MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. CCGE1003 chromosome 1

Total Repeats: 3485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014539	ACGTG	2	10	423	432	20 %	20 %	40 %	20 %	307728077
2	NC_014539	ACCAC	2	10	1869	1878	40 %	0 %	0 %	60 %	307728077
3	NC_014539	AGCGC	2	10	3713	3722	20 %	0 %	40 %	40 %	307728079
4	NC_014539	GTGCT	2	10	4282	4291	0 %	40 %	40 %	20 %	307728079
5	NC_014539	GACGC	2	10	4659	4668	20 %	0 %	40 %	40 %	307728079
6	NC_014539	GAAGC	2	10	5377	5386	40 %	0 %	40 %	20 %	307728079
7	NC_014539	GAACG	2	10	5665	5674	40 %	0 %	40 %	20 %	307728079
8	NC_014539	CATCC	2	10	6334	6343	20 %	20 %	0 %	60 %	307728080
9	NC_014539	AGTGA	2	10	7669	7678	40 %	20 %	40 %	0 %	307728080
10	NC_014539	CGCTG	2	10	9131	9140	0 %	20 %	40 %	40 %	307728082
11	NC_014539	TAAGA	2	10	10051	10060	60 %	20 %	20 %	0 %	307728083
12	NC_014539	GCGCA	2	10	12122	12131	20 %	0 %	40 %	40 %	307728086
13	NC_014539	ACCGT	2	10	17424	17433	20 %	20 %	20 %	40 %	307728091
14	NC_014539	TCAGT	2	10	20392	20401	20 %	40 %	20 %	20 %	307728094
15	NC_014539	GCGCA	2	10	23996	24005	20 %	0 %	40 %	40 %	307728096
16	NC_014539	CGTCA	2	10	26197	26206	20 %	20 %	20 %	40 %	307728098
17	NC_014539	CCGCG	2	10	27244	27253	0 %	0 %	40 %	60 %	307728098
18	NC_014539	CCGGT	2	10	28479	28488	0 %	20 %	40 %	40 %	307728099
19	NC_014539	GAAGC	2	10	28526	28535	40 %	0 %	40 %	20 %	307728099
20	NC_014539	ACTGG	2	10	28858	28867	20 %	20 %	40 %	20 %	307728099
21	NC_014539	CAGGA	2	10	28964	28973	40 %	0 %	40 %	20 %	307728099
22	NC_014539	GCTGG	2	10	29095	29104	0 %	20 %	60 %	20 %	307728099
23	NC_014539	GTCGC	2	10	30058	30067	0 %	20 %	40 %	40 %	307728100
24	NC_014539	TGTCG	2	10	30173	30182	0 %	40 %	40 %	20 %	307728100
25	NC_014539	GCGTG	2	10	30341	30350	0 %	20 %	60 %	20 %	307728100
26	NC_014539	GCGGA	2	10	31681	31690	20 %	0 %	60 %	20 %	307728102
27	NC_014539	GGCTG	2	10	31897	31906	0 %	20 %	60 %	20 %	307728102
28	NC_014539	CCGGG	2	10	32305	32314	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014539	GCTTG	2	10	32716	32725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014539	GGCTG	2	10	33833	33842	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014539	GCAGT	2	10	33865	33874	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014539	CGCGT	2	10	34533	34542	0 %	20 %	40 %	40 %	307728105
33	NC_014539	GATTG	2	10	34731	34740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014539	TTTGG	2	10	36155	36164	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014539	CGAGG	2	10	38433	38442	20 %	0 %	60 %	20 %	307728109
36	NC_014539	GCAGA	2	10	40123	40132	40 %	0 %	40 %	20 %	307728110
37	NC_014539	TCCGG	2	10	40464	40473	0 %	20 %	40 %	40 %	307728110
38	NC_014539	CGTGT	2	10	41239	41248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014539	GTCGA	2	10	41302	41311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014539	GCAAG	2	10	43415	43424	40 %	0 %	40 %	20 %	307728111
41	NC_014539	CGAAG	2	10	43469	43478	40 %	0 %	40 %	20 %	307728111
42	NC_014539	GTTCT	2	10	45719	45728	0 %	60 %	20 %	20 %	307728113
43	NC_014539	GGCGT	2	10	47742	47751	0 %	20 %	60 %	20 %	307728115
44	NC_014539	CGGCG	2	10	47837	47846	0 %	0 %	60 %	40 %	307728115
45	NC_014539	GCCGC	2	10	48274	48283	0 %	0 %	40 %	60 %	307728116
46	NC_014539	GATGC	2	10	48369	48378	20 %	20 %	40 %	20 %	307728116
47	NC_014539	GCCAC	2	10	48696	48705	20 %	0 %	20 %	60 %	307728116
48	NC_014539	TTCGA	2	10	49839	49848	20 %	40 %	20 %	20 %	307728117
49	NC_014539	GCGTC	2	10	50127	50136	0 %	20 %	40 %	40 %	307728118
50	NC_014539	CTCGA	2	10	54075	54084	20 %	20 %	20 %	40 %	307728122
51	NC_014539	CGCGC	2	10	54185	54194	0 %	0 %	40 %	60 %	307728122
52	NC_014539	CGAGG	2	10	54467	54476	20 %	0 %	60 %	20 %	307728122
53	NC_014539	TGAGC	2	10	58659	58668	20 %	20 %	40 %	20 %	307728124
54	NC_014539	TGCGC	2	10	59755	59764	0 %	20 %	40 %	40 %	307728126
55	NC_014539	GCGCG	2	10	60064	60073	0 %	0 %	60 %	40 %	307728126
56	NC_014539	GCGCA	2	10	60320	60329	20 %	0 %	40 %	40 %	307728126
57	NC_014539	CTGCC	2	10	60875	60884	0 %	20 %	20 %	60 %	307728127
58	NC_014539	CGGCG	2	10	62023	62032	0 %	0 %	60 %	40 %	307728128
59	NC_014539	AGGCA	2	10	64858	64867	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014539	GCGTT	2	10	66554	66563	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014539	TGATG	2	10	67417	67426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014539	ACGGC	2	10	71811	71820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014539	CCCGT	2	10	71888	71897	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_014539	CGTGC	2	10	72601	72610	0 %	20 %	40 %	40 %	307728137
65	NC_014539	TGCGC	2	10	72766	72775	0 %	20 %	40 %	40 %	307728137
66	NC_014539	GGCAA	2	10	73185	73194	40 %	0 %	40 %	20 %	307728137
67	NC_014539	CATGC	2	10	76008	76017	20 %	20 %	20 %	40 %	307728139
68	NC_014539	GTGCC	2	10	78469	78478	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014539	GGCCG	2	10	78987	78996	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014539	CGGTT	2	10	79268	79277	0 %	40 %	40 %	20 %	307728141
71	NC_014539	CGCTG	2	10	79369	79378	0 %	20 %	40 %	40 %	307728141
72	NC_014539	GCGCC	2	10	79822	79831	0 %	0 %	40 %	60 %	307728141
73	NC_014539	GCGCC	2	10	80394	80403	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014539	AGCTG	2	10	80526	80535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014539	TGGCG	2	10	81476	81485	0 %	20 %	60 %	20 %	307728143
76	NC_014539	GCCCG	2	10	82492	82501	0 %	0 %	40 %	60 %	307728144
77	NC_014539	CGGCA	2	10	82518	82527	20 %	0 %	40 %	40 %	307728144
78	NC_014539	GCGCC	2	10	83904	83913	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014539	GCTGC	2	10	84159	84168	0 %	20 %	40 %	40 %	307728146
80	NC_014539	CGTGC	2	10	85064	85073	0 %	20 %	40 %	40 %	307728146
81	NC_014539	TACGT	2	10	85212	85221	20 %	40 %	20 %	20 %	307728146
82	NC_014539	GCTCG	2	10	87350	87359	0 %	20 %	40 %	40 %	307728148
83	NC_014539	GCGCG	2	10	87524	87533	0 %	0 %	60 %	40 %	307728148
84	NC_014539	GCGCG	2	10	87770	87779	0 %	0 %	60 %	40 %	307728148
85	NC_014539	CAAGG	2	10	88101	88110	40 %	0 %	40 %	20 %	307728148
86	NC_014539	TCGCG	2	10	89660	89669	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014539	AGGCG	2	10	91787	91796	20 %	0 %	60 %	20 %	307728153
88	NC_014539	TCGCG	2	10	92757	92766	0 %	20 %	40 %	40 %	307728155
89	NC_014539	CAATT	2	10	92878	92887	40 %	40 %	0 %	20 %	307728155
90	NC_014539	GGCGC	2	10	94738	94747	0 %	0 %	60 %	40 %	307728157
91	NC_014539	GACGC	2	10	94896	94905	20 %	0 %	40 %	40 %	307728157
92	NC_014539	TGCCG	2	10	95396	95405	0 %	20 %	40 %	40 %	307728157
93	NC_014539	GCCGT	2	10	95451	95460	0 %	20 %	40 %	40 %	307728157
94	NC_014539	CGTGC	2	10	96068	96077	0 %	20 %	40 %	40 %	307728157
95	NC_014539	GCCTG	2	10	97853	97862	0 %	20 %	40 %	40 %	307728159
96	NC_014539	GCGCG	2	10	98661	98670	0 %	0 %	60 %	40 %	307728159
97	NC_014539	GCACG	2	10	99677	99686	20 %	0 %	40 %	40 %	307728160
98	NC_014539	GGGCC	2	10	100048	100057	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014539	GCCAG	2	10	100165	100174	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014539	CGTGC	2	10	102214	102223	0 %	20 %	40 %	40 %	307728162
101	NC_014539	CGCGC	2	10	102588	102597	0 %	0 %	40 %	60 %	307728163
102	NC_014539	ATCAG	2	10	102647	102656	40 %	20 %	20 %	20 %	307728163
103	NC_014539	GCTGA	2	10	103839	103848	20 %	20 %	40 %	20 %	307728163
104	NC_014539	CTGGC	2	10	103851	103860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014539	TTCTG	2	10	110466	110475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014539	AGGCG	2	10	114440	114449	20 %	0 %	60 %	20 %	307728174
107	NC_014539	GCGAG	2	10	115202	115211	20 %	0 %	60 %	20 %	307728174
108	NC_014539	GCGAG	2	10	117112	117121	20 %	0 %	60 %	20 %	307728176
109	NC_014539	TCACA	2	10	117466	117475	40 %	20 %	0 %	40 %	307728177
110	NC_014539	GCCGC	2	10	119612	119621	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_014539	CCGGG	2	10	121635	121644	0 %	0 %	60 %	40 %	307728180
112	NC_014539	CGCCC	2	10	122612	122621	0 %	0 %	20 %	80 %	307728181
113	NC_014539	CCGCG	2	10	124202	124211	0 %	0 %	40 %	60 %	307728182
114	NC_014539	GCCGA	2	10	126889	126898	20 %	0 %	40 %	40 %	307728185
115	NC_014539	TCGCG	2	10	129134	129143	0 %	20 %	40 %	40 %	307728187
116	NC_014539	ATGCC	2	10	130635	130644	20 %	20 %	20 %	40 %	307728189
117	NC_014539	GCGAC	2	10	133030	133039	20 %	0 %	40 %	40 %	307728192
118	NC_014539	CCGCG	2	10	133242	133251	0 %	0 %	40 %	60 %	307728192
119	NC_014539	GGTTG	2	10	136049	136058	0 %	40 %	60 %	0 %	307728195
120	NC_014539	GCCGC	2	10	136784	136793	0 %	0 %	40 %	60 %	307728196
121	NC_014539	AGTCC	2	10	137241	137250	20 %	20 %	20 %	40 %	307728196
122	NC_014539	TGGCA	2	10	138407	138416	20 %	20 %	40 %	20 %	307728198
123	NC_014539	CGCGC	2	10	138697	138706	0 %	0 %	40 %	60 %	307728198
124	NC_014539	AGTAC	2	10	138898	138907	40 %	20 %	20 %	20 %	307728198
125	NC_014539	CGTGC	2	10	139055	139064	0 %	20 %	40 %	40 %	307728198
126	NC_014539	CGCGC	2	10	139541	139550	0 %	0 %	40 %	60 %	307728198
127	NC_014539	CGGCG	2	10	139711	139720	0 %	0 %	60 %	40 %	307728199
128	NC_014539	CGCGC	2	10	140199	140208	0 %	0 %	40 %	60 %	307728199
129	NC_014539	CCAGG	2	10	142013	142022	20 %	0 %	40 %	40 %	307728201
130	NC_014539	GCCGC	2	10	142518	142527	0 %	0 %	40 %	60 %	307728201
131	NC_014539	TGGGG	2	10	144613	144622	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014539	GAAAC	2	10	150809	150818	60 %	0 %	20 %	20 %	307728206
133	NC_014539	GCCGG	2	10	150826	150835	0 %	0 %	60 %	40 %	307728206
134	NC_014539	GCGTG	2	10	152083	152092	0 %	20 %	60 %	20 %	307728208
135	NC_014539	TGCCG	2	10	155015	155024	0 %	20 %	40 %	40 %	307728210
136	NC_014539	GCGCC	2	10	155169	155178	0 %	0 %	40 %	60 %	307728210
137	NC_014539	CGTCA	2	10	155815	155824	20 %	20 %	20 %	40 %	307728211
138	NC_014539	CGGCC	2	10	156250	156259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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264	NC_014539	CTTGC	2	10	288026	288035	0 %	40 %	20 %	40 %	307728328
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267	NC_014539	CGCGG	2	10	290656	290665	0 %	0 %	60 %	40 %	307728330
268	NC_014539	CGCAA	2	10	291875	291884	40 %	0 %	20 %	40 %	307728331
269	NC_014539	GCCGC	2	10	292422	292431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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