MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301 chromosome

Total Repeats: 54917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014169	CAGCGG	2	12	64938	64949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296453232
1502	NC_014169	GTAACG	2	12	64951	64962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296453232
1503	NC_014169	GAT	2	6	64966	64971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453232
1504	NC_014169	CAA	3	9	64995	65003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453232
1505	NC_014169	TCA	2	6	65037	65042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453232
1506	NC_014169	GGT	2	6	65058	65063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453232
1507	NC_014169	CGG	2	6	65079	65084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453232
1508	NC_014169	TGA	2	6	65096	65101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453232
1509	NC_014169	CGG	2	6	65129	65134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453232
1510	NC_014169	CGC	2	6	65180	65185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453232
1511	NC_014169	CCG	2	6	65333	65338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453232
1512	NC_014169	TGC	2	6	65342	65347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453232
1513	NC_014169	GAG	2	6	65392	65397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453232
1514	NC_014169	GGCA	2	8	65418	65425	25 %	0 %	50 %	25 %	296453233
1515	NC_014169	GCG	2	6	65431	65436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453233
1516	NC_014169	GAC	2	6	65490	65495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1517	NC_014169	GGC	2	6	65507	65512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453233
1518	NC_014169	CAG	2	6	65528	65533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1519	NC_014169	CGT	2	6	65544	65549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1520	NC_014169	GGCA	2	8	65593	65600	25 %	0 %	50 %	25 %	296453233
1521	NC_014169	CTG	2	6	65619	65624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1522	NC_014169	TGG	2	6	65670	65675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453233
1523	NC_014169	GAGC	2	8	65691	65698	25 %	0 %	50 %	25 %	296453233
1524	NC_014169	ACC	2	6	65709	65714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453233
1525	NC_014169	CAA	2	6	65741	65746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453233
1526	NC_014169	AGG	2	6	65776	65781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453233
1527	NC_014169	CAC	2	6	65885	65890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453233
1528	NC_014169	AGC	2	6	65896	65901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1529	NC_014169	ACC	2	6	65931	65936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453233
1530	NC_014169	TCGCCG	2	12	65962	65973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296453233
1531	NC_014169	CAT	2	6	66035	66040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453233
1532	NC_014169	TGC	2	6	66094	66099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1533	NC_014169	CCA	2	6	66151	66156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453233
1534	NC_014169	CCACCC	2	12	66196	66207	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	296453233
1535	NC_014169	CTA	2	6	66277	66282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453233
1536	NC_014169	CCA	2	6	66310	66315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453233
1537	NC_014169	GGT	2	6	66359	66364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453233
1538	NC_014169	GC	3	6	66370	66375	0 %	0 %	50 %	50 %	296453233
1539	NC_014169	CGC	2	6	66401	66406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453233
1540	NC_014169	TGC	2	6	66430	66435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1541	NC_014169	CG	3	6	66444	66449	0 %	0 %	50 %	50 %	296453233
1542	NC_014169	CGC	2	6	66459	66464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453233
1543	NC_014169	GCT	3	9	66527	66535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1544	NC_014169	CTG	3	9	66540	66548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1545	NC_014169	GCC	2	6	66555	66560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453233
1546	NC_014169	GCG	2	6	66561	66566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453233
1547	NC_014169	GCC	3	9	66591	66599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453233
1548	NC_014169	CAG	2	6	66615	66620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453233
1549	NC_014169	TGG	3	9	66720	66728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453234
1550	NC_014169	ACG	2	6	66804	66809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453234
1551	NC_014169	CCCGG	2	10	66866	66875	0 %	0 %	40 %	60 %	296453234
1552	NC_014169	GCG	2	6	66930	66935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453234
1553	NC_014169	CAT	2	6	67012	67017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453234
1554	NC_014169	TGG	2	6	67140	67145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453234
1555	NC_014169	TCAAGG	2	12	67185	67196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296453234
1556	NC_014169	TGA	2	6	67236	67241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453234
1557	NC_014169	GTCG	2	8	67309	67316	0 %	25 %	50 %	25 %	296453234
1558	NC_014169	CG	4	8	67349	67356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_014169	AGGGG	2	10	67406	67415	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014169	CCCCT	2	10	67424	67433	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1561	NC_014169	TG	3	6	67440	67445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014169	TGCGT	2	10	67497	67506	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1563	NC_014169	AC	4	8	67514	67521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_014169	CTCA	3	12	67530	67541	25 %	25 %	0 %	50 %	296453235
1565	NC_014169	C	6	6	67551	67556	0 %	0 %	0 %	100 %	296453235
1566	NC_014169	GTT	2	6	67563	67568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453235
1567	NC_014169	CCGTTG	2	12	67573	67584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453235
1568	NC_014169	CCGTTG	2	12	67591	67602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453235
1569	NC_014169	TGC	2	6	67634	67639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453235
1570	NC_014169	CGG	2	6	67778	67783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453235
1571	NC_014169	CTG	2	6	67971	67976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453235
1572	NC_014169	GACC	2	8	67997	68004	25 %	0 %	25 %	50 %	296453235
1573	NC_014169	GGT	2	6	68019	68024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453235
1574	NC_014169	GAA	2	6	68032	68037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453235
1575	NC_014169	AT	3	6	68040	68045	50 %	50 %	0 %	0 %	296453235
1576	NC_014169	TGG	2	6	68051	68056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453235
1577	NC_014169	CGG	2	6	68078	68083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453235
1578	NC_014169	TGC	2	6	68177	68182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453235
1579	NC_014169	GC	3	6	68181	68186	0 %	0 %	50 %	50 %	296453235
1580	NC_014169	TC	3	6	68367	68372	0 %	50 %	0 %	50 %	296453235
1581	NC_014169	AGCTTG	2	12	68374	68385	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296453235
1582	NC_014169	TGT	2	6	68387	68392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453235
1583	NC_014169	TTG	2	6	68449	68454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453235
1584	NC_014169	ATG	2	6	68476	68481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453235
1585	NC_014169	CGC	2	6	68508	68513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1586	NC_014169	GAT	3	9	68526	68534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453235
1587	NC_014169	CTT	2	6	68535	68540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453235
1588	NC_014169	CTT	2	6	68544	68549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453235
1589	NC_014169	GCC	3	9	68557	68565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1590	NC_014169	GCT	2	6	68570	68575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453235
1591	NC_014169	CGC	2	6	68592	68597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1592	NC_014169	TGGG	2	8	68659	68666	0 %	25 %	75 %	0 %	296453235
1593	NC_014169	CTG	3	9	68667	68675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453235
1594	NC_014169	GTG	2	6	68689	68694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453235
1595	NC_014169	GCC	2	6	68761	68766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1596	NC_014169	CGC	2	6	68774	68779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1597	NC_014169	CAC	2	6	68895	68900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453235
1598	NC_014169	GGC	2	6	68908	68913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453235
1599	NC_014169	CGG	2	6	68970	68975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453235
1600	NC_014169	CGG	2	6	69008	69013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453235
1601	NC_014169	CGC	2	6	69044	69049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1602	NC_014169	GC	3	6	69048	69053	0 %	0 %	50 %	50 %	296453235
1603	NC_014169	CAC	2	6	69084	69089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453235
1604	NC_014169	TGG	2	6	69107	69112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453235
1605	NC_014169	ATG	2	6	69181	69186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453235
1606	NC_014169	ATGCG	2	10	69220	69229	20 %	20 %	40 %	20 %	296453235
1607	NC_014169	GCTG	2	8	69278	69285	0 %	25 %	50 %	25 %	296453235
1608	NC_014169	TGA	2	6	69302	69307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453235
1609	NC_014169	CGC	2	6	69368	69373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1610	NC_014169	GAA	2	6	69379	69384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453235
1611	NC_014169	TTC	2	6	69390	69395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453235
1612	NC_014169	GTT	2	6	69426	69431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453235
1613	NC_014169	CGG	2	6	69457	69462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453235
1614	NC_014169	GTC	2	6	69480	69485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453235
1615	NC_014169	GC	3	6	69499	69504	0 %	0 %	50 %	50 %	296453235
1616	NC_014169	GCC	2	6	69567	69572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1617	NC_014169	CCG	2	6	69604	69609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453235
1618	NC_014169	TCCC	2	8	69646	69653	0 %	25 %	0 %	75 %	296453236
1619	NC_014169	GCGTG	2	10	69683	69692	0 %	20 %	60 %	20 %	296453236
1620	NC_014169	TGG	2	6	69733	69738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453236
1621	NC_014169	CTG	2	6	69755	69760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453236
1622	NC_014169	CAG	2	6	69764	69769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453236
1623	NC_014169	ACC	2	6	69801	69806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453236
1624	NC_014169	GCG	2	6	69921	69926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453236
1625	NC_014169	GTG	2	6	69939	69944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453236
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1749	NC_014169	GTC	2	6	75173	75178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453239
1750	NC_014169	GGA	2	6	75212	75217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453239
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1752	NC_014169	AGG	2	6	75283	75288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453239
1753	NC_014169	CG	3	6	75302	75307	0 %	0 %	50 %	50 %	296453239
1754	NC_014169	GTG	2	6	75330	75335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453239
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1765	NC_014169	GCG	2	6	75722	75727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453240
1766	NC_014169	GGCCTT	2	12	75747	75758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453240
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1769	NC_014169	GCCA	2	8	75841	75848	25 %	0 %	25 %	50 %	296453240
1770	NC_014169	CAG	2	6	75861	75866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453240
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1772	NC_014169	ACT	2	6	75940	75945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453241
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1787	NC_014169	A	6	6	76696	76701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1788	NC_014169	GCG	2	6	76770	76775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1820	NC_014169	CCGT	2	8	78101	78108	0 %	25 %	25 %	50 %	296453242
1821	NC_014169	GAGC	2	8	78146	78153	25 %	0 %	50 %	25 %	296453242
1822	NC_014169	ATC	2	6	78164	78169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453242
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1830	NC_014169	GCG	2	6	78494	78499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453242
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1843	NC_014169	CGG	2	6	79023	79028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453242
1844	NC_014169	CGGC	2	8	79039	79046	0 %	0 %	50 %	50 %	296453242
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1846	NC_014169	CG	3	6	79081	79086	0 %	0 %	50 %	50 %	296453242
1847	NC_014169	TCG	2	6	79122	79127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453242
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1849	NC_014169	CAT	2	6	79291	79296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453242
1850	NC_014169	GCG	2	6	79338	79343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1851	NC_014169	GAT	2	6	79380	79385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453243
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1853	NC_014169	GTG	2	6	79420	79425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453243
1854	NC_014169	GAG	2	6	79450	79455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453243
1855	NC_014169	TCCG	2	8	79467	79474	0 %	25 %	25 %	50 %	296453243
1856	NC_014169	CCG	3	9	79472	79480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453243
1857	NC_014169	CGG	2	6	79524	79529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453243
1858	NC_014169	CGC	2	6	79563	79568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453243
1859	NC_014169	CCG	2	6	79601	79606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453243
1860	NC_014169	TCA	2	6	79625	79630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453243
1861	NC_014169	ACG	2	6	79661	79666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453243
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1863	NC_014169	CG	4	8	79737	79744	0 %	0 %	50 %	50 %	296453243
1864	NC_014169	TGA	2	6	79773	79778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453243
1865	NC_014169	CAG	2	6	79828	79833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453243
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1867	NC_014169	GC	3	6	80000	80005	0 %	0 %	50 %	50 %	296453243
1868	NC_014169	AAG	2	6	80026	80031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453243
1869	NC_014169	GT	3	6	80033	80038	0 %	50 %	50 %	0 %	296453243
1870	NC_014169	GCG	2	6	80158	80163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453243
1871	NC_014169	TGC	2	6	80243	80248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453243
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1998	NC_014169	GAT	2	6	85826	85831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453248
1999	NC_014169	ACA	2	6	85860	85865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453248
2000	NC_014169	TGCC	2	8	85881	85888	0 %	25 %	25 %	50 %	296453248

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