MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 plasmid pBC201

Total Repeats: 1306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014120	CAGC	2	8	196	203	25 %	0 %	25 %	50 %	295701108
2	NC_014120	TCCA	2	8	387	394	25 %	25 %	0 %	50 %	295701108
3	NC_014120	TCGG	2	8	595	602	0 %	25 %	50 %	25 %	295701108
4	NC_014120	CGAC	2	8	640	647	25 %	0 %	25 %	50 %	295701108
5	NC_014120	TCTG	2	8	938	945	0 %	50 %	25 %	25 %	295701108
6	NC_014120	TCGG	2	8	1355	1362	0 %	25 %	50 %	25 %	295701109
7	NC_014120	CCGA	2	8	1720	1727	25 %	0 %	25 %	50 %	295701111
8	NC_014120	GTCG	2	8	1788	1795	0 %	25 %	50 %	25 %	295701111
9	NC_014120	AGCA	2	8	1825	1832	50 %	0 %	25 %	25 %	295701111
10	NC_014120	ACCC	2	8	2234	2241	25 %	0 %	0 %	75 %	295701112
11	NC_014120	CCGC	2	8	2765	2772	0 %	0 %	25 %	75 %	295701113
12	NC_014120	CGCC	2	8	3045	3052	0 %	0 %	25 %	75 %	295701113
13	NC_014120	CGCC	2	8	3246	3253	0 %	0 %	25 %	75 %	295701113
14	NC_014120	GCGG	2	8	3583	3590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014120	GCTG	2	8	3608	3615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014120	CTTC	2	8	4167	4174	0 %	50 %	0 %	50 %	295701114
17	NC_014120	TCGC	2	8	4509	4516	0 %	25 %	25 %	50 %	295701115
18	NC_014120	TGCG	2	8	5922	5929	0 %	25 %	50 %	25 %	295701117
19	NC_014120	AGGC	2	8	6407	6414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014120	GAAA	2	8	6521	6528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014120	GCAG	2	8	6924	6931	25 %	0 %	50 %	25 %	295701118
22	NC_014120	GGTT	2	8	7028	7035	0 %	50 %	50 %	0 %	295701118
23	NC_014120	TAAA	2	8	7320	7327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014120	CGGC	2	8	7578	7585	0 %	0 %	50 %	50 %	295701119
25	NC_014120	TCAG	2	8	8192	8199	25 %	25 %	25 %	25 %	295701120
26	NC_014120	ACCA	2	8	8692	8699	50 %	0 %	0 %	50 %	295701120
27	NC_014120	GAAG	2	8	8940	8947	50 %	0 %	50 %	0 %	295701120
28	NC_014120	TGAT	2	8	9298	9305	25 %	50 %	25 %	0 %	295701120
29	NC_014120	CGGT	2	8	9803	9810	0 %	25 %	50 %	25 %	295701121
30	NC_014120	GATG	2	8	10249	10256	25 %	25 %	50 %	0 %	295701121
31	NC_014120	TTTC	2	8	11343	11350	0 %	75 %	0 %	25 %	295701124
32	NC_014120	AATG	2	8	11813	11820	50 %	25 %	25 %	0 %	295701124
33	NC_014120	CGTC	2	8	11922	11929	0 %	25 %	25 %	50 %	295701124
34	NC_014120	ATCC	2	8	12848	12855	25 %	25 %	0 %	50 %	295701125
35	NC_014120	CCGT	2	8	13182	13189	0 %	25 %	25 %	50 %	295701126
36	NC_014120	ACGT	2	8	13929	13936	25 %	25 %	25 %	25 %	295701126
37	NC_014120	GTGC	2	8	14023	14030	0 %	25 %	50 %	25 %	295701126
38	NC_014120	GCCG	2	8	14570	14577	0 %	0 %	50 %	50 %	295701127
39	NC_014120	CTGC	2	8	14592	14599	0 %	25 %	25 %	50 %	295701127
40	NC_014120	TCGC	2	8	14658	14665	0 %	25 %	25 %	50 %	295701127
41	NC_014120	GCGA	2	8	15864	15871	25 %	0 %	50 %	25 %	295701128
42	NC_014120	CCCG	2	8	16348	16355	0 %	0 %	25 %	75 %	295701129
43	NC_014120	CATC	2	8	16562	16569	25 %	25 %	0 %	50 %	295701129
44	NC_014120	ATCG	2	8	18774	18781	25 %	25 %	25 %	25 %	295701130
45	NC_014120	TCGG	2	8	19370	19377	0 %	25 %	50 %	25 %	295701131
46	NC_014120	CCGA	2	8	20575	20582	25 %	0 %	25 %	50 %	295701132
47	NC_014120	CGCC	2	8	21029	21036	0 %	0 %	25 %	75 %	295701132
48	NC_014120	GCGG	2	8	23575	23582	0 %	0 %	75 %	25 %	295701135
49	NC_014120	GCCG	2	8	24062	24069	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
50	NC_014120	ACCG	2	8	24135	24142	25 %	0 %	25 %	50 %	295701135
51	NC_014120	GAGT	2	8	24438	24445	25 %	25 %	50 %	0 %	295701136
52	NC_014120	CCGC	2	8	24581	24588	0 %	0 %	25 %	75 %	295701136
53	NC_014120	GCAT	2	8	24741	24748	25 %	25 %	25 %	25 %	295701136
54	NC_014120	CAGC	2	8	24842	24849	25 %	0 %	25 %	50 %	295701136
55	NC_014120	CGAC	2	8	24892	24899	25 %	0 %	25 %	50 %	295701136
56	NC_014120	GCCT	2	8	25025	25032	0 %	25 %	25 %	50 %	295701136
57	NC_014120	GGTC	2	8	26486	26493	0 %	25 %	50 %	25 %	295701138
58	NC_014120	GCAG	2	8	26617	26624	25 %	0 %	50 %	25 %	295701138
59	NC_014120	CCGG	2	8	26663	26670	0 %	0 %	50 %	50 %	295701138
60	NC_014120	CGGA	2	8	27218	27225	25 %	0 %	50 %	25 %	295701138
61	NC_014120	AGAT	2	8	28453	28460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014120	AGGA	2	8	28882	28889	50 %	0 %	50 %	0 %	295701140
63	NC_014120	GAAC	2	8	30884	30891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014120	CGAA	2	8	31445	31452	50 %	0 %	25 %	25 %	295701142
65	NC_014120	GAAG	2	8	31566	31573	50 %	0 %	50 %	0 %	295701142
66	NC_014120	TGGC	2	8	32680	32687	0 %	25 %	50 %	25 %	295701143
67	NC_014120	GCTC	2	8	33042	33049	0 %	25 %	25 %	50 %	295701143
68	NC_014120	ATCA	2	8	33304	33311	50 %	25 %	0 %	25 %	295701143
69	NC_014120	CAAG	2	8	33329	33336	50 %	0 %	25 %	25 %	295701143
70	NC_014120	CGCC	3	12	35581	35592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_014120	ACCG	2	8	35745	35752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014120	TTGG	2	8	35803	35810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014120	AATG	2	8	36459	36466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014120	GGGC	2	8	36616	36623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014120	TCGG	2	8	36687	36694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014120	TCGC	2	8	37594	37601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014120	CAAT	2	8	37619	37626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014120	AGCG	2	8	38052	38059	25 %	0 %	50 %	25 %	295701144
79	NC_014120	GCCT	2	8	38684	38691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014120	TGCA	2	8	39710	39717	25 %	25 %	25 %	25 %	295701146
81	NC_014120	TGGG	2	8	40627	40634	0 %	25 %	75 %	0 %	295701147
82	NC_014120	CCCG	2	8	41233	41240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_014120	TCCA	2	8	41560	41567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014120	GAAC	2	8	42803	42810	50 %	0 %	25 %	25 %	295701148
85	NC_014120	TCGC	2	8	43304	43311	0 %	25 %	25 %	50 %	295701149
86	NC_014120	CGAG	2	8	43734	43741	25 %	0 %	50 %	25 %	295701149
87	NC_014120	CGCC	2	8	43992	43999	0 %	0 %	25 %	75 %	295701149
88	NC_014120	TTCG	2	8	44059	44066	0 %	50 %	25 %	25 %	295701149
89	NC_014120	CCGC	2	8	44384	44391	0 %	0 %	25 %	75 %	295701150
90	NC_014120	CACG	2	8	44520	44527	25 %	0 %	25 %	50 %	295701150
91	NC_014120	CAGC	2	8	44540	44547	25 %	0 %	25 %	50 %	295701150
92	NC_014120	GGCG	2	8	44597	44604	0 %	0 %	75 %	25 %	295701150
93	NC_014120	GCAT	2	8	44635	44642	25 %	25 %	25 %	25 %	295701150
94	NC_014120	CTCG	2	8	44843	44850	0 %	25 %	25 %	50 %	295701150
95	NC_014120	CGCC	2	8	44943	44950	0 %	0 %	25 %	75 %	295701151
96	NC_014120	ATCT	2	8	45287	45294	25 %	50 %	0 %	25 %	295701151
97	NC_014120	GGCG	2	8	46084	46091	0 %	0 %	75 %	25 %	295701151
98	NC_014120	ACCG	2	8	46130	46137	25 %	0 %	25 %	50 %	295701151
99	NC_014120	ATGC	2	8	47292	47299	25 %	25 %	25 %	25 %	295701152
100	NC_014120	GCCG	2	8	47586	47593	0 %	0 %	50 %	50 %	295701152
101	NC_014120	AGCG	2	8	47966	47973	25 %	0 %	50 %	25 %	295701153
102	NC_014120	GAGT	2	8	48718	48725	25 %	25 %	50 %	0 %	295701153
103	NC_014120	GACG	2	8	48962	48969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014120	CGTA	2	8	49920	49927	25 %	25 %	25 %	25 %	295701154
105	NC_014120	GCTG	2	8	49967	49974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014120	TTGG	2	8	51073	51080	0 %	50 %	50 %	0 %	295701156
107	NC_014120	TCAG	2	8	51228	51235	25 %	25 %	25 %	25 %	295701156
108	NC_014120	AGTT	2	8	51545	51552	25 %	50 %	25 %	0 %	295701156
109	NC_014120	TGCT	2	8	52055	52062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014120	TGCA	2	8	52269	52276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014120	GGGT	2	8	52656	52663	0 %	25 %	75 %	0 %	295701157
112	NC_014120	CTGC	2	8	52815	52822	0 %	25 %	25 %	50 %	295701158
113	NC_014120	TGGG	2	8	53284	53291	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014120	CGCC	2	8	53961	53968	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_014120	GAGT	2	8	54016	54023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014120	ATCA	2	8	54552	54559	50 %	25 %	0 %	25 %	295701159
117	NC_014120	GCTG	2	8	54886	54893	0 %	25 %	50 %	25 %	295701159
118	NC_014120	GCGA	2	8	56220	56227	25 %	0 %	50 %	25 %	295701159
119	NC_014120	TTCG	2	8	56426	56433	0 %	50 %	25 %	25 %	295701159
120	NC_014120	TCAT	2	8	56829	56836	25 %	50 %	0 %	25 %	295701159
121	NC_014120	ATCT	2	8	57099	57106	25 %	50 %	0 %	25 %	295701159
122	NC_014120	CAGG	2	8	57837	57844	25 %	0 %	50 %	25 %	295701159
123	NC_014120	ATCC	2	8	57958	57965	25 %	25 %	0 %	50 %	295701159
124	NC_014120	GACG	2	8	58056	58063	25 %	0 %	50 %	25 %	295701159
125	NC_014120	GCGG	2	8	58964	58971	0 %	0 %	75 %	25 %	295701159
126	NC_014120	CCGG	2	8	59761	59768	0 %	0 %	50 %	50 %	295701159
127	NC_014120	CCTG	2	8	60020	60027	0 %	25 %	25 %	50 %	295701159
128	NC_014120	GGCT	2	8	60615	60622	0 %	25 %	50 %	25 %	295701160
129	NC_014120	TCCG	2	8	60625	60632	0 %	25 %	25 %	50 %	295701160
130	NC_014120	GGCA	2	8	61205	61212	25 %	0 %	50 %	25 %	295701160
131	NC_014120	AGGA	2	8	62051	62058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014120	CGCT	2	8	62487	62494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014120	TCCA	2	8	62694	62701	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014120	GTGA	2	8	62927	62934	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014120	GCCT	2	8	63496	63503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014120	CGCT	2	8	63922	63929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014120	TTGA	2	8	63940	63947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014120	TGGT	2	8	64424	64431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014120	ACAA	2	8	65311	65318	75 %	0 %	0 %	25 %	295701162
140	NC_014120	AAAG	2	8	65744	65751	75 %	0 %	25 %	0 %	295701162
141	NC_014120	ACAT	2	8	65777	65784	50 %	25 %	0 %	25 %	295701162
142	NC_014120	ATTC	2	8	66088	66095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014120	GTTC	2	8	66323	66330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014120	CGGC	2	8	67208	67215	0 %	0 %	50 %	50 %	295701163
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182	NC_014120	CTGG	2	8	81506	81513	0 %	25 %	50 %	25 %	295701176
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265	NC_014120	GTCT	2	8	117575	117582	0 %	50 %	25 %	25 %	295701198
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281	NC_014120	CCTT	2	8	123953	123960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
282	NC_014120	GACT	2	8	123997	124004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_014120	CATC	2	8	213000	213007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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