MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012815	GTC	2	6	112879	112884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195568
2502	NC_012815	ATG	2	6	112892	112897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195568
2503	NC_012815	CGC	2	6	112962	112967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195568
2504	NC_012815	TTG	2	6	112997	113002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195568
2505	NC_012815	CGCA	2	8	113044	113051	25 %	0 %	25 %	50 %	241195568
2506	NC_012815	TCG	2	6	113054	113059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195568
2507	NC_012815	CG	4	8	113076	113083	0 %	0 %	50 %	50 %	241195568
2508	NC_012815	GCC	2	6	113101	113106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195568
2509	NC_012815	CGT	2	6	113166	113171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195568
2510	NC_012815	GC	3	6	113185	113190	0 %	0 %	50 %	50 %	241195568
2511	NC_012815	CAG	2	6	113284	113289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195568
2512	NC_012815	GATG	2	8	113334	113341	25 %	25 %	50 %	0 %	241195568
2513	NC_012815	GAT	2	6	113394	113399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195568
2514	NC_012815	GC	3	6	113461	113466	0 %	0 %	50 %	50 %	241195568
2515	NC_012815	CCGAGT	2	12	113474	113485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241195568
2516	NC_012815	TCG	2	6	113486	113491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195568
2517	NC_012815	GGA	2	6	113524	113529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195568
2518	NC_012815	GCCG	2	8	113536	113543	0 %	0 %	50 %	50 %	241195568
2519	NC_012815	GAG	2	6	113707	113712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_012815	GCTT	2	8	113804	113811	0 %	50 %	25 %	25 %	241195569
2521	NC_012815	GAC	2	6	113848	113853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2522	NC_012815	CCT	2	6	113862	113867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195569
2523	NC_012815	CGA	2	6	113880	113885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2524	NC_012815	GCA	2	6	113958	113963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2525	NC_012815	GTC	2	6	114016	114021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2526	NC_012815	CAC	2	6	114031	114036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2527	NC_012815	GGC	2	6	114052	114057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2528	NC_012815	CAT	2	6	114136	114141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195569
2529	NC_012815	AGC	2	6	114170	114175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2530	NC_012815	TCT	2	6	114213	114218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2531	NC_012815	CGG	2	6	114219	114224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2532	NC_012815	GCA	2	6	114261	114266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2533	NC_012815	GAT	2	6	114304	114309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2534	NC_012815	CTT	2	6	114322	114327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2535	NC_012815	TCT	2	6	114347	114352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2536	NC_012815	GCA	2	6	114414	114419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2537	NC_012815	GC	3	6	114424	114429	0 %	0 %	50 %	50 %	241195569
2538	NC_012815	TCG	2	6	114467	114472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2539	NC_012815	CGC	2	6	114499	114504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195569
2540	NC_012815	CCACCT	2	12	114609	114620	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	241195569
2541	NC_012815	ACC	2	6	114677	114682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2542	NC_012815	CCT	2	6	114780	114785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195569
2543	NC_012815	CGG	2	6	114789	114794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2544	NC_012815	CGA	2	6	114795	114800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2545	NC_012815	CCA	2	6	114834	114839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2546	NC_012815	CAC	2	6	114907	114912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2547	NC_012815	GCT	2	6	114918	114923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2548	NC_012815	GAA	2	6	114949	114954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195569
2549	NC_012815	TGA	2	6	114999	115004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2550	NC_012815	TCT	2	6	115008	115013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2551	NC_012815	CGGCG	2	10	115051	115060	0 %	0 %	60 %	40 %	241195569
2552	NC_012815	AGC	2	6	115064	115069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2553	NC_012815	TGGCG	2	10	115075	115084	0 %	20 %	60 %	20 %	241195569
2554	NC_012815	CGA	2	6	115134	115139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2555	NC_012815	GAT	2	6	115156	115161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2556	NC_012815	ACGGC	2	10	115167	115176	20 %	0 %	40 %	40 %	241195569
2557	NC_012815	CGG	2	6	115185	115190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2558	NC_012815	CAC	2	6	115195	115200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2559	NC_012815	GGC	2	6	115201	115206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2560	NC_012815	GC	3	6	115205	115210	0 %	0 %	50 %	50 %	241195569
2561	NC_012815	CTC	2	6	115213	115218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195569
2562	NC_012815	GACGA	2	10	115223	115232	40 %	0 %	40 %	20 %	241195569
2563	NC_012815	CTG	2	6	115243	115248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2564	NC_012815	CGT	2	6	115273	115278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2565	NC_012815	ATC	3	9	115283	115291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195569
2566	NC_012815	CGA	2	6	115332	115337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2567	NC_012815	AGC	2	6	115400	115405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2568	NC_012815	CCGAG	2	10	115449	115458	20 %	0 %	40 %	40 %	241195569
2569	NC_012815	CGT	2	6	115464	115469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2570	NC_012815	CTG	2	6	115543	115548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2571	NC_012815	CGC	2	6	115584	115589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195569
2572	NC_012815	GCG	2	6	115629	115634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195569
2573	NC_012815	TGA	2	6	115641	115646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2574	NC_012815	CG	3	6	115662	115667	0 %	0 %	50 %	50 %	241195569
2575	NC_012815	CGATT	2	10	115684	115693	20 %	40 %	20 %	20 %	241195569
2576	NC_012815	CCA	2	6	115707	115712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2577	NC_012815	CAC	2	6	115717	115722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195569
2578	NC_012815	ACG	2	6	115728	115733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2579	NC_012815	CGA	2	6	115770	115775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195569
2580	NC_012815	ATC	2	6	115820	115825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195569
2581	NC_012815	GAT	3	9	115864	115872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2582	NC_012815	GCC	2	6	115952	115957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195569
2583	NC_012815	AGGA	2	8	115969	115976	50 %	0 %	50 %	0 %	241195569
2584	NC_012815	GAT	2	6	115999	116004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195569
2585	NC_012815	TTC	2	6	116006	116011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195569
2586	NC_012815	CGC	2	6	116052	116057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2587	NC_012815	AGCT	2	8	116080	116087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2588	NC_012815	AC	3	6	116138	116143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2589	NC_012815	TTGC	2	8	116156	116163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2590	NC_012815	CG	3	6	116179	116184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2591	NC_012815	CGC	2	6	116312	116317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_012815	CGT	2	6	116351	116356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2593	NC_012815	GTTGCG	2	12	116358	116369	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241195570
2594	NC_012815	TTG	3	9	116371	116379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2595	NC_012815	CGT	2	6	116390	116395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2596	NC_012815	TGT	2	6	116396	116401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
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2598	NC_012815	GTT	2	6	116448	116453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2599	NC_012815	TGC	2	6	116471	116476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2600	NC_012815	CCG	2	6	116483	116488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195570
2601	NC_012815	CAC	2	6	116538	116543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195570
2602	NC_012815	AGC	2	6	116590	116595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2603	NC_012815	AGT	2	6	116597	116602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195570
2604	NC_012815	TGT	2	6	116603	116608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2605	NC_012815	GCT	2	6	116665	116670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2606	NC_012815	CGA	2	6	116681	116686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2607	NC_012815	GCC	2	6	116703	116708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195570
2608	NC_012815	GAT	2	6	116787	116792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195570
2609	NC_012815	TCG	2	6	116794	116799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2610	NC_012815	GCCGAT	2	12	116835	116846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2611	NC_012815	CGG	2	6	116852	116857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195570
2612	NC_012815	CGA	2	6	116886	116891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2613	NC_012815	ACCTG	2	10	116905	116914	20 %	20 %	20 %	40 %	241195570
2614	NC_012815	GCC	2	6	116931	116936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195570
2615	NC_012815	GCG	2	6	116956	116961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195570
2616	NC_012815	GTT	3	9	116991	116999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
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2618	NC_012815	CGT	2	6	117062	117067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2619	NC_012815	CGG	2	6	117153	117158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195570
2620	NC_012815	CAC	2	6	117204	117209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195570
2621	NC_012815	GTT	2	6	117276	117281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2622	NC_012815	CGAC	2	8	117362	117369	25 %	0 %	25 %	50 %	241195570
2623	NC_012815	GTT	2	6	117444	117449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
2624	NC_012815	GCT	2	6	117459	117464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2625	NC_012815	CGC	3	9	117534	117542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195570
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2629	NC_012815	CTG	2	6	117600	117605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
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2631	NC_012815	TGT	2	6	117829	117834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195570
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2633	NC_012815	CGT	2	6	117873	117878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2634	NC_012815	CTG	2	6	117882	117887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195570
2635	NC_012815	AGTCG	2	10	117960	117969	20 %	20 %	40 %	20 %	241195570
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2641	NC_012815	CCG	2	6	118354	118359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195571
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2665	NC_012815	G	6	6	119236	119241	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2738	NC_012815	CG	3	6	122406	122411	0 %	0 %	50 %	50 %	241195573
2739	NC_012815	GC	4	8	122603	122610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2740	NC_012815	GCG	2	6	122688	122693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195574
2741	NC_012815	GC	3	6	122743	122748	0 %	0 %	50 %	50 %	241195574
2742	NC_012815	TCGG	2	8	122759	122766	0 %	25 %	50 %	25 %	241195574
2743	NC_012815	CAC	2	6	122799	122804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195574
2744	NC_012815	ATC	3	9	122819	122827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195574
2745	NC_012815	GCG	2	6	122828	122833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195574
2746	NC_012815	GCGAGC	2	12	122906	122917	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241195574
2747	NC_012815	TCG	2	6	122945	122950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195574
2748	NC_012815	CGT	2	6	122952	122957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195574
2749	NC_012815	GGC	2	6	122995	123000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195574
2750	NC_012815	CAG	2	6	123022	123027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195574
2751	NC_012815	GTCGCG	2	12	123061	123072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241195574
2752	NC_012815	CGA	2	6	123082	123087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195574
2753	NC_012815	CAT	2	6	123100	123105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195574
2754	NC_012815	CATG	2	8	123180	123187	25 %	25 %	25 %	25 %	241195574
2755	NC_012815	CGC	2	6	123204	123209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195574
2756	NC_012815	TCG	2	6	123221	123226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195574
2757	NC_012815	GCA	2	6	123250	123255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195574
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2759	NC_012815	CG	3	6	123343	123348	0 %	0 %	50 %	50 %	241195574
2760	NC_012815	CTG	2	6	123388	123393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195574
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2763	NC_012815	GAT	2	6	123526	123531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195574
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2766	NC_012815	ATG	2	6	123735	123740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195575
2767	NC_012815	CT	3	6	123768	123773	0 %	50 %	0 %	50 %	241195575
2768	NC_012815	GCA	2	6	123781	123786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195575
2769	NC_012815	CGT	2	6	123796	123801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195575
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2773	NC_012815	TCGA	2	8	123894	123901	25 %	25 %	25 %	25 %	241195575
2774	NC_012815	ATG	2	6	123914	123919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195575
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2776	NC_012815	GTTCG	2	10	123971	123980	0 %	40 %	40 %	20 %	241195575
2777	NC_012815	CCA	2	6	124087	124092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195575
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2794	NC_012815	GC	3	6	124961	124966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2795	NC_012815	GACG	2	8	125006	125013	25 %	0 %	50 %	25 %	241195576
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2802	NC_012815	GC	3	6	125370	125375	0 %	0 %	50 %	50 %	241195576
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2811	NC_012815	AGGTG	2	10	125712	125721	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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2815	NC_012815	GCC	2	6	125841	125846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195577
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2844	NC_012815	TG	3	6	127008	127013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2845	NC_012815	GGC	2	6	127063	127068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195578
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2852	NC_012815	CGC	2	6	127290	127295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195578
2853	NC_012815	TGA	2	6	127299	127304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195578
2854	NC_012815	GTG	2	6	127341	127346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2855	NC_012815	GC	3	6	127365	127370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2856	NC_012815	CATG	2	8	127416	127423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2857	NC_012815	TGC	2	6	127428	127433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2858	NC_012815	GC	3	6	127480	127485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2859	NC_012815	GCTG	2	8	127516	127523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2860	NC_012815	AGC	2	6	127528	127533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2861	NC_012815	GTC	2	6	127575	127580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2862	NC_012815	GTG	2	6	127612	127617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2864	NC_012815	TCA	2	6	127650	127655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195579
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2987	NC_012815	TCG	2	6	133265	133270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195585
2988	NC_012815	CCGC	2	8	133299	133306	0 %	0 %	25 %	75 %	241195585
2989	NC_012815	GGC	2	6	133343	133348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195585
2990	NC_012815	GCGCC	2	10	133395	133404	0 %	0 %	40 %	60 %	241195585
2991	NC_012815	GCG	2	6	133413	133418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2992	NC_012815	TGG	2	6	133423	133428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2993	NC_012815	TCG	2	6	133442	133447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2994	NC_012815	CGA	2	6	133510	133515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195586
2995	NC_012815	GCG	2	6	133545	133550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195586
2996	NC_012815	TCGCTG	2	12	133554	133565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195586
2997	NC_012815	GAT	2	6	133600	133605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195586
2998	NC_012815	TCG	2	6	133612	133617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195586
2999	NC_012815	GAT	2	6	133622	133627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195586
3000	NC_012815	CGT	2	6	133667	133672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195586

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