MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus biovar anthracis str. CI plasmid pCI-XO2

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014332	ACTCA	2	10	498	507	40 %	20 %	0 %	40 %	301067931
2	NC_014332	TTTCT	2	10	2891	2900	0 %	80 %	0 %	20 %	301067935
3	NC_014332	CTTTT	2	10	3440	3449	0 %	80 %	0 %	20 %	301067935
4	NC_014332	TCATT	2	10	3497	3506	20 %	60 %	0 %	20 %	301067935
5	NC_014332	ACTTT	2	10	4307	4316	20 %	60 %	0 %	20 %	301067937
6	NC_014332	GAATC	2	10	6523	6532	40 %	20 %	20 %	20 %	301067939
7	NC_014332	ATCTT	2	10	9112	9121	20 %	60 %	0 %	20 %	301067944
8	NC_014332	GCTTC	2	10	9338	9347	0 %	40 %	20 %	40 %	301067944
9	NC_014332	CGCTT	2	10	9580	9589	0 %	40 %	20 %	40 %	301067944
10	NC_014332	TTCAC	2	10	9701	9710	20 %	40 %	0 %	40 %	301067944
11	NC_014332	TTTGT	2	10	10138	10147	0 %	80 %	20 %	0 %	301067944
12	NC_014332	TTTTC	2	10	10427	10436	0 %	80 %	0 %	20 %	301067944
13	NC_014332	TTCAT	2	10	12145	12154	20 %	60 %	0 %	20 %	301067945
14	NC_014332	TTTCT	2	10	12274	12283	0 %	80 %	0 %	20 %	301067945
15	NC_014332	TTCTT	2	10	14646	14655	0 %	80 %	0 %	20 %	301067946
16	NC_014332	ATTCA	2	10	16170	16179	40 %	40 %	0 %	20 %	301067947
17	NC_014332	TCCAA	2	10	16954	16963	40 %	20 %	0 %	40 %	301067948
18	NC_014332	TTTCA	2	10	18894	18903	20 %	60 %	0 %	20 %	301067952
19	NC_014332	AGAAA	2	10	19318	19327	80 %	0 %	20 %	0 %	301067952
20	NC_014332	TCTTG	2	10	20691	20700	0 %	60 %	20 %	20 %	301067953
21	NC_014332	CAAAT	2	10	23673	23682	60 %	20 %	0 %	20 %	301067957
22	NC_014332	CAAAA	2	10	26250	26259	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014332	AAAAT	2	10	26969	26978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014332	AATTT	2	10	27288	27297	40 %	60 %	0 %	0 %	301067960
25	NC_014332	GATGT	2	10	27413	27422	20 %	40 %	40 %	0 %	301067960
26	NC_014332	CATTT	2	10	27793	27802	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014332	CATTA	2	10	27808	27817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014332	TGCTT	2	10	29104	29113	0 %	60 %	20 %	20 %	301067963
29	NC_014332	CTTCT	2	10	29228	29237	0 %	60 %	0 %	40 %	301067963
30	NC_014332	TTTTC	2	10	30758	30767	0 %	80 %	0 %	20 %	301067965
31	NC_014332	TAACT	2	10	31447	31456	40 %	40 %	0 %	20 %	301067965
32	NC_014332	CAACA	2	10	32320	32329	60 %	0 %	0 %	40 %	301067967
33	NC_014332	AACCA	2	10	33067	33076	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014332	ACTTT	2	10	34539	34548	20 %	60 %	0 %	20 %	301067968
35	NC_014332	CTTAT	2	10	35640	35649	20 %	60 %	0 %	20 %	301067969
36	NC_014332	GGGAT	2	10	36443	36452	20 %	20 %	60 %	0 %	301067970
37	NC_014332	AAACA	2	10	36624	36633	80 %	0 %	0 %	20 %	301067970
38	NC_014332	GAAAA	2	10	37524	37533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014332	AAATC	2	10	39246	39255	60 %	20 %	0 %	20 %	301067972
40	NC_014332	TTTCC	2	10	39922	39931	0 %	60 %	0 %	40 %	301067973
41	NC_014332	TTTTG	2	10	42021	42030	0 %	80 %	20 %	0 %	301067978
42	NC_014332	ATAAG	2	10	42366	42375	60 %	20 %	20 %	0 %	301067979
43	NC_014332	CGGTT	2	10	43047	43056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014332	AATAA	2	10	43113	43122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014332	GCAAA	2	10	43853	43862	60 %	0 %	20 %	20 %	301067980
46	NC_014332	GATAA	2	10	44513	44522	60 %	20 %	20 %	0 %	301067981
47	NC_014332	TTCTT	2	10	44971	44980	0 %	80 %	0 %	20 %	301067981
48	NC_014332	CTTCT	2	10	45823	45832	0 %	60 %	0 %	40 %	301067982
49	NC_014332	GAAAA	2	10	46726	46735	80 %	0 %	20 %	0 %	301067983
50	NC_014332	TTAAA	2	10	48510	48519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014332	TGAAT	2	10	48594	48603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014332	ATCTT	2	10	50087	50096	20 %	60 %	0 %	20 %	301067987
53	NC_014332	ATTTC	2	10	50621	50630	20 %	60 %	0 %	20 %	301067987
54	NC_014332	TTTTA	2	10	51103	51112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014332	TAAAA	2	10	52247	52256	80 %	20 %	0 %	0 %	301067988
56	NC_014332	TTTTA	2	10	54264	54273	20 %	80 %	0 %	0 %	301067990
57	NC_014332	ATTTT	2	10	56881	56890	20 %	80 %	0 %	0 %	301067993
58	NC_014332	CCTTT	2	10	57929	57938	0 %	60 %	0 %	40 %	301067994
59	NC_014332	CTAAT	2	10	58274	58283	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014332	TAAAT	2	10	58710	58719	60 %	40 %	0 %	0 %	301067995
61	NC_014332	ATTAA	3	15	58865	58879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014332	GTTTT	2	10	59421	59430	0 %	80 %	20 %	0 %	301067998
63	NC_014332	TTTCA	2	10	60029	60038	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014332	AAATT	2	10	61599	61608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014332	TAAAA	2	10	64887	64896	80 %	20 %	0 %	0 %	301068004
66	NC_014332	TATTT	2	10	65832	65841	20 %	80 %	0 %	0 %	301068006
67	NC_014332	AATAA	2	10	66297	66306	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014332	GAATT	2	10	68776	68785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014332	AAATA	2	10	68819	68828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014332	TAAAG	2	10	69539	69548	60 %	20 %	20 %	0 %	301068011
71	NC_014332	GAAAT	2	10	69999	70008	60 %	20 %	20 %	0 %	301068011
72	NC_014332	TAATA	2	10	71155	71164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014332	AAATC	2	10	72852	72861	60 %	20 %	0 %	20 %	301068015
74	NC_014332	CTTCA	2	10	73494	73503	20 %	40 %	0 %	40 %	301068016
75	NC_014332	TTTCT	2	10	75127	75136	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014332	AACAA	2	10	78343	78352	80 %	0 %	0 %	20 %	301068021
77	NC_014332	TAATA	2	10	78563	78572	60 %	40 %	0 %	0 %	301068021
78	NC_014332	TTAAT	2	10	78991	79000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014332	ACAAT	2	10	80004	80013	60 %	20 %	0 %	20 %	301068023
80	NC_014332	CAAAA	2	10	83267	83276	80 %	0 %	0 %	20 %	301068026
81	NC_014332	CATTT	2	10	85605	85614	20 %	60 %	0 %	20 %	301068029
82	NC_014332	GTTAA	2	10	85974	85983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014332	TTAAA	2	10	86063	86072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014332	TAATG	2	10	87253	87262	40 %	40 %	20 %	0 %	301068031
85	NC_014332	TTTTA	2	10	88959	88968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014332	ATGCA	2	10	89720	89729	40 %	20 %	20 %	20 %	301068033
87	NC_014332	CATTC	2	10	90501	90510	20 %	40 %	0 %	40 %	301068035
88	NC_014332	AAATA	2	10	90540	90549	80 %	20 %	0 %	0 %	301068035
89	NC_014332	TTCCG	2	10	91593	91602	0 %	40 %	20 %	40 %	301068036
90	NC_014332	TAAAA	2	10	91828	91837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.