MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013129	ATT	2	6	16636	16641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013129	ATTT	2	8	16709	16716	25 %	75 %	0 %	0 %	256041973
503	NC_013129	T	8	8	16718	16725	0 %	100 %	0 %	0 %	256041973
504	NC_013129	T	8	8	16736	16743	0 %	100 %	0 %	0 %	256041973
505	NC_013129	CCA	2	6	16748	16753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256041973
506	NC_013129	GCAA	2	8	16814	16821	50 %	0 %	25 %	25 %	256041973
507	NC_013129	ATT	2	6	16843	16848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041973
508	NC_013129	TAT	2	6	16882	16887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041973
509	NC_013129	TCT	2	6	16895	16900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041973
510	NC_013129	CTT	3	9	16980	16988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041973
511	NC_013129	TAT	2	6	16990	16995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041973
512	NC_013129	CAA	2	6	17016	17021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041973
513	NC_013129	CCA	2	6	17054	17059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256041973
514	NC_013129	CTT	2	6	17124	17129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041973
515	NC_013129	TTTTTA	2	12	17130	17141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256041973
516	NC_013129	T	6	6	17150	17155	0 %	100 %	0 %	0 %	256041973
517	NC_013129	TTCT	2	8	17190	17197	0 %	75 %	0 %	25 %	256041973
518	NC_013129	TAC	2	6	17208	17213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041973
519	NC_013129	A	6	6	17230	17235	100 %	0 %	0 %	0 %	256041973
520	NC_013129	T	6	6	17274	17279	0 %	100 %	0 %	0 %	256041973
521	NC_013129	CCT	2	6	17280	17285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_013129	TTAAAT	2	12	17300	17311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013129	ATAAA	3	15	17332	17346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013129	TTAG	2	8	17347	17354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013129	TTTTA	2	10	17409	17418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013129	ATTTT	2	10	17436	17445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013129	TAT	2	6	17446	17451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013129	AAT	2	6	17610	17615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013129	T	8	8	17702	17709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013129	AAG	2	6	17769	17774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013129	T	6	6	17780	17785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013129	T	6	6	17808	17813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013129	TTA	2	6	17868	17873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013129	AAC	2	6	17902	17907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013129	T	7	7	17910	17916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013129	AAT	2	6	17966	17971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013129	AT	3	6	17990	17995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013129	TTA	2	6	18035	18040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013129	TAT	2	6	18045	18050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013129	A	6	6	18055	18060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013129	AATTA	2	10	18072	18081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013129	A	6	6	18090	18095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013129	TTAA	2	8	18126	18133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013129	AATAA	2	10	18134	18143	80 %	20 %	0 %	0 %	256041974
545	NC_013129	AGA	2	6	18163	18168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041974
546	NC_013129	AT	3	6	18169	18174	50 %	50 %	0 %	0 %	256041974
547	NC_013129	T	7	7	18174	18180	0 %	100 %	0 %	0 %	256041974
548	NC_013129	A	6	6	18185	18190	100 %	0 %	0 %	0 %	256041974
549	NC_013129	AAAT	2	8	18256	18263	75 %	25 %	0 %	0 %	256041974
550	NC_013129	AGA	2	6	18319	18324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041974
551	NC_013129	ACT	2	6	18329	18334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041974
552	NC_013129	TGC	2	6	18372	18377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041974
553	NC_013129	A	6	6	18385	18390	100 %	0 %	0 %	0 %	256041974
554	NC_013129	CAC	2	6	18467	18472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256041974
555	NC_013129	A	6	6	18502	18507	100 %	0 %	0 %	0 %	256041974
556	NC_013129	A	7	7	18566	18572	100 %	0 %	0 %	0 %	256041974
557	NC_013129	AG	3	6	18602	18607	50 %	0 %	50 %	0 %	256041974
558	NC_013129	AG	3	6	18627	18632	50 %	0 %	50 %	0 %	256041974
559	NC_013129	A	8	8	18642	18649	100 %	0 %	0 %	0 %	256041974
560	NC_013129	TTA	2	6	18651	18656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041974
561	NC_013129	GA	3	6	18667	18672	50 %	0 %	50 %	0 %	256041974
562	NC_013129	AGT	2	6	18710	18715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041974
563	NC_013129	ACCA	2	8	18832	18839	50 %	0 %	0 %	50 %	256041975
564	NC_013129	AAAT	2	8	18862	18869	75 %	25 %	0 %	0 %	256041975
565	NC_013129	ATT	2	6	18918	18923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041975
566	NC_013129	AAT	2	6	19031	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041975
567	NC_013129	TAT	2	6	19039	19044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041975
568	NC_013129	TGA	2	6	19065	19070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041975
569	NC_013129	AAAAG	2	10	19128	19137	80 %	0 %	20 %	0 %	256041975
570	NC_013129	AAT	2	6	19234	19239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041975
571	NC_013129	TAA	2	6	19287	19292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041975
572	NC_013129	ATT	3	9	19316	19324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041975
573	NC_013129	ATT	2	6	19353	19358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041975
574	NC_013129	CAG	2	6	19434	19439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041975
575	NC_013129	GAT	2	6	19543	19548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041975
576	NC_013129	TCAA	2	8	19551	19558	50 %	25 %	0 %	25 %	256041975
577	NC_013129	AAT	2	6	19579	19584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041975
578	NC_013129	GTGG	2	8	19607	19614	0 %	25 %	75 %	0 %	256041975
579	NC_013129	AT	3	6	19666	19671	50 %	50 %	0 %	0 %	256041975
580	NC_013129	TGCT	2	8	19707	19714	0 %	50 %	25 %	25 %	256041975
581	NC_013129	GAG	2	6	19763	19768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256041975
582	NC_013129	AG	3	6	19767	19772	50 %	0 %	50 %	0 %	256041975
583	NC_013129	TTCTT	2	10	19809	19818	0 %	80 %	0 %	20 %	256041975
584	NC_013129	GC	3	6	19890	19895	0 %	0 %	50 %	50 %	256041975
585	NC_013129	TTTG	2	8	19903	19910	0 %	75 %	25 %	0 %	256041975
586	NC_013129	ATA	2	6	19937	19942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041975
587	NC_013129	CAAAA	2	10	19987	19996	80 %	0 %	0 %	20 %	256041975
588	NC_013129	TCT	2	6	20029	20034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041975
589	NC_013129	ATT	2	6	20059	20064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041975
590	NC_013129	TAAT	2	8	20131	20138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013129	T	6	6	20186	20191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013129	A	6	6	20264	20269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013129	A	6	6	20283	20288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013129	T	8	8	20328	20335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013129	T	7	7	20344	20350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013129	ATT	2	6	20358	20363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013129	TAATT	2	10	20375	20384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013129	TAT	2	6	20387	20392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013129	TAT	2	6	20410	20415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013129	T	6	6	20426	20431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013129	T	7	7	20457	20463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013129	A	7	7	20500	20506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013129	T	8	8	20532	20539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013129	AG	3	6	20543	20548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013129	TTA	2	6	20577	20582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013129	ATTT	2	8	20643	20650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013129	T	6	6	20648	20653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013129	TCT	2	6	20703	20708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041976
609	NC_013129	T	10	10	20708	20717	0 %	100 %	0 %	0 %	256041976
610	NC_013129	TAA	2	6	20745	20750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041976
611	NC_013129	AG	3	6	20806	20811	50 %	0 %	50 %	0 %	256041976
612	NC_013129	TAT	2	6	20812	20817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041976
613	NC_013129	AG	3	6	20851	20856	50 %	0 %	50 %	0 %	256041976
614	NC_013129	A	6	6	20893	20898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013129	TTA	2	6	20905	20910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013129	TTA	2	6	20914	20919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013129	ATA	2	6	20947	20952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013129	AAT	2	6	20964	20969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013129	T	6	6	20992	20997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013129	AAT	2	6	21008	21013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013129	AAAT	2	8	21026	21033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013129	AT	3	6	21066	21071	50 %	50 %	0 %	0 %	256041977
623	NC_013129	TA	3	6	21077	21082	50 %	50 %	0 %	0 %	256041977
624	NC_013129	GAAA	2	8	21132	21139	75 %	0 %	25 %	0 %	256041977
625	NC_013129	TAA	2	6	21147	21152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041977
626	NC_013129	CTTT	2	8	21175	21182	0 %	75 %	0 %	25 %	256041977
627	NC_013129	TGAC	2	8	21233	21240	25 %	25 %	25 %	25 %	256041977
628	NC_013129	T	7	7	21288	21294	0 %	100 %	0 %	0 %	256041977
629	NC_013129	TAG	2	6	21365	21370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041977
630	NC_013129	A	6	6	21371	21376	100 %	0 %	0 %	0 %	256041977
631	NC_013129	TAAG	2	8	21389	21396	50 %	25 %	25 %	0 %	256041977
632	NC_013129	TGC	2	6	21423	21428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041977
633	NC_013129	TAA	2	6	21534	21539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041977
634	NC_013129	TGATT	2	10	21549	21558	20 %	60 %	20 %	0 %	256041977
635	NC_013129	AG	3	6	21567	21572	50 %	0 %	50 %	0 %	256041977
636	NC_013129	TTC	2	6	21659	21664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041978
637	NC_013129	TTGT	2	8	21702	21709	0 %	75 %	25 %	0 %	256041978
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639	NC_013129	AAT	2	6	21791	21796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041978
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