MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 52047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014616	CGC	2	6	42363	42368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286556
1002	NC_014616	TGA	2	6	42437	42442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286556
1003	NC_014616	CGTG	2	8	42519	42526	0 %	25 %	50 %	25 %	310286556
1004	NC_014616	ACG	2	6	42536	42541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286556
1005	NC_014616	TCA	2	6	42599	42604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286556
1006	NC_014616	CGG	2	6	42612	42617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286556
1007	NC_014616	AAG	2	6	42640	42645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286556
1008	NC_014616	AAT	2	6	42720	42725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014616	ATT	2	6	42761	42766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014616	AGG	2	6	42779	42784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014616	TGC	2	6	42791	42796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1012	NC_014616	AACGCC	2	12	42833	42844	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310286557
1013	NC_014616	TCG	2	6	42863	42868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1014	NC_014616	TGG	2	6	42875	42880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286557
1015	NC_014616	GGC	2	6	42978	42983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286557
1016	NC_014616	CAA	2	6	42993	42998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286557
1017	NC_014616	GTC	2	6	43054	43059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1018	NC_014616	CAG	2	6	43074	43079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1019	NC_014616	CAG	2	6	43081	43086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1020	NC_014616	CCA	2	6	43094	43099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286557
1021	NC_014616	GC	3	6	43139	43144	0 %	0 %	50 %	50 %	310286557
1022	NC_014616	TCA	2	6	43175	43180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286557
1023	NC_014616	GCA	2	6	43191	43196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1024	NC_014616	GC	3	6	43214	43219	0 %	0 %	50 %	50 %	310286557
1025	NC_014616	GC	3	6	43261	43266	0 %	0 %	50 %	50 %	310286557
1026	NC_014616	TTG	2	6	43312	43317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286557
1027	NC_014616	TGA	3	9	43323	43331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286557
1028	NC_014616	GGC	2	6	43372	43377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286557
1029	NC_014616	CTG	2	6	43399	43404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1030	NC_014616	CCG	2	6	43451	43456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286557
1031	NC_014616	TTC	2	6	43504	43509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286557
1032	NC_014616	ATC	2	6	43616	43621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286557
1033	NC_014616	GGC	2	6	43635	43640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286557
1034	NC_014616	GAC	2	6	43699	43704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1035	NC_014616	AAC	2	6	43756	43761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286557
1036	NC_014616	CGG	2	6	43817	43822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286557
1037	NC_014616	GTG	2	6	43844	43849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286557
1038	NC_014616	AT	3	6	43858	43863	50 %	50 %	0 %	0 %	310286557
1039	NC_014616	ATT	2	6	43898	43903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310286557
1040	NC_014616	GGT	2	6	43923	43928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286557
1041	NC_014616	GTG	2	6	43945	43950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286557
1042	NC_014616	TGA	2	6	43970	43975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286557
1043	NC_014616	TGC	2	6	44039	44044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1044	NC_014616	TGG	2	6	44144	44149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286557
1045	NC_014616	GC	3	6	44189	44194	0 %	0 %	50 %	50 %	310286557
1046	NC_014616	TA	3	6	44198	44203	50 %	50 %	0 %	0 %	310286557
1047	NC_014616	GAT	2	6	44209	44214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286557
1048	NC_014616	CGG	2	6	44254	44259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286557
1049	NC_014616	GCG	2	6	44299	44304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286557
1050	NC_014616	TGA	2	6	44318	44323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286557
1051	NC_014616	GCT	2	6	44325	44330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286557
1052	NC_014616	AAT	2	6	44468	44473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014616	CGG	2	6	44526	44531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014616	GCC	2	6	44760	44765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_014616	GCTGAT	2	12	44781	44792	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1056	NC_014616	GCG	2	6	44833	44838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_014616	ACGA	2	8	44872	44879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_014616	CGTG	2	8	44933	44940	0 %	25 %	50 %	25 %	310286558
1059	NC_014616	AGC	2	6	44974	44979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286558
1060	NC_014616	ACC	2	6	44997	45002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286558
1061	NC_014616	TGA	2	6	45017	45022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286558
1062	NC_014616	TTG	2	6	45058	45063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286558
1063	NC_014616	GCA	2	6	45083	45088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286558
1064	NC_014616	ATG	2	6	45106	45111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286558
1065	NC_014616	GGT	2	6	45146	45151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286558
1066	NC_014616	CGGC	2	8	45175	45182	0 %	0 %	50 %	50 %	310286558
1067	NC_014616	GAT	2	6	45219	45224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286558
1068	NC_014616	GGC	3	9	45234	45242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286558
1069	NC_014616	CG	3	6	45396	45401	0 %	0 %	50 %	50 %	310286558
1070	NC_014616	TGA	2	6	45449	45454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286558
1071	NC_014616	GAA	2	6	45465	45470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286558
1072	NC_014616	CAT	2	6	45471	45476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286558
1073	NC_014616	GAA	2	6	45501	45506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286558
1074	NC_014616	CGGCGA	2	12	45581	45592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	310286558
1075	NC_014616	AC	3	6	45701	45706	50 %	0 %	0 %	50 %	310286558
1076	NC_014616	TTC	2	6	45796	45801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286558
1077	NC_014616	CCA	2	6	45803	45808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286558
1078	NC_014616	GAA	2	6	45840	45845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286558
1079	NC_014616	GCGA	2	8	45850	45857	25 %	0 %	50 %	25 %	310286558
1080	NC_014616	GCT	2	6	45908	45913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286558
1081	NC_014616	GAT	2	6	45969	45974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286558
1082	NC_014616	CTCA	2	8	46074	46081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_014616	CAT	2	6	46087	46092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_014616	CTA	2	6	46183	46188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014616	TGG	2	6	46203	46208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014616	GAT	2	6	46216	46221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014616	TGAT	2	8	46280	46287	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014616	G	8	8	46289	46296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014616	AGGGC	2	10	46318	46327	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_014616	TCG	2	6	46365	46370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_014616	TGC	2	6	46382	46387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_014616	TGCG	2	8	46397	46404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_014616	CGG	2	6	46529	46534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286559
1094	NC_014616	AGAT	2	8	46561	46568	50 %	25 %	25 %	0 %	310286559
1095	NC_014616	CTG	2	6	46578	46583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1096	NC_014616	CTT	2	6	46611	46616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286559
1097	NC_014616	AACGC	2	10	46625	46634	40 %	0 %	20 %	40 %	310286559
1098	NC_014616	GCGGAT	2	12	46674	46685	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310286559
1099	NC_014616	TGC	2	6	46708	46713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1100	NC_014616	TCG	2	6	46723	46728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1101	NC_014616	TGG	2	6	46751	46756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286559
1102	NC_014616	TCG	2	6	46768	46773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1103	NC_014616	CTT	2	6	46779	46784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286559
1104	NC_014616	TGT	2	6	46862	46867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286559
1105	NC_014616	CTC	2	6	46893	46898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286559
1106	NC_014616	GCG	2	6	46963	46968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286559
1107	NC_014616	GC	3	6	46977	46982	0 %	0 %	50 %	50 %	310286559
1108	NC_014616	GTC	2	6	47019	47024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1109	NC_014616	CGGG	2	8	47055	47062	0 %	0 %	75 %	25 %	310286559
1110	NC_014616	GCA	2	6	47072	47077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1111	NC_014616	GCG	2	6	47093	47098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286559
1112	NC_014616	CAG	2	6	47136	47141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1113	NC_014616	TCT	2	6	47219	47224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286559
1114	NC_014616	GCA	2	6	47243	47248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1115	NC_014616	CGG	2	6	47255	47260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286559
1116	NC_014616	CG	3	6	47379	47384	0 %	0 %	50 %	50 %	310286559
1117	NC_014616	CGAC	2	8	47404	47411	25 %	0 %	25 %	50 %	310286559
1118	NC_014616	CCA	2	6	47416	47421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286559
1119	NC_014616	CGA	2	6	47468	47473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1120	NC_014616	CGG	2	6	47483	47488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286559
1121	NC_014616	GGT	2	6	47508	47513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286559
1122	NC_014616	TTG	2	6	47563	47568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286559
1123	NC_014616	GCT	2	6	47651	47656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
1124	NC_014616	TCC	2	6	47689	47694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286559
1125	NC_014616	GAT	2	6	47763	47768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286559
1126	NC_014616	GCG	2	6	47772	47777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286559
1127	NC_014616	GGC	2	6	47778	47783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286559
1128	NC_014616	TCC	2	6	47896	47901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286559
1129	NC_014616	GC	3	6	47903	47908	0 %	0 %	50 %	50 %	310286559
1130	NC_014616	CAC	2	6	47916	47921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286559
1131	NC_014616	CAGAT	2	10	47977	47986	40 %	20 %	20 %	20 %	310286559
1132	NC_014616	TCG	2	6	48067	48072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
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1134	NC_014616	GCTC	2	8	48194	48201	0 %	25 %	25 %	50 %	310286559
1135	NC_014616	TGG	2	6	48211	48216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286559
1136	NC_014616	GTC	2	6	48250	48255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
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1142	NC_014616	CCT	2	6	48539	48544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286559
1143	NC_014616	CTT	2	6	48558	48563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286559
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1151	NC_014616	GGCC	2	8	48777	48784	0 %	0 %	50 %	50 %	310286559
1152	NC_014616	CAG	2	6	48795	48800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286559
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1155	NC_014616	TCG	2	6	48844	48849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286559
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1165	NC_014616	ATCGGT	2	12	49251	49262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	310286559
1166	NC_014616	CCT	2	6	49272	49277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1167	NC_014616	TCC	2	6	49311	49316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1168	NC_014616	CTC	2	6	49321	49326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1169	NC_014616	TG	3	6	49379	49384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1170	NC_014616	GTC	2	6	49502	49507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1171	NC_014616	TCG	2	6	49518	49523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1172	NC_014616	CAT	2	6	49556	49561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1173	NC_014616	ACT	2	6	49615	49620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1174	NC_014616	GGC	2	6	49658	49663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1234	NC_014616	CGC	2	6	52863	52868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1235	NC_014616	GCC	2	6	52869	52874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1236	NC_014616	CGG	2	6	52901	52906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1237	NC_014616	CGC	2	6	52925	52930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1238	NC_014616	CGG	2	6	52951	52956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1239	NC_014616	CG	3	6	52972	52977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1240	NC_014616	ATCAG	2	10	53019	53028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1241	NC_014616	C	9	9	53117	53125	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1242	NC_014616	TG	3	6	53130	53135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_014616	TCT	2	6	53186	53191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1244	NC_014616	GT	3	6	53209	53214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_014616	GGC	2	6	53232	53237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1246	NC_014616	CCG	2	6	53262	53267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1247	NC_014616	T	6	6	53321	53326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_014616	GCAGC	2	10	53482	53491	20 %	0 %	40 %	40 %	310286562
1249	NC_014616	GCC	2	6	53500	53505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286562
1250	NC_014616	GTC	2	6	53594	53599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1251	NC_014616	TCG	2	6	53625	53630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1252	NC_014616	GTC	2	6	53666	53671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1253	NC_014616	ATG	2	6	53768	53773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286562
1254	NC_014616	GAC	2	6	53797	53802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286562
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1376	NC_014616	GCCA	2	8	59426	59433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1377	NC_014616	ATT	2	6	59484	59489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_014616	TGA	2	6	59496	59501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_014616	GA	3	6	59510	59515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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