MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Blattabacterium sp. (Periplaneta americana) str. BPLAN plasmid pBPLAN

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013419	AGA	2	6	7	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013419	AGA	2	6	15	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013419	CAT	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013419	TTC	2	6	69	74	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013419	AAC	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013419	AAT	2	6	211	216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013419	TAA	2	6	282	287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013419	ATC	2	6	295	300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013419	AGA	2	6	307	312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013419	GAA	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013419	ATC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013419	CAG	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261599113
13	NC_013419	ATA	2	6	625	630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599113
14	NC_013419	GAG	2	6	779	784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261599113
15	NC_013419	ATA	2	6	856	861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599113
16	NC_013419	ATA	2	6	1043	1048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
17	NC_013419	CCT	2	6	1083	1088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261599114
18	NC_013419	AAT	2	6	1209	1214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
19	NC_013419	CAA	2	6	1252	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599114
20	NC_013419	TTA	2	6	1316	1321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599114
21	NC_013419	ACA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599114
22	NC_013419	ATA	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599114
23	NC_013419	TTA	3	9	1389	1397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
24	NC_013419	TAT	2	6	1423	1428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
25	NC_013419	TTA	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599115
26	NC_013419	TTG	2	6	1562	1567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261599115
27	NC_013419	TCA	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599115
28	NC_013419	GAA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261599112
29	NC_013419	AGA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261599112
30	NC_013419	AAC	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261599112
31	NC_013419	GCT	3	9	2408	2416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261599112
32	NC_013419	CTT	2	6	2432	2437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261599112
33	NC_013419	TAT	2	6	2451	2456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261599112
34	NC_013419	CAT	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599112
35	NC_013419	GCT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261599112
36	NC_013419	CAT	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261599112
37	NC_013419	AAT	2	6	2667	2672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261599112
38	NC_013419	TTG	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261599112
39	NC_013419	TAT	3	9	3046	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013419	ATT	2	6	3154	3159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013419	TAT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013419	GAA	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013419	AAG	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013419	AGT	2	6	3409	3414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.