MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 55133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013714	CGG	2	6	257283	257288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455145
5502	NC_013714	TAG	2	6	257328	257333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455145
5503	NC_013714	GAT	2	6	257360	257365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455146
5504	NC_013714	GCT	2	6	257455	257460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455146
5505	NC_013714	GCC	2	6	257495	257500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455146
5506	NC_013714	ATGC	2	8	257513	257520	25 %	25 %	25 %	25 %	283455146
5507	NC_013714	GAT	2	6	257593	257598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455146
5508	NC_013714	CGGT	2	8	257643	257650	0 %	25 %	50 %	25 %	283455146
5509	NC_013714	CGC	2	6	257750	257755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455146
5510	NC_013714	CAG	2	6	257840	257845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455146
5511	NC_013714	CCT	2	6	257866	257871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455146
5512	NC_013714	CGA	2	6	257881	257886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455146
5513	NC_013714	CGC	2	6	257888	257893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455146
5514	NC_013714	CG	3	6	257981	257986	0 %	0 %	50 %	50 %	283455146
5515	NC_013714	TCT	2	6	258100	258105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455146
5516	NC_013714	CCG	2	6	258193	258198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455146
5517	NC_013714	ATC	2	6	258248	258253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455146
5518	NC_013714	GTC	2	6	258287	258292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455146
5519	NC_013714	CCG	2	6	258348	258353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455146
5520	NC_013714	C	6	6	258375	258380	0 %	0 %	0 %	100 %	283455146
5521	NC_013714	TCT	2	6	258403	258408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455146
5522	NC_013714	CGA	2	6	258433	258438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_013714	TCT	2	6	258473	258478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_013714	AACGG	2	10	258490	258499	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5525	NC_013714	GCGG	2	8	258565	258572	0 %	0 %	75 %	25 %	283455147
5526	NC_013714	GACG	2	8	258592	258599	25 %	0 %	50 %	25 %	283455147
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5529	NC_013714	CGGTG	2	10	258686	258695	0 %	20 %	60 %	20 %	283455147
5530	NC_013714	CGG	2	6	258717	258722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455147
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5532	NC_013714	CGG	2	6	258772	258777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455147
5533	NC_013714	ACGC	2	8	258860	258867	25 %	0 %	25 %	50 %	283455147
5534	NC_013714	GC	3	6	258904	258909	0 %	0 %	50 %	50 %	283455147
5535	NC_013714	CGA	2	6	258922	258927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455147
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5537	NC_013714	TCG	2	6	258981	258986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455147
5538	NC_013714	CTTGAT	2	12	259001	259012	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	283455147
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5541	NC_013714	CGG	2	6	259050	259055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455147
5542	NC_013714	G	6	6	259087	259092	0 %	0 %	100 %	0 %	283455147
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5545	NC_013714	CAG	2	6	259187	259192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455147
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5553	NC_013714	CGAT	2	8	259698	259705	25 %	25 %	25 %	25 %	283455147
5554	NC_013714	GCC	2	6	259706	259711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455147
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5557	NC_013714	TCG	2	6	259818	259823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455147
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5593	NC_013714	AAC	2	6	261143	261148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_013714	GAT	2	6	261360	261365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5620	NC_013714	GAT	2	6	262155	262160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_013714	TGA	2	6	262176	262181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455149
5622	NC_013714	CGC	2	6	262237	262242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455149
5623	NC_013714	CTG	2	6	262283	262288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5624	NC_013714	CTA	2	6	262300	262305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455149
5625	NC_013714	GAC	2	6	262314	262319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5626	NC_013714	TCGGC	2	10	262375	262384	0 %	20 %	40 %	40 %	283455149
5627	NC_013714	GGA	2	6	262489	262494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455149
5628	NC_013714	AGG	2	6	262534	262539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455149
5629	NC_013714	TGC	2	6	262623	262628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5630	NC_013714	GCG	2	6	262643	262648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5631	NC_013714	CG	3	6	262653	262658	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5632	NC_013714	CG	3	6	262717	262722	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5633	NC_013714	TGA	2	6	262744	262749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455149
5634	NC_013714	TGAT	2	8	262791	262798	25 %	50 %	25 %	0 %	283455149
5635	NC_013714	TCG	2	6	262911	262916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5636	NC_013714	GAG	2	6	262979	262984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455149
5637	NC_013714	TGCG	2	8	263013	263020	0 %	25 %	50 %	25 %	283455149
5638	NC_013714	GCG	2	6	263153	263158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5639	NC_013714	TGC	2	6	263190	263195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
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5641	NC_013714	GCG	2	6	263273	263278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5642	NC_013714	CGA	2	6	263359	263364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5643	NC_013714	ATGCCG	2	12	263421	263432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5644	NC_013714	GTC	2	6	263441	263446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5645	NC_013714	ATG	2	6	263460	263465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455149
5646	NC_013714	TGC	2	6	263502	263507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5647	NC_013714	TGC	2	6	263511	263516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5648	NC_013714	GCG	2	6	263543	263548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5649	NC_013714	GAAG	2	8	263572	263579	50 %	0 %	50 %	0 %	283455149
5650	NC_013714	GGC	2	6	263609	263614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5651	NC_013714	TCG	2	6	263691	263696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5652	NC_013714	CGC	2	6	263704	263709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455149
5653	NC_013714	TGA	2	6	263754	263759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455149
5654	NC_013714	CAT	2	6	263803	263808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455149
5655	NC_013714	CG	3	6	263851	263856	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5656	NC_013714	GCCG	2	8	264083	264090	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5657	NC_013714	AGG	2	6	264120	264125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455149
5658	NC_013714	GC	3	6	264130	264135	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5659	NC_013714	CG	3	6	264178	264183	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5660	NC_013714	ACCG	2	8	264351	264358	25 %	0 %	25 %	50 %	283455150
5661	NC_013714	GTGA	2	8	264373	264380	25 %	25 %	50 %	0 %	283455150
5662	NC_013714	AAC	2	6	264383	264388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455150
5663	NC_013714	GTC	2	6	264406	264411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5664	NC_013714	ATGG	2	8	264441	264448	25 %	25 %	50 %	0 %	283455150
5665	NC_013714	GTG	2	6	264469	264474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455150
5666	NC_013714	GCT	2	6	264495	264500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5667	NC_013714	GTC	2	6	264523	264528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5668	NC_013714	CCA	2	6	264539	264544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455150
5669	NC_013714	TCG	2	6	264554	264559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5670	NC_013714	CGT	2	6	264619	264624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5671	NC_013714	ATC	2	6	264634	264639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455150
5672	NC_013714	GGT	2	6	264640	264645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455150
5673	NC_013714	CGG	2	6	264659	264664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455150
5674	NC_013714	ATG	2	6	264667	264672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5675	NC_013714	ACCGT	2	10	264691	264700	20 %	20 %	20 %	40 %	283455150
5676	NC_013714	TCG	2	6	264746	264751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5677	NC_013714	ACCG	2	8	264772	264779	25 %	0 %	25 %	50 %	283455150
5678	NC_013714	GGT	2	6	264847	264852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455150
5679	NC_013714	GAT	2	6	264855	264860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5680	NC_013714	CGC	2	6	264936	264941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455150
5681	NC_013714	CGA	2	6	265025	265030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5682	NC_013714	ACT	2	6	265043	265048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455150
5683	NC_013714	TCG	2	6	265076	265081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5684	NC_013714	ATG	2	6	265132	265137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5685	NC_013714	ATG	2	6	265186	265191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5686	NC_013714	CGCCAT	2	12	265197	265208	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283455150
5687	NC_013714	CAT	2	6	265296	265301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455150
5688	NC_013714	TTC	2	6	265306	265311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455150
5689	NC_013714	GAT	3	9	265326	265334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5690	NC_013714	CCG	2	6	265424	265429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455150
5691	NC_013714	GCC	2	6	265492	265497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455150
5692	NC_013714	GCT	2	6	265554	265559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5693	NC_013714	GC	3	6	265562	265567	0 %	0 %	50 %	50 %	283455150
5694	NC_013714	TCA	2	6	265580	265585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455150
5695	NC_013714	ATCA	2	8	265629	265636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5696	NC_013714	GCGG	2	8	265641	265648	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5697	NC_013714	GCC	2	6	265684	265689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5698	NC_013714	GGT	2	6	265726	265731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5699	NC_013714	CGG	2	6	265739	265744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5700	NC_013714	CGG	2	6	265836	265841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5701	NC_013714	ACC	2	6	265854	265859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5702	NC_013714	GCG	2	6	265891	265896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455151
5703	NC_013714	CGC	2	6	265916	265921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455151
5704	NC_013714	CCG	2	6	265975	265980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455151
5705	NC_013714	AGCC	2	8	265999	266006	25 %	0 %	25 %	50 %	283455151
5706	NC_013714	GCG	2	6	266041	266046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455151
5707	NC_013714	GTG	3	9	266080	266088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455151
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5710	NC_013714	TGG	2	6	266177	266182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455151
5711	NC_013714	TGC	2	6	266213	266218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455151
5712	NC_013714	TGG	2	6	266368	266373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455151
5713	NC_013714	TCG	2	6	266423	266428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455151
5714	NC_013714	GCGG	2	8	266805	266812	0 %	0 %	75 %	25 %	283455151
5715	NC_013714	GGC	2	6	266903	266908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455152
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5717	NC_013714	CGA	2	6	267007	267012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455152
5718	NC_013714	GCGTGC	2	12	267048	267059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283455152
5719	NC_013714	CAC	2	6	267149	267154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455152
5720	NC_013714	TGGCT	2	10	267168	267177	0 %	40 %	40 %	20 %	283455152
5721	NC_013714	CGA	2	6	267210	267215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455152
5722	NC_013714	ACC	2	6	267248	267253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455152
5723	NC_013714	CCG	2	6	267281	267286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455152
5724	NC_013714	CAT	2	6	267295	267300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455152
5725	NC_013714	CAT	2	6	267335	267340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455152
5726	NC_013714	AG	3	6	267365	267370	50 %	0 %	50 %	0 %	283455152
5727	NC_013714	GTG	2	6	267513	267518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455152
5728	NC_013714	ACC	2	6	267524	267529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455152
5729	NC_013714	TGG	2	6	267567	267572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455152
5730	NC_013714	GCT	2	6	267580	267585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455152
5731	NC_013714	CCG	2	6	267609	267614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455152
5732	NC_013714	TGC	2	6	267642	267647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455152
5733	NC_013714	GAAC	2	8	267653	267660	50 %	0 %	25 %	25 %	283455152
5734	NC_013714	CGAA	2	8	267758	267765	50 %	0 %	25 %	25 %	283455152
5735	NC_013714	GCG	2	6	267787	267792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455152
5736	NC_013714	AC	3	6	267847	267852	50 %	0 %	0 %	50 %	283455153
5737	NC_013714	TGA	2	6	267863	267868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455153
5738	NC_013714	GTGGCT	2	12	267912	267923	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	283455153
5739	NC_013714	GCC	2	6	267926	267931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455153
5740	NC_013714	GGCAG	2	10	268011	268020	20 %	0 %	60 %	20 %	283455153
5741	NC_013714	GC	3	6	268085	268090	0 %	0 %	50 %	50 %	283455153
5742	NC_013714	TG	3	6	268117	268122	0 %	50 %	50 %	0 %	283455153
5743	NC_013714	CGTA	2	8	268140	268147	25 %	25 %	25 %	25 %	283455153
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5855	NC_013714	GGCG	2	8	273457	273464	0 %	0 %	75 %	25 %	283455160
5856	NC_013714	GCA	2	6	273469	273474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455160
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5862	NC_013714	CG	4	8	273889	273896	0 %	0 %	50 %	50 %	283455160
5863	NC_013714	GCC	2	6	274015	274020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5864	NC_013714	CAT	2	6	274166	274171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455161
5865	NC_013714	CGTAC	2	10	274192	274201	20 %	20 %	20 %	40 %	283455161
5866	NC_013714	TCG	2	6	274216	274221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455161
5867	NC_013714	CCG	2	6	274255	274260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455161
5868	NC_013714	AAG	2	6	274326	274331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455161
5869	NC_013714	TGC	2	6	274363	274368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455161
5870	NC_013714	CGG	2	6	274460	274465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455161
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5874	NC_013714	CGG	3	9	274598	274606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455161
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5897	NC_013714	CTG	2	6	275988	275993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455161
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5907	NC_013714	CAG	2	6	276672	276677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455161
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5909	NC_013714	CGA	2	6	276716	276721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455161
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5930	NC_013714	CTG	2	6	277463	277468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455162
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5933	NC_013714	TCG	2	6	277638	277643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455162
5934	NC_013714	CGG	2	6	277677	277682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455162
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5937	NC_013714	CGG	2	6	277753	277758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5938	NC_013714	GCCAT	2	10	277805	277814	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5972	NC_013714	CGC	2	6	279310	279315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455163
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5979	NC_013714	CGTGCG	2	12	280012	280023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283455163
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5981	NC_013714	CGG	2	6	280138	280143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455163
5982	NC_013714	TCGGTT	2	12	280155	280166	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	283455163
5983	NC_013714	CAA	2	6	280180	280185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455163
5984	NC_013714	CTA	2	6	280216	280221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455163
5985	NC_013714	GTG	2	6	280238	280243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455163
5986	NC_013714	AAG	2	6	280260	280265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455163
5987	NC_013714	CGG	2	6	280269	280274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455163
5988	NC_013714	TGC	2	6	280275	280280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455163
5989	NC_013714	CGA	2	6	280350	280355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455163
5990	NC_013714	AGG	2	6	280359	280364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455163
5991	NC_013714	GAT	2	6	280365	280370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455164
5992	NC_013714	ATC	2	6	280387	280392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455164
5993	NC_013714	CGG	3	9	280401	280409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455164
5994	NC_013714	GTG	2	6	280422	280427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455164
5995	NC_013714	GCG	2	6	280428	280433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455164
5996	NC_013714	CATC	2	8	280581	280588	25 %	25 %	0 %	50 %	283455164
5997	NC_013714	TACG	2	8	280608	280615	25 %	25 %	25 %	25 %	283455164
5998	NC_013714	GGC	2	6	280648	280653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455164
5999	NC_013714	TGG	2	6	280775	280780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455164
6000	NC_013714	TCA	2	6	280790	280795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455164

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