MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 2

Total Repeats: 67001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014118	TCG	2	6	17030	17035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698865
502	NC_014118	CG	3	6	17086	17091	0 %	0 %	50 %	50 %	295698865
503	NC_014118	TCGCG	2	10	17109	17118	0 %	20 %	40 %	40 %	295698865
504	NC_014118	TCG	2	6	17144	17149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698865
505	NC_014118	CGG	2	6	17234	17239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698865
506	NC_014118	CG	4	8	17258	17265	0 %	0 %	50 %	50 %	295698865
507	NC_014118	CTG	2	6	17266	17271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698865
508	NC_014118	GCG	2	6	17300	17305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698865
509	NC_014118	GC	4	8	17308	17315	0 %	0 %	50 %	50 %	295698865
510	NC_014118	CCG	2	6	17320	17325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698865
511	NC_014118	CG	3	6	17355	17360	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
512	NC_014118	CGG	2	6	17365	17370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
513	NC_014118	CGG	2	6	17390	17395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
514	NC_014118	TCG	2	6	17416	17421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698866
515	NC_014118	CGT	2	6	17444	17449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698866
516	NC_014118	GC	3	6	17529	17534	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
517	NC_014118	CGC	2	6	17540	17545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698866
518	NC_014118	GCA	2	6	17546	17551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698866
519	NC_014118	GC	3	6	17609	17614	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
520	NC_014118	CGCT	2	8	17626	17633	0 %	25 %	25 %	50 %	295698866
521	NC_014118	GGCT	2	8	17676	17683	0 %	25 %	50 %	25 %	295698866
522	NC_014118	CGC	2	6	17684	17689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698866
523	NC_014118	CGGC	2	8	17701	17708	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
524	NC_014118	CGTCG	2	10	17717	17726	0 %	20 %	40 %	40 %	295698866
525	NC_014118	GCT	2	6	17777	17782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698866
526	NC_014118	GCA	2	6	17794	17799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698866
527	NC_014118	CCA	2	6	17800	17805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295698866
528	NC_014118	CAT	2	6	17810	17815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698866
529	NC_014118	TCG	2	6	17821	17826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698866
530	NC_014118	CGT	2	6	17834	17839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698866
531	NC_014118	CG	3	6	17840	17845	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
532	NC_014118	GCG	2	6	17875	17880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
533	NC_014118	CGT	2	6	17897	17902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698866
534	NC_014118	GCG	2	6	17917	17922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
535	NC_014118	CGG	2	6	17942	17947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
536	NC_014118	TGA	2	6	17962	17967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698866
537	NC_014118	ACC	2	6	17982	17987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295698866
538	NC_014118	ACG	2	6	18028	18033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698866
539	NC_014118	GGC	2	6	18068	18073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
540	NC_014118	CG	4	8	18078	18085	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
541	NC_014118	CG	3	6	18089	18094	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
542	NC_014118	ACG	2	6	18106	18111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698866
543	NC_014118	ACG	2	6	18115	18120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698866
544	NC_014118	GCG	2	6	18149	18154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
545	NC_014118	GC	4	8	18158	18165	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
546	NC_014118	CGC	2	6	18206	18211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698866
547	NC_014118	CGG	2	6	18226	18231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
548	NC_014118	CGC	2	6	18232	18237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698866
549	NC_014118	TGG	2	6	18238	18243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698866
550	NC_014118	TCG	2	6	18265	18270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698866
551	NC_014118	GC	3	6	18279	18284	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
552	NC_014118	GC	3	6	18291	18296	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
553	NC_014118	GGCG	2	8	18320	18327	0 %	0 %	75 %	25 %	295698866
554	NC_014118	GCG	2	6	18342	18347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
555	NC_014118	GCG	2	6	18351	18356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
556	NC_014118	GC	3	6	18361	18366	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
557	NC_014118	GCT	2	6	18383	18388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698866
558	NC_014118	GC	3	6	18393	18398	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
559	NC_014118	GCG	2	6	18413	18418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698866
560	NC_014118	GC	3	6	18421	18426	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
561	NC_014118	GTGGC	2	10	18427	18436	0 %	20 %	60 %	20 %	295698866
562	NC_014118	CG	5	10	18437	18446	0 %	0 %	50 %	50 %	295698866
563	NC_014118	CGGCG	2	10	18459	18468	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
564	NC_014118	TGA	2	6	18531	18536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014118	ACG	2	6	18550	18555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014118	ACA	2	6	18588	18593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014118	GGT	2	6	18602	18607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698867
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569	NC_014118	GTG	2	6	18687	18692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698867
570	NC_014118	CGG	3	9	18701	18709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698867
571	NC_014118	CGA	2	6	18755	18760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698867
572	NC_014118	GCT	2	6	18806	18811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698867
573	NC_014118	CGAG	2	8	18847	18854	25 %	0 %	50 %	25 %	295698867
574	NC_014118	CGC	2	6	18968	18973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698867
575	NC_014118	CGA	2	6	18982	18987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698867
576	NC_014118	TCG	2	6	19009	19014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698867
577	NC_014118	CGC	2	6	19031	19036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698867
578	NC_014118	CGA	2	6	19037	19042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698867
579	NC_014118	TCG	2	6	19087	19092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698867
580	NC_014118	GCG	2	6	19188	19193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_014118	GCG	2	6	19227	19232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698868
582	NC_014118	CGC	2	6	19233	19238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698868
583	NC_014118	GCCG	2	8	19259	19266	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
584	NC_014118	GCG	2	6	19315	19320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698868
585	NC_014118	CGC	2	6	19425	19430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698868
586	NC_014118	CG	3	6	19436	19441	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
587	NC_014118	GC	3	6	19453	19458	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
588	NC_014118	GCC	2	6	19492	19497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698868
589	NC_014118	TCG	2	6	19562	19567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698868
590	NC_014118	GCC	2	6	19573	19578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698868
591	NC_014118	CAG	2	6	19585	19590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698868
592	NC_014118	ACG	2	6	19598	19603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698868
593	NC_014118	GCT	2	6	19623	19628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698868
594	NC_014118	GCG	2	6	19636	19641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698868
595	NC_014118	CG	3	6	19640	19645	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
596	NC_014118	CG	4	8	19653	19660	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
597	NC_014118	CG	4	8	19707	19714	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
598	NC_014118	TCG	2	6	19721	19726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698868
599	NC_014118	CGGC	2	8	19734	19741	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
600	NC_014118	CGCTG	2	10	19753	19762	0 %	20 %	40 %	40 %	295698868
601	NC_014118	GC	3	6	19784	19789	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
602	NC_014118	CG	3	6	19796	19801	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
603	NC_014118	GCC	2	6	19828	19833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698868
604	NC_014118	GC	3	6	19836	19841	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
605	NC_014118	CGT	2	6	19842	19847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698868
606	NC_014118	CGGCGC	2	12	19872	19883	0 %	0 %	50 %	50 %	295698868
607	NC_014118	GCG	2	6	19886	19891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698868
608	NC_014118	GCAA	2	8	19922	19929	50 %	0 %	25 %	25 %	295698868
609	NC_014118	TCA	2	6	19935	19940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698868
610	NC_014118	GCC	2	6	19993	19998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698869
611	NC_014118	CG	3	6	20010	20015	0 %	0 %	50 %	50 %	295698869
612	NC_014118	CG	3	6	20020	20025	0 %	0 %	50 %	50 %	295698869
613	NC_014118	CGA	2	6	20033	20038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698869
614	NC_014118	CGG	2	6	20069	20074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698869
615	NC_014118	CGGC	2	8	20123	20130	0 %	0 %	50 %	50 %	295698869
616	NC_014118	CCG	2	6	20171	20176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698869
617	NC_014118	GC	3	6	20180	20185	0 %	0 %	50 %	50 %	295698869
618	NC_014118	TCA	2	6	20231	20236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698869
619	NC_014118	GTC	2	6	20256	20261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698869
620	NC_014118	TCG	2	6	20269	20274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698869
621	NC_014118	ACGC	2	8	20310	20317	25 %	0 %	25 %	50 %	295698869
622	NC_014118	GGT	2	6	20394	20399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698869
623	NC_014118	CGA	2	6	20426	20431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698869
624	NC_014118	GAT	2	6	20469	20474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698869
625	NC_014118	GC	4	8	20490	20497	0 %	0 %	50 %	50 %	295698869
626	NC_014118	GTG	2	6	20536	20541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698869
627	NC_014118	GGCC	2	8	20594	20601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_014118	CAG	2	6	20604	20609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_014118	AC	4	8	20617	20624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_014118	ACAT	2	8	20680	20687	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_014118	GTC	2	6	20728	20733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_014118	TCC	2	6	20749	20754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_014118	CGC	2	6	20786	20791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_014118	CGG	2	6	20820	20825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_014118	CGTG	2	8	20853	20860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
636	NC_014118	CCGG	2	8	20863	20870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_014118	GGCG	2	8	20874	20881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
638	NC_014118	CG	3	6	20934	20939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_014118	CG	3	6	20960	20965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_014118	TTC	2	6	21192	21197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_014118	CCG	2	6	21249	21254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698870
642	NC_014118	GC	3	6	21273	21278	0 %	0 %	50 %	50 %	295698870
643	NC_014118	CG	3	6	21292	21297	0 %	0 %	50 %	50 %	295698870
644	NC_014118	TGA	2	6	21316	21321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698870
645	NC_014118	CGC	2	6	21397	21402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698870
646	NC_014118	GCCGCG	2	12	21426	21437	0 %	0 %	50 %	50 %	295698870
647	NC_014118	TCG	2	6	21450	21455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698870
648	NC_014118	GGT	2	6	21470	21475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698870
649	NC_014118	GACC	2	8	21479	21486	25 %	0 %	25 %	50 %	295698870
650	NC_014118	CG	3	6	21510	21515	0 %	0 %	50 %	50 %	295698870
651	NC_014118	CG	3	6	21547	21552	0 %	0 %	50 %	50 %	295698870
652	NC_014118	CGA	2	6	21554	21559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698870
653	NC_014118	ATC	2	6	21636	21641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698870
654	NC_014118	CCG	2	6	21729	21734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698870
655	NC_014118	TCG	3	9	21742	21750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698870
656	NC_014118	GGC	2	6	21775	21780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698870
657	NC_014118	GGT	2	6	21839	21844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698870
658	NC_014118	GCG	2	6	21859	21864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698870
659	NC_014118	GAC	2	6	21882	21887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698870
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661	NC_014118	CGGC	2	8	22006	22013	0 %	0 %	50 %	50 %	295698870
662	NC_014118	GGA	2	6	22019	22024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295698870
663	NC_014118	GC	3	6	22034	22039	0 %	0 %	50 %	50 %	295698870
664	NC_014118	GCTCG	2	10	22055	22064	0 %	20 %	40 %	40 %	295698870
665	NC_014118	TGA	2	6	22072	22077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698870
666	NC_014118	CCTGCA	2	12	22145	22156	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	295698870
667	NC_014118	CG	3	6	22158	22163	0 %	0 %	50 %	50 %	295698870
668	NC_014118	GCAAC	2	10	22184	22193	40 %	0 %	20 %	40 %	295698870
669	NC_014118	GGCG	2	8	22235	22242	0 %	0 %	75 %	25 %	295698870
670	NC_014118	CATGCG	2	12	22248	22259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295698870
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674	NC_014118	CGGG	2	8	22411	22418	0 %	0 %	75 %	25 %	295698870
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684	NC_014118	CG	3	6	22791	22796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
685	NC_014118	TCA	2	6	22829	22834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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689	NC_014118	CGA	2	6	22960	22965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698871
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694	NC_014118	CCGG	2	8	23149	23156	0 %	0 %	50 %	50 %	295698871
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698	NC_014118	GCA	2	6	23321	23326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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701	NC_014118	GCC	2	6	23346	23351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698872
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713	NC_014118	GGTC	2	8	23705	23712	0 %	25 %	50 %	25 %	295698872
714	NC_014118	CG	3	6	23740	23745	0 %	0 %	50 %	50 %	295698872
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751	NC_014118	CGA	2	6	24880	24885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698873
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753	NC_014118	GAA	2	6	24981	24986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698873
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755	NC_014118	CG	5	10	25083	25092	0 %	0 %	50 %	50 %	295698873
756	NC_014118	GCATC	2	10	25133	25142	20 %	20 %	20 %	40 %	295698873
757	NC_014118	GCG	3	9	25150	25158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698873
758	NC_014118	GGCG	2	8	25253	25260	0 %	0 %	75 %	25 %	295698873
759	NC_014118	CGCGC	2	10	25298	25307	0 %	0 %	40 %	60 %	295698873
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998	NC_014118	TCG	2	6	33338	33343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698880
999	NC_014118	CGG	2	6	33387	33392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698880
1000	NC_014118	TGC	3	9	33393	33401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698880

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