MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 102688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014150	AAT	2	6	175599	175604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125195
5502	NC_014150	GA	3	6	175672	175677	50 %	0 %	50 %	0 %	296125195
5503	NC_014150	AGA	2	6	175697	175702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125195
5504	NC_014150	TTA	2	6	175766	175771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_014150	TATTT	2	10	175795	175804	20 %	80 %	0 %	0 %	296125196
5506	NC_014150	TA	3	6	175805	175810	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5507	NC_014150	T	8	8	175811	175818	0 %	100 %	0 %	0 %	296125196
5508	NC_014150	TC	3	6	175837	175842	0 %	50 %	0 %	50 %	296125196
5509	NC_014150	T	6	6	175844	175849	0 %	100 %	0 %	0 %	296125196
5510	NC_014150	T	7	7	175889	175895	0 %	100 %	0 %	0 %	296125196
5511	NC_014150	AAT	2	6	175911	175916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125196
5512	NC_014150	TGC	2	6	175924	175929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125196
5513	NC_014150	ATT	2	6	175953	175958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
5514	NC_014150	ATA	2	6	175959	175964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125196
5515	NC_014150	TTTTG	2	10	175971	175980	0 %	80 %	20 %	0 %	296125196
5516	NC_014150	AGC	2	6	175995	176000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125196
5517	NC_014150	TTA	2	6	176002	176007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
5518	NC_014150	AAT	2	6	176027	176032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125196
5519	NC_014150	AT	3	6	176053	176058	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5520	NC_014150	TCATAT	2	12	176071	176082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296125196
5521	NC_014150	CAT	2	6	176105	176110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125196
5522	NC_014150	ATA	2	6	176118	176123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125196
5523	NC_014150	T	7	7	176174	176180	0 %	100 %	0 %	0 %	296125196
5524	NC_014150	TCG	2	6	176191	176196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125196
5525	NC_014150	TAT	2	6	176204	176209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
5526	NC_014150	CTTT	2	8	176210	176217	0 %	75 %	0 %	25 %	296125196
5527	NC_014150	AGT	2	6	176222	176227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125196
5528	NC_014150	ATA	2	6	176240	176245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125196
5529	NC_014150	GAT	3	9	176261	176269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125196
5530	NC_014150	AT	3	6	176268	176273	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5531	NC_014150	ATT	2	6	176301	176306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
5532	NC_014150	TTA	2	6	176338	176343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
5533	NC_014150	TCT	2	6	176347	176352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125196
5534	NC_014150	ATC	2	6	176367	176372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125196
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5536	NC_014150	TTG	2	6	176420	176425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125196
5537	NC_014150	TAA	2	6	176426	176431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125196
5538	NC_014150	CAA	2	6	176445	176450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125196
5539	NC_014150	CTTT	2	8	176482	176489	0 %	75 %	0 %	25 %	296125196
5540	NC_014150	AT	4	8	176526	176533	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5541	NC_014150	TA	3	6	176565	176570	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5542	NC_014150	A	7	7	176570	176576	100 %	0 %	0 %	0 %	296125196
5543	NC_014150	ATC	2	6	176583	176588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125196
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5545	NC_014150	TTC	2	6	176625	176630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125196
5546	NC_014150	TTG	2	6	176656	176661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125196
5547	NC_014150	TCA	2	6	176686	176691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125196
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5549	NC_014150	ATT	3	9	176727	176735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
5550	NC_014150	TTC	2	6	176736	176741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125196
5551	NC_014150	ATC	2	6	176757	176762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125196
5552	NC_014150	A	7	7	176787	176793	100 %	0 %	0 %	0 %	296125196
5553	NC_014150	TCT	2	6	176836	176841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125196
5554	NC_014150	T	8	8	176885	176892	0 %	100 %	0 %	0 %	296125196
5555	NC_014150	AT	3	6	176922	176927	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5556	NC_014150	ATAA	2	8	176935	176942	75 %	25 %	0 %	0 %	296125196
5557	NC_014150	TAT	2	6	176981	176986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
5558	NC_014150	AT	3	6	176991	176996	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5559	NC_014150	CTT	2	6	177011	177016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125196
5560	NC_014150	TAA	2	6	177026	177031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125196
5561	NC_014150	ATA	3	9	177055	177063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125196
5562	NC_014150	AT	3	6	177068	177073	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5563	NC_014150	TA	3	6	177078	177083	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5564	NC_014150	T	7	7	177096	177102	0 %	100 %	0 %	0 %	296125196
5565	NC_014150	ATT	2	6	177108	177113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
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5571	NC_014150	TTA	2	6	177217	177222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125196
5572	NC_014150	T	7	7	177243	177249	0 %	100 %	0 %	0 %	296125196
5573	NC_014150	TA	4	8	177260	177267	50 %	50 %	0 %	0 %	296125196
5574	NC_014150	T	6	6	177268	177273	0 %	100 %	0 %	0 %	296125196
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5588	NC_014150	AAT	2	6	177583	177588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_014150	TAT	2	6	177589	177594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_014150	TAA	2	6	177731	177736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125197
5595	NC_014150	TAT	2	6	177753	177758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125197
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5602	NC_014150	TA	3	6	177957	177962	50 %	50 %	0 %	0 %	296125197
5603	NC_014150	TGAT	2	8	178001	178008	25 %	50 %	25 %	0 %	296125197
5604	NC_014150	GTCAAA	2	12	178011	178022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296125197
5605	NC_014150	A	6	6	178020	178025	100 %	0 %	0 %	0 %	296125197
5606	NC_014150	TCA	2	6	178099	178104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125197
5607	NC_014150	AT	3	6	178193	178198	50 %	50 %	0 %	0 %	296125197
5608	NC_014150	CTTC	2	8	178204	178211	0 %	50 %	0 %	50 %	296125197
5609	NC_014150	TGCCTT	2	12	178245	178256	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296125197
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5612	NC_014150	T	7	7	178428	178434	0 %	100 %	0 %	0 %	296125197
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