MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012815	CGA	2	6	46904	46909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195516
1002	NC_012815	AAC	2	6	47019	47024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_012815	GT	3	6	47133	47138	0 %	50 %	50 %	0 %	241195517
1004	NC_012815	GCC	2	6	47216	47221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195517
1005	NC_012815	GAG	2	6	47234	47239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195517
1006	NC_012815	CGGT	2	8	47241	47248	0 %	25 %	50 %	25 %	241195517
1007	NC_012815	GCG	2	6	47249	47254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195517
1008	NC_012815	CG	3	6	47274	47279	0 %	0 %	50 %	50 %	241195517
1009	NC_012815	GAT	2	6	47349	47354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195518
1010	NC_012815	CCA	2	6	47399	47404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195518
1011	NC_012815	GC	4	8	47432	47439	0 %	0 %	50 %	50 %	241195518
1012	NC_012815	GAG	2	6	47442	47447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195518
1013	NC_012815	CAG	2	6	47451	47456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195518
1014	NC_012815	CCG	2	6	47539	47544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195518
1015	NC_012815	CCGAC	2	10	47665	47674	20 %	0 %	20 %	60 %	241195518
1016	NC_012815	GCTG	2	8	47728	47735	0 %	25 %	50 %	25 %	241195518
1017	NC_012815	TCG	2	6	47749	47754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195518
1018	NC_012815	CTTCGA	2	12	47804	47815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241195518
1019	NC_012815	CGA	2	6	47822	47827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195518
1020	NC_012815	TTC	2	6	47871	47876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195518
1021	NC_012815	GC	4	8	47924	47931	0 %	0 %	50 %	50 %	241195518
1022	NC_012815	TA	3	6	47947	47952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012815	GTG	3	9	47978	47986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012815	CCA	2	6	48015	48020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_012815	ATG	2	6	48062	48067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195519
1026	NC_012815	CGGC	2	8	48080	48087	0 %	0 %	50 %	50 %	241195519
1027	NC_012815	CAG	2	6	48097	48102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1028	NC_012815	TGG	2	6	48108	48113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195519
1029	NC_012815	AGC	2	6	48134	48139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1030	NC_012815	ATG	2	6	48164	48169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195519
1031	NC_012815	CTG	2	6	48181	48186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1032	NC_012815	GCC	2	6	48220	48225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195519
1033	NC_012815	GTC	2	6	48232	48237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1034	NC_012815	TCG	2	6	48245	48250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1035	NC_012815	GGA	2	6	48256	48261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195519
1036	NC_012815	TGA	2	6	48328	48333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195519
1037	NC_012815	CTCGG	2	10	48383	48392	0 %	20 %	40 %	40 %	241195519
1038	NC_012815	CTG	2	6	48410	48415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1039	NC_012815	TCT	2	6	48462	48467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195519
1040	NC_012815	GGGC	2	8	48486	48493	0 %	0 %	75 %	25 %	241195519
1041	NC_012815	GGC	2	6	48496	48501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195519
1042	NC_012815	GC	3	6	48545	48550	0 %	0 %	50 %	50 %	241195519
1043	NC_012815	CCTG	2	8	48669	48676	0 %	25 %	25 %	50 %	241195519
1044	NC_012815	GTA	2	6	48688	48693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195519
1045	NC_012815	TCG	2	6	48767	48772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1046	NC_012815	GCC	2	6	48850	48855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195519
1047	NC_012815	AGC	2	6	48866	48871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1048	NC_012815	ACC	2	6	48944	48949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195519
1049	NC_012815	GAA	2	6	49060	49065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195519
1050	NC_012815	CAC	2	6	49069	49074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195519
1051	NC_012815	GCCAT	2	10	49083	49092	20 %	20 %	20 %	40 %	241195519
1052	NC_012815	GCG	2	6	49115	49120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195519
1053	NC_012815	ACG	2	6	49197	49202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1054	NC_012815	CCCT	2	8	49234	49241	0 %	25 %	0 %	75 %	241195519
1055	NC_012815	GTGC	2	8	49253	49260	0 %	25 %	50 %	25 %	241195519
1056	NC_012815	CGG	2	6	49296	49301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195519
1057	NC_012815	AGC	2	6	49331	49336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1058	NC_012815	CTG	2	6	49405	49410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1059	NC_012815	AGC	2	6	49420	49425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1060	NC_012815	CAA	2	6	49480	49485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195519
1061	NC_012815	ACC	2	6	49505	49510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195519
1062	NC_012815	GGC	2	6	49529	49534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195519
1063	NC_012815	CAC	2	6	49600	49605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195519
1064	NC_012815	TCG	2	6	49622	49627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1065	NC_012815	AGC	2	6	49643	49648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1066	NC_012815	CG	3	6	49778	49783	0 %	0 %	50 %	50 %	241195519
1067	NC_012815	CGGT	2	8	49796	49803	0 %	25 %	50 %	25 %	241195519
1068	NC_012815	GTT	2	6	49810	49815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195519
1069	NC_012815	CGC	2	6	49816	49821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195519
1070	NC_012815	CGAA	2	8	49920	49927	50 %	0 %	25 %	25 %	241195519
1071	NC_012815	GCCCG	2	10	49960	49969	0 %	0 %	40 %	60 %	241195519
1072	NC_012815	AGC	2	6	49970	49975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1073	NC_012815	CGG	2	6	50068	50073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195519
1074	NC_012815	GCC	2	6	50219	50224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195519
1075	NC_012815	CTG	2	6	50263	50268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195519
1076	NC_012815	TG	3	6	50318	50323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012815	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_012815	GC	3	6	50398	50403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_012815	AT	3	6	50445	50450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012815	GCT	2	6	50466	50471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_012815	CAAT	2	8	50520	50527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_012815	GGTCGA	2	12	50664	50675	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1083	NC_012815	TCG	2	6	50696	50701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_012815	ATG	2	6	50705	50710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012815	AGT	2	6	50721	50726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012815	GAT	2	6	50773	50778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012815	CGT	2	6	50787	50792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012815	GCA	2	6	50937	50942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_012815	CGC	2	6	51006	51011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_012815	CG	3	6	51016	51021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_012815	AGC	2	6	51026	51031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_012815	GGTA	2	8	51056	51063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012815	GTC	2	6	51103	51108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_012815	GC	3	6	51112	51117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_012815	CGC	2	6	51139	51144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_012815	GCC	2	6	51184	51189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_012815	CG	3	6	51204	51209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_012815	GAG	2	6	51218	51223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012815	CTG	2	6	51224	51229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012815	GT	3	6	51297	51302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012815	GGAAAA	2	12	51364	51375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012815	GA	3	6	51487	51492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012815	GA	3	6	51497	51502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012815	CGC	2	6	51519	51524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_012815	AAG	2	6	51713	51718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195520
1106	NC_012815	ACT	2	6	51726	51731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195520
1107	NC_012815	TGGC	2	8	51772	51779	0 %	25 %	50 %	25 %	241195520
1108	NC_012815	TGG	2	6	51897	51902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195520
1109	NC_012815	TGC	2	6	51927	51932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195520
1110	NC_012815	TG	3	6	51948	51953	0 %	50 %	50 %	0 %	241195520
1111	NC_012815	TGG	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012815	GAA	2	6	52163	52168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012815	GT	3	6	52312	52317	0 %	50 %	50 %	0 %	241195521
1114	NC_012815	GCT	2	6	52336	52341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1115	NC_012815	TGG	2	6	52368	52373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195521
1116	NC_012815	GAGG	2	8	52507	52514	25 %	0 %	75 %	0 %	241195521
1117	NC_012815	CGGTC	2	10	52543	52552	0 %	20 %	40 %	40 %	241195521
1118	NC_012815	GTC	2	6	52555	52560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1119	NC_012815	CAT	2	6	52573	52578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195521
1120	NC_012815	CGC	2	6	52584	52589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195521
1121	NC_012815	GTC	2	6	52597	52602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1122	NC_012815	CGT	2	6	52635	52640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1123	NC_012815	TCG	2	6	52718	52723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1124	NC_012815	CAG	2	6	52729	52734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1125	NC_012815	GC	3	6	52736	52741	0 %	0 %	50 %	50 %	241195521
1126	NC_012815	GGC	2	6	52800	52805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195521
1127	NC_012815	GCG	2	6	52826	52831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195521
1128	NC_012815	ACG	2	6	52841	52846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1129	NC_012815	ACG	2	6	52880	52885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1130	NC_012815	ACC	2	6	52928	52933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195521
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1133	NC_012815	CAG	2	6	53014	53019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195521
1134	NC_012815	CGA	2	6	53055	53060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195521
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1143	NC_012815	GCG	2	6	53362	53367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195521
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1148	NC_012815	CGC	2	6	53540	53545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1149	NC_012815	CA	3	6	53650	53655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1150	NC_012815	ATG	2	6	53660	53665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_012815	AC	3	6	53679	53684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1152	NC_012815	AGG	2	6	53706	53711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1232	NC_012815	CGT	2	6	57541	57546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1233	NC_012815	AAG	2	6	57580	57585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_012815	GCG	2	6	57941	57946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195524
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1248	NC_012815	CGGC	2	8	58045	58052	0 %	0 %	50 %	50 %	241195524
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1251	NC_012815	ATG	2	6	58172	58177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195524
1252	NC_012815	CCGA	2	8	58203	58210	25 %	0 %	25 %	50 %	241195524
1253	NC_012815	GGT	2	6	58253	58258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195524
1254	NC_012815	C	7	7	58453	58459	0 %	0 %	0 %	100 %	241195524
1255	NC_012815	CTGG	2	8	58480	58487	0 %	25 %	50 %	25 %	241195524
1256	NC_012815	TAC	2	6	58520	58525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195524
1257	NC_012815	GCA	2	6	58579	58584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195524
1258	NC_012815	GAT	2	6	58621	58626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195524
1259	NC_012815	GGTT	2	8	58720	58727	0 %	50 %	50 %	0 %	241195524
1260	NC_012815	TGC	2	6	58731	58736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195524
1261	NC_012815	CAA	2	6	58846	58851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195524
1262	NC_012815	AGG	2	6	58854	58859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195524
1263	NC_012815	ACG	2	6	58892	58897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195524
1264	NC_012815	CGG	2	6	58948	58953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195524
1265	NC_012815	GGT	2	6	58960	58965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195524
1266	NC_012815	CGC	2	6	58987	58992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195524
1267	NC_012815	TCA	2	6	59007	59012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195524
1268	NC_012815	TGA	2	6	59054	59059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_012815	TCG	2	6	59148	59153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195525
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1272	NC_012815	GCG	2	6	59440	59445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195525
1273	NC_012815	TCA	2	6	59518	59523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195525
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1279	NC_012815	AAT	2	6	59822	59827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_012815	GTC	2	6	59974	59979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195526
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1296	NC_012815	CATGAG	2	12	60441	60452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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