MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 52047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014616	GCA	2	6	241134	241139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286734
5502	NC_014616	CGA	2	6	241185	241190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286734
5503	NC_014616	CCGG	2	8	241240	241247	0 %	0 %	50 %	50 %	310286734
5504	NC_014616	CGC	2	6	241272	241277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286734
5505	NC_014616	AG	3	6	241283	241288	50 %	0 %	50 %	0 %	310286734
5506	NC_014616	GGC	3	9	241332	241340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286734
5507	NC_014616	TCG	2	6	241364	241369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286734
5508	NC_014616	CGG	2	6	241425	241430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286734
5509	NC_014616	AGC	2	6	241436	241441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286734
5510	NC_014616	GC	4	8	241453	241460	0 %	0 %	50 %	50 %	310286734
5511	NC_014616	CGA	2	6	241491	241496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286734
5512	NC_014616	GACC	2	8	241521	241528	25 %	0 %	25 %	50 %	310286734
5513	NC_014616	AAG	2	6	241553	241558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286734
5514	NC_014616	CCA	2	6	241568	241573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286734
5515	NC_014616	TCG	2	6	241580	241585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286734
5516	NC_014616	ATC	2	6	241621	241626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286734
5517	NC_014616	GTC	2	6	241645	241650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286734
5518	NC_014616	TCAG	2	8	241718	241725	25 %	25 %	25 %	25 %	310286734
5519	NC_014616	GCG	2	6	241798	241803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286735
5520	NC_014616	ACT	2	6	241858	241863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286735
5521	NC_014616	TCA	3	9	241882	241890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286735
5522	NC_014616	ATC	2	6	241929	241934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286735
5523	NC_014616	GCCG	2	8	241982	241989	0 %	0 %	50 %	50 %	310286735
5524	NC_014616	TGA	2	6	242008	242013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286735
5525	NC_014616	GCT	2	6	242051	242056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5526	NC_014616	GAT	2	6	242105	242110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286735
5527	NC_014616	CAA	2	6	242168	242173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286735
5528	NC_014616	ACG	2	6	242233	242238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5529	NC_014616	GCTC	2	8	242275	242282	0 %	25 %	25 %	50 %	310286735
5530	NC_014616	GC	3	6	242308	242313	0 %	0 %	50 %	50 %	310286735
5531	NC_014616	ATG	2	6	242319	242324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286735
5532	NC_014616	ACA	2	6	242329	242334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286735
5533	NC_014616	TCA	2	6	242338	242343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286735
5534	NC_014616	TCA	3	9	242380	242388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286735
5535	NC_014616	TCA	2	6	242395	242400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286735
5536	NC_014616	CGCC	2	8	242423	242430	0 %	0 %	25 %	75 %	310286735
5537	NC_014616	GAG	2	6	242466	242471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286735
5538	NC_014616	CCG	2	6	242525	242530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286735
5539	NC_014616	TGA	2	6	242593	242598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286735
5540	NC_014616	TGA	2	6	242605	242610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286735
5541	NC_014616	TCG	2	6	242614	242619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5542	NC_014616	GCG	2	6	242655	242660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286735
5543	NC_014616	GGAC	2	8	242669	242676	25 %	0 %	50 %	25 %	310286735
5544	NC_014616	TCG	2	6	242695	242700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5545	NC_014616	ATG	2	6	242706	242711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286735
5546	NC_014616	GCC	3	9	242781	242789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286735
5547	NC_014616	GATG	2	8	242822	242829	25 %	25 %	50 %	0 %	310286735
5548	NC_014616	GCC	2	6	242865	242870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286735
5549	NC_014616	GCACG	2	10	242875	242884	20 %	0 %	40 %	40 %	310286735
5550	NC_014616	CG	3	6	242919	242924	0 %	0 %	50 %	50 %	310286735
5551	NC_014616	CCG	2	6	242932	242937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286735
5552	NC_014616	GCT	2	6	242963	242968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5553	NC_014616	CGGC	2	8	242980	242987	0 %	0 %	50 %	50 %	310286735
5554	NC_014616	GCG	2	6	243004	243009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286735
5555	NC_014616	ATC	2	6	243057	243062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286735
5556	NC_014616	CCG	2	6	243085	243090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286735
5557	NC_014616	TCG	2	6	243106	243111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5558	NC_014616	ACC	2	6	243132	243137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286735
5559	NC_014616	CTG	2	6	243147	243152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5560	NC_014616	CGG	2	6	243173	243178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286735
5561	NC_014616	CTCCAT	2	12	243179	243190	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	310286735
5562	NC_014616	CGA	2	6	243320	243325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5563	NC_014616	CT	3	6	243374	243379	0 %	50 %	0 %	50 %	310286735
5564	NC_014616	CGA	2	6	243404	243409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5565	NC_014616	GCT	2	6	243440	243445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286735
5566	NC_014616	CCT	2	6	243502	243507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286735
5567	NC_014616	GAA	2	6	243525	243530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286735
5568	NC_014616	CCA	2	6	243598	243603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286735
5569	NC_014616	CGG	2	6	243679	243684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286735
5570	NC_014616	ACA	2	6	243706	243711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286735
5571	NC_014616	TGA	2	6	243761	243766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_014616	CGTG	2	8	243804	243811	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_014616	TA	3	6	243862	243867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_014616	GTC	2	6	243918	243923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_014616	GC	3	6	243930	243935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_014616	TTG	2	6	243962	243967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_014616	CA	3	6	244070	244075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_014616	GGA	2	6	244121	244126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_014616	TGT	2	6	244167	244172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_014616	CAC	2	6	244177	244182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_014616	CTGG	2	8	244218	244225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_014616	CA	3	6	244227	244232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5583	NC_014616	GAC	2	6	244284	244289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_014616	GGCC	2	8	244292	244299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_014616	CGG	2	6	244368	244373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_014616	ATA	2	6	244388	244393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_014616	AAC	2	6	244421	244426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_014616	CT	3	6	244439	244444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_014616	TA	3	6	244509	244514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_014616	GCT	2	6	244533	244538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_014616	TGG	2	6	244604	244609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286736
5592	NC_014616	TGC	2	6	244631	244636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5593	NC_014616	ACG	2	6	244672	244677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5594	NC_014616	TCC	2	6	244702	244707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286736
5595	NC_014616	CCG	2	6	244730	244735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286736
5596	NC_014616	CGAG	2	8	244757	244764	25 %	0 %	50 %	25 %	310286736
5597	NC_014616	ACC	2	6	244864	244869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286736
5598	NC_014616	CTG	2	6	244885	244890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5599	NC_014616	CACCGA	2	12	244977	244988	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310286736
5600	NC_014616	ACC	2	6	245014	245019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286736
5601	NC_014616	GCG	2	6	245045	245050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286736
5602	NC_014616	CTC	2	6	245097	245102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286736
5603	NC_014616	TCG	2	6	245105	245110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5604	NC_014616	GTACG	2	10	245130	245139	20 %	20 %	40 %	20 %	310286736
5605	NC_014616	AAG	2	6	245185	245190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286736
5606	NC_014616	CAG	2	6	245221	245226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5607	NC_014616	AAG	2	6	245239	245244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286736
5608	NC_014616	TCA	2	6	245246	245251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286736
5609	NC_014616	AAG	2	6	245272	245277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286736
5610	NC_014616	ACG	2	6	245308	245313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5611	NC_014616	CCA	2	6	245366	245371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286736
5612	NC_014616	CCG	2	6	245390	245395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286736
5613	NC_014616	GAA	2	6	245424	245429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286736
5614	NC_014616	GAA	3	9	245433	245441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286736
5615	NC_014616	GC	3	6	245459	245464	0 %	0 %	50 %	50 %	310286736
5616	NC_014616	TGA	2	6	245549	245554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286736
5617	NC_014616	GGT	2	6	245664	245669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286736
5618	NC_014616	GCACCG	2	12	245690	245701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310286736
5619	NC_014616	CAA	2	6	245715	245720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286736
5620	NC_014616	AAG	2	6	245803	245808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286736
5621	NC_014616	AAG	2	6	245845	245850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286736
5622	NC_014616	CAT	2	6	245871	245876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286736
5623	NC_014616	GAA	2	6	245916	245921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286736
5624	NC_014616	CAA	2	6	245946	245951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286736
5625	NC_014616	GCA	2	6	245969	245974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286736
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5630	NC_014616	CGG	2	6	246315	246320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286736
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5642	NC_014616	CGG	2	6	246564	246569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286736
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5645	NC_014616	CAA	2	6	246615	246620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286736
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5647	NC_014616	ACGAC	2	10	246737	246746	40 %	0 %	20 %	40 %	310286736
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5652	NC_014616	CGCC	2	8	246867	246874	0 %	0 %	25 %	75 %	310286736
5653	NC_014616	ACT	2	6	246932	246937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286736
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5656	NC_014616	CTG	2	6	247009	247014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286736
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5660	NC_014616	GCC	3	9	247219	247227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286736
5661	NC_014616	CCG	2	6	247241	247246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286736
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5672	NC_014616	GCT	2	6	247890	247895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286736
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5694	NC_014616	GCT	2	6	248931	248936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5695	NC_014616	ACC	2	6	248947	248952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286736
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5710	NC_014616	TCG	2	6	249551	249556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286736
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5712	NC_014616	CGA	2	6	249633	249638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286736
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5726	NC_014616	CGGC	2	8	250202	250209	0 %	0 %	50 %	50 %	310286736
5727	NC_014616	GAC	2	6	250222	250227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286736
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5729	NC_014616	CGA	2	6	250254	250259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5730	NC_014616	GCC	2	6	250297	250302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286736
5731	NC_014616	ACG	2	6	250316	250321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5732	NC_014616	GCC	2	6	250357	250362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286736
5733	NC_014616	GC	3	6	250367	250372	0 %	0 %	50 %	50 %	310286736
5734	NC_014616	TGC	2	6	250391	250396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286736
5735	NC_014616	GTG	2	6	250414	250419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286736
5736	NC_014616	CGC	2	6	250426	250431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286736
5737	NC_014616	CTGA	2	8	250482	250489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5738	NC_014616	CGG	2	6	250523	250528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5739	NC_014616	TTG	2	6	250540	250545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5740	NC_014616	CG	4	8	250561	250568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5741	NC_014616	CGA	2	6	250654	250659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286737
5742	NC_014616	GCC	2	6	250670	250675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286737
5743	NC_014616	CGA	2	6	250729	250734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286737
5744	NC_014616	GATC	2	8	250735	250742	25 %	25 %	25 %	25 %	310286737
5745	NC_014616	CCG	2	6	250743	250748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286737
5746	NC_014616	CCG	2	6	250886	250891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286737
5747	NC_014616	GCA	2	6	250968	250973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286737
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5752	NC_014616	GC	3	6	251238	251243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5862	NC_014616	TG	3	6	255333	255338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5863	NC_014616	CAAT	2	8	255393	255400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5987	NC_014616	ACC	2	6	260097	260102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286745
5988	NC_014616	CCG	2	6	260194	260199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286745
5989	NC_014616	GGC	2	6	260222	260227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286745
5990	NC_014616	GCC	2	6	260240	260245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286745
5991	NC_014616	GGCG	2	8	260254	260261	0 %	0 %	75 %	25 %	310286745
5992	NC_014616	CGA	2	6	260398	260403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286745
5993	NC_014616	CGAACC	2	12	260425	260436	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310286745
5994	NC_014616	TGA	2	6	260461	260466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286745
5995	NC_014616	GCG	3	9	260481	260489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286745
5996	NC_014616	AGC	2	6	260490	260495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286745
5997	NC_014616	GATA	2	8	260497	260504	50 %	25 %	25 %	0 %	310286745
5998	NC_014616	GCCGAT	2	12	260534	260545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310286745
5999	NC_014616	CGAT	2	8	260638	260645	25 %	25 %	25 %	25 %	310286745
6000	NC_014616	GCG	2	6	260646	260651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286745

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