MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-02

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013793	ATTA	2	8	272	279	50 %	50 %	0 %	0 %	288557108
2	NC_013793	AACG	2	8	292	299	50 %	0 %	25 %	25 %	288557108
3	NC_013793	TCTT	2	8	1808	1815	0 %	75 %	0 %	25 %	288557110
4	NC_013793	TCAA	2	8	1908	1915	50 %	25 %	0 %	25 %	288557110
5	NC_013793	CTTT	2	8	2339	2346	0 %	75 %	0 %	25 %	288557110
6	NC_013793	GGGT	2	8	2796	2803	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013793	CTTT	2	8	3201	3208	0 %	75 %	0 %	25 %	288557111
8	NC_013793	ACAG	2	8	3387	3394	50 %	0 %	25 %	25 %	288557111
9	NC_013793	ATAG	2	8	3888	3895	50 %	25 %	25 %	0 %	288557111
10	NC_013793	TATT	2	8	4138	4145	25 %	75 %	0 %	0 %	288557112
11	NC_013793	ATGA	2	8	4225	4232	50 %	25 %	25 %	0 %	288557112
12	NC_013793	AAAT	2	8	4633	4640	75 %	25 %	0 %	0 %	288557114
13	NC_013793	ACAA	2	8	5077	5084	75 %	0 %	0 %	25 %	288557115
14	NC_013793	AAGA	2	8	5821	5828	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013793	AATT	2	8	5903	5910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013793	ATTT	2	8	6141	6148	25 %	75 %	0 %	0 %	288557117
17	NC_013793	ATAA	2	8	6339	6346	75 %	25 %	0 %	0 %	288557117
18	NC_013793	TATT	2	8	6449	6456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013793	GAGC	2	8	6953	6960	25 %	0 %	50 %	25 %	288557119
20	NC_013793	CAGC	2	8	7802	7809	25 %	0 %	25 %	50 %	288557119
21	NC_013793	GAAA	2	8	7868	7875	75 %	0 %	25 %	0 %	288557119
22	NC_013793	TTAA	2	8	7992	7999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013793	GTTT	2	8	8037	8044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013793	AACT	2	8	8319	8326	50 %	25 %	0 %	25 %	288557120
25	NC_013793	ATTC	2	8	8401	8408	25 %	50 %	0 %	25 %	288557120
26	NC_013793	TGGT	2	8	8477	8484	0 %	50 %	50 %	0 %	288557120
27	NC_013793	GAAA	2	8	9016	9023	75 %	0 %	25 %	0 %	288557120
28	NC_013793	CCCT	2	8	9224	9231	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_013793	GCAT	2	8	9246	9253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013793	GGTG	2	8	9259	9266	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013793	CTAA	2	8	9282	9289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013793	AATT	2	8	9926	9933	50 %	50 %	0 %	0 %	288557121
33	NC_013793	CTTT	2	8	10153	10160	0 %	75 %	0 %	25 %	288557122
34	NC_013793	ATGT	2	8	10274	10281	25 %	50 %	25 %	0 %	288557122
35	NC_013793	TCCT	2	8	10498	10505	0 %	50 %	0 %	50 %	288557122
36	NC_013793	ATTT	2	8	10736	10743	25 %	75 %	0 %	0 %	288557122
37	NC_013793	ATCG	2	8	11138	11145	25 %	25 %	25 %	25 %	288557122
38	NC_013793	TAAC	2	8	11240	11247	50 %	25 %	0 %	25 %	288557122
39	NC_013793	TAGG	2	8	11314	11321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013793	AAAG	2	8	11399	11406	75 %	0 %	25 %	0 %	288557123
41	NC_013793	TTTC	2	8	12131	12138	0 %	75 %	0 %	25 %	288557123
42	NC_013793	AACT	2	8	12393	12400	50 %	25 %	0 %	25 %	288557123
43	NC_013793	CTAC	2	8	12453	12460	25 %	25 %	0 %	50 %	288557124
44	NC_013793	TAAA	2	8	12796	12803	75 %	25 %	0 %	0 %	288557124
45	NC_013793	TATG	2	8	13222	13229	25 %	50 %	25 %	0 %	288557124
46	NC_013793	TAAA	2	8	13417	13424	75 %	25 %	0 %	0 %	288557124
47	NC_013793	GAAA	2	8	13553	13560	75 %	0 %	25 %	0 %	288557124
48	NC_013793	AAGT	2	8	14824	14831	50 %	25 %	25 %	0 %	288557125
49	NC_013793	ATAC	2	8	15278	15285	50 %	25 %	0 %	25 %	288557126
50	NC_013793	AACG	2	8	15412	15419	50 %	0 %	25 %	25 %	288557126
51	NC_013793	ATGG	2	8	15647	15654	25 %	25 %	50 %	0 %	288557126
52	NC_013793	AACA	2	8	16071	16078	75 %	0 %	0 %	25 %	288557127
53	NC_013793	GTAA	2	8	16090	16097	50 %	25 %	25 %	0 %	288557127
54	NC_013793	TAAT	2	8	16508	16515	50 %	50 %	0 %	0 %	288557127
55	NC_013793	CATC	2	8	16952	16959	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013793	TCTG	2	8	17205	17212	0 %	50 %	25 %	25 %	288557128
57	NC_013793	AAAT	2	8	17700	17707	75 %	25 %	0 %	0 %	288557130
58	NC_013793	CGTC	2	8	18245	18252	0 %	25 %	25 %	50 %	288557131
59	NC_013793	ATTC	2	8	18552	18559	25 %	50 %	0 %	25 %	288557131
60	NC_013793	AAAT	2	8	19352	19359	75 %	25 %	0 %	0 %	288557132
61	NC_013793	TTCA	2	8	19407	19414	25 %	50 %	0 %	25 %	288557132
62	NC_013793	GAAA	2	8	19547	19554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013793	ATTT	2	8	19626	19633	25 %	75 %	0 %	0 %	288557133
64	NC_013793	TAAT	2	8	19816	19823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013793	ACCA	2	8	20234	20241	50 %	0 %	0 %	50 %	288557135
66	NC_013793	TTCT	2	8	20976	20983	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013793	AAAG	2	8	21940	21947	75 %	0 %	25 %	0 %	288557136
68	NC_013793	TTTG	2	8	21958	21965	0 %	75 %	25 %	0 %	288557137
69	NC_013793	TTTG	2	8	22330	22337	0 %	75 %	25 %	0 %	288557137
70	NC_013793	TCAA	2	8	22753	22760	50 %	25 %	0 %	25 %	288557137
71	NC_013793	TTTC	2	8	22922	22929	0 %	75 %	0 %	25 %	288557137
72	NC_013793	TAAT	2	8	23289	23296	50 %	50 %	0 %	0 %	288557137
73	NC_013793	TAGT	2	8	23373	23380	25 %	50 %	25 %	0 %	288557137
74	NC_013793	TAAA	2	8	23548	23555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013793	ATTT	2	8	23835	23842	25 %	75 %	0 %	0 %	288557138
76	NC_013793	TTAT	2	8	24165	24172	25 %	75 %	0 %	0 %	288557138
77	NC_013793	AACA	2	8	24634	24641	75 %	0 %	0 %	25 %	288557139
78	NC_013793	AATT	2	8	24672	24679	50 %	50 %	0 %	0 %	288557139
79	NC_013793	TAAA	2	8	25213	25220	75 %	25 %	0 %	0 %	288557140
80	NC_013793	CCTT	2	8	25295	25302	0 %	50 %	0 %	50 %	288557140
81	NC_013793	TAAG	2	8	25318	25325	50 %	25 %	25 %	0 %	288557140
82	NC_013793	TAAA	2	8	25410	25417	75 %	25 %	0 %	0 %	288557140
83	NC_013793	AGAA	2	8	26312	26319	75 %	0 %	25 %	0 %	288557141
84	NC_013793	TCTT	2	8	26396	26403	0 %	75 %	0 %	25 %	288557141
85	NC_013793	ACCA	2	8	26431	26438	50 %	0 %	0 %	50 %	288557141
86	NC_013793	ATGT	2	8	26665	26672	25 %	50 %	25 %	0 %	288557141
87	NC_013793	GAAG	2	8	26794	26801	50 %	0 %	50 %	0 %	288557141
88	NC_013793	TATT	2	8	27385	27392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013793	AAAT	2	8	27727	27734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013793	AGGT	2	8	27758	27765	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013793	TGGT	2	8	27980	27987	0 %	50 %	50 %	0 %	288557142
92	NC_013793	TTGG	2	8	28396	28403	0 %	50 %	50 %	0 %	288557142
93	NC_013793	CGGT	2	8	28418	28425	0 %	25 %	50 %	25 %	288557142
94	NC_013793	GAGG	2	8	28764	28771	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013793	TAGA	2	8	28807	28814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013793	CAAC	2	8	29150	29157	50 %	0 %	0 %	50 %	288557143
97	NC_013793	AGCA	2	8	29267	29274	50 %	0 %	25 %	25 %	288557143
98	NC_013793	TGCT	2	8	29927	29934	0 %	50 %	25 %	25 %	288557143
99	NC_013793	GAAA	2	8	30503	30510	75 %	0 %	25 %	0 %	288557143
100	NC_013793	ATAA	2	8	31078	31085	75 %	25 %	0 %	0 %	288557145
101	NC_013793	AAAT	2	8	31409	31416	75 %	25 %	0 %	0 %	288557145
102	NC_013793	TACT	2	8	31455	31462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013793	GAAG	2	8	32053	32060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013793	AGAT	2	8	32179	32186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013793	CTTT	2	8	32703	32710	0 %	75 %	0 %	25 %	288557147
106	NC_013793	TTAT	2	8	32874	32881	25 %	75 %	0 %	0 %	288557147
107	NC_013793	ATGT	2	8	33728	33735	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013793	AAAT	2	8	33968	33975	75 %	25 %	0 %	0 %	288557149
109	NC_013793	AACT	2	8	34431	34438	50 %	25 %	0 %	25 %	288557150
110	NC_013793	TGAT	2	8	34496	34503	25 %	50 %	25 %	0 %	288557150
111	NC_013793	GAAA	2	8	34773	34780	75 %	0 %	25 %	0 %	288557150
112	NC_013793	TGTT	2	8	34942	34949	0 %	75 %	25 %	0 %	288557150
113	NC_013793	GTAC	2	8	35375	35382	25 %	25 %	25 %	25 %	288557151
114	NC_013793	CAAG	2	8	35994	36001	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013793	AATA	4	16	36017	36032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013793	ACGA	2	8	36046	36053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013793	TTAA	2	8	36190	36197	50 %	50 %	0 %	0 %	288557152
118	NC_013793	TTTA	2	8	36198	36205	25 %	75 %	0 %	0 %	288557152
119	NC_013793	AAAT	2	8	36417	36424	75 %	25 %	0 %	0 %	288557152
120	NC_013793	TTCT	2	8	36674	36681	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013793	ATTA	2	8	37146	37153	50 %	50 %	0 %	0 %	288557153
122	NC_013793	ATTT	2	8	37195	37202	25 %	75 %	0 %	0 %	288557153
123	NC_013793	AATG	2	8	37957	37964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013793	AAAG	2	8	38220	38227	75 %	0 %	25 %	0 %	288557156
125	NC_013793	AGAA	2	8	38710	38717	75 %	0 %	25 %	0 %	288557156
126	NC_013793	GAAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	288557156
127	NC_013793	TGTT	2	8	39190	39197	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013793	AGTT	2	8	39269	39276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013793	TTTA	2	8	39640	39647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013793	GAAC	2	8	40557	40564	50 %	0 %	25 %	25 %	288557158
131	NC_013793	TTAT	2	8	40927	40934	25 %	75 %	0 %	0 %	288557159
132	NC_013793	TTTA	2	8	41115	41122	25 %	75 %	0 %	0 %	288557159
133	NC_013793	CAAC	2	8	41410	41417	50 %	0 %	0 %	50 %	288557160
134	NC_013793	TAAG	2	8	41428	41435	50 %	25 %	25 %	0 %	288557160
135	NC_013793	TGCT	2	8	41558	41565	0 %	50 %	25 %	25 %	288557161
136	NC_013793	AAGA	2	8	41782	41789	75 %	0 %	25 %	0 %	288557162
137	NC_013793	AAGA	2	8	42023	42030	75 %	0 %	25 %	0 %	288557163
138	NC_013793	GACC	2	8	42079	42086	25 %	0 %	25 %	50 %	288557163
139	NC_013793	AATA	2	8	42241	42248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013793	GTTT	2	8	43145	43152	0 %	75 %	25 %	0 %	288557165
141	NC_013793	TGGG	2	8	43289	43296	0 %	25 %	75 %	0 %	288557165
142	NC_013793	AATA	2	8	43439	43446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013793	CATA	2	8	44054	44061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013793	GAGT	2	8	44111	44118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013793	AAAG	2	8	44187	44194	75 %	0 %	25 %	0 %	288557166
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.