MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-01

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013792	CATTAT	2	12	2164	2175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288561478
2	NC_013792	TGCTTT	2	12	7285	7296	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013792	CCAATG	2	12	13705	13716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288561493
4	NC_013792	TTGATA	2	12	15094	15105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288561495
5	NC_013792	AAAAAG	2	12	16459	16470	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	288561496
6	NC_013792	GTTTTT	2	12	18389	18400	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	288561498
7	NC_013792	AAATAA	2	12	19932	19943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	288561500
8	NC_013792	AATTAA	2	12	21415	21426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013792	TATTAA	2	12	27482	27493	50 %	50 %	0 %	0 %	288561506
10	NC_013792	ATTTAG	2	12	31716	31727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288561513
11	NC_013792	ATTTCA	2	12	34269	34280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288561515
12	NC_013792	CTTTTT	2	12	34995	35006	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013792	AATTTA	2	12	35345	35356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013792	ATTATA	2	12	39388	39399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013792	TCTTTT	2	12	40634	40645	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	288561521
16	NC_013792	ATCAAC	2	12	42031	42042	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288561522
17	NC_013792	TCTTTT	2	12	43086	43097	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	288561523
18	NC_013792	TTCATT	2	12	44318	44329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	288561523
19	NC_013792	CATTTT	2	12	46638	46649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013792	AACGAT	2	12	47287	47298	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	288561527
21	NC_013792	ATTTGG	2	12	48190	48201	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013792	TTTTGG	2	12	50668	50679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288561530
23	NC_013792	ATCAAC	2	12	52337	52348	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288561531
24	NC_013792	AGATTT	2	12	55686	55697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288561534
25	NC_013792	TACATG	2	12	57927	57938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	288561536
26	NC_013792	TGATAT	2	12	59162	59173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288561538
27	NC_013792	TCAACA	2	12	62354	62365	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288561541
28	NC_013792	TATGAT	2	12	62586	62597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288561541
29	NC_013792	TCTTTT	2	12	64688	64699	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	288561543
30	NC_013792	AAAAAG	2	12	67290	67301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	288561547
31	NC_013792	GTAACT	2	12	68609	68620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	288561548
32	NC_013792	TAAAAA	2	12	68712	68723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013792	TTCATT	2	12	69144	69155	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	288561549
34	NC_013792	AATTCC	2	12	72758	72769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288561552
35	NC_013792	AAAAAT	2	12	74942	74953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	288561555
36	NC_013792	TACAAA	2	12	76079	76090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	288561557
37	NC_013792	AAAATT	2	12	76536	76547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288561557
38	NC_013792	TCCAAT	2	12	77276	77287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288561558
39	NC_013792	AAAAAG	2	12	78231	78242	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013792	TTTATC	2	12	81571	81582	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	288561562
41	NC_013792	TGACTT	2	12	84358	84369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	288561565
42	NC_013792	AGAACA	2	12	84809	84820	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288561566
43	NC_013792	TAACAC	2	12	87473	87484	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288561568
44	NC_013792	GAATCA	2	12	90897	90908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	288561571
45	NC_013792	GAATTG	2	12	92156	92167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288561572
46	NC_013792	CTTAAT	2	12	96503	96514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288561576
47	NC_013792	TCACTT	2	12	98843	98854	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288561578
48	NC_013792	CATGTC	2	12	101831	101842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288561580
49	NC_013792	CATGTC	2	12	101870	101881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288561580
50	NC_013792	TTCTCT	2	12	105422	105433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288561584
51	NC_013792	ACTTGT	2	12	105909	105920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013792	GTTCAC	2	12	108397	108408	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288561587
53	NC_013792	CGAAGC	2	12	110463	110474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288561589
54	NC_013792	GCTACA	2	12	114537	114548	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288561594
55	NC_013792	TTATTT	2	12	115280	115291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	288561597
56	NC_013792	CATTCT	2	12	119883	119894	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288561602
57	NC_013792	TTGATG	2	12	122224	122235	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	288561603
58	NC_013792	GCACCA	2	12	123210	123221	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288561603
59	NC_013792	TTAAAC	2	12	128659	128670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013792	GCATTT	2	12	133369	133380	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	288561613
61	NC_013792	CCTTTT	2	12	134027	134038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288561613
62	NC_013792	TATCAA	2	12	141527	141538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	288561618
63	NC_013792	ATCGGC	2	12	144069	144080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288561620
64	NC_013792	CATTAC	2	12	144614	144625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288561621
65	NC_013792	GTGAAC	2	12	147126	147137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288561623
66	NC_013792	CTAATT	2	12	154326	154337	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288561633
67	NC_013792	TTTAAA	2	12	154415	154426	50 %	50 %	0 %	0 %	288561633
68	NC_013792	TTGGAA	2	12	154660	154671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288561633
69	NC_013792	TTTTAT	2	12	155796	155807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013792	ATTTCT	2	12	157299	157310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013792	CTGGCT	2	12	163155	163166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288561641
72	NC_013792	TTAAAT	2	12	163695	163706	50 %	50 %	0 %	0 %	288561642
73	NC_013792	TGCTCC	2	12	163856	163867	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	288561642
74	NC_013792	CTTTCA	2	12	164830	164841	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288561643
75	NC_013792	CCTCCA	2	12	172952	172963	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	288561652
76	NC_013792	AGAAGC	2	12	176902	176913	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	288561654
77	NC_013792	CTTTCT	2	12	179073	179084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288561659
78	NC_013792	CTACTT	2	12	183486	183497	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288561661
79	NC_013792	GATATT	2	12	190026	190037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288561670
80	NC_013792	CATTGG	2	12	191180	191191	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288561671
81	NC_013792	TTCATA	2	12	193837	193848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288561673
82	NC_013792	AACCAA	2	12	195593	195604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288561673
83	NC_013792	TGAAGA	2	12	198468	198479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288561675
84	NC_013792	TAAATA	2	12	200839	200850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288561678
85	NC_013792	TTAATA	2	12	201219	201230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013792	GAAAAA	2	12	208079	208090	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013792	TATTGT	2	12	209934	209945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	288561692
88	NC_013792	TCTACT	2	12	213168	213179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288561696
89	NC_013792	TGACTA	2	12	217176	217187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	288561699
90	NC_013792	GTAGAA	2	12	217826	217837	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288561700
91	NC_013792	AAACGA	2	12	219196	219207	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288561701
92	NC_013792	AATCCG	2	12	224504	224515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288561706
93	NC_013792	ATAGAA	2	12	227426	227437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288561709
94	NC_013792	TCTAGG	2	12	228702	228713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288561710
95	NC_013792	TCCAAA	2	12	230935	230946	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288561712
96	NC_013792	ATGCTG	2	12	231591	231602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288561712
97	NC_013792	CTCTAC	2	12	232159	232170	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	288561712
98	NC_013792	GAAAGT	2	12	239617	239628	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288561718
99	NC_013792	AATGAA	2	12	239701	239712	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288561718
100	NC_013792	AAAGAA	2	12	241945	241956	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	288561720
101	NC_013792	TAATAT	2	12	244418	244429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013792	AAATCT	2	12	246013	246024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	288561723
103	NC_013792	AGAACC	2	12	247012	247023	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288561724
104	NC_013792	AGAACC	2	12	247030	247041	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288561724
105	NC_013792	ACTAAT	2	12	251383	251394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013792	CATTCT	2	12	251970	251981	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013792	CATATG	2	12	254468	254479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013792	TTTTTA	2	12	254687	254698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013792	AAATGA	2	12	258674	258685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288561738
110	NC_013792	TCACTA	2	12	260738	260749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288561740
111	NC_013792	ATGAAA	2	12	264696	264707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288561746
112	NC_013792	AAAACA	2	12	267405	267416	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	288561747
113	NC_013792	ATTCTC	2	12	271688	271699	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288561750
114	NC_013792	TATAAT	2	12	271897	271908	50 %	50 %	0 %	0 %	288561750
115	NC_013792	ATTTTA	2	12	275431	275442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288561755
116	NC_013792	TCAACA	2	12	276090	276101	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288561756
117	NC_013792	CTAAAC	2	12	280077	280088	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288561761
118	NC_013792	CAAAAA	2	12	280142	280153	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	288561761
119	NC_013792	ATATTA	2	12	282113	282124	50 %	50 %	0 %	0 %	288561765
120	NC_013792	ATATTA	2	12	283871	283882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013792	ATTAAG	2	12	284388	284399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288561767
122	NC_013792	TTGGTA	2	12	285077	285088	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	288561768

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.