MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301 chromosome

Total Repeats: 54917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014169	GTC	2	6	43927	43932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1002	NC_014169	CGGG	2	8	43963	43970	0 %	0 %	75 %	25 %	296453217
1003	NC_014169	GCA	2	6	43980	43985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1004	NC_014169	GCG	2	6	44001	44006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1005	NC_014169	TCG	2	6	44075	44080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1006	NC_014169	GCA	2	6	44151	44156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1007	NC_014169	CGC	2	6	44161	44166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453217
1008	NC_014169	ACCG	2	8	44266	44273	25 %	0 %	25 %	50 %	296453217
1009	NC_014169	CG	3	6	44287	44292	0 %	0 %	50 %	50 %	296453217
1010	NC_014169	GCC	3	9	44302	44310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453217
1011	NC_014169	CGAC	2	8	44312	44319	25 %	0 %	25 %	50 %	296453217
1012	NC_014169	CCG	2	6	44324	44329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453217
1013	NC_014169	GAG	2	6	44438	44443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453217
1014	NC_014169	TTG	2	6	44471	44476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453217
1015	NC_014169	GCT	2	6	44559	44564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1016	NC_014169	TGG	2	6	44586	44591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453217
1017	NC_014169	TCC	2	6	44597	44602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453217
1018	NC_014169	GAT	2	6	44671	44676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453217
1019	NC_014169	GCG	2	6	44680	44685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1020	NC_014169	GGC	2	6	44686	44691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1021	NC_014169	CGC	2	6	44769	44774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453217
1022	NC_014169	CAC	2	6	44824	44829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453217
1023	NC_014169	CCA	2	6	44853	44858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453217
1024	NC_014169	CAGAT	2	10	44885	44894	40 %	20 %	20 %	20 %	296453217
1025	NC_014169	CGG	3	9	44928	44936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1026	NC_014169	ACC	2	6	44951	44956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453217
1027	NC_014169	GTC	2	6	44974	44979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1028	NC_014169	CG	3	6	45052	45057	0 %	0 %	50 %	50 %	296453217
1029	NC_014169	TGG	2	6	45069	45074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453217
1030	NC_014169	GGC	2	6	45082	45087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1031	NC_014169	CGCT	2	8	45101	45108	0 %	25 %	25 %	50 %	296453217
1032	NC_014169	TGG	2	6	45119	45124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453217
1033	NC_014169	CGG	2	6	45151	45156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1034	NC_014169	GCG	2	6	45215	45220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1035	NC_014169	GAA	2	6	45319	45324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453217
1036	NC_014169	CGA	2	6	45342	45347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1037	NC_014169	GTC	2	6	45373	45378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1038	NC_014169	CTT	2	6	45466	45471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453217
1039	NC_014169	CTT	2	6	45535	45540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453217
1040	NC_014169	GCC	2	6	45547	45552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453217
1041	NC_014169	CTC	2	6	45565	45570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453217
1042	NC_014169	CGG	2	6	45587	45592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1043	NC_014169	CGG	2	6	45614	45619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1044	NC_014169	CCTTGG	2	12	45675	45686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1045	NC_014169	TGA	2	6	45702	45707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453217
1046	NC_014169	TGG	2	6	45710	45715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453217
1047	NC_014169	GTT	2	6	45766	45771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453217
1048	NC_014169	CAG	2	6	45853	45858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1049	NC_014169	CGT	2	6	45864	45869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1050	NC_014169	TGT	2	6	45879	45884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453217
1051	NC_014169	CCT	2	6	45900	45905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453217
1052	NC_014169	CAG	2	6	46000	46005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453217
1053	NC_014169	CTC	2	6	46090	46095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453217
1054	NC_014169	GGC	2	6	46129	46134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453217
1055	NC_014169	TTC	2	6	46153	46158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453217
1056	NC_014169	CCT	2	6	46175	46180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_014169	GTC	2	6	46211	46216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014169	CTC	2	6	46222	46227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_014169	GTT	2	6	46232	46237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014169	GTT	2	6	46278	46283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014169	AGT	2	6	46449	46454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014169	AGA	2	6	46475	46480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453218
1063	NC_014169	A	7	7	46480	46486	100 %	0 %	0 %	0 %	296453218
1064	NC_014169	GGT	2	6	46584	46589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453218
1065	NC_014169	CGC	2	6	46602	46607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453218
1066	NC_014169	CGTG	2	8	46671	46678	0 %	25 %	50 %	25 %	296453218
1067	NC_014169	ATG	2	6	46681	46686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453218
1068	NC_014169	ACC	2	6	46801	46806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453218
1069	NC_014169	GCT	2	6	46830	46835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453218
1070	NC_014169	CTG	2	6	46955	46960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453218
1071	NC_014169	GGC	2	6	47004	47009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453218
1072	NC_014169	GAT	2	6	47086	47091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453218
1073	NC_014169	GAA	2	6	47098	47103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453218
1074	NC_014169	ACG	2	6	47174	47179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453218
1075	NC_014169	CCG	2	6	47246	47251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453218
1076	NC_014169	CTG	2	6	47258	47263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453218
1077	NC_014169	CGA	2	6	47328	47333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453218
1078	NC_014169	CGG	3	9	47472	47480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453218
1079	NC_014169	TTC	2	6	47566	47571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453218
1080	NC_014169	TG	3	6	47580	47585	0 %	50 %	50 %	0 %	296453218
1081	NC_014169	CGG	2	6	47594	47599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453218
1082	NC_014169	TCA	2	6	47711	47716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453218
1083	NC_014169	CGG	2	6	47718	47723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453218
1084	NC_014169	CAT	2	6	47784	47789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453218
1085	NC_014169	GCCGTG	2	12	47815	47826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296453218
1086	NC_014169	TGCACC	2	12	47831	47842	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296453218
1087	NC_014169	TGC	2	6	47888	47893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453218
1088	NC_014169	GGC	2	6	47901	47906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453218
1089	NC_014169	TCG	2	6	47909	47914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453218
1090	NC_014169	CGC	2	6	47945	47950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453218
1091	NC_014169	GCC	3	9	47965	47973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453218
1092	NC_014169	GGCGT	2	10	48081	48090	0 %	20 %	60 %	20 %	296453218
1093	NC_014169	TGGC	2	8	48105	48112	0 %	25 %	50 %	25 %	296453218
1094	NC_014169	CCG	2	6	48115	48120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453218
1095	NC_014169	TCTG	2	8	48269	48276	0 %	50 %	25 %	25 %	296453218
1096	NC_014169	GTG	2	6	48301	48306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453218
1097	NC_014169	CGC	2	6	48483	48488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_014169	CTG	2	6	48601	48606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453219
1099	NC_014169	CTC	3	9	48669	48677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453219
1100	NC_014169	GCGG	2	8	48691	48698	0 %	0 %	75 %	25 %	296453219
1101	NC_014169	GCG	2	6	48701	48706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453219
1102	NC_014169	GGCT	2	8	48754	48761	0 %	25 %	50 %	25 %	296453219
1103	NC_014169	GGCCT	2	10	48778	48787	0 %	20 %	40 %	40 %	296453219
1104	NC_014169	CTT	2	6	48921	48926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453219
1105	NC_014169	AAG	2	6	48946	48951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453219
1106	NC_014169	CCA	2	6	48962	48967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453219
1107	NC_014169	ATC	2	6	48979	48984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453219
1108	NC_014169	TTC	2	6	48991	48996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453219
1109	NC_014169	GCT	2	6	49013	49018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453219
1110	NC_014169	GTT	2	6	49047	49052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453219
1111	NC_014169	ATG	2	6	49072	49077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453219
1112	NC_014169	ATC	2	6	49078	49083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453219
1113	NC_014169	GGT	2	6	49089	49094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453219
1114	NC_014169	GTG	2	6	49111	49116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453219
1115	NC_014169	GGC	2	6	49117	49122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453219
1116	NC_014169	GTG	2	6	49132	49137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453219
1117	NC_014169	TTCA	2	8	49147	49154	25 %	50 %	0 %	25 %	296453219
1118	NC_014169	TTC	2	6	49168	49173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453219
1119	NC_014169	GGT	2	6	49182	49187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453219
1120	NC_014169	GCGG	2	8	49210	49217	0 %	0 %	75 %	25 %	296453219
1121	NC_014169	ACA	2	6	49223	49228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453219
1122	NC_014169	CAG	2	6	49309	49314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453219
1123	NC_014169	TCG	2	6	49316	49321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453219
1124	NC_014169	GC	3	6	49343	49348	0 %	0 %	50 %	50 %	296453219
1125	NC_014169	CAT	2	6	49362	49367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453219
1126	NC_014169	CAT	2	6	49371	49376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453219
1127	NC_014169	GAA	2	6	49453	49458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453219
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1130	NC_014169	TGG	2	6	49529	49534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453219
1131	NC_014169	GC	3	6	49536	49541	0 %	0 %	50 %	50 %	296453219
1132	NC_014169	GAT	2	6	49542	49547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453219
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1134	NC_014169	CTG	2	6	49609	49614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453219
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1138	NC_014169	ATC	2	6	49687	49692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453219
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1152	NC_014169	CTG	2	6	50228	50233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_014169	T	6	6	50264	50269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_014169	CGG	2	6	50385	50390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_014169	TGGCGT	2	12	50393	50404	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1156	NC_014169	GAT	2	6	50432	50437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_014169	CGG	2	6	50465	50470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1158	NC_014169	GACT	2	8	50530	50537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1159	NC_014169	TTA	2	6	50547	50552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296453220
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1184	NC_014169	CGC	2	6	51728	51733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1224	NC_014169	T	7	7	53479	53485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1230	NC_014169	GC	3	6	53863	53868	0 %	0 %	50 %	50 %	296453222
1231	NC_014169	TTG	2	6	53869	53874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453222
1232	NC_014169	CGT	2	6	53876	53881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453222
1233	NC_014169	CGGCG	2	10	53921	53930	0 %	0 %	60 %	40 %	296453222
1234	NC_014169	CGG	2	6	54050	54055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453222
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1237	NC_014169	GCG	2	6	54105	54110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453222
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1239	NC_014169	CTT	2	6	54129	54134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453222
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1242	NC_014169	CAGA	2	8	54236	54243	50 %	0 %	25 %	25 %	296453222
1243	NC_014169	GGC	2	6	54246	54251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453222
1244	NC_014169	TTC	2	6	54271	54276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453222
1245	NC_014169	CGG	2	6	54298	54303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453222
1246	NC_014169	AGA	2	6	54371	54376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453222
1247	NC_014169	AGC	2	6	54409	54414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453222
1248	NC_014169	GCA	3	9	54506	54514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453222
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1250	NC_014169	CGG	2	6	54533	54538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453222
1251	NC_014169	CAT	2	6	54549	54554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453222
1252	NC_014169	CGG	2	6	54575	54580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453222
1253	NC_014169	GGT	2	6	54627	54632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453222
1254	NC_014169	CGGT	2	8	54637	54644	0 %	25 %	50 %	25 %	296453222
1255	NC_014169	GAT	3	9	54663	54671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453222
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1259	NC_014169	GAC	2	6	54781	54786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453222
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1262	NC_014169	TGC	2	6	54877	54882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453222
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1265	NC_014169	TTG	2	6	54986	54991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1372	NC_014169	TCG	2	6	59463	59468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1373	NC_014169	CGA	2	6	59497	59502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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