MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	TAA	2	6	5	10	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013129	TCT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013129	ATA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013129	TAC	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013129	TAA	2	6	157	162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013129	TAA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013129	AAG	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013129	TAT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013129	TCT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013129	TCT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013129	TAT	2	6	514	519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013129	TTA	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013129	ATA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013129	TGG	2	6	837	842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041952
15	NC_013129	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
16	NC_013129	TTA	2	6	986	991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
17	NC_013129	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
18	NC_013129	TAA	2	6	1125	1130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013129	ATA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013129	CCT	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013129	TAA	2	6	1296	1301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013129	ATT	2	6	1306	1311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013129	TAA	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013129	TAA	3	9	1346	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013129	ATT	2	6	1357	1362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013129	ATT	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013129	AAT	3	9	1411	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013129	ATT	2	6	1457	1462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041953
29	NC_013129	ATG	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
30	NC_013129	AAC	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041953
31	NC_013129	TGA	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
32	NC_013129	TTA	2	6	1673	1678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041953
33	NC_013129	TAG	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
34	NC_013129	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
35	NC_013129	AGA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
36	NC_013129	AGA	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
37	NC_013129	TAA	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041953
38	NC_013129	ATT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
39	NC_013129	ATT	2	6	2210	2215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
40	NC_013129	TTA	2	6	2371	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
41	NC_013129	AGT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041954
42	NC_013129	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
43	NC_013129	TAA	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041954
44	NC_013129	TAA	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041954
45	NC_013129	TTA	2	6	2790	2795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
46	NC_013129	ATC	2	6	2822	2827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041954
47	NC_013129	ATT	2	6	2937	2942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013129	AGA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013129	TTG	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
50	NC_013129	TAA	2	6	3073	3078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
51	NC_013129	ACT	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041955
52	NC_013129	TCT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
53	NC_013129	CAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041955
54	NC_013129	TCT	3	9	3346	3354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
55	NC_013129	GTA	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041955
56	NC_013129	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
57	NC_013129	TTG	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
58	NC_013129	CAA	2	6	3485	3490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041955
59	NC_013129	ACC	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256041955
60	NC_013129	TTG	2	6	3537	3542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
61	NC_013129	AGA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
62	NC_013129	TCT	2	6	3574	3579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
63	NC_013129	AAT	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
64	NC_013129	AGA	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
65	NC_013129	TCA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041955
66	NC_013129	TCT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
67	NC_013129	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
68	NC_013129	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
69	NC_013129	TTA	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041955
70	NC_013129	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041955
71	NC_013129	TCT	3	9	4165	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
72	NC_013129	TAA	3	9	4211	4219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
73	NC_013129	ATT	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013129	TAA	2	6	4361	4366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013129	TAA	2	6	4432	4437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013129	TAA	2	6	4461	4466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013129	ATT	2	6	4472	4477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013129	TAA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013129	CAT	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041956
80	NC_013129	TAG	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041956
81	NC_013129	AAC	2	6	4850	4855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041956
82	NC_013129	CTT	2	6	4957	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041956
83	NC_013129	ATC	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041956
84	NC_013129	AAT	2	6	5065	5070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041956
85	NC_013129	TAA	2	6	5093	5098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041956
86	NC_013129	ATA	2	6	5107	5112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041956
87	NC_013129	TAT	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013129	ATA	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013129	TGA	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041957
90	NC_013129	AAC	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041957
91	NC_013129	GAA	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041957
92	NC_013129	AGA	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041958
93	NC_013129	ATA	2	6	5757	5762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041958
94	NC_013129	AGA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041958
95	NC_013129	TAC	2	6	5983	5988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041958
96	NC_013129	CTA	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041958
97	NC_013129	AAG	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041958
98	NC_013129	AGT	2	6	6185	6190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041958
99	NC_013129	ACA	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041958
100	NC_013129	ATT	2	6	6330	6335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041958
101	NC_013129	ATG	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041958
102	NC_013129	TAA	2	6	6425	6430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041958
103	NC_013129	ATT	3	9	6456	6464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041958
104	NC_013129	CTT	2	6	6483	6488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041958
105	NC_013129	TAT	2	6	6745	6750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041959
106	NC_013129	TGA	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041959
107	NC_013129	ATA	3	9	6857	6865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041959
108	NC_013129	GCA	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041959
109	NC_013129	TTA	2	6	7020	7025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041959
110	NC_013129	GAA	2	6	7044	7049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041959
111	NC_013129	CAG	2	6	7113	7118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041959
112	NC_013129	TGA	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041960
113	NC_013129	TAG	2	6	7288	7293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041960
114	NC_013129	AAC	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041960
115	NC_013129	CAC	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256041960
116	NC_013129	AAC	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041960
117	NC_013129	GCT	2	6	7801	7806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041960
118	NC_013129	TGG	2	6	7845	7850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041960
119	NC_013129	TGA	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041960
120	NC_013129	AAT	2	6	7904	7909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041960
121	NC_013129	TAA	2	6	7975	7980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041960
122	NC_013129	AGA	2	6	8048	8053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041960
123	NC_013129	TCT	2	6	8118	8123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041960
124	NC_013129	TAC	2	6	8166	8171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041960
125	NC_013129	GAA	2	6	8199	8204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041960
126	NC_013129	CAA	2	6	8276	8281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041961
127	NC_013129	AGG	2	6	8307	8312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256041961
128	NC_013129	TAA	2	6	8327	8332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041961
129	NC_013129	GAT	2	6	8337	8342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041961
130	NC_013129	AAT	2	6	8469	8474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041962
131	NC_013129	TAA	2	6	8560	8565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041962
132	NC_013129	AGA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041962
133	NC_013129	TAA	3	9	8642	8650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041962
134	NC_013129	ATG	2	6	8677	8682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041962
135	NC_013129	CAT	2	6	8696	8701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041962
136	NC_013129	TTA	2	6	8872	8877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041963
137	NC_013129	AGA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041963
138	NC_013129	CAT	2	6	8930	8935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041963
139	NC_013129	TAT	2	6	8994	8999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041963
140	NC_013129	TGC	2	6	9126	9131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041963
141	NC_013129	TTA	2	6	9338	9343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013129	AGC	2	6	9505	9510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041964
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144	NC_013129	TCA	2	6	9799	9804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041964
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147	NC_013129	CTG	2	6	9956	9961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041964
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150	NC_013129	AGT	2	6	10057	10062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041964
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159	NC_013129	CTG	2	6	10619	10624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041965
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167	NC_013129	AGG	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_013129	TAA	2	6	11408	11413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013129	AAT	2	6	11474	11479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013129	TAA	2	6	11489	11494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013129	TAA	2	6	11510	11515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013129	AAT	2	6	11549	11554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_013129	TTA	2	6	11589	11594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013129	ACT	2	6	11720	11725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_013129	TAT	2	6	17446	17451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_013129	TTA	2	6	17868	17873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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