MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_012815	TGC	2	6	1405837	1405842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196647
31502	NC_012815	TGC	2	6	1405903	1405908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196647
31503	NC_012815	CGC	2	6	1405963	1405968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196647
31504	NC_012815	ATTC	2	8	1405972	1405979	25 %	50 %	0 %	25 %	241196647
31505	NC_012815	CGA	2	6	1406072	1406077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196647
31506	NC_012815	CAAA	2	8	1406081	1406088	75 %	0 %	0 %	25 %	241196647
31507	NC_012815	TCG	2	6	1406089	1406094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196647
31508	NC_012815	GCCG	2	8	1406123	1406130	0 %	0 %	50 %	50 %	241196647
31509	NC_012815	ACG	2	6	1406140	1406145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196647
31510	NC_012815	GAG	2	6	1406184	1406189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241196647
31511	NC_012815	TGCA	2	8	1406281	1406288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31512	NC_012815	GCG	2	6	1406296	1406301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31513	NC_012815	CGC	2	6	1406331	1406336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31514	NC_012815	TCACAT	2	12	1406345	1406356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31515	NC_012815	CTT	2	6	1406382	1406387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196648
31516	NC_012815	CTC	2	6	1406418	1406423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196648
31517	NC_012815	TTG	2	6	1406437	1406442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196648
31518	NC_012815	GAA	2	6	1406448	1406453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196648
31519	NC_012815	TCA	2	6	1406587	1406592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241196648
31520	NC_012815	TCT	2	6	1406615	1406620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196648
31521	NC_012815	GCC	2	6	1406641	1406646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196648
31522	NC_012815	AGC	2	6	1406647	1406652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196648
31523	NC_012815	GC	3	6	1406690	1406695	0 %	0 %	50 %	50 %	241196648
31524	NC_012815	GC	3	6	1406706	1406711	0 %	0 %	50 %	50 %	241196648
31525	NC_012815	GTT	2	6	1406763	1406768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196648
31526	NC_012815	CAG	2	6	1406776	1406781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196648
31527	NC_012815	GCA	2	6	1406860	1406865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196648
31528	NC_012815	GA	4	8	1407039	1407046	50 %	0 %	50 %	0 %	241196648
31529	NC_012815	ACC	2	6	1407055	1407060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196648
31530	NC_012815	ATG	2	6	1407073	1407078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196648
31531	NC_012815	GCG	2	6	1407198	1407203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196648
31532	NC_012815	GCC	2	6	1407243	1407248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196648
31533	NC_012815	GATC	2	8	1407251	1407258	25 %	25 %	25 %	25 %	241196648
31534	NC_012815	GTC	2	6	1407279	1407284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196648
31535	NC_012815	TCGGG	2	10	1407482	1407491	0 %	20 %	60 %	20 %	241196648
31536	NC_012815	GTC	2	6	1407504	1407509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196648
31537	NC_012815	AC	3	6	1407515	1407520	50 %	0 %	0 %	50 %	241196648
31538	NC_012815	CTC	2	6	1407561	1407566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196648
31539	NC_012815	TTG	2	6	1407687	1407692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196648
31540	NC_012815	ACGG	2	8	1407772	1407779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31541	NC_012815	TGCC	2	8	1407813	1407820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31542	NC_012815	AAGCG	2	10	1407866	1407875	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31543	NC_012815	CT	3	6	1407964	1407969	0 %	50 %	0 %	50 %	241196649
31544	NC_012815	GCG	2	6	1408001	1408006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196649
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31547	NC_012815	ACC	2	6	1408152	1408157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196649
31548	NC_012815	GTGCA	2	10	1408167	1408176	20 %	20 %	40 %	20 %	241196649
31549	NC_012815	TCT	2	6	1408207	1408212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196649
31550	NC_012815	CGA	2	6	1408253	1408258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196649
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31552	NC_012815	AAGGAG	2	12	1408338	1408349	50 %	0 %	50 %	0 %	241196649
31553	NC_012815	ATG	2	6	1408354	1408359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196649
31554	NC_012815	AGA	2	6	1408451	1408456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196649
31555	NC_012815	AAG	2	6	1408545	1408550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241196649
31556	NC_012815	CAA	2	6	1408556	1408561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196649
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31561	NC_012815	GGT	2	6	1408763	1408768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196649
31562	NC_012815	GCT	2	6	1408792	1408797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196649
31563	NC_012815	GAC	2	6	1408827	1408832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196649
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31569	NC_012815	TG	3	6	1409095	1409100	0 %	50 %	50 %	0 %	241196649
31570	NC_012815	GTG	2	6	1409102	1409107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196649
31571	NC_012815	CATGCG	2	12	1409115	1409126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241196649
31572	NC_012815	GCG	2	6	1409131	1409136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196649
31573	NC_012815	CGA	2	6	1409171	1409176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196649
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31576	NC_012815	ATGC	2	8	1409315	1409322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31577	NC_012815	GCA	2	6	1409494	1409499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196650
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31589	NC_012815	CCAC	2	8	1410010	1410017	25 %	0 %	0 %	75 %	241196650
31590	NC_012815	GTGC	2	8	1410018	1410025	0 %	25 %	50 %	25 %	241196650
31591	NC_012815	GCG	2	6	1410034	1410039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196650
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31593	NC_012815	CGGC	2	8	1410109	1410116	0 %	0 %	50 %	50 %	241196650
31594	NC_012815	AAC	2	6	1410171	1410176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31601	NC_012815	TGCA	2	8	1410662	1410669	25 %	25 %	25 %	25 %	241196651
31602	NC_012815	ACG	2	6	1410695	1410700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196651
31603	NC_012815	GC	3	6	1410770	1410775	0 %	0 %	50 %	50 %	241196651
31604	NC_012815	TTC	2	6	1410838	1410843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31605	NC_012815	TCGA	2	8	1410863	1410870	25 %	25 %	25 %	25 %	241196652
31606	NC_012815	GAT	2	6	1410904	1410909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196652
31607	NC_012815	CTG	2	6	1410961	1410966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196652
31608	NC_012815	GTG	2	6	1410983	1410988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241196652
31609	NC_012815	TCC	2	6	1411004	1411009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196652
31610	NC_012815	CGG	3	9	1411039	1411047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196652
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31612	NC_012815	CGG	2	6	1411086	1411091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196652
31613	NC_012815	CCA	2	6	1411137	1411142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196652
31614	NC_012815	GCC	2	6	1411163	1411168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196652
31615	NC_012815	GCA	2	6	1411194	1411199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196652
31616	NC_012815	GCGA	2	8	1411247	1411254	25 %	0 %	50 %	25 %	241196652
31617	NC_012815	GGC	2	6	1411261	1411266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196652
31618	NC_012815	TTG	2	6	1411316	1411321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196652
31619	NC_012815	TCG	3	9	1411340	1411348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196652
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31621	NC_012815	TCG	2	6	1411388	1411393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196652
31622	NC_012815	TCG	2	6	1411451	1411456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196652
31623	NC_012815	CGT	2	6	1411548	1411553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196652
31624	NC_012815	TCG	2	6	1411556	1411561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196652
31625	NC_012815	TTG	2	6	1411577	1411582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241196652
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31709	NC_012815	TCGTC	2	10	1415385	1415394	0 %	40 %	20 %	40 %	241196656
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31730	NC_012815	CG	3	6	1416466	1416471	0 %	0 %	50 %	50 %	241196656
31731	NC_012815	GCG	2	6	1416518	1416523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196656
31732	NC_012815	GAT	2	6	1416544	1416549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196656
31733	NC_012815	TCG	2	6	1416563	1416568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196656
31734	NC_012815	CCT	2	6	1416573	1416578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241196656
31735	NC_012815	GGAT	2	8	1416599	1416606	25 %	25 %	50 %	0 %	241196656
31736	NC_012815	TCT	2	6	1416615	1416620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241196656
31737	NC_012815	GCT	2	6	1416729	1416734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196656
31738	NC_012815	AGC	2	6	1416737	1416742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196656
31739	NC_012815	AC	3	6	1416771	1416776	50 %	0 %	0 %	50 %	241196656
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31742	NC_012815	GTC	2	6	1416817	1416822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196656
31743	NC_012815	GTC	3	9	1416965	1416973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196656
31744	NC_012815	CAG	2	6	1416994	1416999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241196656
31745	NC_012815	TCG	2	6	1417091	1417096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196656
31746	NC_012815	GCC	2	6	1417214	1417219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196656
31747	NC_012815	GGC	2	6	1417220	1417225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241196656
31748	NC_012815	ATG	2	6	1417268	1417273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241196656
31749	NC_012815	CGC	2	6	1417356	1417361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241196656
31750	NC_012815	CGGCC	2	10	1417529	1417538	0 %	0 %	40 %	60 %	241196656
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31752	NC_012815	CCA	3	9	1417581	1417589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241196656
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31756	NC_012815	GTC	2	6	1417777	1417782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196656
31757	NC_012815	CTG	2	6	1417861	1417866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196656
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31767	NC_012815	TCG	2	6	1418324	1418329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196656
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31774	NC_012815	GAAG	2	8	1418851	1418858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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31802	NC_012815	CA	3	6	1420417	1420422	50 %	0 %	0 %	50 %	241196659
31803	NC_012815	TCGGTC	2	12	1420541	1420552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241196659
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31837	NC_012815	ACC	2	6	1422199	1422204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31838	NC_012815	T	6	6	1422239	1422244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31839	NC_012815	T	6	6	1422287	1422292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31840	NC_012815	ACA	2	6	1422356	1422361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241196661
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31999	NC_012815	TG	3	6	1430312	1430317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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