MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013129	GA	3	6	36897	36902	50 %	0 %	50 %	0 %	256041998
1002	NC_013129	TGG	2	6	36905	36910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041998
1003	NC_013129	AG	3	6	36968	36973	50 %	0 %	50 %	0 %	256041998
1004	NC_013129	GCA	2	6	37000	37005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041998
1005	NC_013129	T	8	8	37048	37055	0 %	100 %	0 %	0 %	256041998
1006	NC_013129	ATGA	2	8	37056	37063	50 %	25 %	25 %	0 %	256041998
1007	NC_013129	A	6	6	37069	37074	100 %	0 %	0 %	0 %	256041998
1008	NC_013129	AG	3	6	37088	37093	50 %	0 %	50 %	0 %	256041998
1009	NC_013129	GGC	2	6	37135	37140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256041998
1010	NC_013129	TTG	2	6	37162	37167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041998
1011	NC_013129	ATTT	2	8	37202	37209	25 %	75 %	0 %	0 %	256041998
1012	NC_013129	GCT	2	6	37233	37238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041998
1013	NC_013129	TTTG	2	8	37268	37275	0 %	75 %	25 %	0 %	256041998
1014	NC_013129	AGAC	2	8	37379	37386	50 %	0 %	25 %	25 %	256041998
1015	NC_013129	AGT	2	6	37434	37439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041998
1016	NC_013129	AG	3	6	37443	37448	50 %	0 %	50 %	0 %	256041998
1017	NC_013129	TAT	2	6	37488	37493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041998
1018	NC_013129	AAT	2	6	37498	37503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041998
1019	NC_013129	TTC	2	6	37536	37541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041999
1020	NC_013129	GT	3	6	37547	37552	0 %	50 %	50 %	0 %	256041999
1021	NC_013129	TTA	2	6	37598	37603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041999
1022	NC_013129	GTT	2	6	37633	37638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041999
1023	NC_013129	GTA	2	6	37676	37681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041999
1024	NC_013129	CAG	2	6	37706	37711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041999
1025	NC_013129	ATA	2	6	37763	37768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041999
1026	NC_013129	ATT	2	6	37784	37789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041999
1027	NC_013129	A	7	7	37816	37822	100 %	0 %	0 %	0 %	256041999
1028	NC_013129	A	7	7	37899	37905	100 %	0 %	0 %	0 %	256041999
1029	NC_013129	ATA	2	6	37922	37927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041999
1030	NC_013129	TAG	2	6	38010	38015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041999
1031	NC_013129	CAA	2	6	38024	38029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041999
1032	NC_013129	T	6	6	38067	38072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013129	CTTTTT	2	12	38079	38090	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1034	NC_013129	T	7	7	38122	38128	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1035	NC_013129	TTA	2	6	38147	38152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042000
1036	NC_013129	TTG	2	6	38171	38176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042000
1037	NC_013129	ATT	2	6	38182	38187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042000
1038	NC_013129	GTTG	2	8	38199	38206	0 %	50 %	50 %	0 %	256042000
1039	NC_013129	GTT	2	6	38228	38233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042000
1040	NC_013129	TGT	2	6	38309	38314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042000
1041	NC_013129	TTTGGG	2	12	38320	38331	0 %	50 %	50 %	0 %	256042000
1042	NC_013129	T	6	6	38388	38393	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1043	NC_013129	AGC	2	6	38394	38399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256042000
1044	NC_013129	T	6	6	38410	38415	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1045	NC_013129	T	6	6	38491	38496	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1046	NC_013129	ATT	2	6	38497	38502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042000
1047	NC_013129	GTATTA	2	12	38515	38526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256042000
1048	NC_013129	T	7	7	38550	38556	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1049	NC_013129	CT	3	6	38598	38603	0 %	50 %	0 %	50 %	256042000
1050	NC_013129	T	6	6	38626	38631	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1051	NC_013129	AG	3	6	38653	38658	50 %	0 %	50 %	0 %	256042000
1052	NC_013129	TCA	2	6	38698	38703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256042000
1053	NC_013129	T	6	6	38704	38709	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1054	NC_013129	AGTG	2	8	38711	38718	25 %	25 %	50 %	0 %	256042000
1055	NC_013129	TCT	2	6	38803	38808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256042000
1056	NC_013129	TGT	2	6	38831	38836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042000
1057	NC_013129	TCT	3	9	38845	38853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256042000
1058	NC_013129	TGG	2	6	38879	38884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256042000
1059	NC_013129	TTG	2	6	38885	38890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042000
1060	NC_013129	AAT	2	6	38983	38988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256042000
1061	NC_013129	TCT	3	9	39010	39018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256042000
1062	NC_013129	CTT	2	6	39035	39040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256042000
1063	NC_013129	TTC	2	6	39045	39050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256042000
1064	NC_013129	T	6	6	39116	39121	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1065	NC_013129	T	7	7	39171	39177	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1066	NC_013129	T	6	6	39229	39234	0 %	100 %	0 %	0 %	256042000
1067	NC_013129	TAA	2	6	39293	39298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256042000
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1069	NC_013129	TGT	2	6	39309	39314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042000
1070	NC_013129	A	6	6	39373	39378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013129	T	6	6	39404	39409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013129	ATTTT	2	10	39418	39427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013129	T	7	7	39484	39490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013129	T	7	7	39509	39515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013129	AAAATT	2	12	39516	39527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013129	AGT	2	6	39577	39582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013129	TTC	2	6	39630	39635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_013129	T	6	6	39636	39641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013129	AT	3	6	39747	39752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013129	TAA	2	6	39793	39798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013129	TGCTC	2	10	39829	39838	0 %	40 %	20 %	40 %	256042001
1082	NC_013129	CT	3	6	39840	39845	0 %	50 %	0 %	50 %	256042001
1083	NC_013129	ATC	4	12	39854	39865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256042001
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1085	NC_013129	GTT	2	6	39878	39883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042001
1086	NC_013129	TCT	2	6	39894	39899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256042001
1087	NC_013129	T	7	7	39927	39933	0 %	100 %	0 %	0 %	256042001
1088	NC_013129	T	8	8	39938	39945	0 %	100 %	0 %	0 %	256042001
1089	NC_013129	AGAAT	2	10	39975	39984	60 %	20 %	20 %	0 %	256042001
1090	NC_013129	AATA	2	8	40022	40029	75 %	25 %	0 %	0 %	256042001
1091	NC_013129	AAAT	2	8	40039	40046	75 %	25 %	0 %	0 %	256042001
1092	NC_013129	ATT	2	6	40047	40052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042001
1093	NC_013129	T	7	7	40051	40057	0 %	100 %	0 %	0 %	256042001
1094	NC_013129	TA	3	6	40101	40106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013129	TAAT	2	8	40117	40124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013129	TATTT	2	10	40135	40144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_013129	ATT	2	6	40196	40201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042002
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1099	NC_013129	TGT	2	6	40309	40314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042002
1100	NC_013129	T	6	6	40334	40339	0 %	100 %	0 %	0 %	256042002
1101	NC_013129	T	6	6	40341	40346	0 %	100 %	0 %	0 %	256042002
1102	NC_013129	CGT	2	6	40444	40449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256042002
1103	NC_013129	ATG	2	6	40464	40469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256042002
1104	NC_013129	ATA	2	6	40513	40518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256042002
1105	NC_013129	GAA	2	6	40532	40537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256042002
1106	NC_013129	T	6	6	40566	40571	0 %	100 %	0 %	0 %	256042002
1107	NC_013129	T	6	6	40616	40621	0 %	100 %	0 %	0 %	256042002
1108	NC_013129	TTA	2	6	40624	40629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042002
1109	NC_013129	TG	3	6	40656	40661	0 %	50 %	50 %	0 %	256042002
1110	NC_013129	TCT	2	6	40674	40679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256042002
1111	NC_013129	GCTT	2	8	40743	40750	0 %	50 %	25 %	25 %	256042002
1112	NC_013129	GTA	2	6	40751	40756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256042002
1113	NC_013129	ATTTG	2	10	40776	40785	20 %	60 %	20 %	0 %	256042002
1114	NC_013129	ATT	2	6	40824	40829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042002
1115	NC_013129	TGC	2	6	40832	40837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256042002
1116	NC_013129	T	6	6	40906	40911	0 %	100 %	0 %	0 %	256042002
1117	NC_013129	T	6	6	40918	40923	0 %	100 %	0 %	0 %	256042002
1118	NC_013129	TTTA	2	8	40928	40935	25 %	75 %	0 %	0 %	256042002
1119	NC_013129	CAAGA	2	10	40947	40956	60 %	0 %	20 %	20 %	256042002
1120	NC_013129	T	6	6	40985	40990	0 %	100 %	0 %	0 %	256042002
1121	NC_013129	ATTT	2	8	40995	41002	25 %	75 %	0 %	0 %	256042002
1122	NC_013129	T	6	6	41018	41023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013129	TA	3	6	41027	41032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013129	ATTAAT	2	12	41033	41044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013129	TAA	2	6	41048	41053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_013129	GTT	2	6	41054	41059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013129	TTA	2	6	41081	41086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013129	ATA	2	6	41090	41095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013129	ATTA	2	8	41099	41106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_013129	A	6	6	41110	41115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013129	CTT	2	6	41138	41143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1133	NC_013129	TGA	2	6	41199	41204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_013129	ATT	2	6	50216	50221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042012
1404	NC_013129	T	6	6	50220	50225	0 %	100 %	0 %	0 %	256042012
1405	NC_013129	TGT	2	6	50252	50257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042012
1406	NC_013129	T	6	6	50295	50300	0 %	100 %	0 %	0 %	256042012
1407	NC_013129	TGT	2	6	50361	50366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042012
1408	NC_013129	A	8	8	50461	50468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_013129	AATATA	2	12	50513	50524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_013129	T	7	7	50549	50555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_013129	TAA	2	6	50575	50580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_013129	T	7	7	50598	50604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_013129	A	8	8	50605	50612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_013129	T	6	6	50632	50637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_013129	T	6	6	50708	50713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_013129	TTA	2	6	50715	50720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_013129	TTGTTT	2	12	50724	50735	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_013129	TAA	3	9	50769	50777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_013129	TAT	2	6	50785	50790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_013129	TTA	2	6	50841	50846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_013129	TTAA	2	8	50872	50879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_013129	A	6	6	50878	50883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_013129	TTTA	2	8	50898	50905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_013129	ATA	2	6	50941	50946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_013129	AAAT	2	8	50948	50955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_013129	TAA	2	6	51000	51005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256042013
1427	NC_013129	ATT	2	6	51013	51018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042013
1428	NC_013129	ATA	2	6	51114	51119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256042013
1429	NC_013129	A	6	6	51119	51124	100 %	0 %	0 %	0 %	256042013
1430	NC_013129	ATC	2	6	51214	51219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256042013
1431	NC_013129	ATG	2	6	51240	51245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256042013
1432	NC_013129	AGT	2	6	51250	51255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256042013
1433	NC_013129	TGT	2	6	51307	51312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042013
1434	NC_013129	AAG	2	6	51321	51326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256042013
1435	NC_013129	GTT	2	6	51377	51382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042013
1436	NC_013129	TAAA	2	8	51471	51478	75 %	25 %	0 %	0 %	256042013
1437	NC_013129	ATA	2	6	51486	51491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256042013
1438	NC_013129	GGAATT	2	12	51493	51504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256042013
1439	NC_013129	AGA	2	6	51511	51516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256042013
1440	NC_013129	A	7	7	51652	51658	100 %	0 %	0 %	0 %	256042013
1441	NC_013129	TGT	2	6	51682	51687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042013
1442	NC_013129	AT	3	6	51756	51761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_013129	AAT	2	6	51771	51776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_013129	T	6	6	51825	51830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_013129	TAA	2	6	51834	51839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_013129	ATATA	2	10	51877	51886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_013129	TAA	2	6	51928	51933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_013129	AAGG	2	8	51944	51951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_013129	AATT	2	8	51954	51961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_013129	GAT	2	6	52023	52028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256042014
1451	NC_013129	AG	3	6	52067	52072	50 %	0 %	50 %	0 %	256042014
1452	NC_013129	AAAAG	2	10	52077	52086	80 %	0 %	20 %	0 %	256042014
1453	NC_013129	TAA	2	6	52108	52113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256042014
1454	NC_013129	CA	3	6	52122	52127	50 %	0 %	0 %	50 %	256042014
1455	NC_013129	GGT	2	6	52142	52147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256042014
1456	NC_013129	TTG	2	6	52177	52182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256042014
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1459	NC_013129	CAT	2	6	52356	52361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256042014
1460	NC_013129	TA	3	6	52447	52452	50 %	50 %	0 %	0 %	256042014
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1462	NC_013129	TTA	2	6	52495	52500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042014
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1464	NC_013129	ATT	2	6	52677	52682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256042014
1465	NC_013129	ATTG	2	8	52752	52759	25 %	50 %	25 %	0 %	256042014
1466	NC_013129	GT	3	6	52767	52772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1467	NC_013129	T	6	6	52827	52832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1468	NC_013129	TAAAT	2	10	52872	52881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1469	NC_013129	TAA	2	6	52898	52903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1470	NC_013129	TTA	2	6	52908	52913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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