MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 82625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014330	ATT	2	6	14489	14494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869653
502	NC_014330	TAT	2	6	14495	14500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869653
503	NC_014330	GGATT	2	10	14521	14530	20 %	40 %	40 %	0 %	300869653
504	NC_014330	A	6	6	14622	14627	100 %	0 %	0 %	0 %	300869653
505	NC_014330	TGTAT	2	10	14628	14637	20 %	60 %	20 %	0 %	300869653
506	NC_014330	TTG	2	6	14645	14650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869653
507	NC_014330	TGTA	2	8	14661	14668	25 %	50 %	25 %	0 %	300869653
508	NC_014330	ATT	2	6	14681	14686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
509	NC_014330	TTA	2	6	14753	14758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
510	NC_014330	AT	3	6	14811	14816	50 %	50 %	0 %	0 %	300869654
511	NC_014330	AT	3	6	14900	14905	50 %	50 %	0 %	0 %	300869654
512	NC_014330	TAA	2	6	14907	14912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869654
513	NC_014330	TTA	2	6	14936	14941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
514	NC_014330	TAT	2	6	14942	14947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
515	NC_014330	TCA	2	6	14959	14964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869654
516	NC_014330	TCT	2	6	14995	15000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
517	NC_014330	ATT	3	9	15006	15014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
518	NC_014330	TCA	2	6	15061	15066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869654
519	NC_014330	CTA	2	6	15071	15076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869654
520	NC_014330	T	6	6	15100	15105	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
521	NC_014330	TTTC	2	8	15109	15116	0 %	75 %	0 %	25 %	300869654
522	NC_014330	AAT	2	6	15122	15127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869654
523	NC_014330	TAT	2	6	15140	15145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
524	NC_014330	T	6	6	15201	15206	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
525	NC_014330	TTA	2	6	15227	15232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
526	NC_014330	TCT	2	6	15241	15246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
527	NC_014330	TAT	13	39	15254	15292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
528	NC_014330	ATT	2	6	15316	15321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
529	NC_014330	GTT	3	9	15327	15335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869654
530	NC_014330	TAT	2	6	15350	15355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
531	NC_014330	ATTA	2	8	15372	15379	50 %	50 %	0 %	0 %	300869654
532	NC_014330	TAT	2	6	15383	15388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
533	NC_014330	ATT	3	9	15393	15401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
534	NC_014330	T	6	6	15400	15405	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
535	NC_014330	TAT	3	9	15413	15421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
536	NC_014330	TAT	2	6	15447	15452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
537	NC_014330	TGT	2	6	15468	15473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869654
538	NC_014330	TTC	2	6	15474	15479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
539	NC_014330	TAT	4	12	15506	15517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
540	NC_014330	AACTA	2	10	15519	15528	60 %	20 %	0 %	20 %	300869654
541	NC_014330	TAT	2	6	15557	15562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
542	NC_014330	T	6	6	15562	15567	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
543	NC_014330	CAT	2	6	15599	15604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869654
544	NC_014330	TGT	2	6	15609	15614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869654
545	NC_014330	TAT	2	6	15615	15620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
546	NC_014330	AATTAT	2	12	15632	15643	50 %	50 %	0 %	0 %	300869654
547	NC_014330	TCT	2	6	15646	15651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
548	NC_014330	T	6	6	15651	15656	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
549	NC_014330	TCT	2	6	15658	15663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
550	NC_014330	ATA	2	6	15669	15674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869654
551	NC_014330	ATT	2	6	15681	15686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
552	NC_014330	TAT	2	6	15689	15694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
553	NC_014330	ATT	2	6	15711	15716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
554	NC_014330	GGA	2	6	15733	15738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300869654
555	NC_014330	GTT	2	6	15754	15759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869654
556	NC_014330	TTG	2	6	15785	15790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869654
557	NC_014330	A	6	6	15818	15823	100 %	0 %	0 %	0 %	300869654
558	NC_014330	TAT	2	6	15842	15847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
559	NC_014330	TGC	2	6	15849	15854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869654
560	NC_014330	T	6	6	15857	15862	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
561	NC_014330	AGTT	2	8	15887	15894	25 %	50 %	25 %	0 %	300869654
562	NC_014330	T	7	7	15913	15919	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
563	NC_014330	ATT	2	6	15930	15935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
564	NC_014330	ATT	3	9	15954	15962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
565	NC_014330	TAT	8	24	15974	15997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
566	NC_014330	TGTA	2	8	16027	16034	25 %	50 %	25 %	0 %	300869654
567	NC_014330	TTC	2	6	16071	16076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
568	NC_014330	TAT	3	9	16088	16096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
569	NC_014330	ATT	2	6	16134	16139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
570	NC_014330	ATT	3	9	16143	16151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
571	NC_014330	A	6	6	16152	16157	100 %	0 %	0 %	0 %	300869654
572	NC_014330	CT	3	6	16170	16175	0 %	50 %	0 %	50 %	300869654
573	NC_014330	GTT	2	6	16188	16193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869654
574	NC_014330	GAA	2	6	16293	16298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869654
575	NC_014330	TTATT	2	10	16328	16337	20 %	80 %	0 %	0 %	300869654
576	NC_014330	TTC	3	9	16338	16346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
577	NC_014330	A	6	6	16392	16397	100 %	0 %	0 %	0 %	300869654
578	NC_014330	T	7	7	16431	16437	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
579	NC_014330	T	6	6	16494	16499	0 %	100 %	0 %	0 %	300869654
580	NC_014330	AAATT	2	10	16501	16510	60 %	40 %	0 %	0 %	300869654
581	NC_014330	CTT	2	6	16522	16527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
582	NC_014330	TTC	2	6	16529	16534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
583	NC_014330	T	6	6	16599	16604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014330	A	6	6	16628	16633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014330	TAT	2	6	16655	16660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014330	AT	4	8	16659	16666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014330	AT	3	6	16673	16678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014330	TAAT	2	8	16682	16689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014330	TAT	2	6	16712	16717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014330	TAT	2	6	16726	16731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014330	ATT	2	6	16760	16765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869655
592	NC_014330	TATTTT	2	12	16775	16786	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	300869655
593	NC_014330	ATT	2	6	16788	16793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869655
594	NC_014330	AAT	2	6	16803	16808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869655
595	NC_014330	TTC	2	6	16817	16822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869655
596	NC_014330	ATT	2	6	16829	16834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869655
597	NC_014330	GAA	2	6	16848	16853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869655
598	NC_014330	ATA	2	6	16923	16928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869655
599	NC_014330	GAT	2	6	16983	16988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869655
600	NC_014330	GA	4	8	17012	17019	50 %	0 %	50 %	0 %	300869655
601	NC_014330	GCT	2	6	17082	17087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869655
602	NC_014330	TGC	2	6	17099	17104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869655
603	NC_014330	AT	3	6	17126	17131	50 %	50 %	0 %	0 %	300869655
604	NC_014330	A	6	6	17132	17137	100 %	0 %	0 %	0 %	300869655
605	NC_014330	AGA	2	6	17171	17176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869655
606	NC_014330	GAT	2	6	17196	17201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869655
607	NC_014330	T	6	6	17240	17245	0 %	100 %	0 %	0 %	300869655
608	NC_014330	TACT	2	8	17251	17258	25 %	50 %	0 %	25 %	300869655
609	NC_014330	TGA	2	6	17306	17311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869655
610	NC_014330	AG	3	6	17363	17368	50 %	0 %	50 %	0 %	300869655
611	NC_014330	TGA	2	6	17375	17380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869655
612	NC_014330	A	6	6	17380	17385	100 %	0 %	0 %	0 %	300869655
613	NC_014330	GTA	2	6	17391	17396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869655
614	NC_014330	A	6	6	17396	17401	100 %	0 %	0 %	0 %	300869655
615	NC_014330	ATT	2	6	17407	17412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869655
616	NC_014330	ATA	2	6	17422	17427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869655
617	NC_014330	A	6	6	17437	17442	100 %	0 %	0 %	0 %	300869655
618	NC_014330	TGA	3	9	17452	17460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869655
619	NC_014330	AGA	2	6	17549	17554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869655
620	NC_014330	CTA	2	6	17608	17613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869655
621	NC_014330	TA	3	6	17673	17678	50 %	50 %	0 %	0 %	300869655
622	NC_014330	TGT	2	6	17687	17692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869655
623	NC_014330	CTA	2	6	17710	17715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869655
624	NC_014330	ATG	2	6	17740	17745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869655
625	NC_014330	AT	3	6	17777	17782	50 %	50 %	0 %	0 %	300869655
626	NC_014330	TAA	2	6	17807	17812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869655
627	NC_014330	ATT	2	6	17831	17836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869655
628	NC_014330	ACT	2	6	17889	17894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869655
629	NC_014330	GCA	2	6	17930	17935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869655
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