MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014172	CGGTT	2	10	24	33	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014172	AATAA	2	10	90	99	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014172	GCAAA	2	10	386	395	60 %	0 %	20 %	20 %	296506383
4	NC_014172	TTCTT	2	10	1504	1513	0 %	80 %	0 %	20 %	296506384
5	NC_014172	TTTAA	2	10	1980	1989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014172	AGTTA	2	10	2269	2278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014172	ATCTT	2	10	2699	2708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014172	TAATG	2	10	11082	11091	40 %	40 %	20 %	0 %	296506394
9	NC_014172	GTATA	2	10	12566	12575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014172	GAATC	2	10	12682	12691	40 %	20 %	20 %	20 %	296506397
11	NC_014172	ATTCC	2	10	15528	15537	20 %	40 %	0 %	40 %	296506399
12	NC_014172	TTTAT	2	10	18203	18212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014172	TTTGT	2	10	18290	18299	0 %	80 %	20 %	0 %	296506402
14	NC_014172	AAACC	2	10	19763	19772	60 %	0 %	0 %	40 %	296506403
15	NC_014172	ATATT	2	10	19937	19946	40 %	60 %	0 %	0 %	296506403
16	NC_014172	TTGTT	2	10	20409	20418	0 %	80 %	20 %	0 %	296506403
17	NC_014172	AAAGG	2	10	21363	21372	60 %	0 %	40 %	0 %	296506404
18	NC_014172	AAGAT	2	10	22866	22875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014172	ATCTT	2	10	22887	22896	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014172	TTTGA	2	10	23681	23690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014172	CTGTT	2	10	25035	25044	0 %	60 %	20 %	20 %	296506407
22	NC_014172	CAACC	2	10	25720	25729	40 %	0 %	0 %	60 %	296506408
23	NC_014172	TTGCA	2	10	25745	25754	20 %	40 %	20 %	20 %	296506408
24	NC_014172	ATTTG	2	10	27071	27080	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014172	ATAAA	2	10	27229	27238	80 %	20 %	0 %	0 %	296506411
26	NC_014172	ATAAA	2	10	27670	27679	80 %	20 %	0 %	0 %	296506411
27	NC_014172	AAAAG	2	10	31497	31506	80 %	0 %	20 %	0 %	296506414
28	NC_014172	AGATG	2	10	31861	31870	40 %	20 %	40 %	0 %	296506414
29	NC_014172	CTGGA	2	10	32680	32689	20 %	20 %	40 %	20 %	296506414
30	NC_014172	TAAAT	2	10	35415	35424	60 %	40 %	0 %	0 %	296506415
31	NC_014172	ATCAC	2	10	35524	35533	40 %	20 %	0 %	40 %	296506415
32	NC_014172	ATTTC	2	10	39440	39449	20 %	60 %	0 %	20 %	296506423
33	NC_014172	GAAAA	2	10	40084	40093	80 %	0 %	20 %	0 %	296506424
34	NC_014172	AATTA	2	10	41532	41541	60 %	40 %	0 %	0 %	296506427
35	NC_014172	TAATT	2	10	42072	42081	40 %	60 %	0 %	0 %	296506427
36	NC_014172	CATAA	2	10	44080	44089	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014172	CTATG	2	10	44288	44297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014172	AAAAT	2	10	44302	44311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014172	CTCAA	2	10	46879	46888	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014172	CAAAT	2	10	47614	47623	60 %	20 %	0 %	20 %	296506436
41	NC_014172	TTTCT	2	10	48044	48053	0 %	80 %	0 %	20 %	296506436
42	NC_014172	ATTTA	2	10	50045	50054	40 %	60 %	0 %	0 %	296506439
43	NC_014172	AAATT	2	10	50983	50992	60 %	40 %	0 %	0 %	296506441
44	NC_014172	TGTTA	2	10	51176	51185	20 %	60 %	20 %	0 %	296506441
45	NC_014172	TTAAA	2	10	55601	55610	60 %	40 %	0 %	0 %	296506445
46	NC_014172	TAATA	2	10	55827	55836	60 %	40 %	0 %	0 %	296506445
47	NC_014172	TTAGA	2	10	56084	56093	40 %	40 %	20 %	0 %	296506445
48	NC_014172	AAATA	2	10	56585	56594	80 %	20 %	0 %	0 %	296506446
49	NC_014172	TTATG	2	10	58056	58065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014172	ATTTT	2	10	58735	58744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014172	CAAAA	2	10	59369	59378	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014172	TTCTG	2	10	59717	59726	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
53	NC_014172	TTCTG	2	10	59741	59750	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
54	NC_014172	TTCTG	2	10	59765	59774	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
55	NC_014172	TTCTG	2	10	59789	59798	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
56	NC_014172	TTCTG	2	10	59813	59822	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
57	NC_014172	TTCTG	2	10	59837	59846	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
58	NC_014172	CTTCT	2	10	60121	60130	0 %	60 %	0 %	40 %	296506452
59	NC_014172	CTTTT	2	10	61183	61192	0 %	80 %	0 %	20 %	296506452
60	NC_014172	CTTCT	2	10	61520	61529	0 %	60 %	0 %	40 %	296506453
61	NC_014172	TTATT	2	10	62144	62153	20 %	80 %	0 %	0 %	296506453
62	NC_014172	AATTA	2	10	63307	63316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014172	TTTAG	2	10	66973	66982	20 %	60 %	20 %	0 %	296506457
64	NC_014172	GTTTC	2	10	67025	67034	0 %	60 %	20 %	20 %	296506457
65	NC_014172	TTCTT	2	10	69563	69572	0 %	80 %	0 %	20 %	296506458
66	NC_014172	AAATT	2	10	70284	70293	60 %	40 %	0 %	0 %	296506459
67	NC_014172	ATTTG	2	10	74438	74447	20 %	60 %	20 %	0 %	296506461
68	NC_014172	TCATT	2	10	75286	75295	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014172	ATTAA	2	10	75498	75507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014172	GTATT	2	10	75827	75836	20 %	60 %	20 %	0 %	296506462
71	NC_014172	AGTTT	2	10	75942	75951	20 %	60 %	20 %	0 %	296506462
72	NC_014172	TGTGT	2	10	76219	76228	0 %	60 %	40 %	0 %	296506462
73	NC_014172	AAATT	2	10	77233	77242	60 %	40 %	0 %	0 %	296506463
74	NC_014172	TTTTA	2	10	77591	77600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014172	GAAAA	2	10	78953	78962	80 %	0 %	20 %	0 %	296506465
76	NC_014172	TCAAA	2	10	79181	79190	60 %	20 %	0 %	20 %	296506465
77	NC_014172	TAGTA	2	10	79807	79816	40 %	40 %	20 %	0 %	296506465
78	NC_014172	TTTCA	2	10	83129	83138	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014172	AATAT	2	10	83457	83466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014172	ATATT	2	10	83687	83696	40 %	60 %	0 %	0 %	296506469
81	NC_014172	TTTCA	2	10	84718	84727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014172	ATACT	2	10	86839	86848	40 %	40 %	0 %	20 %	296506471
83	NC_014172	ATGTT	2	10	87498	87507	20 %	60 %	20 %	0 %	296506471
84	NC_014172	CAATG	2	10	89206	89215	40 %	20 %	20 %	20 %	296506471
85	NC_014172	TATTT	2	10	90026	90035	20 %	80 %	0 %	0 %	296506472
86	NC_014172	ATTAA	2	10	90447	90456	60 %	40 %	0 %	0 %	296506472
87	NC_014172	CTTCT	2	10	90548	90557	0 %	60 %	0 %	40 %	296506472
88	NC_014172	TTTAA	2	10	91221	91230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014172	TTATT	2	10	92057	92066	20 %	80 %	0 %	0 %	296506473
90	NC_014172	TAATT	2	10	94726	94735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014172	ATATA	2	10	94761	94770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014172	TTATC	2	10	95067	95076	20 %	60 %	0 %	20 %	296506474
93	NC_014172	TCAAC	2	10	95905	95914	40 %	20 %	0 %	40 %	296506475
94	NC_014172	TAGTC	2	10	96242	96251	20 %	40 %	20 %	20 %	296506475
95	NC_014172	TATCT	2	10	98590	98599	20 %	60 %	0 %	20 %	296506476
96	NC_014172	ATTGT	2	10	98715	98724	20 %	60 %	20 %	0 %	296506476
97	NC_014172	TACAA	2	10	99582	99591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014172	TAAAA	2	10	100695	100704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014172	AAAGC	2	10	100922	100931	60 %	0 %	20 %	20 %	296506477
100	NC_014172	ACTCA	2	10	101430	101439	40 %	20 %	0 %	40 %	296506477
101	NC_014172	AAATC	2	10	102238	102247	60 %	20 %	0 %	20 %	296506477
102	NC_014172	ATTTC	2	10	103215	103224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014172	AAAGA	2	10	103537	103546	80 %	0 %	20 %	0 %	296506478
104	NC_014172	TTAGT	2	10	105295	105304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014172	GATTA	2	10	106080	106089	40 %	40 %	20 %	0 %	296506481
106	NC_014172	CTAAA	2	10	106239	106248	60 %	20 %	0 %	20 %	296506481
107	NC_014172	ACTAA	2	10	107595	107604	60 %	20 %	0 %	20 %	296506482
108	NC_014172	ATTAG	2	10	107715	107724	40 %	40 %	20 %	0 %	296506482
109	NC_014172	AAGGT	2	10	109602	109611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014172	ACTAA	2	10	110598	110607	60 %	20 %	0 %	20 %	296506484
111	NC_014172	AAAAT	2	10	110800	110809	80 %	20 %	0 %	0 %	296506484
112	NC_014172	GAAAT	2	10	111010	111019	60 %	20 %	20 %	0 %	296506484
113	NC_014172	ATTTA	2	10	111154	111163	40 %	60 %	0 %	0 %	296506485
114	NC_014172	CTGGA	2	10	112162	112171	20 %	20 %	40 %	20 %	296506485
115	NC_014172	AGAAA	2	10	112565	112574	80 %	0 %	20 %	0 %	296506485
116	NC_014172	TGAAA	2	10	114815	114824	60 %	20 %	20 %	0 %	296506487
117	NC_014172	AATTT	2	10	115332	115341	40 %	60 %	0 %	0 %	296506487
118	NC_014172	ATAAG	2	10	116694	116703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014172	AACTA	2	10	117296	117305	60 %	20 %	0 %	20 %	296506489
120	NC_014172	AACTT	2	10	118747	118756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014172	ATTTT	2	10	118775	118784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014172	AGAAA	2	10	120320	120329	80 %	0 %	20 %	0 %	296506492
123	NC_014172	GATAT	2	10	120654	120663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014172	ATTTT	3	15	121053	121067	20 %	80 %	0 %	0 %	296506493
125	NC_014172	CAAGC	2	10	121400	121409	40 %	0 %	20 %	40 %	296506493
126	NC_014172	ATAAA	2	10	121559	121568	80 %	20 %	0 %	0 %	296506493
127	NC_014172	TATGT	2	10	121895	121904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014172	TTTTG	2	10	122913	122922	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014172	ATTCC	2	10	124308	124317	20 %	40 %	0 %	40 %	296506497
130	NC_014172	GATAA	2	10	124625	124634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014172	AAATT	2	10	124966	124975	60 %	40 %	0 %	0 %	296506498
132	NC_014172	ATGAG	2	10	127028	127037	40 %	20 %	40 %	0 %	296506501
133	NC_014172	AAAAG	2	10	127677	127686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014172	GGAAA	2	10	127976	127985	60 %	0 %	40 %	0 %	296506502
135	NC_014172	ATTTC	2	10	128445	128454	20 %	60 %	0 %	20 %	296506502
136	NC_014172	ATGAA	2	10	128796	128805	60 %	20 %	20 %	0 %	296506502
137	NC_014172	TTTTA	2	10	130662	130671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014172	AAATC	2	10	130673	130682	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014172	AGGAA	2	10	131897	131906	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014172	AAAAG	2	10	133119	133128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014172	CAATA	2	10	133389	133398	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014172	TAAAG	2	10	135810	135819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014172	GATTG	2	10	135925	135934	20 %	40 %	40 %	0 %	296506508
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155	NC_014172	TTTAA	2	10	145975	145984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014172	ATTTT	2	10	147217	147226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_014172	TTTTA	2	10	265495	265504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_014172	TATTC	2	10	270527	270536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_014172	TAATT	2	10	270973	270982	40 %	60 %	0 %	0 %	296506626
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266	NC_014172	TTTAG	2	10	272500	272509	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014172	TGTAC	2	10	272529	272538	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
268	NC_014172	AAAAT	2	10	273311	273320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014172	TCTTT	2	10	273492	273501	0 %	80 %	0 %	20 %	296506629
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271	NC_014172	TTTAG	2	10	274982	274991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014172	AAAGA	2	10	275117	275126	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_014172	TTTAG	2	10	279404	279413	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014172	AACTT	2	10	280186	280195	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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276	NC_014172	TTCAT	2	10	281756	281765	20 %	60 %	0 %	20 %	296506633
277	NC_014172	TCAAA	2	10	282867	282876	60 %	20 %	0 %	20 %	296506634
278	NC_014172	TTTCA	2	10	284188	284197	20 %	60 %	0 %	20 %	296506634
279	NC_014172	TTTCA	2	10	284584	284593	20 %	60 %	0 %	20 %	296506634
280	NC_014172	AATAC	2	10	284604	284613	60 %	20 %	0 %	20 %	296506634
281	NC_014172	TAACG	2	10	286415	286424	40 %	20 %	20 %	20 %	296506634
282	NC_014172	AATCC	2	10	287784	287793	40 %	20 %	0 %	40 %	296506634
283	NC_014172	AACGG	2	10	288957	288966	40 %	0 %	40 %	20 %	296506634
284	NC_014172	ACCAA	2	10	290189	290198	60 %	0 %	0 %	40 %	296506634
285	NC_014172	ATCCA	2	10	293495	293504	40 %	20 %	0 %	40 %	296506634
286	NC_014172	GATTC	2	10	293592	293601	20 %	40 %	20 %	20 %	296506634
287	NC_014172	ACAAT	2	10	294496	294505	60 %	20 %	0 %	20 %	296506634
288	NC_014172	CTATT	2	10	295681	295690	20 %	60 %	0 %	20 %	296506634
289	NC_014172	TCAGC	2	10	297049	297058	20 %	20 %	20 %	40 %	296506634
290	NC_014172	GAAAA	2	10	297662	297671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014172	AAAAT	2	10	297780	297789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014172	CATTT	2	10	299014	299023	20 %	60 %	0 %	20 %	296506635
293	NC_014172	TTAAC	2	10	299302	299311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_014172	AGAAA	2	10	299591	299600	80 %	0 %	20 %	0 %	296506636
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297	NC_014172	TTTTG	2	10	302426	302435	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
298	NC_014172	GTTTT	2	10	303301	303310	0 %	80 %	20 %	0 %	296506641
299	NC_014172	AACAA	2	10	304140	304149	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_014172	CTTTT	2	10	304438	304447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_014172	AATTG	2	10	304769	304778	40 %	40 %	20 %	0 %	296506642
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305	NC_014172	CATAT	2	10	306653	306662	40 %	40 %	0 %	20 %	296506644
306	NC_014172	ATTAA	2	10	309823	309832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_014172	GAACT	2	10	311186	311195	40 %	20 %	20 %	20 %	296506650
308	NC_014172	TTTTG	2	10	311961	311970	0 %	80 %	20 %	0 %	296506652
309	NC_014172	ATAAG	2	10	312306	312315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.