MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus pseudofirmus OF4 plasmid pBpOF4-01

Total Repeats: 284

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013792	GGGGA	2	10	2291	2300	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013792	GCAAG	2	10	2530	2539	40 %	0 %	40 %	20 %	288561479
3	NC_013792	AGAAT	2	10	2819	2828	60 %	20 %	20 %	0 %	288561479
4	NC_013792	GTAAA	2	10	3969	3978	60 %	20 %	20 %	0 %	288561481
5	NC_013792	ATTAT	2	10	4097	4106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013792	CTATC	2	10	4289	4298	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013792	AAAAG	2	10	6677	6686	80 %	0 %	20 %	0 %	288561483
8	NC_013792	GAAGG	2	10	6912	6921	40 %	0 %	60 %	0 %	288561484
9	NC_013792	TAATA	2	10	7259	7268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013792	TCTTT	2	10	7895	7904	0 %	80 %	0 %	20 %	288561486
11	NC_013792	CTTTT	2	10	9719	9728	0 %	80 %	0 %	20 %	288561488
12	NC_013792	GTAGT	2	10	10043	10052	20 %	40 %	40 %	0 %	288561489
13	NC_013792	TAATA	2	10	12044	12053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013792	AATGA	2	10	12688	12697	60 %	20 %	20 %	0 %	288561492
15	NC_013792	GGATT	2	10	13264	13273	20 %	40 %	40 %	0 %	288561493
16	NC_013792	ACTAT	2	10	14146	14155	40 %	40 %	0 %	20 %	288561494
17	NC_013792	CTATT	2	10	14190	14199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013792	AAAGT	2	10	14793	14802	60 %	20 %	20 %	0 %	288561495
19	NC_013792	AATGA	2	10	15424	15433	60 %	20 %	20 %	0 %	288561495
20	NC_013792	GAAAT	2	10	15691	15700	60 %	20 %	20 %	0 %	288561496
21	NC_013792	GATTG	2	10	16834	16843	20 %	40 %	40 %	0 %	288561496
22	NC_013792	GCAAA	2	10	17562	17571	60 %	0 %	20 %	20 %	288561497
23	NC_013792	GATTT	2	10	18276	18285	20 %	60 %	20 %	0 %	288561498
24	NC_013792	ATTCG	2	10	19668	19677	20 %	40 %	20 %	20 %	288561500
25	NC_013792	ATCAA	2	10	21438	21447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013792	TTCCA	2	10	22603	22612	20 %	40 %	0 %	40 %	288561501
27	NC_013792	ATTTC	2	10	23627	23636	20 %	60 %	0 %	20 %	288561502
28	NC_013792	GTTGG	2	10	24377	24386	0 %	40 %	60 %	0 %	288561503
29	NC_013792	AAAGT	2	10	24534	24543	60 %	20 %	20 %	0 %	288561503
30	NC_013792	ATTTT	2	10	24831	24840	20 %	80 %	0 %	0 %	288561504
31	NC_013792	AAAAC	2	10	27407	27416	80 %	0 %	0 %	20 %	288561506
32	NC_013792	ATTTT	2	10	28578	28587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013792	ATAAA	2	10	28599	28608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013792	AAAAT	2	10	28878	28887	80 %	20 %	0 %	0 %	288561509
35	NC_013792	TATAA	2	10	30742	30751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013792	TATTT	2	10	31013	31022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013792	ATGAT	2	10	32601	32610	40 %	40 %	20 %	0 %	288561514
38	NC_013792	CATTA	2	10	32776	32785	40 %	40 %	0 %	20 %	288561514
39	NC_013792	ATTTA	2	10	33689	33698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013792	TTTAA	2	10	33887	33896	40 %	60 %	0 %	0 %	288561515
41	NC_013792	GAAAG	2	10	35935	35944	60 %	0 %	40 %	0 %	288561516
42	NC_013792	ATCCG	2	10	36386	36395	20 %	20 %	20 %	40 %	288561516
43	NC_013792	TGACA	2	10	37057	37066	40 %	20 %	20 %	20 %	288561517
44	NC_013792	AGAAA	2	10	37076	37085	80 %	0 %	20 %	0 %	288561517
45	NC_013792	AGAGG	2	10	40872	40881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013792	TAAAG	2	10	41444	41453	60 %	20 %	20 %	0 %	288561522
47	NC_013792	TTATC	2	10	42279	42288	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013792	TATGA	2	10	45203	45212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013792	TTTTC	2	10	45215	45224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013792	CTCAC	2	10	46962	46971	20 %	20 %	0 %	60 %	288561527
51	NC_013792	CTGTA	2	10	49665	49674	20 %	40 %	20 %	20 %	288561529
52	NC_013792	AAAAC	2	10	49826	49835	80 %	0 %	0 %	20 %	288561529
53	NC_013792	ATAAC	2	10	51497	51506	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013792	TGATG	2	10	52730	52739	20 %	40 %	40 %	0 %	288561531
55	NC_013792	TTTAG	2	10	55286	55295	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013792	ATTTA	2	10	55329	55338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013792	GAAGA	2	10	55645	55654	60 %	0 %	40 %	0 %	288561534
58	NC_013792	TTCTT	2	10	56347	56356	0 %	80 %	0 %	20 %	288561534
59	NC_013792	AAATG	2	10	57112	57121	60 %	20 %	20 %	0 %	288561535
60	NC_013792	ATATT	2	10	57387	57396	40 %	60 %	0 %	0 %	288561535
61	NC_013792	GAAGC	2	10	57910	57919	40 %	0 %	40 %	20 %	288561536
62	NC_013792	TTTTA	2	10	58502	58511	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013792	TAAAA	2	10	59317	59326	80 %	20 %	0 %	0 %	288561538
64	NC_013792	TTGAG	2	10	59965	59974	20 %	40 %	40 %	0 %	288561539
65	NC_013792	ATTGT	2	10	61311	61320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013792	AAAGA	2	10	62524	62533	80 %	0 %	20 %	0 %	288561541
67	NC_013792	TTTTC	2	10	66166	66175	0 %	80 %	0 %	20 %	288561544
68	NC_013792	CATTT	2	10	66250	66259	20 %	60 %	0 %	20 %	288561544
69	NC_013792	GCGAT	2	10	68269	68278	20 %	20 %	40 %	20 %	288561548
70	NC_013792	AAGTG	2	10	68445	68454	40 %	20 %	40 %	0 %	288561548
71	NC_013792	AAGAA	2	10	69188	69197	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013792	CTTCC	2	10	70268	70277	0 %	40 %	0 %	60 %	288561551
73	NC_013792	CTCTT	2	10	71078	71087	0 %	60 %	0 %	40 %	288561552
74	NC_013792	CGGCT	2	10	71567	71576	0 %	20 %	40 %	40 %	288561552
75	NC_013792	ATCAA	2	10	74987	74996	60 %	20 %	0 %	20 %	288561555
76	NC_013792	CTTTT	2	10	75970	75979	0 %	80 %	0 %	20 %	288561557
77	NC_013792	TAAAC	2	10	77257	77266	60 %	20 %	0 %	20 %	288561558
78	NC_013792	ATTGC	2	10	77528	77537	20 %	40 %	20 %	20 %	288561558
79	NC_013792	TCTTT	2	10	78601	78610	0 %	80 %	0 %	20 %	288561559
80	NC_013792	TTCAT	2	10	78624	78633	20 %	60 %	0 %	20 %	288561559
81	NC_013792	TCAAA	2	10	81705	81714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013792	TCAAA	2	10	81849	81858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013792	AACCA	2	10	82436	82445	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013792	ACATT	2	10	84302	84311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013792	AGATA	2	10	90314	90323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013792	TGATT	2	10	90476	90485	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013792	TAGGA	2	10	92069	92078	40 %	20 %	40 %	0 %	288561572
88	NC_013792	TAAAG	2	10	92771	92780	60 %	20 %	20 %	0 %	288561573
89	NC_013792	ACTCC	2	10	92959	92968	20 %	20 %	0 %	60 %	288561573
90	NC_013792	TCGTT	2	10	94446	94455	0 %	60 %	20 %	20 %	288561574
91	NC_013792	GTTTT	2	10	98376	98385	0 %	80 %	20 %	0 %	288561577
92	NC_013792	GCTTG	2	10	99980	99989	0 %	40 %	40 %	20 %	288561579
93	NC_013792	ATATT	2	10	100373	100382	40 %	60 %	0 %	0 %	288561579
94	NC_013792	GTATC	2	10	100715	100724	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013792	ACAGA	2	10	100799	100808	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013792	AATAG	2	10	103023	103032	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013792	TAAAC	2	10	106543	106552	60 %	20 %	0 %	20 %	288561585
98	NC_013792	AACTT	2	10	107492	107501	40 %	40 %	0 %	20 %	288561586
99	NC_013792	TTGAT	2	10	107673	107682	20 %	60 %	20 %	0 %	288561587
100	NC_013792	CAATA	2	10	107972	107981	60 %	20 %	0 %	20 %	288561587
101	NC_013792	ATCGT	2	10	108451	108460	20 %	40 %	20 %	20 %	288561587
102	NC_013792	CAAGG	2	10	109523	109532	40 %	0 %	40 %	20 %	288561588
103	NC_013792	AAAAT	2	10	111313	111322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013792	GAAAA	2	10	111459	111468	80 %	0 %	20 %	0 %	288561590
105	NC_013792	AAGCC	2	10	111698	111707	40 %	0 %	20 %	40 %	288561591
106	NC_013792	CCAGT	2	10	112179	112188	20 %	20 %	20 %	40 %	288561592
107	NC_013792	CTTGT	2	10	112364	112373	0 %	60 %	20 %	20 %	288561592
108	NC_013792	AATGA	2	10	112792	112801	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013792	TGCTT	2	10	112868	112877	0 %	60 %	20 %	20 %	288561593
110	NC_013792	ATCAC	2	10	113115	113124	40 %	20 %	0 %	40 %	288561594
111	NC_013792	AACAA	2	10	115436	115445	80 %	0 %	0 %	20 %	288561597
112	NC_013792	CTTTT	2	10	116573	116582	0 %	80 %	0 %	20 %	288561599
113	NC_013792	CTCTT	2	10	119020	119029	0 %	60 %	0 %	40 %	288561601
114	NC_013792	CGATG	2	10	119353	119362	20 %	20 %	40 %	20 %	288561601
115	NC_013792	ATACC	2	10	121647	121656	40 %	20 %	0 %	40 %	288561602
116	NC_013792	GAGGT	2	10	121999	122008	20 %	20 %	60 %	0 %	288561603
117	NC_013792	CCTTC	2	10	122821	122830	0 %	40 %	0 %	60 %	288561603
118	NC_013792	TGATA	2	10	123042	123051	40 %	40 %	20 %	0 %	288561603
119	NC_013792	TAACG	2	10	124858	124867	40 %	20 %	20 %	20 %	288561604
120	NC_013792	GCCTT	2	10	125083	125092	0 %	40 %	20 %	40 %	288561604
121	NC_013792	ATTTA	2	10	125775	125784	40 %	60 %	0 %	0 %	288561604
122	NC_013792	AAATG	2	10	127702	127711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013792	AAATA	2	10	128270	128279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013792	GATCT	2	10	128385	128394	20 %	40 %	20 %	20 %	288561608
125	NC_013792	GCTTG	2	10	129294	129303	0 %	40 %	40 %	20 %	288561609
126	NC_013792	TTTCT	2	10	129973	129982	0 %	80 %	0 %	20 %	288561610
127	NC_013792	GTTTT	2	10	131817	131826	0 %	80 %	20 %	0 %	288561612
128	NC_013792	ACTCT	2	10	132699	132708	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_013792	AAGTA	2	10	134167	134176	60 %	20 %	20 %	0 %	288561613
130	NC_013792	CATAG	2	10	134498	134507	40 %	20 %	20 %	20 %	288561613
131	NC_013792	ATTTG	2	10	134905	134914	20 %	60 %	20 %	0 %	288561613
132	NC_013792	AATAA	2	10	137679	137688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013792	TTCTC	2	10	138174	138183	0 %	60 %	0 %	40 %	288561616
134	NC_013792	CCCTA	2	10	138835	138844	20 %	20 %	0 %	60 %	288561617
135	NC_013792	CTTCA	2	10	139477	139486	20 %	40 %	0 %	40 %	288561617
136	NC_013792	ATTTA	2	10	140289	140298	40 %	60 %	0 %	0 %	288561618
137	NC_013792	TAAAT	2	10	140817	140826	60 %	40 %	0 %	0 %	288561618
138	NC_013792	ATATT	2	10	142535	142544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013792	TTTTC	2	10	144949	144958	0 %	80 %	0 %	20 %	288561621
140	NC_013792	GGTTT	2	10	145278	145287	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_013792	AAAAT	2	10	251638	251647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_013792	AACGA	2	10	269569	269578	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.