MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp54

Total Repeats: 740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013130	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013130	TAA	2	6	15	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013130	TCT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013130	ATA	2	6	77	82	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013130	TAC	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013130	TAA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013130	TAA	2	6	245	250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013130	AAG	2	6	269	274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013130	TAT	2	6	384	389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013130	TCT	2	6	470	475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013130	TCT	2	6	491	496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013130	TAT	2	6	523	528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013130	TTA	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013130	ATA	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013130	TGG	2	6	846	851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055274
16	NC_013130	ATT	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
17	NC_013130	TTA	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
18	NC_013130	TTA	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055274
19	NC_013130	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013130	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013130	CCT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013130	TAA	2	6	1305	1310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013130	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013130	TAA	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013130	TAA	3	9	1355	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013130	ATT	2	6	1366	1371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013130	ATT	2	6	1393	1398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013130	AAT	3	9	1420	1428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013130	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055275
30	NC_013130	ATG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
31	NC_013130	AAC	2	6	1532	1537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055275
32	NC_013130	TGA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
33	NC_013130	TTA	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055275
34	NC_013130	TAG	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055275
35	NC_013130	AGA	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
36	NC_013130	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
37	NC_013130	AGA	2	6	1858	1863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055275
38	NC_013130	TAA	2	6	1939	1944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055275
39	NC_013130	ATT	2	6	2097	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
40	NC_013130	ATT	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
41	NC_013130	TTA	2	6	2380	2385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
42	NC_013130	AGT	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055276
43	NC_013130	TAT	2	6	2441	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
44	NC_013130	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055276
45	NC_013130	TAA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055276
46	NC_013130	TTA	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055276
47	NC_013130	ATC	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055276
48	NC_013130	ATT	2	6	2946	2951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013130	AGA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013130	TTG	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
51	NC_013130	TAA	2	6	3082	3087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
52	NC_013130	ACT	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055277
53	NC_013130	TCT	2	6	3238	3243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
54	NC_013130	CAA	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055277
55	NC_013130	TCT	3	9	3355	3363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
56	NC_013130	GTA	2	6	3415	3420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055277
57	NC_013130	AAG	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
58	NC_013130	TTG	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
59	NC_013130	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055277
60	NC_013130	ACC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055277
61	NC_013130	TTG	2	6	3546	3551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256055277
62	NC_013130	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
63	NC_013130	TCT	2	6	3583	3588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
64	NC_013130	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
65	NC_013130	AGA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
66	NC_013130	TCA	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055277
67	NC_013130	TCT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
68	NC_013130	GAA	2	6	3907	3912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055277
69	NC_013130	CTT	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
70	NC_013130	TTA	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055277
71	NC_013130	GTG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055277
72	NC_013130	TCT	3	9	4174	4182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055277
73	NC_013130	TAA	3	9	4220	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055277
74	NC_013130	ATT	2	6	4272	4277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013130	TAA	2	6	4370	4375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013130	TAA	2	6	4441	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013130	TAA	2	6	4470	4475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013130	ATT	2	6	4481	4486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013130	TAA	2	6	4487	4492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013130	CAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055278
81	NC_013130	TAG	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055278
82	NC_013130	TGC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055278
83	NC_013130	AAC	2	6	4859	4864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055278
84	NC_013130	ACC	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055278
85	NC_013130	CTT	2	6	4966	4971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055278
86	NC_013130	TCA	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055278
87	NC_013130	AAT	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
88	NC_013130	TAA	2	6	5102	5107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
89	NC_013130	ATA	2	6	5116	5121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055278
90	NC_013130	TAT	2	6	5155	5160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013130	ATA	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013130	TGA	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055279
93	NC_013130	AAC	2	6	5347	5352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055279
94	NC_013130	GAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055279
95	NC_013130	AGA	2	6	5687	5692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
96	NC_013130	ATA	2	6	5766	5771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055280
97	NC_013130	AGA	2	6	5870	5875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
98	NC_013130	TAC	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055280
99	NC_013130	CTA	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055280
100	NC_013130	AAG	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055280
101	NC_013130	AGT	2	6	6194	6199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055280
102	NC_013130	ACA	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055280
103	NC_013130	ATT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055280
104	NC_013130	ATG	2	6	6385	6390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055280
105	NC_013130	TAA	2	6	6434	6439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055280
106	NC_013130	ATT	3	9	6465	6473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055280
107	NC_013130	CTT	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055280
108	NC_013130	GCT	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055281
109	NC_013130	TAT	2	6	6754	6759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055281
110	NC_013130	ATA	3	9	6866	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055281
111	NC_013130	GCA	2	6	6917	6922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256055281
112	NC_013130	TTA	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055281
113	NC_013130	GAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055281
114	NC_013130	CAG	2	6	7122	7127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256055281
115	NC_013130	TGA	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055282
116	NC_013130	TAG	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055282
117	NC_013130	AAC	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055282
118	NC_013130	CAC	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256055282
119	NC_013130	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055282
120	NC_013130	GCT	2	6	7810	7815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055282
121	NC_013130	TGG	2	6	7854	7859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256055282
122	NC_013130	TGA	2	6	7901	7906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055282
123	NC_013130	AAT	2	6	7913	7918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055282
124	NC_013130	TAA	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055282
125	NC_013130	AGA	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055282
126	NC_013130	TCT	2	6	8127	8132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055282
127	NC_013130	TAC	2	6	8175	8180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055282
128	NC_013130	GAA	2	6	8208	8213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055282
129	NC_013130	CAA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055283
130	NC_013130	AGG	2	6	8316	8321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256055283
131	NC_013130	TAA	2	6	8336	8341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055283
132	NC_013130	GAT	2	6	8346	8351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055283
133	NC_013130	AAT	2	6	8478	8483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055284
134	NC_013130	TAA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055284
135	NC_013130	AGA	2	6	8612	8617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055284
136	NC_013130	TAA	3	9	8651	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055284
137	NC_013130	ATG	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055284
138	NC_013130	CAT	2	6	8705	8710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055284
139	NC_013130	TTA	2	6	8881	8886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055285
140	NC_013130	AGA	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256055285
141	NC_013130	CAT	2	6	8939	8944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055285
142	NC_013130	TAT	2	6	9003	9008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055285
143	NC_013130	TGC	2	6	9135	9140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055285
144	NC_013130	TTA	2	6	9347	9352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013130	AGC	2	6	9514	9519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256055286
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147	NC_013130	TCA	2	6	9808	9813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055286
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149	NC_013130	TAA	2	6	9857	9862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055286
150	NC_013130	CTG	2	6	9965	9970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055286
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153	NC_013130	AGT	2	6	10066	10071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055286
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162	NC_013130	CTG	2	6	10628	10633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256055287
163	NC_013130	TAA	2	6	10737	10742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055287
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167	NC_013130	ACA	2	6	11093	11098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256055287
168	NC_013130	ATA	2	6	11169	11174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055287
169	NC_013130	TTA	2	6	11220	11225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013130	AGG	2	6	11284	11289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013130	AAT	2	6	11319	11324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013130	TAA	2	6	11449	11454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013130	AAT	2	6	11515	11520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013130	TAA	2	6	11530	11535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013130	TAA	2	6	11551	11556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013130	AAT	2	6	11590	11595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013130	TAT	2	6	11614	11619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_013130	TTA	2	6	11620	11625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_013130	TTA	2	6	11630	11635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013130	ACT	2	6	11761	11766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_013130	ACT	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055288
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256	NC_013130	TAA	2	6	16643	16648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_013130	AGC	2	6	16650	16655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_013130	TAA	2	6	16666	16671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_013130	TAT	2	6	16759	16764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055295
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262	NC_013130	TAT	2	6	16910	16915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055295
263	NC_013130	TCT	2	6	16923	16928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055295
264	NC_013130	CTT	3	9	17008	17016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256055295
265	NC_013130	TAT	2	6	17018	17023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256055295
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269	NC_013130	TAC	2	6	17236	17241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256055295
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271	NC_013130	TAT	2	6	17474	17479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_013130	TTA	2	6	17896	17901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_013130	TAT	2	6	18073	18078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_013130	TAT	2	6	20459	20464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_013130	TGA	2	6	28471	28476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256055306
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423	NC_013130	AAG	2	6	30099	30104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_013130	TAA	2	6	30148	30153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055310
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500	NC_013130	AAT	2	6	36794	36799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256055320

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