MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 plasmid pBC201

Total Repeats: 10043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014120	CG	3	6	46145	46150	0 %	0 %	50 %	50 %	295701151
1002	NC_014120	CTG	2	6	46151	46156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701151
1003	NC_014120	GC	3	6	46318	46323	0 %	0 %	50 %	50 %	295701151
1004	NC_014120	GAA	2	6	46343	46348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295701151
1005	NC_014120	CAA	2	6	46360	46365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295701151
1006	NC_014120	GCT	2	6	46426	46431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701151
1007	NC_014120	CTT	2	6	46459	46464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295701151
1008	NC_014120	TCG	2	6	46485	46490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701151
1009	NC_014120	GCT	2	6	46497	46502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701151
1010	NC_014120	CAA	2	6	46648	46653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295701151
1011	NC_014120	GC	3	6	46761	46766	0 %	0 %	50 %	50 %	295701151
1012	NC_014120	CGC	2	6	46830	46835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701152
1013	NC_014120	GCCTG	2	10	46845	46854	0 %	20 %	40 %	40 %	295701152
1014	NC_014120	GCC	2	6	46887	46892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701152
1015	NC_014120	ACG	2	6	46898	46903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701152
1016	NC_014120	GCT	2	6	46971	46976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701152
1017	NC_014120	GCT	2	6	47030	47035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701152
1018	NC_014120	GC	3	6	47094	47099	0 %	0 %	50 %	50 %	295701152
1019	NC_014120	GCC	2	6	47224	47229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701152
1020	NC_014120	CGT	2	6	47262	47267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701152
1021	NC_014120	ATGC	2	8	47292	47299	25 %	25 %	25 %	25 %	295701152
1022	NC_014120	GGC	2	6	47316	47321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701152
1023	NC_014120	GGC	2	6	47419	47424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701152
1024	NC_014120	GC	3	6	47456	47461	0 %	0 %	50 %	50 %	295701152
1025	NC_014120	CTG	2	6	47481	47486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701152
1026	NC_014120	GCA	2	6	47519	47524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701152
1027	NC_014120	AAC	2	6	47540	47545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295701152
1028	NC_014120	GCCG	2	8	47586	47593	0 %	0 %	50 %	50 %	295701152
1029	NC_014120	GAACGC	2	12	47597	47608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701152
1030	NC_014120	CCG	2	6	47679	47684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701153
1031	NC_014120	CGA	2	6	47732	47737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701153
1032	NC_014120	GC	3	6	47760	47765	0 %	0 %	50 %	50 %	295701153
1033	NC_014120	CGC	2	6	47777	47782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701153
1034	NC_014120	AGG	2	6	47842	47847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295701153
1035	NC_014120	GGC	2	6	47850	47855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701153
1036	NC_014120	CGT	2	6	47879	47884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701153
1037	NC_014120	GCG	2	6	47953	47958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701153
1038	NC_014120	AGCG	2	8	47966	47973	25 %	0 %	50 %	25 %	295701153
1039	NC_014120	CGC	2	6	47981	47986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701153
1040	NC_014120	CGG	2	6	47990	47995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701153
1041	NC_014120	GC	3	6	48171	48176	0 %	0 %	50 %	50 %	295701153
1042	NC_014120	GGA	2	6	48266	48271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295701153
1043	NC_014120	CGA	2	6	48320	48325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701153
1044	NC_014120	GCT	2	6	48428	48433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701153
1045	NC_014120	CGG	2	6	48443	48448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701153
1046	NC_014120	CGT	2	6	48457	48462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701153
1047	NC_014120	GAT	2	6	48497	48502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701153
1048	NC_014120	CGT	2	6	48569	48574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701153
1049	NC_014120	GGA	2	6	48590	48595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295701153
1050	NC_014120	GC	3	6	48632	48637	0 %	0 %	50 %	50 %	295701153
1051	NC_014120	GAGT	2	8	48718	48725	25 %	25 %	50 %	0 %	295701153
1052	NC_014120	CGC	2	6	48745	48750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701153
1053	NC_014120	GC	4	8	48788	48795	0 %	0 %	50 %	50 %	295701153
1054	NC_014120	CGT	2	6	48851	48856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701153
1055	NC_014120	GTA	2	6	48887	48892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014120	CCG	2	6	48935	48940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_014120	GACG	2	8	48962	48969	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_014120	TCG	2	6	49188	49193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_014120	GAC	2	6	49209	49214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_014120	TGG	2	6	49302	49307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014120	CGG	2	6	49308	49313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014120	AGA	2	6	49369	49374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014120	GC	3	6	49683	49688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_014120	CGC	2	6	49711	49716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_014120	CGTA	2	8	49920	49927	25 %	25 %	25 %	25 %	295701154
1066	NC_014120	GCTG	2	8	49967	49974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_014120	AGA	2	6	49998	50003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014120	AAC	2	6	50021	50026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014120	GTT	2	6	50182	50187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014120	TGG	2	6	50200	50205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014120	CGT	2	6	50211	50216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_014120	GCG	2	6	50310	50315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_014120	CG	3	6	50416	50421	0 %	0 %	50 %	50 %	295701155
1074	NC_014120	GA	3	6	50476	50481	50 %	0 %	50 %	0 %	295701155
1075	NC_014120	GCG	2	6	50619	50624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_014120	AGGTC	2	10	50782	50791	20 %	20 %	40 %	20 %	295701156
1077	NC_014120	GC	3	6	50857	50862	0 %	0 %	50 %	50 %	295701156
1078	NC_014120	GGC	2	6	50894	50899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701156
1079	NC_014120	CAT	2	6	50960	50965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701156
1080	NC_014120	CG	3	6	50992	50997	0 %	0 %	50 %	50 %	295701156
1081	NC_014120	CTG	2	6	51013	51018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701156
1082	NC_014120	TTGG	2	8	51073	51080	0 %	50 %	50 %	0 %	295701156
1083	NC_014120	TGC	2	6	51157	51162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701156
1084	NC_014120	CG	3	6	51186	51191	0 %	0 %	50 %	50 %	295701156
1085	NC_014120	CGA	2	6	51208	51213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701156
1086	NC_014120	TCAG	2	8	51228	51235	25 %	25 %	25 %	25 %	295701156
1087	NC_014120	TGA	2	6	51258	51263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701156
1088	NC_014120	CTT	2	6	51302	51307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295701156
1089	NC_014120	GCC	2	6	51318	51323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701156
1090	NC_014120	GCA	2	6	51364	51369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701156
1091	NC_014120	GCC	2	6	51403	51408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701156
1092	NC_014120	GGA	2	6	51414	51419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295701156
1093	NC_014120	CG	3	6	51468	51473	0 %	0 %	50 %	50 %	295701156
1094	NC_014120	AGTT	2	8	51545	51552	25 %	50 %	25 %	0 %	295701156
1095	NC_014120	GTC	2	6	51647	51652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_014120	CGT	2	6	51677	51682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_014120	ACC	2	6	51751	51756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_014120	ACC	2	6	51884	51889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_014120	CG	3	6	51985	51990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_014120	TGCT	2	8	52055	52062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_014120	CGA	2	6	52094	52099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_014120	AGA	2	6	52242	52247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014120	TGCA	2	8	52269	52276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_014120	CAG	2	6	52330	52335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_014120	TC	3	6	52442	52447	0 %	50 %	0 %	50 %	295701157
1106	NC_014120	GCG	2	6	52473	52478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701157
1107	NC_014120	CTC	2	6	52491	52496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295701157
1108	NC_014120	CGT	2	6	52517	52522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701157
1109	NC_014120	TCT	2	6	52603	52608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295701157
1110	NC_014120	GGGT	2	8	52656	52663	0 %	25 %	75 %	0 %	295701157
1111	NC_014120	ATG	2	6	52684	52689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701157
1112	NC_014120	CCT	2	6	52694	52699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_014120	TTG	2	6	52768	52773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295701158
1114	NC_014120	CTGC	2	8	52815	52822	0 %	25 %	25 %	50 %	295701158
1115	NC_014120	GGC	2	6	53089	53094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701158
1116	NC_014120	TCT	2	6	53103	53108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295701158
1117	NC_014120	CGG	2	6	53119	53124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701158
1118	NC_014120	CAA	2	6	53127	53132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295701158
1119	NC_014120	AG	3	6	53175	53180	50 %	0 %	50 %	0 %	295701158
1120	NC_014120	ACG	2	6	53192	53197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701158
1121	NC_014120	TGGG	2	8	53284	53291	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014120	G	6	6	53289	53294	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014120	TCG	2	6	53324	53329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014120	AG	3	6	53335	53340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014120	CGC	2	6	53432	53437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_014120	TCG	2	6	53450	53455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_014120	GTG	2	6	53465	53470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014120	TC	3	6	53599	53604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_014120	AC	4	8	53680	53687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_014120	A	6	6	53719	53724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014120	TTA	2	6	53775	53780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014120	ATC	2	6	53798	53803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014120	GAA	2	6	53858	53863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014120	CGCC	2	8	53961	53968	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1135	NC_014120	GA	3	6	53969	53974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014120	GAGT	2	8	54016	54023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014120	ACT	2	6	54055	54060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701159
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1253	NC_014120	CAT	2	6	60080	60085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701159
1254	NC_014120	CGT	2	6	60129	60134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701159
1255	NC_014120	GGC	2	6	60173	60178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701159
1256	NC_014120	CTG	2	6	60186	60191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701159
1257	NC_014120	GAT	2	6	60195	60200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701159
1258	NC_014120	TGG	2	6	60214	60219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295701159
1259	NC_014120	GTC	2	6	60240	60245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701159
1260	NC_014120	ATC	2	6	60265	60270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701159
1261	NC_014120	TGC	2	6	60283	60288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701159
1262	NC_014120	CGA	2	6	60304	60309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701159
1263	NC_014120	GATGG	2	10	60321	60330	20 %	20 %	60 %	0 %	295701159
1264	NC_014120	TCA	2	6	60341	60346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701159
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1269	NC_014120	CAG	2	6	60552	60557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_014120	GGCT	2	8	60615	60622	0 %	25 %	50 %	25 %	295701160
1271	NC_014120	TCCG	2	8	60625	60632	0 %	25 %	25 %	50 %	295701160
1272	NC_014120	GGC	2	6	60687	60692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701160
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1281	NC_014120	GCT	2	6	61306	61311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701160
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1288	NC_014120	TGC	2	6	61773	61778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701160
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1290	NC_014120	GAA	2	6	61940	61945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1291	NC_014120	TCA	2	6	61987	61992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1292	NC_014120	CAG	2	6	62023	62028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1293	NC_014120	AGGA	2	8	62051	62058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1294	NC_014120	AAG	2	6	62059	62064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1295	NC_014120	CG	3	6	62234	62239	0 %	0 %	50 %	50 %	295701161
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1303	NC_014120	CCG	2	6	62422	62427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1304	NC_014120	GTT	2	6	62438	62443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1305	NC_014120	AAG	2	6	62458	62463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1306	NC_014120	CGCT	2	8	62487	62494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1307	NC_014120	GCA	2	6	62505	62510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1308	NC_014120	GGC	2	6	62538	62543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1309	NC_014120	AGT	2	6	62660	62665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1310	NC_014120	TC	3	6	62669	62674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1311	NC_014120	CTG	2	6	62682	62687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1312	NC_014120	TCCA	2	8	62694	62701	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1313	NC_014120	GTGA	2	8	62927	62934	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1314	NC_014120	GGT	2	6	63088	63093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1315	NC_014120	TGA	2	6	63216	63221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1316	NC_014120	TCG	2	6	63298	63303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1317	NC_014120	GA	3	6	63351	63356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1318	NC_014120	GTC	2	6	63370	63375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1319	NC_014120	TCG	2	6	63394	63399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1320	NC_014120	CAG	2	6	63419	63424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1321	NC_014120	CG	3	6	63443	63448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1322	NC_014120	GTC	3	9	63457	63465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1323	NC_014120	GCCT	2	8	63496	63503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1324	NC_014120	CTT	2	6	63545	63550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1325	NC_014120	TC	3	6	63554	63559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1326	NC_014120	ACC	2	6	63644	63649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1327	NC_014120	CG	3	6	63711	63716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1328	NC_014120	GCA	2	6	63745	63750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1329	NC_014120	TTC	2	6	63758	63763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1331	NC_014120	TCC	2	6	63821	63826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1332	NC_014120	ACC	2	6	63838	63843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1333	NC_014120	CGCT	2	8	63922	63929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1334	NC_014120	TTGA	2	8	63940	63947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1335	NC_014120	ATT	2	6	63971	63976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1342	NC_014120	TGGT	2	8	64424	64431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1343	NC_014120	ATC	2	6	64667	64672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1344	NC_014120	TTC	2	6	64729	64734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1361	NC_014120	ACAT	2	8	65777	65784	50 %	25 %	0 %	25 %	295701162
1362	NC_014120	GTC	2	6	65850	65855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1364	NC_014120	GAC	2	6	65990	65995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1365	NC_014120	ACA	2	6	66029	66034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1366	NC_014120	GTC	2	6	66068	66073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1368	NC_014120	CG	3	6	66127	66132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1369	NC_014120	CTG	2	6	66184	66189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1370	NC_014120	ACAAA	2	10	66228	66237	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1371	NC_014120	GCG	2	6	66312	66317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1372	NC_014120	GTTC	2	8	66323	66330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1373	NC_014120	GAA	2	6	66342	66347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1374	NC_014120	CGG	2	6	66410	66415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1382	NC_014120	GC	3	6	67113	67118	0 %	0 %	50 %	50 %	295701163
1383	NC_014120	CGGC	2	8	67208	67215	0 %	0 %	50 %	50 %	295701163
1384	NC_014120	CAG	2	6	67253	67258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701163
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1386	NC_014120	CCGG	2	8	67271	67278	0 %	0 %	50 %	50 %	295701163
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