MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 chromosome

Total Repeats: 128657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014171	GAT	2	6	222074	222079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501044
5002	NC_014171	AAG	2	6	222183	222188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501044
5003	NC_014171	TGA	2	6	222227	222232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501044
5004	NC_014171	GCG	2	6	222262	222267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296501044
5005	NC_014171	TAT	2	6	222281	222286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501044
5006	NC_014171	TTA	2	6	222318	222323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501044
5007	NC_014171	CAA	2	6	222337	222342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296501044
5008	NC_014171	CTA	2	6	222381	222386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501044
5009	NC_014171	AGA	2	6	222398	222403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501044
5010	NC_014171	ATTA	2	8	222422	222429	50 %	50 %	0 %	0 %	296501044
5011	NC_014171	TGT	2	6	222467	222472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296501044
5012	NC_014171	TATG	2	8	222476	222483	25 %	50 %	25 %	0 %	296501044
5013	NC_014171	GAA	2	6	222498	222503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501044
5014	NC_014171	ATT	2	6	222554	222559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501044
5015	NC_014171	TATTC	2	10	222600	222609	20 %	60 %	0 %	20 %	296501044
5016	NC_014171	AAG	2	6	222694	222699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501044
5017	NC_014171	TAAATG	2	12	222709	222720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501044
5018	NC_014171	GAG	2	6	222753	222758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296501044
5019	NC_014171	ATT	2	6	222781	222786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501045
5020	NC_014171	TAG	2	6	222835	222840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501045
5021	NC_014171	TAA	2	6	222886	222891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296501045
5022	NC_014171	ACA	2	6	222935	222940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296501045
5023	NC_014171	A	6	6	222969	222974	100 %	0 %	0 %	0 %	296501045
5024	NC_014171	GGAG	2	8	222976	222983	25 %	0 %	75 %	0 %	296501045
5025	NC_014171	GAGAAT	2	12	223093	223104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296501045
5026	NC_014171	CGA	2	6	223146	223151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296501045
5027	NC_014171	TGG	2	6	223240	223245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296501045
5028	NC_014171	TGA	2	6	223306	223311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501045
5029	NC_014171	GGC	2	6	223318	223323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296501045
5030	NC_014171	TATC	2	8	223332	223339	25 %	50 %	0 %	25 %	296501045
5031	NC_014171	ATT	2	6	223349	223354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501045
5032	NC_014171	ATTT	2	8	223356	223363	25 %	75 %	0 %	0 %	296501045
5033	NC_014171	TTAT	2	8	223393	223400	25 %	75 %	0 %	0 %	296501045
5034	NC_014171	GTA	2	6	223421	223426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501045
5035	NC_014171	TGA	2	6	223489	223494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501045
5036	NC_014171	A	7	7	223670	223676	100 %	0 %	0 %	0 %	296501045
5037	NC_014171	TTG	2	6	223713	223718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296501045
5038	NC_014171	TCA	2	6	223723	223728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501045
5039	NC_014171	A	6	6	223734	223739	100 %	0 %	0 %	0 %	296501045
5040	NC_014171	T	7	7	223765	223771	0 %	100 %	0 %	0 %	296501046
5041	NC_014171	GTTT	2	8	223786	223793	0 %	75 %	25 %	0 %	296501046
5042	NC_014171	TTGT	2	8	223834	223841	0 %	75 %	25 %	0 %	296501046
5043	NC_014171	ACA	2	6	223849	223854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296501046
5044	NC_014171	T	6	6	223864	223869	0 %	100 %	0 %	0 %	296501046
5045	NC_014171	TCT	2	6	223873	223878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296501046
5046	NC_014171	CAT	2	6	223928	223933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501046
5047	NC_014171	CTG	2	6	223992	223997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296501046
5048	NC_014171	TAG	2	6	224042	224047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501046
5049	NC_014171	ATA	2	6	224065	224070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296501046
5050	NC_014171	TCT	2	6	224077	224082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296501046
5051	NC_014171	GAA	2	6	224133	224138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501046
5052	NC_014171	ACA	2	6	224167	224172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296501046
5053	NC_014171	TCT	2	6	224173	224178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296501046
5054	NC_014171	T	7	7	224180	224186	0 %	100 %	0 %	0 %	296501046
5055	NC_014171	TTC	2	6	224271	224276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296501046
5056	NC_014171	TA	3	6	224333	224338	50 %	50 %	0 %	0 %	296501046
5057	NC_014171	TCCA	2	8	224424	224431	25 %	25 %	0 %	50 %	296501046
5058	NC_014171	TTGC	2	8	224449	224456	0 %	50 %	25 %	25 %	296501046
5059	NC_014171	TTC	2	6	224481	224486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296501046
5060	NC_014171	CTT	2	6	224546	224551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296501046
5061	NC_014171	GAT	2	6	224599	224604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501046
5062	NC_014171	AGT	2	6	224605	224610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501046
5063	NC_014171	CCAT	2	8	224614	224621	25 %	25 %	0 %	50 %	296501046
5064	NC_014171	ACC	2	6	224647	224652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_014171	TAT	2	6	224663	224668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014171	TA	3	6	224676	224681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014171	AGTA	2	8	224734	224741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014171	TAAA	2	8	224766	224773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_014171	AG	3	6	224791	224796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_014171	TAAA	2	8	224872	224879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_014171	TTA	2	6	224892	224897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_014171	A	7	7	224899	224905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_014171	A	7	7	224909	224915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_014171	TAA	2	6	224919	224924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014171	TAA	2	6	224949	224954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_014171	ACGTT	2	10	224980	224989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_014171	GGA	2	6	225070	225075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296501047
5078	NC_014171	GTA	2	6	225144	225149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501047
5079	NC_014171	AAAAGA	2	12	225207	225218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296501047
5080	NC_014171	GTA	2	6	225295	225300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501048
5081	NC_014171	A	6	6	225363	225368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_014171	AGT	2	6	225446	225451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501049
5083	NC_014171	AAG	2	6	225518	225523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_014171	GTA	2	6	225598	225603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501050
5085	NC_014171	CAAA	2	8	225660	225667	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_014171	A	6	6	225665	225670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_014171	TTA	2	6	225728	225733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501051
5088	NC_014171	CAT	2	6	225762	225767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501051
5089	NC_014171	TATTC	2	10	225769	225778	20 %	60 %	0 %	20 %	296501051
5090	NC_014171	AT	3	6	225801	225806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_014171	A	8	8	225821	225828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_014171	AGTA	2	8	225847	225854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014171	T	6	6	225872	225877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014171	TTC	2	6	225881	225886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_014171	AAT	2	6	225970	225975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014171	A	6	6	226016	226021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_014171	A	7	7	226041	226047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014171	CTAA	2	8	226102	226109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_014171	ATTA	2	8	226115	226122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_014171	GGTT	2	8	226140	226147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_014171	GGA	2	6	226231	226236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296501052
5102	NC_014171	T	6	6	226238	226243	0 %	100 %	0 %	0 %	296501052
5103	NC_014171	TTA	2	6	226300	226305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501052
5104	NC_014171	A	7	7	226392	226398	100 %	0 %	0 %	0 %	296501052
5105	NC_014171	AGT	2	6	226427	226432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501052
5106	NC_014171	ACT	2	6	226489	226494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501052
5107	NC_014171	TGA	2	6	226498	226503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501052
5108	NC_014171	GTG	2	6	226536	226541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296501052
5109	NC_014171	A	6	6	226592	226597	100 %	0 %	0 %	0 %	296501052
5110	NC_014171	A	6	6	226752	226757	100 %	0 %	0 %	0 %	296501052
5111	NC_014171	GTTA	2	8	226769	226776	25 %	50 %	25 %	0 %	296501052
5112	NC_014171	TGA	3	9	226816	226824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501052
5113	NC_014171	CAG	2	6	226905	226910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296501052
5114	NC_014171	ACA	2	6	226969	226974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296501052
5115	NC_014171	TTA	2	6	226982	226987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501052
5116	NC_014171	TTA	2	6	227059	227064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501052
5117	NC_014171	TGA	2	6	227065	227070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501052
5118	NC_014171	GAA	2	6	227099	227104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501052
5119	NC_014171	TAG	2	6	227133	227138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501052
5120	NC_014171	TGA	3	9	227143	227151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501052
5121	NC_014171	TTAC	2	8	227155	227162	25 %	50 %	0 %	25 %	296501052
5122	NC_014171	TTTA	2	8	227200	227207	25 %	75 %	0 %	0 %	296501052
5123	NC_014171	CCA	2	6	227321	227326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_014171	TGG	2	6	227343	227348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014171	AGG	2	6	227365	227370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014171	CTTC	2	8	227399	227406	0 %	50 %	0 %	50 %	296501053
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5252	NC_014171	TAA	2	6	232186	232191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296501056
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5255	NC_014171	T	6	6	232358	232363	0 %	100 %	0 %	0 %	296501056
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5368	NC_014171	GAAA	2	8	237127	237134	75 %	0 %	25 %	0 %	296501059
5369	NC_014171	CAT	2	6	237136	237141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501059
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5371	NC_014171	A	8	8	237161	237168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_014171	T	8	8	237194	237201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_014171	TAC	2	6	237219	237224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5374	NC_014171	ATA	2	6	237225	237230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5376	NC_014171	CATCTC	2	12	237305	237316	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296501060
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5488	NC_014171	TAGT	2	8	241770	241777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5491	NC_014171	TGTTT	2	10	241806	241815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_014171	TAT	2	6	241876	241881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5494	NC_014171	GT	3	6	241909	241914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_014171	ACT	2	6	241957	241962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5497	NC_014171	AGC	2	6	242187	242192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296501065
5498	NC_014171	TTAG	2	8	242209	242216	25 %	50 %	25 %	0 %	296501065
5499	NC_014171	G	6	6	242218	242223	0 %	0 %	100 %	0 %	296501065
5500	NC_014171	GTT	2	6	242276	242281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296501066

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