MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 chromosome 2

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014388	AGTGA	2	10	4113	4122	40 %	20 %	40 %	0 %	302669128
2	NC_014388	ATGAC	2	10	4327	4336	40 %	20 %	20 %	20 %	302669128
3	NC_014388	AAAAC	2	10	4975	4984	80 %	0 %	0 %	20 %	302669129
4	NC_014388	TTCTT	2	10	9060	9069	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014388	GTATT	2	10	11578	11587	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014388	TAAGG	2	10	12208	12217	40 %	20 %	40 %	0 %	302669135
7	NC_014388	AAGAG	2	10	14723	14732	60 %	0 %	40 %	0 %	302669137
8	NC_014388	GCTTT	2	10	16169	16178	0 %	60 %	20 %	20 %	302669137
9	NC_014388	CGGAG	2	10	17203	17212	20 %	0 %	60 %	20 %	302669139
10	NC_014388	TGTTC	2	10	21460	21469	0 %	60 %	20 %	20 %	302669140
11	NC_014388	TTCAG	2	10	25342	25351	20 %	40 %	20 %	20 %	302669144
12	NC_014388	ATAAA	2	10	26783	26792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014388	CACTT	2	10	27908	27917	20 %	40 %	0 %	40 %	302669145
14	NC_014388	AGAGA	2	10	31739	31748	60 %	0 %	40 %	0 %	302669148
15	NC_014388	CTTAT	2	10	32801	32810	20 %	60 %	0 %	20 %	302669149
16	NC_014388	ATATC	2	10	33478	33487	40 %	40 %	0 %	20 %	302669150
17	NC_014388	CTGAA	2	10	34177	34186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014388	TTTAT	2	10	34457	34466	20 %	80 %	0 %	0 %	302669151
19	NC_014388	GAAGA	2	10	35129	35138	60 %	0 %	40 %	0 %	302669151
20	NC_014388	TTCTT	2	10	36198	36207	0 %	80 %	0 %	20 %	302669153
21	NC_014388	CTGGA	2	10	37704	37713	20 %	20 %	40 %	20 %	302669154
22	NC_014388	ATAGT	2	10	40089	40098	40 %	40 %	20 %	0 %	302669156
23	NC_014388	TTTGG	2	10	41413	41422	0 %	60 %	40 %	0 %	302669157
24	NC_014388	GAGCA	2	10	43410	43419	40 %	0 %	40 %	20 %	302669159
25	NC_014388	CAGGA	2	10	47955	47964	40 %	0 %	40 %	20 %	302669162
26	NC_014388	CTTAT	2	10	50445	50454	20 %	60 %	0 %	20 %	302669164
27	NC_014388	TTATT	2	10	51826	51835	20 %	80 %	0 %	0 %	302669165
28	NC_014388	ATATG	2	10	53390	53399	40 %	40 %	20 %	0 %	302669167
29	NC_014388	TATGC	2	10	54425	54434	20 %	40 %	20 %	20 %	302669167
30	NC_014388	ATTTA	2	10	55783	55792	40 %	60 %	0 %	0 %	302669169
31	NC_014388	TATAT	2	10	60040	60049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014388	GCTGC	2	10	60472	60481	0 %	20 %	40 %	40 %	302669174
33	NC_014388	AGTAC	2	10	61194	61203	40 %	20 %	20 %	20 %	302669174
34	NC_014388	CAGAA	2	10	62046	62055	60 %	0 %	20 %	20 %	302669174
35	NC_014388	TCTGA	2	10	63161	63170	20 %	40 %	20 %	20 %	302669175
36	NC_014388	GCAGA	2	10	63408	63417	40 %	0 %	40 %	20 %	302669175
37	NC_014388	TCGTG	2	10	65024	65033	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014388	GGGAG	2	10	66459	66468	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014388	CCGTA	2	10	67527	67536	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014388	AGAGG	2	10	67753	67762	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014388	CAGGG	2	10	69519	69528	20 %	0 %	60 %	20 %	302669176
42	NC_014388	TCGTG	2	10	74431	74440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014388	GGGAG	2	10	75866	75875	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014388	CCGTA	2	10	76934	76943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014388	AGAGG	2	10	77160	77169	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014388	ATTAT	2	10	78988	78997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014388	GAAGA	2	10	79071	79080	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014388	TGCAG	2	10	83245	83254	20 %	20 %	40 %	20 %	302669183
49	NC_014388	ATTTT	2	10	87531	87540	20 %	80 %	0 %	0 %	302669185
50	NC_014388	TATGG	2	10	89271	89280	20 %	40 %	40 %	0 %	302669186
51	NC_014388	TGCTA	2	10	89581	89590	20 %	40 %	20 %	20 %	302669186
52	NC_014388	TCGGA	2	10	94979	94988	20 %	20 %	40 %	20 %	302669190
53	NC_014388	CAGAA	2	10	96688	96697	60 %	0 %	20 %	20 %	302669192
54	NC_014388	TTTTC	2	10	96837	96846	0 %	80 %	0 %	20 %	302669192
55	NC_014388	TTGTA	2	10	97918	97927	20 %	60 %	20 %	0 %	302669193
56	NC_014388	AGCTT	2	10	98749	98758	20 %	40 %	20 %	20 %	302669194
57	NC_014388	TAATA	2	10	99431	99440	60 %	40 %	0 %	0 %	302669194
58	NC_014388	AAAGT	2	10	99769	99778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014388	CTTTT	2	10	100583	100592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014388	ATGAA	2	10	102478	102487	60 %	20 %	20 %	0 %	302669199
61	NC_014388	ATGGA	2	10	102756	102765	40 %	20 %	40 %	0 %	302669199
62	NC_014388	ATTTT	2	10	103183	103192	20 %	80 %	0 %	0 %	302669200
63	NC_014388	TTTTA	2	10	105302	105311	20 %	80 %	0 %	0 %	302669203
64	NC_014388	GATAT	2	10	105722	105731	40 %	40 %	20 %	0 %	302669204
65	NC_014388	AAAAG	2	10	105809	105818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014388	AGAGA	2	10	108445	108454	60 %	0 %	40 %	0 %	302669209
67	NC_014388	AAGGA	2	10	109740	109749	60 %	0 %	40 %	0 %	302669211
68	NC_014388	GGCAA	2	10	109917	109926	40 %	0 %	40 %	20 %	302669211
69	NC_014388	GGTAT	2	10	114617	114626	20 %	40 %	40 %	0 %	302669214
70	NC_014388	GAAAA	2	10	115778	115787	80 %	0 %	20 %	0 %	302669215
71	NC_014388	GTTAT	2	10	116109	116118	20 %	60 %	20 %	0 %	302669215
72	NC_014388	GAAAT	2	10	118433	118442	60 %	20 %	20 %	0 %	302669218
73	NC_014388	AGAAA	2	10	118648	118657	80 %	0 %	20 %	0 %	302669218
74	NC_014388	GAAAA	2	10	120367	120376	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014388	AGAAA	2	10	122215	122224	80 %	0 %	20 %	0 %	302669220
76	NC_014388	ATTCC	2	10	124611	124620	20 %	40 %	0 %	40 %	302669221
77	NC_014388	AAAAC	2	10	125184	125193	80 %	0 %	0 %	20 %	302669222
78	NC_014388	TGAGT	2	10	125221	125230	20 %	40 %	40 %	0 %	302669222
79	NC_014388	AATGT	2	10	125931	125940	40 %	40 %	20 %	0 %	302669223
80	NC_014388	AAATC	2	10	126994	127003	60 %	20 %	0 %	20 %	302669224
81	NC_014388	CAAAA	2	10	129114	129123	80 %	0 %	0 %	20 %	302669225
82	NC_014388	AATGA	2	10	129305	129314	60 %	20 %	20 %	0 %	302669225
83	NC_014388	TAGTA	2	10	131372	131381	40 %	40 %	20 %	0 %	302669228
84	NC_014388	AATTT	2	10	132114	132123	40 %	60 %	0 %	0 %	302669229
85	NC_014388	AACTG	2	10	133495	133504	40 %	20 %	20 %	20 %	302669230
86	NC_014388	GAAAA	2	10	134687	134696	80 %	0 %	20 %	0 %	302669231
87	NC_014388	GGTCT	2	10	137030	137039	0 %	40 %	40 %	20 %	302669232
88	NC_014388	TGACA	2	10	137552	137561	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014388	ATGCC	2	10	137812	137821	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014388	AGAAA	2	10	138688	138697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014388	ATTTT	2	10	138917	138926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014388	GACAT	2	10	139195	139204	40 %	20 %	20 %	20 %	302669234
93	NC_014388	AAAAT	2	10	143005	143014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014388	TCAAT	2	10	144884	144893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014388	GATAT	2	10	147438	147447	40 %	40 %	20 %	0 %	302669243
96	NC_014388	TGGTG	2	10	147604	147613	0 %	40 %	60 %	0 %	302669243
97	NC_014388	CTTTT	2	10	147976	147985	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014388	CAAAG	2	10	152760	152769	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014388	AATGA	2	10	154452	154461	60 %	20 %	20 %	0 %	302669251
100	NC_014388	GAAGA	2	10	155056	155065	60 %	0 %	40 %	0 %	302669251
101	NC_014388	CTTAT	2	10	155251	155260	20 %	60 %	0 %	20 %	302669251
102	NC_014388	AGATA	2	10	159073	159082	60 %	20 %	20 %	0 %	302669256
103	NC_014388	TGTTC	2	10	159149	159158	0 %	60 %	20 %	20 %	302669256
104	NC_014388	CATCC	2	10	159908	159917	20 %	20 %	0 %	60 %	302669257
105	NC_014388	AGAAA	2	10	160744	160753	80 %	0 %	20 %	0 %	302669258
106	NC_014388	CTTTT	2	10	162130	162139	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014388	AAATC	2	10	162765	162774	60 %	20 %	0 %	20 %	302669259
108	NC_014388	GCTCT	2	10	163790	163799	0 %	40 %	20 %	40 %	302669259
109	NC_014388	AACAA	2	10	165771	165780	80 %	0 %	0 %	20 %	302669260
110	NC_014388	TTTTC	2	10	171688	171697	0 %	80 %	0 %	20 %	302669268
111	NC_014388	AGATC	2	10	172652	172661	40 %	20 %	20 %	20 %	302669269
112	NC_014388	TCCAT	2	10	173318	173327	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014388	TTTAT	2	10	173517	173526	20 %	80 %	0 %	0 %	302669270
114	NC_014388	TGTTC	2	10	178649	178658	0 %	60 %	20 %	20 %	302669273
115	NC_014388	TATTC	2	10	180023	180032	20 %	60 %	0 %	20 %	302669274
116	NC_014388	ATTTT	2	10	180360	180369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014388	CTTCC	2	10	182148	182157	0 %	40 %	0 %	60 %	302669276
118	NC_014388	CTGCT	2	10	187005	187014	0 %	40 %	20 %	40 %	302669278
119	NC_014388	CTTTT	2	10	189771	189780	0 %	80 %	0 %	20 %	302669279
120	NC_014388	CGCAG	2	10	193569	193578	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014388	AAAAC	2	10	193593	193602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014388	CATAT	2	10	194846	194855	40 %	40 %	0 %	20 %	302669282
123	NC_014388	GTTTT	2	10	195418	195427	0 %	80 %	20 %	0 %	302669282
124	NC_014388	TGAAC	2	10	197345	197354	40 %	20 %	20 %	20 %	302669284
125	NC_014388	CCTTC	2	10	198304	198313	0 %	40 %	0 %	60 %	302669285
126	NC_014388	TATTG	2	10	198594	198603	20 %	60 %	20 %	0 %	302669286
127	NC_014388	TATAA	2	10	198964	198973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014388	TCTTT	2	10	199388	199397	0 %	80 %	0 %	20 %	302669287
129	NC_014388	TTCTC	2	10	199703	199712	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014388	CATTT	2	10	200446	200455	20 %	60 %	0 %	20 %	302669289
131	NC_014388	CATAA	2	10	202506	202515	60 %	20 %	0 %	20 %	302669290
132	NC_014388	GTTCA	2	10	205000	205009	20 %	40 %	20 %	20 %	302669293
133	NC_014388	TTTCT	2	10	206233	206242	0 %	80 %	0 %	20 %	302669295
134	NC_014388	GTTCT	2	10	206743	206752	0 %	60 %	20 %	20 %	302669296
135	NC_014388	TTTCT	2	10	208908	208917	0 %	80 %	0 %	20 %	302669300
136	NC_014388	TGAAT	2	10	212804	212813	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014388	ATAGA	2	10	212875	212884	60 %	20 %	20 %	0 %	302669307
138	NC_014388	CATTC	2	10	213063	213072	20 %	40 %	0 %	40 %	302669307
139	NC_014388	ATTCC	2	10	213952	213961	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014388	CTTTG	2	10	214875	214884	0 %	60 %	20 %	20 %	302669308
141	NC_014388	GTAAT	2	10	215284	215293	40 %	40 %	20 %	0 %	302669308
142	NC_014388	TTTAT	2	10	216029	216038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_014388	AAAAT	2	10	218389	218398	80 %	20 %	0 %	0 %	302669313
147	NC_014388	AATCA	2	10	219246	219255	60 %	20 %	0 %	20 %	302669314
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160	NC_014388	AGGGG	2	10	242796	242805	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_014388	ACTAT	2	10	245215	245224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_014388	GATGA	2	10	247550	247559	40 %	20 %	40 %	0 %	302669334
164	NC_014388	CAGAT	2	10	247587	247596	40 %	20 %	20 %	20 %	302669334
165	NC_014388	GAAAA	2	10	256743	256752	80 %	0 %	20 %	0 %	302669340
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169	NC_014388	AAAGA	2	10	262755	262764	80 %	0 %	20 %	0 %	302669348
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171	NC_014388	TCTTG	2	10	268841	268850	0 %	60 %	20 %	20 %	302669354
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178	NC_014388	CGATA	2	10	274463	274472	40 %	20 %	20 %	20 %	302669359
179	NC_014388	TGTCC	2	10	275685	275694	0 %	40 %	20 %	40 %	302669360
180	NC_014388	CCGTT	2	10	276497	276506	0 %	40 %	20 %	40 %	302669361
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182	NC_014388	GTCCT	2	10	280468	280477	0 %	40 %	20 %	40 %	302669364
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187	NC_014388	CTTAT	2	10	291702	291711	20 %	60 %	0 %	20 %	302669369
188	NC_014388	ACGGT	2	10	293396	293405	20 %	20 %	40 %	20 %	302669371
189	NC_014388	GAGCT	2	10	298232	298241	20 %	20 %	40 %	20 %	302669373
190	NC_014388	TCCAA	2	10	298256	298265	40 %	20 %	0 %	40 %	302669373
191	NC_014388	ATATT	2	10	300080	300089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014388	AATAT	2	10	302227	302236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.