MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301 chromosome

Total Repeats: 54917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014169	CCTC	2	8	21926	21933	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
502	NC_014169	CTG	2	6	21967	21972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_014169	TGGGT	2	10	21979	21988	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014169	TGG	2	6	21998	22003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014169	CCG	2	6	22017	22022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_014169	CGG	2	6	22023	22028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014169	GTG	2	6	22058	22063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014169	TGT	2	6	22099	22104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014169	TTC	2	6	22143	22148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_014169	CGC	2	6	22165	22170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_014169	GCGCT	2	10	22205	22214	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
512	NC_014169	ACGG	2	8	22226	22233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
513	NC_014169	CTG	2	6	22276	22281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_014169	CAT	2	6	22287	22292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014169	GAG	2	6	22342	22347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014169	G	10	10	22349	22358	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014169	GCCG	2	8	22377	22384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_014169	GAG	2	6	22416	22421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453202
519	NC_014169	TCG	2	6	22456	22461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453202
520	NC_014169	TCT	2	6	22496	22501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453202
521	NC_014169	GTC	2	6	22509	22514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453202
522	NC_014169	AGC	2	6	22522	22527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453202
523	NC_014169	AGC	2	6	22586	22591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453202
524	NC_014169	TG	3	6	22621	22626	0 %	50 %	50 %	0 %	296453202
525	NC_014169	TTG	2	6	22631	22636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453202
526	NC_014169	CCG	2	6	22638	22643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453202
527	NC_014169	CGT	2	6	22675	22680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453203
528	NC_014169	GCC	2	6	22729	22734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453203
529	NC_014169	CATC	2	8	22758	22765	25 %	25 %	0 %	50 %	296453203
530	NC_014169	CCG	2	6	22813	22818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453203
531	NC_014169	CAG	3	9	22909	22917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453203
532	NC_014169	CAT	2	6	22944	22949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453203
533	NC_014169	ATG	2	6	23012	23017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453203
534	NC_014169	GCCG	2	8	23026	23033	0 %	0 %	50 %	50 %	296453203
535	NC_014169	GTC	2	6	23054	23059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453203
536	NC_014169	GCCGG	2	10	23074	23083	0 %	0 %	60 %	40 %	296453203
537	NC_014169	CGA	2	6	23136	23141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453203
538	NC_014169	GCG	2	6	23155	23160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453203
539	NC_014169	CGC	2	6	23172	23177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453203
540	NC_014169	GCT	2	6	23187	23192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453203
541	NC_014169	CGGC	2	8	23214	23221	0 %	0 %	50 %	50 %	296453203
542	NC_014169	CA	3	6	23226	23231	50 %	0 %	0 %	50 %	296453203
543	NC_014169	CGC	2	6	23273	23278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453203
544	NC_014169	CCGCAT	2	12	23286	23297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296453203
545	NC_014169	CGC	2	6	23398	23403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453203
546	NC_014169	CCTA	2	8	23411	23418	25 %	25 %	0 %	50 %	296453203
547	NC_014169	CCG	2	6	23451	23456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453203
548	NC_014169	GTG	2	6	23458	23463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453203
549	NC_014169	TTCG	2	8	23522	23529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_014169	CCA	2	6	23545	23550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_014169	GCC	2	6	23559	23564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453204
552	NC_014169	CGA	2	6	23579	23584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453204
553	NC_014169	CGC	2	6	23612	23617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453204
554	NC_014169	CGA	2	6	23624	23629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453204
555	NC_014169	GCC	2	6	23637	23642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453204
556	NC_014169	CCG	2	6	23650	23655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453204
557	NC_014169	GAA	2	6	23675	23680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453204
558	NC_014169	GTG	2	6	23712	23717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453204
559	NC_014169	CGA	2	6	23741	23746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453204
560	NC_014169	TGC	2	6	23797	23802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453204
561	NC_014169	GGCCGT	2	12	23888	23899	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296453204
562	NC_014169	TC	3	6	23926	23931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_014169	GCG	2	6	23962	23967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_014169	CGA	2	6	23971	23976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_014169	ACCA	2	8	24068	24075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_014169	CCAG	2	8	24078	24085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
567	NC_014169	GACC	2	8	24094	24101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
568	NC_014169	TTG	2	6	24156	24161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014169	CAGG	2	8	24211	24218	25 %	0 %	50 %	25 %	296453205
570	NC_014169	GCA	2	6	24355	24360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453205
571	NC_014169	CTT	2	6	24404	24409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453205
572	NC_014169	TGT	2	6	24412	24417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453205
573	NC_014169	AGT	2	6	24418	24423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453205
574	NC_014169	CGT	2	6	24556	24561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453205
575	NC_014169	TCT	2	6	24789	24794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453205
576	NC_014169	GC	3	6	24797	24802	0 %	0 %	50 %	50 %	296453205
577	NC_014169	ACGA	2	8	24882	24889	50 %	0 %	25 %	25 %	296453205
578	NC_014169	GGCA	2	8	24899	24906	25 %	0 %	50 %	25 %	296453205
579	NC_014169	GCC	2	6	24908	24913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453205
580	NC_014169	TGA	2	6	24951	24956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453205
581	NC_014169	CGT	2	6	25012	25017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453205
582	NC_014169	TGC	2	6	25026	25031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453205
583	NC_014169	CAG	2	6	25035	25040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453205
584	NC_014169	CAT	2	6	25159	25164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453205
585	NC_014169	TCA	2	6	25273	25278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453205
586	NC_014169	AAT	2	6	25308	25313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296453205
587	NC_014169	TGA	2	6	25384	25389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453205
588	NC_014169	CAG	2	6	25424	25429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453205
589	NC_014169	GCA	2	6	25486	25491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453205
590	NC_014169	TATG	2	8	25646	25653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014169	CT	3	6	25660	25665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_014169	GAT	2	6	25787	25792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453206
593	NC_014169	GTC	2	6	25841	25846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453206
594	NC_014169	CTC	2	6	25889	25894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453206
595	NC_014169	CG	3	6	25955	25960	0 %	0 %	50 %	50 %	296453206
596	NC_014169	GCC	2	6	25973	25978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453206
597	NC_014169	CGG	2	6	25996	26001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453206
598	NC_014169	TCG	2	6	26004	26009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453206
599	NC_014169	GTGC	2	8	26089	26096	0 %	25 %	50 %	25 %	296453206
600	NC_014169	CCT	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453206
601	NC_014169	GATGGC	2	12	26144	26155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296453206
602	NC_014169	TCA	2	6	26172	26177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453206
603	NC_014169	CAA	2	6	26188	26193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453206
604	NC_014169	CTT	2	6	26214	26219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_014169	CGAA	2	8	26274	26281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_014169	GGT	2	6	26284	26289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014169	TCG	2	6	26313	26318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453207
608	NC_014169	GCG	2	6	26387	26392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453207
609	NC_014169	TGA	2	6	26407	26412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453207
610	NC_014169	TGT	2	6	26416	26421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453207
611	NC_014169	CGT	2	6	26425	26430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453207
612	NC_014169	GCA	2	6	26437	26442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453207
613	NC_014169	TCC	2	6	26511	26516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453207
614	NC_014169	GTG	2	6	26601	26606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453207
615	NC_014169	CGC	2	6	26611	26616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453207
616	NC_014169	CTC	2	6	26663	26668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453207
617	NC_014169	CCGT	2	8	26694	26701	0 %	25 %	25 %	50 %	296453207
618	NC_014169	TCG	2	6	26712	26717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453207
619	NC_014169	GATG	2	8	26731	26738	25 %	25 %	50 %	0 %	296453207
620	NC_014169	GCA	2	6	26749	26754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453207
621	NC_014169	GCA	2	6	26767	26772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453207
622	NC_014169	CAC	2	6	26807	26812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453207
623	NC_014169	CAG	2	6	26849	26854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453207
624	NC_014169	CGT	2	6	26881	26886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453207
625	NC_014169	CGG	2	6	26941	26946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453207
626	NC_014169	CGA	2	6	27010	27015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453207
627	NC_014169	TCG	3	9	27102	27110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453207
628	NC_014169	CTG	2	6	27128	27133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453207
629	NC_014169	GAT	2	6	27188	27193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453207
630	NC_014169	GGC	2	6	27196	27201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453207
631	NC_014169	CGG	2	6	27205	27210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453207
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634	NC_014169	GAT	2	6	27314	27319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453207
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650	NC_014169	CGC	2	6	27935	27940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453208
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663	NC_014169	GCA	2	6	28658	28663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453209
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753	NC_014169	CTG	2	6	32067	32072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
754	NC_014169	TAG	2	6	32080	32085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
755	NC_014169	TGA	2	6	32184	32189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
756	NC_014169	CG	3	6	32240	32245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
757	NC_014169	GGT	3	9	32271	32279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
758	NC_014169	GAT	2	6	32314	32319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453211
759	NC_014169	GCA	2	6	32329	32334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453211
760	NC_014169	AAC	2	6	32369	32374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453211
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764	NC_014169	CTG	2	6	32624	32629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453211
765	NC_014169	ATGGC	2	10	32661	32670	20 %	20 %	40 %	20 %	296453211
766	NC_014169	GCG	2	6	32676	32681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453211
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770	NC_014169	CT	3	6	32914	32919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
771	NC_014169	G	9	9	32946	32954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
772	NC_014169	AG	3	6	33020	33025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
773	NC_014169	CAA	2	6	33065	33070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453212
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778	NC_014169	CGG	2	6	33176	33181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453212
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783	NC_014169	CAG	2	6	33264	33269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453212
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788	NC_014169	CGG	3	9	33509	33517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453212
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820	NC_014169	CG	3	6	34695	34700	0 %	0 %	50 %	50 %	296453212
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828	NC_014169	GTT	2	6	35071	35076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
829	NC_014169	GCTGAT	2	12	35144	35155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296453213
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832	NC_014169	CGTG	2	8	35296	35303	0 %	25 %	50 %	25 %	296453213
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862	NC_014169	TGAT	2	8	36690	36697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
863	NC_014169	CAC	2	6	36801	36806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453214
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868	NC_014169	TG	4	8	37163	37170	0 %	50 %	50 %	0 %	296453215
869	NC_014169	CGA	2	6	37230	37235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453215
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873	NC_014169	GC	3	6	37426	37431	0 %	0 %	50 %	50 %	296453215
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880	NC_014169	GCAAGT	2	12	37625	37636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296453215
881	NC_014169	ACG	2	6	37637	37642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453215
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