MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 plasmid pBC201

Total Repeats: 10043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014120	CGATG	2	10	21848	21857	20 %	20 %	40 %	20 %	295701132
502	NC_014120	CGT	2	6	21863	21868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701132
503	NC_014120	ATC	2	6	21910	21915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701132
504	NC_014120	CG	5	10	21988	21997	0 %	0 %	50 %	50 %	295701133
505	NC_014120	GTT	2	6	22012	22017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295701133
506	NC_014120	GCG	2	6	22209	22214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701133
507	NC_014120	AAAGCG	2	12	22215	22226	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295701133
508	NC_014120	ACC	2	6	22265	22270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295701133
509	NC_014120	GCA	2	6	22331	22336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701133
510	NC_014120	TGCGGG	3	18	22348	22365	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	295701133
511	NC_014120	GCGCGG	2	12	22377	22388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701133
512	NC_014120	CG	3	6	22414	22419	0 %	0 %	50 %	50 %	295701133
513	NC_014120	GAC	2	6	22421	22426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701133
514	NC_014120	CGG	2	6	22458	22463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701133
515	NC_014120	GCG	2	6	22496	22501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701133
516	NC_014120	CG	3	6	22547	22552	0 %	0 %	50 %	50 %	295701133
517	NC_014120	GGC	2	6	22617	22622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701134
518	NC_014120	GCT	2	6	22647	22652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701134
519	NC_014120	GTTCAC	2	12	22855	22866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295701134
520	NC_014120	CG	3	6	22903	22908	0 %	0 %	50 %	50 %	295701134
521	NC_014120	AGC	2	6	22936	22941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701134
522	NC_014120	TCC	2	6	22946	22951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295701134
523	NC_014120	GC	4	8	22961	22968	0 %	0 %	50 %	50 %	295701134
524	NC_014120	GC	3	6	23020	23025	0 %	0 %	50 %	50 %	295701134
525	NC_014120	CCG	2	6	23147	23152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701135
526	NC_014120	GCCGT	2	10	23170	23179	0 %	20 %	40 %	40 %	295701135
527	NC_014120	GTA	2	6	23187	23192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701135
528	NC_014120	TGG	2	6	23318	23323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295701135
529	NC_014120	CG	3	6	23353	23358	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
530	NC_014120	GC	3	6	23401	23406	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
531	NC_014120	TCA	2	6	23414	23419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701135
532	NC_014120	GTC	2	6	23523	23528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701135
533	NC_014120	GC	3	6	23546	23551	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
534	NC_014120	CAG	2	6	23565	23570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701135
535	NC_014120	GCGG	2	8	23575	23582	0 %	0 %	75 %	25 %	295701135
536	NC_014120	GCC	2	6	23614	23619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701135
537	NC_014120	GC	3	6	23669	23674	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
538	NC_014120	TCA	2	6	23750	23755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701135
539	NC_014120	GC	3	6	23903	23908	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
540	NC_014120	TG	3	6	23929	23934	0 %	50 %	50 %	0 %	295701135
541	NC_014120	TCG	2	6	23983	23988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701135
542	NC_014120	GC	3	6	24002	24007	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
543	NC_014120	CCG	3	9	24016	24024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701135
544	NC_014120	GC	3	6	24048	24053	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
545	NC_014120	GCCG	2	8	24062	24069	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
546	NC_014120	ACCG	2	8	24135	24142	25 %	0 %	25 %	50 %	295701135
547	NC_014120	CG	3	6	24159	24164	0 %	0 %	50 %	50 %	295701135
548	NC_014120	CGT	2	6	24188	24193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701135
549	NC_014120	AATCGA	2	12	24239	24250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	295701135
550	NC_014120	CGC	2	6	24264	24269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701135
551	NC_014120	CG	3	6	24363	24368	0 %	0 %	50 %	50 %	295701136
552	NC_014120	GAGT	2	8	24438	24445	25 %	25 %	50 %	0 %	295701136
553	NC_014120	GCGAA	2	10	24517	24526	40 %	0 %	40 %	20 %	295701136
554	NC_014120	CCGC	2	8	24581	24588	0 %	0 %	25 %	75 %	295701136
555	NC_014120	GC	3	6	24587	24592	0 %	0 %	50 %	50 %	295701136
556	NC_014120	CG	3	6	24625	24630	0 %	0 %	50 %	50 %	295701136
557	NC_014120	GAA	2	6	24635	24640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295701136
558	NC_014120	GCCCT	2	10	24644	24653	0 %	20 %	20 %	60 %	295701136
559	NC_014120	GCAT	2	8	24741	24748	25 %	25 %	25 %	25 %	295701136
560	NC_014120	GCC	2	6	24785	24790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701136
561	NC_014120	CGT	2	6	24817	24822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701136
562	NC_014120	CAGC	2	8	24842	24849	25 %	0 %	25 %	50 %	295701136
563	NC_014120	CTT	2	6	24851	24856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295701136
564	NC_014120	CAG	2	6	24860	24865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701136
565	NC_014120	CG	3	6	24883	24888	0 %	0 %	50 %	50 %	295701136
566	NC_014120	CGAC	2	8	24892	24899	25 %	0 %	25 %	50 %	295701136
567	NC_014120	TGC	2	6	24922	24927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701136
568	NC_014120	GTG	2	6	24946	24951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295701136
569	NC_014120	GCCT	2	8	25025	25032	0 %	25 %	25 %	50 %	295701136
570	NC_014120	TCG	2	6	25048	25053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701136
571	NC_014120	TGA	2	6	25057	25062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701136
572	NC_014120	CGC	2	6	25076	25081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701136
573	NC_014120	GCG	2	6	25185	25190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701137
574	NC_014120	CGT	2	6	25203	25208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701137
575	NC_014120	CGG	2	6	25274	25279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701137
576	NC_014120	GTG	2	6	25312	25317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295701137
577	NC_014120	CGA	2	6	25320	25325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701137
578	NC_014120	GCC	2	6	25329	25334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701137
579	NC_014120	ACG	2	6	25370	25375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701137
580	NC_014120	CCG	2	6	25450	25455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701137
581	NC_014120	CAA	2	6	25502	25507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295701137
582	NC_014120	CTG	2	6	25515	25520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701137
583	NC_014120	ATC	2	6	25555	25560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701137
584	NC_014120	ATC	2	6	25573	25578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701137
585	NC_014120	CCA	2	6	25616	25621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295701137
586	NC_014120	GCG	3	9	25685	25693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701137
587	NC_014120	GCC	2	6	25725	25730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701137
588	NC_014120	CTG	2	6	25763	25768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701137
589	NC_014120	GCC	2	6	25846	25851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701137
590	NC_014120	GCG	2	6	25858	25863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701137
591	NC_014120	CTG	2	6	25893	25898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701137
592	NC_014120	CTG	2	6	25923	25928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701137
593	NC_014120	CCTTGA	2	12	25976	25987	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295701137
594	NC_014120	CGA	2	6	26066	26071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701137
595	NC_014120	CG	4	8	26121	26128	0 %	0 %	50 %	50 %	295701137
596	NC_014120	CGC	2	6	26154	26159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701137
597	NC_014120	CGT	2	6	26164	26169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701137
598	NC_014120	CTT	2	6	26250	26255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295701137
599	NC_014120	TCG	3	9	26269	26277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701137
600	NC_014120	TAG	2	6	26302	26307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701137
601	NC_014120	GAC	2	6	26325	26330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701137
602	NC_014120	CTGCGC	2	12	26388	26399	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	295701137
603	NC_014120	GAC	2	6	26462	26467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701138
604	NC_014120	GGTC	2	8	26486	26493	0 %	25 %	50 %	25 %	295701138
605	NC_014120	GC	3	6	26497	26502	0 %	0 %	50 %	50 %	295701138
606	NC_014120	TCG	2	6	26512	26517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701138
607	NC_014120	ACG	2	6	26530	26535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701138
608	NC_014120	ACG	2	6	26547	26552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701138
609	NC_014120	CGGCA	2	10	26595	26604	20 %	0 %	40 %	40 %	295701138
610	NC_014120	GCAG	2	8	26617	26624	25 %	0 %	50 %	25 %	295701138
611	NC_014120	CAT	2	6	26645	26650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701138
612	NC_014120	CCGG	2	8	26663	26670	0 %	0 %	50 %	50 %	295701138
613	NC_014120	CATTGG	2	12	26741	26752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295701138
614	NC_014120	CG	5	10	26795	26804	0 %	0 %	50 %	50 %	295701138
615	NC_014120	C	6	6	26860	26865	0 %	0 %	0 %	100 %	295701138
616	NC_014120	GAG	2	6	26872	26877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295701138
617	NC_014120	CG	3	6	27035	27040	0 %	0 %	50 %	50 %	295701138
618	NC_014120	GCG	2	6	27065	27070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701138
619	NC_014120	ATG	2	6	27076	27081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701138
620	NC_014120	CGGA	2	8	27218	27225	25 %	0 %	50 %	25 %	295701138
621	NC_014120	GCA	2	6	27244	27249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701138
622	NC_014120	ACC	2	6	27265	27270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295701138
623	NC_014120	ATC	2	6	27319	27324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701138
624	NC_014120	TCT	2	6	27331	27336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295701139
625	NC_014120	AAC	2	6	27345	27350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295701139
626	NC_014120	CGT	2	6	27467	27472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701139
627	NC_014120	CCA	2	6	27487	27492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295701139
628	NC_014120	CTG	2	6	27566	27571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701139
629	NC_014120	CAT	2	6	27626	27631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701139
630	NC_014120	AC	3	6	27808	27813	50 %	0 %	0 %	50 %	295701139
631	NC_014120	ACG	2	6	27825	27830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295701139
632	NC_014120	GCC	2	6	27860	27865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701139
633	NC_014120	GAT	2	6	27941	27946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295701139
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637	NC_014120	TTC	2	6	28350	28355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_014120	ATC	2	6	28407	28412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_014120	AGAT	2	8	28453	28460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014120	CGG	2	6	28512	28517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_014120	GGC	2	6	28540	28545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_014120	TGC	2	6	28636	28641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_014120	GC	3	6	28640	28645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
644	NC_014120	GGC	2	6	28680	28685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_014120	GA	3	6	28713	28718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
646	NC_014120	CG	3	6	28764	28769	0 %	0 %	50 %	50 %	295701140
647	NC_014120	GGCTT	2	10	28818	28827	0 %	40 %	40 %	20 %	295701140
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651	NC_014120	AG	3	6	29007	29012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
652	NC_014120	TCG	2	6	29040	29045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_014120	GA	3	6	29082	29087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
654	NC_014120	CT	3	6	29107	29112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
655	NC_014120	AGACCT	2	12	29162	29173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295701141
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659	NC_014120	CGG	2	6	29361	29366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295701141
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661	NC_014120	CGC	2	6	29420	29425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295701141
662	NC_014120	ACTTCG	2	12	29448	29459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	295701141
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679	NC_014120	TCACC	2	10	30598	30607	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
680	NC_014120	CGG	2	6	30613	30618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
681	NC_014120	GTT	2	6	30795	30800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
682	NC_014120	GTT	2	6	30827	30832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
683	NC_014120	ACC	2	6	30862	30867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
684	NC_014120	GAAC	2	8	30884	30891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
685	NC_014120	CGGTT	2	10	30912	30921	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
686	NC_014120	GGGAGA	2	12	30935	30946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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688	NC_014120	CGC	2	6	31045	31050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
689	NC_014120	GTC	2	6	31149	31154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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691	NC_014120	GAA	2	6	31318	31323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
692	NC_014120	ATC	2	6	31324	31329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
693	NC_014120	CGAA	2	8	31445	31452	50 %	0 %	25 %	25 %	295701142
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697	NC_014120	T	6	6	31622	31627	0 %	100 %	0 %	0 %	295701142
698	NC_014120	AAG	2	6	31634	31639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295701142
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742	NC_014120	CG	3	6	34005	34010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
743	NC_014120	TGA	2	6	34041	34046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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745	NC_014120	AC	3	6	34134	34139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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747	NC_014120	GTT	2	6	34197	34202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
748	NC_014120	TCG	2	6	34203	34208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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750	NC_014120	ATC	2	6	34298	34303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
751	NC_014120	GCC	2	6	34305	34310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
752	NC_014120	GTC	2	6	34324	34329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_014120	GGA	2	6	34364	34369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
754	NC_014120	TCT	2	6	34392	34397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_014120	GCG	2	6	34461	34466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
756	NC_014120	TCG	2	6	34578	34583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_014120	TAA	2	6	34624	34629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_014120	GC	3	6	34686	34691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
760	NC_014120	CGA	2	6	34717	34722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
761	NC_014120	GGC	2	6	34739	34744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
762	NC_014120	GGC	2	6	34815	34820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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765	NC_014120	ACT	2	6	34937	34942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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767	NC_014120	CGG	2	6	35110	35115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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769	NC_014120	CGG	2	6	35163	35168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_014120	CTG	2	6	35189	35194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_014120	GC	3	6	35243	35248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
772	NC_014120	AGA	2	6	35302	35307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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774	NC_014120	CCG	2	6	35391	35396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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786	NC_014120	AGG	2	6	36262	36267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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793	NC_014120	GGGC	2	8	36616	36623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
794	NC_014120	TCGG	2	8	36687	36694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
795	NC_014120	CCG	2	6	36746	36751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
796	NC_014120	GGC	2	6	36793	36798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
797	NC_014120	GAA	2	6	36911	36916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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881	NC_014120	GTTTG	2	10	41054	41063	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
882	NC_014120	T	6	6	41067	41072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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885	NC_014120	CGC	2	6	41249	41254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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888	NC_014120	TCCA	2	8	41560	41567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
889	NC_014120	TCG	2	6	41707	41712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295701148
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893	NC_014120	ACT	2	6	41911	41916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295701148
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