MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 55133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013714	GAA	2	6	26401	26406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454980
502	NC_013714	GA	3	6	26435	26440	50 %	0 %	50 %	0 %	283454980
503	NC_013714	GACGA	2	10	26484	26493	40 %	0 %	40 %	20 %	283454980
504	NC_013714	GTTG	2	8	26525	26532	0 %	50 %	50 %	0 %	283454980
505	NC_013714	TCA	2	6	26533	26538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454980
506	NC_013714	CCT	2	6	26541	26546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_013714	CTC	2	6	26589	26594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_013714	GCGT	2	8	26666	26673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_013714	AATG	2	8	26722	26729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013714	GAA	2	6	26755	26760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013714	CATTC	2	10	26867	26876	20 %	40 %	0 %	40 %	283454981
512	NC_013714	GGA	2	6	26887	26892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283454981
513	NC_013714	ATG	2	6	27014	27019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454981
514	NC_013714	CATCG	2	10	27020	27029	20 %	20 %	20 %	40 %	283454981
515	NC_013714	CCT	2	6	27084	27089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283454981
516	NC_013714	ACC	2	6	27134	27139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454981
517	NC_013714	GCT	2	6	27163	27168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454981
518	NC_013714	AAG	2	6	27266	27271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454981
519	NC_013714	GAA	2	6	27301	27306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454981
520	NC_013714	CAG	2	6	27317	27322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454981
521	NC_013714	CGA	2	6	27349	27354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454981
522	NC_013714	TCGC	2	8	27407	27414	0 %	25 %	25 %	50 %	283454981
523	NC_013714	CCG	2	6	27527	27532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454981
524	NC_013714	GAC	2	6	27578	27583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454981
525	NC_013714	CAGG	2	8	27584	27591	25 %	0 %	50 %	25 %	283454981
526	NC_013714	GCCTGC	2	12	27680	27691	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283454981
527	NC_013714	CGG	3	9	27712	27720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454981
528	NC_013714	CAT	2	6	27791	27796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454981
529	NC_013714	TTC	2	6	27806	27811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454981
530	NC_013714	GCA	2	6	27895	27900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454981
531	NC_013714	CGG	2	6	27958	27963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454981
532	NC_013714	CAT	2	6	28024	28029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454981
533	NC_013714	GATG	2	8	28050	28057	25 %	25 %	50 %	0 %	283454981
534	NC_013714	CTGC	2	8	28123	28130	0 %	25 %	25 %	50 %	283454981
535	NC_013714	CGC	2	6	28207	28212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454981
536	NC_013714	TCG	2	6	28251	28256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454981
537	NC_013714	CCG	2	6	28269	28274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454981
538	NC_013714	TTGC	2	8	28298	28305	0 %	50 %	25 %	25 %	283454981
539	NC_013714	CTG	2	6	28310	28315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454981
540	NC_013714	CAT	2	6	28340	28345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454981
541	NC_013714	CTG	2	6	28349	28354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454981
542	NC_013714	ACCGT	2	10	28388	28397	20 %	20 %	20 %	40 %	283454981
543	NC_013714	CTGC	2	8	28510	28517	0 %	25 %	25 %	50 %	283454981
544	NC_013714	GGA	2	6	28589	28594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013714	GCG	3	9	28630	28638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013714	CA	3	6	28669	28674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_013714	CTG	2	6	28719	28724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
548	NC_013714	TCA	2	6	28753	28758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454982
549	NC_013714	GGT	2	6	28812	28817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
550	NC_013714	GGCT	2	8	28872	28879	0 %	25 %	50 %	25 %	283454982
551	NC_013714	GCC	2	6	28917	28922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454982
552	NC_013714	GGT	2	6	29006	29011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
553	NC_013714	CTT	2	6	29039	29044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454982
554	NC_013714	GAA	2	6	29066	29071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454982
555	NC_013714	TCA	2	6	29095	29100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454982
556	NC_013714	TTC	2	6	29109	29114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454982
557	NC_013714	GCT	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
558	NC_013714	GTT	2	6	29165	29170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454982
559	NC_013714	CGT	2	6	29210	29215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
560	NC_013714	CGG	2	6	29234	29239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454982
561	NC_013714	GTG	3	9	29250	29258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
562	NC_013714	TTC	2	6	29286	29291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454982
563	NC_013714	GCTG	2	8	29294	29301	0 %	25 %	50 %	25 %	283454982
564	NC_013714	GTG	2	6	29332	29337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
565	NC_013714	ACA	2	6	29341	29346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454982
566	NC_013714	CA	3	6	29387	29392	50 %	0 %	0 %	50 %	283454982
567	NC_013714	GC	3	6	29458	29463	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
568	NC_013714	AAG	2	6	29577	29582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454982
569	NC_013714	ATC	2	6	29589	29594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454982
570	NC_013714	CCA	2	6	29596	29601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283454982
571	NC_013714	GT	3	6	29606	29611	0 %	50 %	50 %	0 %	283454982
572	NC_013714	GCG	2	6	29626	29631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454982
573	NC_013714	ATG	2	6	29658	29663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454982
574	NC_013714	GTG	2	6	29709	29714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
575	NC_013714	TG	3	6	29740	29745	0 %	50 %	50 %	0 %	283454982
576	NC_013714	CGT	2	6	29747	29752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
577	NC_013714	CGC	2	6	29768	29773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454982
578	NC_013714	CTC	2	6	29783	29788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283454982
579	NC_013714	ATC	2	6	29802	29807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454982
580	NC_013714	ATG	2	6	29877	29882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454982
581	NC_013714	GC	3	6	29886	29891	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
582	NC_013714	GCT	2	6	29897	29902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
583	NC_013714	GGCC	2	8	29978	29985	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
584	NC_013714	CAA	2	6	30038	30043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283454982
585	NC_013714	TCA	2	6	30103	30108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454982
586	NC_013714	CGG	2	6	30116	30121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454982
587	NC_013714	CTG	2	6	30165	30170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454982
588	NC_013714	GTG	2	6	30177	30182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454982
589	NC_013714	CGC	2	6	30281	30286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283454982
590	NC_013714	CGG	2	6	30295	30300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454982
591	NC_013714	CG	3	6	30309	30314	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
592	NC_013714	TCT	2	6	30333	30338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013714	CAA	2	6	30362	30367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_013714	CG	3	6	30385	30390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_013714	AT	3	6	30391	30396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013714	ACT	2	6	30405	30410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_013714	TCT	2	6	30482	30487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013714	TTG	2	6	30490	30495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013714	TTCG	2	8	30555	30562	0 %	50 %	25 %	25 %	283454983
600	NC_013714	TTG	2	6	30568	30573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283454983
601	NC_013714	CAT	2	6	30575	30580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283454983
602	NC_013714	GTG	2	6	30638	30643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454983
603	NC_013714	CGG	2	6	30749	30754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
604	NC_013714	CAG	2	6	30759	30764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454983
605	NC_013714	GCGG	2	8	30776	30783	0 %	0 %	75 %	25 %	283454983
606	NC_013714	CTT	2	6	30828	30833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454983
607	NC_013714	TGG	2	6	30842	30847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454983
608	NC_013714	CGG	2	6	30854	30859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
609	NC_013714	ATG	2	6	30871	30876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454983
610	NC_013714	CGGC	2	8	30947	30954	0 %	0 %	50 %	50 %	283454983
611	NC_013714	CTT	2	6	30972	30977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454983
612	NC_013714	CGTT	2	8	30985	30992	0 %	50 %	25 %	25 %	283454983
613	NC_013714	ACG	2	6	30996	31001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454983
614	NC_013714	AGA	2	6	31070	31075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283454983
615	NC_013714	AGC	2	6	31108	31113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283454983
616	NC_013714	CGG	2	6	31232	31237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
617	NC_013714	CGG	2	6	31274	31279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
618	NC_013714	GGT	2	6	31326	31331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283454983
619	NC_013714	CGGT	2	8	31336	31343	0 %	25 %	50 %	25 %	283454983
620	NC_013714	GAT	3	9	31362	31370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454983
621	NC_013714	AGT	2	6	31424	31429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283454983
622	NC_013714	GGC	2	6	31442	31447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
623	NC_013714	CGGT	3	12	31448	31459	0 %	25 %	50 %	25 %	283454983
624	NC_013714	TCC	2	6	31492	31497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283454983
625	NC_013714	GCGTC	2	10	31508	31517	0 %	20 %	40 %	40 %	283454983
626	NC_013714	TTC	2	6	31525	31530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283454983
627	NC_013714	GCG	2	6	31531	31536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283454983
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629	NC_013714	CTG	2	6	31575	31580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283454983
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