MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 52047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014616	CAA	2	6	22024	22029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286542
502	NC_014616	GCT	2	6	22051	22056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286542
503	NC_014616	GGCGAA	2	12	22057	22068	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310286542
504	NC_014616	CGA	2	6	22096	22101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286542
505	NC_014616	CCG	2	6	22122	22127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286542
506	NC_014616	AGC	2	6	22128	22133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286542
507	NC_014616	GCT	2	6	22144	22149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286542
508	NC_014616	CAC	2	6	22194	22199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_014616	GAA	2	6	22369	22374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014616	GC	3	6	22392	22397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_014616	GGC	2	6	22464	22469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_014616	CAA	2	6	22485	22490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_014616	ACG	2	6	22570	22575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286543
514	NC_014616	TTGTC	2	10	22692	22701	0 %	60 %	20 %	20 %	310286543
515	NC_014616	TGG	2	6	22712	22717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286543
516	NC_014616	GCT	2	6	22718	22723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
517	NC_014616	TCAGGC	2	12	22793	22804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310286543
518	NC_014616	CCTT	2	8	22820	22827	0 %	50 %	0 %	50 %	310286543
519	NC_014616	ACG	2	6	22835	22840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286543
520	NC_014616	CGGTGA	2	12	22878	22889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	310286543
521	NC_014616	CAT	2	6	22926	22931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286543
522	NC_014616	CGG	2	6	22932	22937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286543
523	NC_014616	CGC	2	6	22945	22950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
524	NC_014616	AGCG	2	8	22951	22958	25 %	0 %	50 %	25 %	310286543
525	NC_014616	TCC	2	6	22970	22975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286543
526	NC_014616	CGT	2	6	22977	22982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
527	NC_014616	TGA	2	6	23046	23051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286543
528	NC_014616	GCA	2	6	23075	23080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286543
529	NC_014616	CGT	2	6	23098	23103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
530	NC_014616	GCG	2	6	23112	23117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286543
531	NC_014616	CGC	2	6	23137	23142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
532	NC_014616	GCT	2	6	23155	23160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
533	NC_014616	TGC	2	6	23212	23217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
534	NC_014616	CAGA	2	8	23247	23254	50 %	0 %	25 %	25 %	310286543
535	NC_014616	GC	3	6	23289	23294	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
536	NC_014616	GAT	2	6	23308	23313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286543
537	NC_014616	CAT	3	9	23328	23336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286543
538	NC_014616	CGAGC	2	10	23389	23398	20 %	0 %	40 %	40 %	310286543
539	NC_014616	GAA	2	6	23467	23472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286543
540	NC_014616	CTG	2	6	23536	23541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
541	NC_014616	CGAG	2	8	23550	23557	25 %	0 %	50 %	25 %	310286543
542	NC_014616	GC	3	6	23676	23681	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
543	NC_014616	TGA	2	6	23709	23714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286543
544	NC_014616	TGCC	2	8	23724	23731	0 %	25 %	25 %	50 %	310286543
545	NC_014616	CGCC	2	8	23766	23773	0 %	0 %	25 %	75 %	310286543
546	NC_014616	CTT	2	6	23782	23787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286543
547	NC_014616	CGT	3	9	23793	23801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
548	NC_014616	CGT	2	6	23859	23864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
549	NC_014616	TGA	2	6	23898	23903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286543
550	NC_014616	CCGT	2	8	23951	23958	0 %	25 %	25 %	50 %	310286543
551	NC_014616	GGT	2	6	23986	23991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286543
552	NC_014616	CTG	2	6	24055	24060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
553	NC_014616	GC	3	6	24105	24110	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
554	NC_014616	CGG	2	6	24150	24155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286543
555	NC_014616	GTC	2	6	24163	24168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
556	NC_014616	GTTC	2	8	24183	24190	0 %	50 %	25 %	25 %	310286543
557	NC_014616	ACGCTG	2	12	24212	24223	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310286543
558	NC_014616	TTG	2	6	24227	24232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286543
559	NC_014616	ACGA	2	8	24239	24246	50 %	0 %	25 %	25 %	310286543
560	NC_014616	GTC	2	6	24250	24255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
561	NC_014616	TCC	2	6	24362	24367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286543
562	NC_014616	GCC	2	6	24403	24408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
563	NC_014616	GCC	2	6	24430	24435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
564	NC_014616	GGT	2	6	24445	24450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286543
565	NC_014616	GC	3	6	24557	24562	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
566	NC_014616	GCC	2	6	24580	24585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
567	NC_014616	CCG	2	6	24630	24635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
568	NC_014616	GCC	2	6	24739	24744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
569	NC_014616	GTT	2	6	24754	24759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286543
570	NC_014616	GC	3	6	24791	24796	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
571	NC_014616	TGG	2	6	24804	24809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286543
572	NC_014616	GTC	2	6	24892	24897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
573	NC_014616	GAT	2	6	24951	24956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286543
574	NC_014616	CG	3	6	25094	25099	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
575	NC_014616	GCG	3	9	25097	25105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286543
576	NC_014616	TGCGCC	2	12	25163	25174	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	310286543
577	NC_014616	CAG	2	6	25201	25206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286543
578	NC_014616	GTT	2	6	25236	25241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286543
579	NC_014616	GTC	2	6	25288	25293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
580	NC_014616	CAT	2	6	25305	25310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286543
581	NC_014616	GTC	2	6	25321	25326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
582	NC_014616	CAG	2	6	25384	25389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286543
583	NC_014616	GC	3	6	25440	25445	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
584	NC_014616	TGC	2	6	25499	25504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
585	NC_014616	CCG	2	6	25508	25513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
586	NC_014616	TTG	2	6	25526	25531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286543
587	NC_014616	GTCG	2	8	25540	25547	0 %	25 %	50 %	25 %	310286543
588	NC_014616	CGGC	2	8	25598	25605	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
589	NC_014616	CTG	2	6	25612	25617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
590	NC_014616	CGT	2	6	25654	25659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
591	NC_014616	CGCGCC	2	12	25738	25749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
592	NC_014616	CGG	2	6	25776	25781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286543
593	NC_014616	GAT	2	6	25789	25794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286543
594	NC_014616	GTC	2	6	25801	25806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
595	NC_014616	GCT	2	6	25828	25833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
596	NC_014616	GCC	2	6	25837	25842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
597	NC_014616	GTT	2	6	25843	25848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286543
598	NC_014616	GCCG	2	8	25864	25871	0 %	0 %	50 %	50 %	310286543
599	NC_014616	GGT	2	6	25915	25920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286543
600	NC_014616	GGCGTC	2	12	25933	25944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310286543
601	NC_014616	GCT	2	6	25982	25987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286543
602	NC_014616	GCC	2	6	25997	26002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286543
603	NC_014616	GTGAT	2	10	26037	26046	20 %	40 %	40 %	0 %	310286543
604	NC_014616	CT	3	6	26062	26067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_014616	TG	3	6	26120	26125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014616	CCG	2	6	26396	26401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_014616	GCG	2	6	26404	26409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_014616	A	7	7	26421	26427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014616	GGA	2	6	26468	26473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014616	ACC	2	6	26514	26519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_014616	T	6	6	26604	26609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014616	TCG	2	6	26631	26636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_014616	TG	3	6	26638	26643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014616	CGG	2	6	26736	26741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_014616	CGA	2	6	26758	26763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_014616	TGT	2	6	26790	26795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014616	GAT	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286544
618	NC_014616	GAT	2	6	26976	26981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286544
619	NC_014616	GCG	2	6	26988	26993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
620	NC_014616	TGG	2	6	27028	27033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286544
621	NC_014616	CGT	2	6	27179	27184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
622	NC_014616	CGG	2	6	27185	27190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
623	NC_014616	ATC	2	6	27234	27239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286544
624	NC_014616	GC	3	6	27247	27252	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
625	NC_014616	CTA	2	6	27305	27310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286544
626	NC_014616	CG	3	6	27322	27327	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
627	NC_014616	GTACAA	2	12	27380	27391	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310286544
628	NC_014616	CGA	2	6	27428	27433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286544
629	NC_014616	CAT	2	6	27479	27484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286544
630	NC_014616	CGA	2	6	27491	27496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286544
631	NC_014616	GC	3	6	27502	27507	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
632	NC_014616	CG	3	6	27571	27576	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
633	NC_014616	CAC	2	6	27645	27650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286544
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636	NC_014616	GCT	2	6	27941	27946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
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640	NC_014616	CGA	2	6	28064	28069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286544
641	NC_014616	AAC	2	6	28077	28082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286544
642	NC_014616	CG	3	6	28094	28099	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
643	NC_014616	GC	3	6	28201	28206	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
644	NC_014616	GCG	2	6	28252	28257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
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650	NC_014616	GCC	2	6	28323	28328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
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653	NC_014616	GC	3	6	28411	28416	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
654	NC_014616	GCG	2	6	28423	28428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286544
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661	NC_014616	CGC	2	6	28723	28728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
662	NC_014616	CG	3	6	28737	28742	0 %	0 %	50 %	50 %	310286544
663	NC_014616	GCT	2	6	28760	28765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286544
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665	NC_014616	GCC	2	6	28848	28853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286544
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669	NC_014616	CGGAAT	2	12	29080	29091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310286544
670	NC_014616	CG	3	6	29173	29178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
671	NC_014616	GTT	2	6	29198	29203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
672	NC_014616	GCTG	2	8	29219	29226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
673	NC_014616	CGC	2	6	29299	29304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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675	NC_014616	TAGA	2	8	29508	29515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
676	NC_014616	C	6	6	29536	29541	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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703	NC_014616	GCG	2	6	30635	30640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286545
704	NC_014616	TCA	2	6	30673	30678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
705	NC_014616	TA	3	6	30733	30738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
706	NC_014616	CGC	2	6	30770	30775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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709	NC_014616	GGA	2	6	30987	30992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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719	NC_014616	GAAA	2	8	31554	31561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
720	NC_014616	ATGTCA	2	12	31663	31674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	310286547
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726	NC_014616	AAGAA	2	10	31893	31902	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
727	NC_014616	TCA	2	6	31938	31943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286548
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733	NC_014616	CGT	2	6	32152	32157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286548
734	NC_014616	CCA	2	6	32160	32165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
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741	NC_014616	CCA	2	6	32293	32298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
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743	NC_014616	GTG	2	6	32327	32332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286548
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749	NC_014616	CCA	2	6	32601	32606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
750	NC_014616	GCT	2	6	32608	32613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286548
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754	NC_014616	TCT	2	6	32685	32690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286548
755	NC_014616	CCA	2	6	32691	32696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286548
756	NC_014616	GTTC	2	8	32712	32719	0 %	50 %	25 %	25 %	310286548
757	NC_014616	CAT	2	6	32767	32772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286548
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762	NC_014616	ATC	2	6	32951	32956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286548
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783	NC_014616	GGT	2	6	33591	33596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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814	NC_014616	TGA	2	6	35239	35244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
815	NC_014616	TCA	2	6	35245	35250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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818	NC_014616	G	8	8	35379	35386	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
819	NC_014616	CAG	2	6	35433	35438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
820	NC_014616	GTCA	2	8	35463	35470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
821	NC_014616	CGG	2	6	35510	35515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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824	NC_014616	TGGC	2	8	35588	35595	0 %	25 %	50 %	25 %	310286551
825	NC_014616	GGCC	2	8	35598	35605	0 %	0 %	50 %	50 %	310286551
826	NC_014616	CTG	2	6	35656	35661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286551
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830	NC_014616	TCG	2	6	35810	35815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286551
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832	NC_014616	GTC	2	6	35841	35846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286551
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868	NC_014616	CGC	2	6	36929	36934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286552
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879	NC_014616	CAG	2	6	37200	37205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286552
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881	NC_014616	GC	3	6	37339	37344	0 %	0 %	50 %	50 %	310286552
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