MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	T	8	8	123	130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013129	A	6	6	131	136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013129	A	7	7	640	646	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
4	NC_013129	A	8	8	757	764	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
5	NC_013129	A	7	7	1030	1036	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
6	NC_013129	A	7	7	1108	1114	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
7	NC_013129	A	7	7	1448	1454	100 %	0 %	0 %	0 %	256041953
8	NC_013129	A	6	6	1832	1837	100 %	0 %	0 %	0 %	256041953
9	NC_013129	A	6	6	1986	1991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013129	T	7	7	2025	2031	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
11	NC_013129	T	7	7	2092	2098	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
12	NC_013129	T	6	6	2151	2156	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
13	NC_013129	T	6	6	2243	2248	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
14	NC_013129	A	6	6	2713	2718	100 %	0 %	0 %	0 %	256041954
15	NC_013129	A	7	7	2967	2973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013129	T	6	6	3048	3053	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
17	NC_013129	T	6	6	3421	3426	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
18	NC_013129	T	6	6	3473	3478	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
19	NC_013129	T	6	6	3655	3660	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
20	NC_013129	T	6	6	3979	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
21	NC_013129	T	7	7	4026	4032	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
22	NC_013129	T	8	8	4045	4052	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
23	NC_013129	T	7	7	4111	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
24	NC_013129	T	7	7	4371	4377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013129	A	7	7	4382	4388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013129	A	6	6	4451	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013129	A	7	7	4570	4576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013129	T	6	6	4677	4682	0 %	100 %	0 %	0 %	256041956
29	NC_013129	T	6	6	4750	4755	0 %	100 %	0 %	0 %	256041956
30	NC_013129	A	6	6	4946	4951	100 %	0 %	0 %	0 %	256041956
31	NC_013129	T	6	6	5184	5189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013129	A	8	8	5190	5197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013129	T	7	7	5389	5395	0 %	100 %	0 %	0 %	256041957
34	NC_013129	T	9	9	5502	5510	0 %	100 %	0 %	0 %	256041957
35	NC_013129	T	6	6	5586	5591	0 %	100 %	0 %	0 %	256041957
36	NC_013129	A	6	6	5668	5673	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
37	NC_013129	A	8	8	5695	5702	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
38	NC_013129	T	6	6	5815	5820	0 %	100 %	0 %	0 %	256041958
39	NC_013129	A	8	8	6013	6020	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
40	NC_013129	A	9	9	6133	6141	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
41	NC_013129	A	8	8	6386	6393	100 %	0 %	0 %	0 %	256041958
42	NC_013129	A	6	6	6578	6583	100 %	0 %	0 %	0 %	256041959
43	NC_013129	A	6	6	6704	6709	100 %	0 %	0 %	0 %	256041959
44	NC_013129	A	6	6	6913	6918	100 %	0 %	0 %	0 %	256041959
45	NC_013129	A	8	8	6931	6938	100 %	0 %	0 %	0 %	256041959
46	NC_013129	A	6	6	6962	6967	100 %	0 %	0 %	0 %	256041959
47	NC_013129	A	6	6	7067	7072	100 %	0 %	0 %	0 %	256041959
48	NC_013129	A	7	7	7099	7105	100 %	0 %	0 %	0 %	256041959
49	NC_013129	T	8	8	7123	7130	0 %	100 %	0 %	0 %	256041959
50	NC_013129	A	6	6	7377	7382	100 %	0 %	0 %	0 %	256041960
51	NC_013129	A	6	6	7433	7438	100 %	0 %	0 %	0 %	256041960
52	NC_013129	G	6	6	7872	7877	0 %	0 %	100 %	0 %	256041960
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62	NC_013129	A	6	6	9192	9197	100 %	0 %	0 %	0 %	256041963
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64	NC_013129	A	6	6	9272	9277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013129	T	8	8	9352	9359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013129	A	6	6	9445	9450	100 %	0 %	0 %	0 %	256041964
67	NC_013129	A	7	7	9575	9581	100 %	0 %	0 %	0 %	256041964
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70	NC_013129	A	6	6	9962	9967	100 %	0 %	0 %	0 %	256041964
71	NC_013129	A	7	7	10072	10078	100 %	0 %	0 %	0 %	256041964
72	NC_013129	A	7	7	10129	10135	100 %	0 %	0 %	0 %	256041964
73	NC_013129	A	6	6	10387	10392	100 %	0 %	0 %	0 %	256041965
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.