MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	TAA	2	6	5	10	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013129	TCT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013129	ATA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013129	ATTTTT	2	12	75	86	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013129	TAAAAA	2	12	91	102	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013129	TAC	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013129	T	8	8	123	130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013129	A	6	6	131	136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013129	TAA	2	6	157	162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013129	TA	3	6	171	176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013129	TAA	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013129	AAG	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013129	AAAT	2	8	298	305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013129	TAT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013129	AATT	2	8	399	406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013129	TCT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013129	TCT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013129	TAT	2	6	514	519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013129	GCAA	2	8	521	528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013129	TTGC	2	8	551	558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013129	ATTAAT	2	12	564	575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013129	TTA	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013129	ATA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013129	A	7	7	640	646	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
25	NC_013129	ATTAAT	2	12	654	665	50 %	50 %	0 %	0 %	256041952
26	NC_013129	AC	3	6	701	706	50 %	0 %	0 %	50 %	256041952
27	NC_013129	A	8	8	757	764	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
28	NC_013129	ATTT	2	8	788	795	25 %	75 %	0 %	0 %	256041952
29	NC_013129	TGG	2	6	837	842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041952
30	NC_013129	ATTTA	2	10	858	867	40 %	60 %	0 %	0 %	256041952
31	NC_013129	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
32	NC_013129	AT	4	8	930	937	50 %	50 %	0 %	0 %	256041952
33	NC_013129	AGCA	2	8	951	958	50 %	0 %	25 %	25 %	256041952
34	NC_013129	TTA	2	6	986	991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
35	NC_013129	A	7	7	1030	1036	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
36	NC_013129	A	7	7	1108	1114	100 %	0 %	0 %	0 %	256041952
37	NC_013129	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041952
38	NC_013129	TAA	2	6	1125	1130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013129	ATA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013129	AATTAA	2	12	1153	1164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013129	CCT	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013129	TAA	2	6	1296	1301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013129	ATT	2	6	1306	1311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013129	TAA	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013129	TAA	3	9	1346	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013129	ATT	2	6	1357	1362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013129	ATT	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013129	TAAT	2	8	1406	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013129	AAT	3	9	1411	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013129	A	7	7	1448	1454	100 %	0 %	0 %	0 %	256041953
51	NC_013129	ATT	2	6	1457	1462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041953
52	NC_013129	ATG	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
53	NC_013129	AAC	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041953
54	NC_013129	TGA	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
55	NC_013129	GAATT	2	10	1578	1587	40 %	40 %	20 %	0 %	256041953
56	NC_013129	AGCAA	2	10	1589	1598	60 %	0 %	20 %	20 %	256041953
57	NC_013129	TTAAAC	2	12	1625	1636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256041953
58	NC_013129	TTA	2	6	1673	1678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041953
59	NC_013129	TAG	2	6	1689	1694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041953
60	NC_013129	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
61	NC_013129	AGA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
62	NC_013129	A	6	6	1832	1837	100 %	0 %	0 %	0 %	256041953
63	NC_013129	AGA	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041953
64	NC_013129	TAA	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041953
65	NC_013129	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	256041953
66	NC_013129	TAAT	2	8	1976	1983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013129	A	6	6	1986	1991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013129	T	7	7	2025	2031	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
69	NC_013129	TTAA	2	8	2034	2041	50 %	50 %	0 %	0 %	256041954
70	NC_013129	TTTTA	2	10	2066	2075	20 %	80 %	0 %	0 %	256041954
71	NC_013129	ATT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
72	NC_013129	T	7	7	2092	2098	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
73	NC_013129	T	6	6	2151	2156	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
74	NC_013129	ATT	2	6	2210	2215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
75	NC_013129	T	6	6	2243	2248	0 %	100 %	0 %	0 %	256041954
76	NC_013129	TTA	2	6	2371	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
77	NC_013129	CT	4	8	2409	2416	0 %	50 %	0 %	50 %	256041954
78	NC_013129	AGT	2	6	2417	2422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041954
79	NC_013129	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
80	NC_013129	GGCAT	2	10	2439	2448	20 %	20 %	40 %	20 %	256041954
81	NC_013129	TAA	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041954
82	NC_013129	CAAA	2	8	2533	2540	75 %	0 %	0 %	25 %	256041954
83	NC_013129	ATTT	2	8	2641	2648	25 %	75 %	0 %	0 %	256041954
84	NC_013129	A	6	6	2713	2718	100 %	0 %	0 %	0 %	256041954
85	NC_013129	TAA	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041954
86	NC_013129	TTA	2	6	2790	2795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041954
87	NC_013129	TC	3	6	2804	2809	0 %	50 %	0 %	50 %	256041954
88	NC_013129	ATC	2	6	2822	2827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041954
89	NC_013129	TCTA	2	8	2907	2914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013129	ATT	2	6	2937	2942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013129	AGA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013129	A	7	7	2967	2973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013129	TA	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	256041955
94	NC_013129	T	6	6	3048	3053	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
95	NC_013129	TTG	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
96	NC_013129	TAA	2	6	3073	3078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
97	NC_013129	ACT	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041955
98	NC_013129	TCT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
99	NC_013129	CAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041955
100	NC_013129	TCT	3	9	3346	3354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
101	NC_013129	GTA	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041955
102	NC_013129	T	6	6	3421	3426	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
103	NC_013129	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
104	NC_013129	TTG	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
105	NC_013129	T	6	6	3473	3478	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
106	NC_013129	CAA	2	6	3485	3490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041955
107	NC_013129	ACC	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256041955
108	NC_013129	TTG	2	6	3537	3542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041955
109	NC_013129	AGA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
110	NC_013129	TCT	2	6	3574	3579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
111	NC_013129	AAT	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
112	NC_013129	CAAT	2	8	3605	3612	50 %	25 %	0 %	25 %	256041955
113	NC_013129	AGA	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
114	NC_013129	T	6	6	3655	3660	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
115	NC_013129	CTGTAT	2	12	3697	3708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256041955
116	NC_013129	TCA	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041955
117	NC_013129	CCAC	2	8	3738	3745	25 %	0 %	0 %	75 %	256041955
118	NC_013129	TCT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
119	NC_013129	GAA	2	6	3898	3903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041955
120	NC_013129	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
121	NC_013129	T	6	6	3979	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
122	NC_013129	T	7	7	4026	4032	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
123	NC_013129	T	8	8	4045	4052	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
124	NC_013129	T	7	7	4111	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	256041955
125	NC_013129	TTA	2	6	4124	4129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041955
126	NC_013129	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041955
127	NC_013129	TCT	3	9	4165	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041955
128	NC_013129	AACA	2	8	4194	4201	75 %	0 %	0 %	25 %	256041955
129	NC_013129	TAA	3	9	4211	4219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041955
130	NC_013129	TAAAT	2	10	4241	4250	60 %	40 %	0 %	0 %	256041955
131	NC_013129	ATT	2	6	4263	4268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013129	TAAA	2	8	4273	4280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013129	TACA	2	8	4295	4302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013129	ATGT	2	8	4307	4314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013129	TAA	2	6	4361	4366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013129	T	7	7	4371	4377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013129	A	7	7	4382	4388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013129	TAAA	2	8	4404	4411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013129	TAA	2	6	4432	4437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013129	A	6	6	4451	4456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013129	TAA	2	6	4461	4466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013129	ATT	2	6	4472	4477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013129	TAA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013129	AAATTT	2	12	4535	4546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013129	A	7	7	4570	4576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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