MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	ATTTTT	2	12	85	96	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013130	TAAAAA	2	12	101	112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013130	ATTAAT	2	12	573	584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013130	ATTAAT	2	12	663	674	50 %	50 %	0 %	0 %	256055274
5	NC_013130	AATTAA	2	12	1162	1173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013130	TTAAAC	2	12	1634	1645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256055275
7	NC_013130	CTGTAT	2	12	3706	3717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256055277
8	NC_013130	AAATTT	2	12	4544	4555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013130	CTTAAG	2	12	4616	4627	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013130	TAAAAA	2	12	4647	4658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013130	ACAATA	2	12	5581	5592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256055279
12	NC_013130	ATTGAG	2	12	6111	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055280
13	NC_013130	AAAAGT	2	12	10941	10952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256055287
14	NC_013130	GAAAAA	2	12	12097	12108	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256055288
15	NC_013130	AAAAAC	2	12	12580	12591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	256055288
16	NC_013130	AAAGCA	2	12	13052	13063	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	256055289
17	NC_013130	GATAAA	2	12	14377	14388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256055291
18	NC_013130	TAAAGA	2	12	14527	14538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256055291
19	NC_013130	TAACTT	2	12	15883	15894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013130	TTTTTA	2	12	17158	17169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256055295
21	NC_013130	TTAAAT	2	12	17328	17339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013130	TTCCAA	2	12	23185	23196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055300
23	NC_013130	TCTTTT	2	12	24483	24494	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013130	ATCAAA	2	12	24694	24705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256055302
25	NC_013130	TGAAGA	2	12	25776	25787	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256055303
26	NC_013130	ATTATG	2	12	25967	25978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256055303
27	NC_013130	GTTTTA	2	12	30595	30606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256055310
28	NC_013130	GCTTAA	2	12	31681	31692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	256055311
29	NC_013130	TTCCAA	2	12	31917	31928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055312
30	NC_013130	AAAAAG	2	12	33818	33829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256055315
31	NC_013130	AAATTC	2	12	33920	33931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256055315
32	NC_013130	TACAAA	2	12	34604	34615	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256055316
33	NC_013130	AAATAT	2	12	35319	35330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055317
34	NC_013130	ACAAAA	2	12	35344	35355	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	256055317
35	NC_013130	CTTTTT	2	12	38138	38149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013130	TTTGGG	2	12	38379	38390	0 %	50 %	50 %	0 %	256055322
37	NC_013130	GTATTA	2	12	38574	38585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256055322
38	NC_013130	AAAATT	2	12	39574	39585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013130	ATTAAT	2	12	41091	41102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013130	GTTTAA	2	12	41380	41391	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013130	ATTGAT	2	12	42210	42221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013130	ATTAAA	2	12	42560	42571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013130	CTTTGT	2	12	44464	44475	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256055328
44	NC_013130	TTGTCA	2	12	45772	45783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256055329
45	NC_013130	TTTAAA	2	12	46344	46355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013130	AATATA	2	12	51368	51379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013130	TTGTTT	2	12	51579	51590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013130	GGAATT	2	12	52348	52359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055336

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.