MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 82625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014330	ATA	3	9	28440	28448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869666
1003	NC_014330	TTC	2	6	28473	28478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869666
1004	NC_014330	CTG	2	6	28509	28514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869666
1005	NC_014330	CTT	2	6	28526	28531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869666
1006	NC_014330	TCC	2	6	28620	28625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300869666
1007	NC_014330	GTAT	2	8	28640	28647	25 %	50 %	25 %	0 %	300869666
1008	NC_014330	AAT	2	6	28666	28671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869666
1009	NC_014330	TA	3	6	28706	28711	50 %	50 %	0 %	0 %	300869666
1010	NC_014330	AAT	2	6	28766	28771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869666
1011	NC_014330	AT	3	6	28770	28775	50 %	50 %	0 %	0 %	300869666
1012	NC_014330	TTC	2	6	28785	28790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869666
1013	NC_014330	AGA	2	6	28797	28802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869666
1014	NC_014330	CTTTTT	2	12	28826	28837	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300869666
1015	NC_014330	TCC	2	6	28848	28853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300869666
1016	NC_014330	AAG	2	6	28860	28865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869666
1017	NC_014330	ATT	2	6	28930	28935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869666
1018	NC_014330	TAA	2	6	28943	28948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869666
1019	NC_014330	T	6	6	28953	28958	0 %	100 %	0 %	0 %	300869666
1020	NC_014330	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014330	A	7	7	28987	28993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014330	A	9	9	29041	29049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014330	TAAA	2	8	29050	29057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014330	AGG	2	6	29068	29073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014330	ATTT	2	8	29099	29106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014330	A	7	7	29123	29129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014330	ATA	2	6	29168	29173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014330	ATTTT	2	10	29192	29201	20 %	80 %	0 %	0 %	300869667
1029	NC_014330	A	7	7	29229	29235	100 %	0 %	0 %	0 %	300869667
1030	NC_014330	TAT	2	6	29311	29316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869667
1031	NC_014330	TGA	2	6	29349	29354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869667
1032	NC_014330	A	7	7	29388	29394	100 %	0 %	0 %	0 %	300869667
1033	NC_014330	A	6	6	29406	29411	100 %	0 %	0 %	0 %	300869667
1034	NC_014330	T	6	6	29433	29438	0 %	100 %	0 %	0 %	300869667
1035	NC_014330	AAG	2	6	29476	29481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869667
1036	NC_014330	TTA	2	6	29498	29503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869667
1037	NC_014330	TAA	2	6	29556	29561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869667
1038	NC_014330	GTTAT	2	10	29660	29669	20 %	60 %	20 %	0 %	300869667
1039	NC_014330	ATA	2	6	29734	29739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869667
1040	NC_014330	TA	3	6	29738	29743	50 %	50 %	0 %	0 %	300869667
1041	NC_014330	T	6	6	29749	29754	0 %	100 %	0 %	0 %	300869667
1042	NC_014330	CATT	2	8	29799	29806	25 %	50 %	0 %	25 %	300869667
1043	NC_014330	AAT	2	6	29881	29886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869668
1044	NC_014330	T	7	7	29898	29904	0 %	100 %	0 %	0 %	300869668
1045	NC_014330	AAAATA	2	12	29933	29944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869668
1046	NC_014330	ATA	2	6	29954	29959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869668
1047	NC_014330	T	6	6	29970	29975	0 %	100 %	0 %	0 %	300869668
1048	NC_014330	GCA	2	6	29987	29992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869668
1049	NC_014330	AT	3	6	30033	30038	50 %	50 %	0 %	0 %	300869668
1050	NC_014330	AT	3	6	30098	30103	50 %	50 %	0 %	0 %	300869668
1051	NC_014330	CTT	2	6	30157	30162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869668
1052	NC_014330	CTAT	2	8	30205	30212	25 %	50 %	0 %	25 %	300869668
1053	NC_014330	ATT	2	6	30230	30235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869668
1054	NC_014330	ATA	2	6	30260	30265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869668
1055	NC_014330	AAT	2	6	30293	30298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869668
1056	NC_014330	T	7	7	30298	30304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014330	TA	3	6	30346	30351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014330	AT	4	8	30365	30372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014330	TA	3	6	30404	30409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014330	TA	3	6	30430	30435	50 %	50 %	0 %	0 %	300869669
1061	NC_014330	CTA	2	6	30439	30444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869669
1062	NC_014330	TTC	2	6	30454	30459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869669
1063	NC_014330	TAA	2	6	30494	30499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869669
1064	NC_014330	AAG	2	6	30500	30505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869669
1065	NC_014330	AG	3	6	30547	30552	50 %	0 %	50 %	0 %	300869669
1066	NC_014330	A	6	6	30575	30580	100 %	0 %	0 %	0 %	300869669
1067	NC_014330	AT	3	6	30589	30594	50 %	50 %	0 %	0 %	300869669
1068	NC_014330	ACT	2	6	30597	30602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869669
1069	NC_014330	GGGA	2	8	30658	30665	25 %	0 %	75 %	0 %	300869669
1070	NC_014330	ATT	2	6	30673	30678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869669
1071	NC_014330	ACT	2	6	30711	30716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869669
1072	NC_014330	ATA	2	6	30772	30777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869669
1073	NC_014330	CTG	2	6	30793	30798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869669
1074	NC_014330	TTA	2	6	30802	30807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869669
1075	NC_014330	AGA	2	6	30821	30826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869669
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1077	NC_014330	A	6	6	30871	30876	100 %	0 %	0 %	0 %	300869669
1078	NC_014330	A	7	7	30897	30903	100 %	0 %	0 %	0 %	300869669
1079	NC_014330	ACA	2	6	30909	30914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300869669
1080	NC_014330	A	6	6	30929	30934	100 %	0 %	0 %	0 %	300869669
1081	NC_014330	TAG	2	6	30982	30987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869669
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1088	NC_014330	AG	3	6	31188	31193	50 %	0 %	50 %	0 %	300869669
1089	NC_014330	GAT	2	6	31251	31256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869669
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1092	NC_014330	ACTT	2	8	31316	31323	25 %	50 %	0 %	25 %	300869669
1093	NC_014330	CAA	2	6	31325	31330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300869669
1094	NC_014330	ATAG	2	8	31332	31339	50 %	25 %	25 %	0 %	300869669
1095	NC_014330	AT	3	6	31344	31349	50 %	50 %	0 %	0 %	300869669
1096	NC_014330	CTG	2	6	31384	31389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869669
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1098	NC_014330	AG	3	6	31442	31447	50 %	0 %	50 %	0 %	300869669
1099	NC_014330	GCT	2	6	31449	31454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869669
1100	NC_014330	A	6	6	31455	31460	100 %	0 %	0 %	0 %	300869669
1101	NC_014330	TGAAGC	2	12	31466	31477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300869669
1102	NC_014330	ATA	2	6	31515	31520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869669
1103	NC_014330	AT	3	6	31529	31534	50 %	50 %	0 %	0 %	300869669
1104	NC_014330	TAA	2	6	31535	31540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869669
1105	NC_014330	TGCCT	2	10	31568	31577	0 %	40 %	20 %	40 %	300869669
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1108	NC_014330	ATA	2	6	31681	31686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869669
1109	NC_014330	T	6	6	31687	31692	0 %	100 %	0 %	0 %	300869669
1110	NC_014330	TTA	2	6	31701	31706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869669
1111	NC_014330	AGA	3	9	31724	31732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869669
1112	NC_014330	TGT	2	6	31823	31828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869669
1113	NC_014330	CTA	2	6	31876	31881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869669
1114	NC_014330	GTA	2	6	31905	31910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869669
1115	NC_014330	ATG	2	6	31942	31947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869669
1116	NC_014330	TAC	2	6	31967	31972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869669
1117	NC_014330	TAAA	2	8	31984	31991	75 %	25 %	0 %	0 %	300869669
1118	NC_014330	TGATA	2	10	32027	32036	40 %	40 %	20 %	0 %	300869669
1119	NC_014330	A	7	7	32096	32102	100 %	0 %	0 %	0 %	300869669
1120	NC_014330	TTATA	2	10	32103	32112	40 %	60 %	0 %	0 %	300869669
1121	NC_014330	TAA	2	6	32141	32146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869669
1122	NC_014330	TAT	2	6	32168	32173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869669
1123	NC_014330	GCT	2	6	32175	32180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869669
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1125	NC_014330	AGAT	2	8	32287	32294	50 %	25 %	25 %	0 %	300869669
1126	NC_014330	AGA	2	6	32339	32344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869669
1127	NC_014330	GAT	2	6	32370	32375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869669
1128	NC_014330	ATGA	2	8	32403	32410	50 %	25 %	25 %	0 %	300869669
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