6	96015	96020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286604
2128	NC_014616	CCG	2	6	96028	96033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286604
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2130	NC_014616	GGT	2	6	96195	96200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286604
2131	NC_014616	GACATG	2	12	96226	96237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310286604
2132	NC_014616	CGA	2	6	96252	96257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286604
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2134	NC_014616	CGG	2	6	96339	96344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286604
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2137	NC_014616	CGA	2	6	96528	96533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286604
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2140	NC_014616	ATCG	2	8	96670	96677	25 %	25 %	25 %	25 %	310286604
2141	NC_014616	CGA	2	6	96687	96692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286604
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2153	NC_014616	AATCG	2	10	97207	97216	40 %	20 %	20 %	20 %	310286605
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2164	NC_014616	GCG	2	6	97616	97621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286606
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2192	NC_014616	GCA	2	6	98883	98888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286609
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2212	NC_014616	AGG	2	6	99551	99556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2237	NC_014616	CGC	2	6	100695	100700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286612
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2241	NC_014616	GCC	2	6	100880	100885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286612
2242	NC_014616	GCAT	2	8	100897	100904	25 %	25 %	25 %	25 %	310286612
2243	NC_014616	CACG	2	8	100959	100966	25 %	0 %	25 %	50 %	310286612
2244	NC_014616	GAA	2	6	101067	101072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286612
2245	NC_014616	CGTCAC	2	12	101085	101096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310286612
2246	NC_014616	GCCGC	2	10	101114	101123	0 %	0 %	40 %	60 %	310286612
2247	NC_014616	TGC	2	6	101141	101146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286612
2248	NC_014616	CACC	2	8	101160	101167	25 %	0 %	0 %	75 %	310286612
2249	NC_014616	CGC	2	6	101187	101192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286612
2250	NC_014616	CGC	2	6	101199	101204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286612
2251	NC_014616	CACCGA	2	12	101256	101267	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310286612
2252	NC_014616	TCG	2	6	101279	101284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286612
2253	NC_014616	CAG	2	6	101316	101321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286612
2254	NC_014616	CCG	2	6	101322	101327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286612
2255	NC_014616	ATC	2	6	101350	101355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286612
2256	NC_014616	CAC	2	6	101378	101383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286613
2257	NC_014616	CAGC	2	8	101402	101409	25 %	0 %	25 %	50 %	310286613
2258	NC_014616	CGG	2	6	101421	101426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286613
2259	NC_014616	CG	4	8	101451	101458	0 %	0 %	50 %	50 %	310286613
2260	NC_014616	CCGCAC	2	12	101462	101473	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	310286613
2261	NC_014616	CTA	2	6	101477	101482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286613
2262	NC_014616	GCC	2	6	101522	101527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286613
2263	NC_014616	GTC	2	6	101550	101555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286613
2264	NC_014616	CGT	2	6	101594	101599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286613
2265	NC_014616	CG	3	6	101617	101622	0 %	0 %	50 %	50 %	310286613
2266	NC_014616	CGG	2	6	101683	101688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286613
2267	NC_014616	CAT	2	6	101774	101779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286613
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2269	NC_014616	ACG	3	9	101866	101874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286613
2270	NC_014616	ACG	2	6	101977	101982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286613
2271	NC_014616	TGA	2	6	102061	102066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286613
2272	NC_014616	CCG	2	6	102079	102084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286613
2273	NC_014616	GCC	2	6	102131	102136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286613
2274	NC_014616	CGA	2	6	102173	102178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286613
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2277	NC_014616	CAG	2	6	102279	102284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286613
2278	NC_014616	CGG	2	6	102337	102342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286613
2279	NC_014616	CGA	2	6	102343	102348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286613
2280	NC_014616	GCC	2	6	102353	102358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286613
2281	NC_014616	GCG	3	9	102396	102404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286613
2282	NC_014616	CGC	2	6	102453	102458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286613
2283	NC_014616	ATC	2	6	102480	102485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286613
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2285	NC_014616	CCG	4	12	102574	102585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286613
2286	NC_014616	CGG	2	6	102607	102612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286613
2287	NC_014616	CCG	2	6	102622	102627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286613
2288	NC_014616	AAC	2	6	102775	102780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286613
2289	NC_014616	ACG	2	6	102798	102803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286613
2290	NC_014616	GCT	2	6	102819	102824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286613
2291	NC_014616	GAT	2	6	102850	102855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2292	NC_014616	CGA	2	6	102882	102887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2293	NC_014616	GCCA	2	8	102955	102962	25 %	0 %	25 %	50 %	310286614
2294	NC_014616	ACT	2	6	102974	102979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286614
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2297	NC_014616	GGC	2	6	103084	103089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286614
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2303	NC_014616	CG	3	6	103301	103306	0 %	0 %	50 %	50 %	310286614
2304	NC_014616	CGACTG	2	12	103398	103409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310286614
2305	NC_014616	ATC	2	6	103414	103419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286614
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2307	NC_014616	CAGA	2	8	103527	103534	50 %	0 %	25 %	25 %	310286614
2308	NC_014616	GCC	2	6	103538	103543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286614
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2312	NC_014616	CGA	2	6	103874	103879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286614
2313	NC_014616	GCA	2	6	103881	103886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286614
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2316	NC_014616	GCT	2	6	104099	104104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286615
2317	NC_014616	CGA	2	6	104105	104110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286615
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2319	NC_014616	CCG	2	6	104152	104157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2320	NC_014616	TCA	3	9	104158	104166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2321	NC_014616	GTG	2	6	104183	104188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2322	NC_014616	TGG	2	6	104209	104214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2323	NC_014616	AGC	2	6	104223	104228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2324	NC_014616	CATC	2	8	104286	104293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2325	NC_014616	CGC	2	6	104312	104317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2326	NC_014616	CAT	2	6	104353	104358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286616
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2328	NC_014616	CCG	2	6	104454	104459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286616
2329	NC_014616	CGG	2	6	104464	104469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286616
2330	NC_014616	AGCCTC	2	12	104499	104510	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310286616
2331	NC_014616	ACC	2	6	104515	104520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286616
2332	NC_014616	GGA	2	6	104521	104526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286616
2333	NC_014616	GAG	2	6	104612	104617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286616
2334	NC_014616	AAGGCC	2	12	104621	104632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2335	NC_014616	ACG	2	6	104640	104645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2336	NC_014616	ACG	2	6	104655	104660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2337	NC_014616	GCG	2	6	104686	104691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286616
2338	NC_014616	CGA	2	6	104695	104700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2339	NC_014616	CAAGGC	2	12	104707	104718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2340	NC_014616	TCG	2	6	104805	104810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2341	NC_014616	ATC	2	6	104834	104839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286616
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2343	NC_014616	CGCGC	2	10	104866	104875	0 %	0 %	40 %	60 %	310286616
2344	NC_014616	GGC	2	6	104891	104896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286616
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2347	NC_014616	ACGCGT	2	12	105097	105108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310286617
2348	NC_014616	GAG	2	6	105114	105119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286617
2349	NC_014616	CGG	2	6	105215	105220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286617
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2352	NC_014616	GC	3	6	105275	105280	0 %	0 %	50 %	50 %	310286617
2353	NC_014616	TTC	2	6	105333	105338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286617
2354	NC_014616	CCG	2	6	105349	105354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286617
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2356	NC_014616	GC	3	6	105397	105402	0 %	0 %	50 %	50 %	310286617
2357	NC_014616	CGG	2	6	105413	105418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286617
2358	NC_014616	CGA	2	6	105482	105487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286617
2359	NC_014616	CGC	2	6	105494	105499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286617
2360	NC_014616	CAT	2	6	105548	105553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286617
2361	NC_014616	GGA	2	6	105605	105610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286617
2362	NC_014616	GC	3	6	105623	105628	0 %	0 %	50 %	50 %	310286617
2363	NC_014616	CCG	2	6	105670	105675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286617
2364	NC_014616	GCG	2	6	105676	105681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286617
2365	NC_014616	CGC	2	6	105692	105697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286617
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2367	NC_014616	TCC	2	6	105774	105779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286617
2368	NC_014616	CGG	2	6	105812	105817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286617
2369	NC_014616	GCC	2	6	105912	105917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286617
2370	NC_014616	TCGACC	2	12	105971	105982	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310286618
2371	NC_014616	CGG	2	6	106025	106030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286618
2372	NC_014616	TCCC	2	8	106058	106065	0 %	25 %	0 %	75 %	310286618
2373	NC_014616	CGA	2	6	106201	106206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286619
2374	NC_014616	GCT	2	6	106261	106266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286619
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2379	NC_014616	CTG	2	6	106499	106504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286619
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2382	NC_014616	TGG	2	6	106658	106663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286620
2383	NC_014616	GGCGA	2	10	106675	106684	20 %	0 %	60 %	20 %	310286620
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2386	NC_014616	CCG	2	6	106817	106822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286620
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2398	NC_014616	GCT	2	6	107490	107495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286622
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2401	NC_014616	TCA	2	6	107605	107610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286623
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2432	NC_014616	GCC	2	6	109088	109093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2433	NC_014616	GAACC	2	10	109099	109108	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2434	NC_014616	GAG	2	6	109124	109129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2435	NC_014616	CGC	3	9	109228	109236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286626
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2441	NC_014616	CAT	2	6	109441	109446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286626
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2443	NC_014616	CG	4	8	109639	109646	0 %	0 %	50 %	50 %	310286626
2444	NC_014616	CGA	2	6	109660	109665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286626
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2480	NC_014616	CT	3	6	111001	111006	0 %	50 %	0 %	50 %	310286626
2481	NC_014616	GGC	2	6	111047	111052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286626
2482	NC_014616	CTG	2	6	111122	111127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
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2486	NC_014616	GTC	2	6	111257	111262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
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2488	NC_014616	GCT	2	6	111322	111327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
2489	NC_014616	TCGC	2	8	111332	111339	0 %	25 %	25 %	50 %	310286626
2490	NC_014616	ATC	2	6	111389	111394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286626
2491	NC_014616	ATC	2	6	111434	111439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286626
2492	NC_014616	ATC	3	9	111455	111463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286626
2493	NC_014616	GGA	2	6	111473	111478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286626
2494	NC_014616	CAG	2	6	111526	111531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286626
2495	NC_014616	CAT	2	6	111580	111585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286626
2496	NC_014616	CGGC	2	8	111615	111622	0 %	0 %	50 %	50 %	310286626
2497	NC_014616	TCG	2	6	111627	111632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
2498	NC_014616	CGC	2	6	111646	111651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286626
2499	NC_014616	CGA	2	6	111715	111720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286626
2500	NC_014616	CCG	2	6	111738	111743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286626

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