MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 chromosome

Total Repeats: 2491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014171	TAGCTG	2	12	683	694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296500839
2	NC_014171	CTATTA	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014171	TCTTTG	2	12	3537	3548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296500842
4	NC_014171	TGGCGG	2	12	4792	4803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296500843
5	NC_014171	TGCACG	2	12	5617	5628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296500843
6	NC_014171	CCGATG	2	12	5970	5981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296500843
7	NC_014171	TGAAGA	2	12	7964	7975	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500844
8	NC_014171	TTTCGT	2	12	10787	10798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014171	GAACTG	2	12	17851	17862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500847
10	NC_014171	AAAGAT	2	12	18131	18142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296500847
11	NC_014171	CAGGAA	2	12	19079	19090	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296500848
12	NC_014171	ACAGGA	2	12	21061	21072	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296500850
13	NC_014171	CAAGAT	2	12	24649	24660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500855
14	NC_014171	TTTCGT	2	12	30754	30765	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014171	TGCACA	2	12	35381	35392	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296500862
16	NC_014171	CGTATA	2	12	36016	36027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296500862
17	NC_014171	AGCTTT	2	12	37520	37531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296500864
18	NC_014171	AAATGA	2	12	38107	38118	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296500865
19	NC_014171	TGTAGA	2	12	38212	38223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500865
20	NC_014171	TGGAAG	2	12	43407	43418	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296500870
21	NC_014171	GCACGT	2	12	52667	52678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296500881
22	NC_014171	TTTTCC	2	12	54670	54681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014171	AAGCAA	2	12	55143	55154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296500886
24	NC_014171	ATTAAC	2	12	57059	57070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296500886
25	NC_014171	TTTCAT	2	12	59557	59568	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296500888
26	NC_014171	TTTAGG	2	12	60806	60817	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296500889
27	NC_014171	TATTGA	2	12	66661	66672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296500895
28	NC_014171	CAGGTA	2	12	70427	70438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500898
29	NC_014171	TGTCGG	2	12	70521	70532	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296500898
30	NC_014171	GGTGTT	2	12	73232	73243	0 %	50 %	50 %	0 %	296500900
31	NC_014171	AAAGTA	2	12	73427	73438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296500900
32	NC_014171	CTGGTG	2	12	74294	74305	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296500901
33	NC_014171	CAAGGT	2	12	77907	77918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500905
34	NC_014171	GTATCT	2	12	79498	79509	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296500908
35	NC_014171	ATATCA	2	12	80785	80796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296500912
36	NC_014171	TTATAT	2	12	82374	82385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014171	TATATT	2	12	82469	82480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014171	TTTCGT	2	12	84266	84277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014171	TTTCGT	2	12	90427	90438	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014171	AGTCAA	2	12	94246	94257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014171	CAAATA	2	12	95126	95137	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296500914
42	NC_014171	GTGAAG	2	12	96886	96897	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296500916
43	NC_014171	ATGCAA	2	12	99219	99230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500917
44	NC_014171	AGAGGC	2	12	101146	101157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296500918
45	NC_014171	AGAGGT	2	12	102161	102172	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296500919
46	NC_014171	CAGATG	2	12	103720	103731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500921
47	NC_014171	GCAGTA	2	12	104774	104785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500922
48	NC_014171	GTAGAA	2	12	111275	111286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500930
49	NC_014171	TCTGGT	2	12	112105	112116	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296500931
50	NC_014171	GAAGCT	2	12	112704	112715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500932
51	NC_014171	TGAGGT	2	12	114918	114929	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296500935
52	NC_014171	AAGAGA	2	12	115168	115179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014171	GCAAGA	2	12	124221	124232	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296500941
54	NC_014171	AGTAGA	2	12	124326	124337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500941
55	NC_014171	AGCGTG	2	12	125099	125110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296500941
56	NC_014171	ATTCGA	2	12	125619	125630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296500941
57	NC_014171	AAGTTG	2	12	125873	125884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500941
58	NC_014171	GCTAAA	2	12	126259	126270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500942
59	NC_014171	GAAACT	2	12	126466	126477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500942
60	NC_014171	CAAGCT	2	12	127060	127071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296500942
61	NC_014171	AACTGA	2	12	128304	128315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500944
62	NC_014171	TAAAGG	2	12	128526	128537	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500944
63	NC_014171	GAAATC	2	12	129730	129741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500946
64	NC_014171	ACAAGC	2	12	132079	132090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	296500950
65	NC_014171	TTGAAG	2	12	135258	135269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500958
66	NC_014171	AAAGGT	2	12	135368	135379	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500958
67	NC_014171	TAGTTG	2	12	135955	135966	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296500960
68	NC_014171	CTGAAA	2	12	138498	138509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500964
69	NC_014171	TAAACA	2	12	140185	140196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296500967
70	NC_014171	TTAGGT	2	12	142106	142117	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296500970
71	NC_014171	ATTTTT	2	12	144458	144469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296500974
72	NC_014171	TGCAGT	2	12	148561	148572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296500980
73	NC_014171	TTTCTT	2	12	151635	151646	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296500983
74	NC_014171	TTTCGT	2	12	154095	154106	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014171	TTAGAT	2	12	160738	160749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296500986
76	NC_014171	AGCAAA	2	12	162282	162293	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296500988
77	NC_014171	CAAAAT	2	12	163414	163425	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296500988
78	NC_014171	AAGATA	2	12	163427	163438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296500988
79	NC_014171	GATGGC	2	12	164219	164230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296500989
80	NC_014171	CGCATC	2	12	165585	165596	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296500990
81	NC_014171	ATCGTA	2	12	165965	165976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296500990
82	NC_014171	CTCCGT	2	12	167510	167521	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296500991
83	NC_014171	GTATGT	2	12	176086	176097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014171	CAAAGA	2	12	177491	177502	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296501001
85	NC_014171	CAAAAT	2	12	178906	178917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296501002
86	NC_014171	CCATCT	2	12	184538	184549	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296501008
87	NC_014171	ATTTTG	2	12	185358	185369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296501009
88	NC_014171	GTGGTT	2	12	192900	192911	0 %	50 %	50 %	0 %	296501016
89	NC_014171	AAGTTA	2	12	196612	196623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501018
90	NC_014171	TCTGGA	2	12	196624	196635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296501018
91	NC_014171	ATTTAT	2	12	204312	204323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501025
92	NC_014171	TTCATT	2	12	205199	205210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296501027
93	NC_014171	TATGAA	2	12	209251	209262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501032
94	NC_014171	AAAATA	2	12	209472	209483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014171	AAGGGG	2	12	209555	209566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014171	CTAATA	2	12	212392	212403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296501035
97	NC_014171	AGAGGT	2	12	212937	212948	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014171	TATATT	2	12	212990	213001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501036
99	NC_014171	TTCATA	2	12	214535	214546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014171	GGAACA	2	12	215554	215565	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296501040
101	NC_014171	AGTTAT	2	12	215857	215868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296501040
102	NC_014171	CCCGAC	2	12	217371	217382	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014171	TTATAT	2	12	219042	219053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501041
104	NC_014171	ATACGA	2	12	219219	219230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296501041
105	NC_014171	GAAAGA	2	12	222032	222043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501044
106	NC_014171	TAAATG	2	12	222709	222720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501044
107	NC_014171	GAGAAT	2	12	223093	223104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296501045
108	NC_014171	AAAAGA	2	12	225207	225218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296501047
109	NC_014171	CCATAT	2	12	231993	232004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501056
110	NC_014171	TGAAAA	2	12	236727	236738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296501059
111	NC_014171	CATCTC	2	12	237305	237316	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296501060
112	NC_014171	ATATGA	2	12	237566	237577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501060
113	NC_014171	TAAAGA	2	12	237735	237746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296501060
114	NC_014171	AAAACA	2	12	239768	239779	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	296501063
115	NC_014171	GTAAGT	2	12	240173	240184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501063
116	NC_014171	TTTCGT	2	12	248609	248620	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014171	AGCTGA	2	12	253695	253706	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296501070
118	NC_014171	GGATAT	2	12	257987	257998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501074
119	NC_014171	GGCATG	2	12	261713	261724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296501078
120	NC_014171	AATTTA	2	12	264836	264847	50 %	50 %	0 %	0 %	296501080
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123	NC_014171	TTTCGT	2	12	281093	281104	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014171	AGTTGG	2	12	287029	287040	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296501090
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234	NC_014171	AAAATT	2	12	498076	498087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296501271
235	NC_014171	GGACGT	2	12	500207	500218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296501272
236	NC_014171	GGTAAA	2	12	502140	502151	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296501273
237	NC_014171	GAAAAT	2	12	504067	504078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296501274
238	NC_014171	AATGAA	2	12	504638	504649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
239	NC_014171	AATGGC	2	12	508925	508936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296501280
240	NC_014171	ACAATC	2	12	512802	512813	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296501285
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244	NC_014171	TCACGG	2	12	520257	520268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296501290
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253	NC_014171	ATCATT	2	12	549321	549332	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_014171	AGTGAT	2	12	549649	549660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501310
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281	NC_014171	CATTAC	2	12	602037	602048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501355
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332	NC_014171	GAAAGG	2	12	707122	707133	50 %	0 %	50 %	0 %	296501445
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341	NC_014171	CTTTTT	2	12	717396	717407	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
342	NC_014171	ATTACG	2	12	721777	721788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296501459
343	NC_014171	CCATTG	2	12	725375	725386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296501462
344	NC_014171	TAAATT	2	12	726334	726345	50 %	50 %	0 %	0 %	296501463
345	NC_014171	TTAAAA	2	12	727288	727299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_014171	TTCAAG	2	12	727626	727637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296501465
347	NC_014171	TGTTTG	2	12	731133	731144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296501468
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350	NC_014171	GTTTTT	2	12	732873	732884	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	296501468
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468	NC_014171	TTGTTT	2	12	983862	983873	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	296501701
469	NC_014171	ATGGGA	2	12	986093	986104	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296501703
470	NC_014171	CGTATT	2	12	987227	987238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296501703
471	NC_014171	TTACGT	2	12	987632	987643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296501703
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500	NC_014171	AGATAA	2	12	1056499	1056510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

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