MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012815	TCT	2	6	21113	21118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195489
502	NC_012815	TAA	2	6	21325	21330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012815	TCTGT	2	10	21384	21393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
504	NC_012815	TGC	2	6	21651	21656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012815	TCT	2	6	21674	21679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012815	GC	3	6	21703	21708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_012815	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_012815	CAGT	2	8	21817	21824	25 %	25 %	25 %	25 %	241195490
509	NC_012815	GT	3	6	21840	21845	0 %	50 %	50 %	0 %	241195490
510	NC_012815	TGA	2	6	21882	21887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195490
511	NC_012815	GAT	2	6	21997	22002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195490
512	NC_012815	GCT	3	9	22022	22030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195490
513	NC_012815	AT	3	6	22084	22089	50 %	50 %	0 %	0 %	241195490
514	NC_012815	TGA	2	6	22107	22112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195490
515	NC_012815	CCA	2	6	22122	22127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195490
516	NC_012815	GTC	2	6	22150	22155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195490
517	NC_012815	GC	4	8	22206	22213	0 %	0 %	50 %	50 %	241195490
518	NC_012815	CTG	2	6	22276	22281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195490
519	NC_012815	GCA	2	6	22286	22291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195490
520	NC_012815	CCA	2	6	22301	22306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195490
521	NC_012815	CGG	2	6	22419	22424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195490
522	NC_012815	CGC	2	6	22437	22442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195490
523	NC_012815	TCT	2	6	22455	22460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195490
524	NC_012815	GCC	2	6	22528	22533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195490
525	NC_012815	GTA	2	6	22653	22658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195491
526	NC_012815	GAA	2	6	22863	22868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195491
527	NC_012815	CTG	2	6	22869	22874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195491
528	NC_012815	AGT	2	6	22894	22899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195491
529	NC_012815	TG	3	6	22964	22969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012815	CGC	2	6	22988	22993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_012815	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_012815	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_012815	TG	3	6	23078	23083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012815	ATG	2	6	23124	23129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012815	ATG	2	6	23157	23162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012815	CAC	2	6	23189	23194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_012815	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_012815	GCA	2	6	23255	23260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012815	AC	3	6	23310	23315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_012815	GGC	2	6	23329	23334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_012815	TCG	2	6	23425	23430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_012815	GC	3	6	23444	23449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_012815	CGG	2	6	23462	23467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012815	CG	3	6	23474	23479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_012815	GGC	2	6	23532	23537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012815	TGG	2	6	23617	23622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195492
547	NC_012815	ATC	2	6	23651	23656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195492
548	NC_012815	CGC	2	6	23691	23696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195492
549	NC_012815	CGC	3	9	23724	23732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195492
550	NC_012815	GCG	2	6	23743	23748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
551	NC_012815	GCC	2	6	23777	23782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195492
552	NC_012815	GCA	2	6	23824	23829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195492
553	NC_012815	GAGC	2	8	23843	23850	25 %	0 %	50 %	25 %	241195492
554	NC_012815	ATC	2	6	23952	23957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195492
555	NC_012815	GGA	2	6	23972	23977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195492
556	NC_012815	GGA	2	6	23996	24001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195492
557	NC_012815	GCG	2	6	24019	24024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
558	NC_012815	GAA	2	6	24272	24277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195492
559	NC_012815	TCA	2	6	24388	24393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195492
560	NC_012815	GAG	2	6	24396	24401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195492
561	NC_012815	CAA	2	6	24431	24436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195492
562	NC_012815	CGCA	2	8	24440	24447	25 %	0 %	25 %	50 %	241195492
563	NC_012815	GAT	2	6	24543	24548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195492
564	NC_012815	TCG	2	6	24571	24576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195492
565	NC_012815	CGCAC	2	10	24588	24597	20 %	0 %	20 %	60 %	241195492
566	NC_012815	ACTCGG	2	12	24611	24622	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241195492
567	NC_012815	CG	3	6	24686	24691	0 %	0 %	50 %	50 %	241195492
568	NC_012815	CGA	2	6	24731	24736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195492
569	NC_012815	GTC	3	9	24819	24827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195492
570	NC_012815	TGC	2	6	24844	24849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195492
571	NC_012815	ATC	2	6	24864	24869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195492
572	NC_012815	GGC	2	6	24897	24902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
573	NC_012815	GTGA	2	8	24924	24931	25 %	25 %	50 %	0 %	241195492
574	NC_012815	GCGA	2	8	24972	24979	25 %	0 %	50 %	25 %	241195492
575	NC_012815	CGA	2	6	25025	25030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195492
576	NC_012815	CGC	2	6	25054	25059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195492
577	NC_012815	GC	3	6	25083	25088	0 %	0 %	50 %	50 %	241195492
578	NC_012815	GCCT	2	8	25198	25205	0 %	25 %	25 %	50 %	241195492
579	NC_012815	GC	4	8	25214	25221	0 %	0 %	50 %	50 %	241195492
580	NC_012815	GAT	2	6	25250	25255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195492
581	NC_012815	CGACG	2	10	25256	25265	20 %	0 %	40 %	40 %	241195492
582	NC_012815	CGA	2	6	25316	25321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195492
583	NC_012815	GCG	2	6	25325	25330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
584	NC_012815	GC	3	6	25338	25343	0 %	0 %	50 %	50 %	241195492
585	NC_012815	GCG	2	6	25350	25355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
586	NC_012815	GGCG	2	8	25373	25380	0 %	0 %	75 %	25 %	241195492
587	NC_012815	ACA	2	6	25390	25395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195492
588	NC_012815	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	241195492
589	NC_012815	GAA	2	6	25538	25543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195492
590	NC_012815	GCG	2	6	25625	25630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
591	NC_012815	GCG	2	6	25711	25716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
592	NC_012815	CG	3	6	25752	25757	0 %	0 %	50 %	50 %	241195492
593	NC_012815	TGTTCG	2	12	25771	25782	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241195492
594	NC_012815	CGA	2	6	25789	25794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195492
595	NC_012815	ATC	2	6	25914	25919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195492
596	NC_012815	GGC	3	9	25932	25940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
597	NC_012815	CGG	2	6	25946	25951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
598	NC_012815	TCG	2	6	25957	25962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195492
599	NC_012815	GAGT	2	8	26034	26041	25 %	25 %	50 %	0 %	241195492
600	NC_012815	GCCGT	2	10	26067	26076	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
601	NC_012815	GTT	2	6	26136	26141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012815	AG	3	6	26181	26186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012815	GGT	2	6	26194	26199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012815	GGT	2	6	26246	26251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012815	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
606	NC_012815	GGT	2	6	26291	26296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012815	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_012815	ATG	2	6	26335	26340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012815	CGG	2	6	26365	26370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_012815	GAA	2	6	26378	26383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012815	GCA	2	6	26496	26501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
612	NC_012815	GCG	3	9	26594	26602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195493
613	NC_012815	GCA	2	6	26604	26609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
614	NC_012815	GCCGTT	2	12	26742	26753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195493
615	NC_012815	GGC	2	6	26869	26874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195493
616	NC_012815	GAG	2	6	26908	26913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195493
617	NC_012815	ACG	2	6	26951	26956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
618	NC_012815	GCT	3	9	26970	26978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195493
619	NC_012815	CGA	2	6	26979	26984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
620	NC_012815	CGA	2	6	27015	27020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
621	NC_012815	CGG	2	6	27027	27032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195493
622	NC_012815	GC	4	8	27057	27064	0 %	0 %	50 %	50 %	241195493
623	NC_012815	GGGGA	2	10	27082	27091	20 %	0 %	80 %	0 %	241195493
624	NC_012815	ATC	2	6	27304	27309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195494
625	NC_012815	TCT	2	6	27338	27343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195494
626	NC_012815	CATT	2	8	27401	27408	25 %	50 %	0 %	25 %	241195494
627	NC_012815	GCC	2	6	27478	27483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195494
628	NC_012815	GTG	2	6	27502	27507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195494
629	NC_012815	GAT	2	6	27522	27527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195494
630	NC_012815	ATT	2	6	27574	27579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241195494
631	NC_012815	TGG	2	6	27656	27661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195494
632	NC_012815	TGG	2	6	27665	27670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195494
633	NC_012815	GTG	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195494
634	NC_012815	CCG	2	6	27701	27706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195494
635	NC_012815	GACG	2	8	27804	27811	25 %	0 %	50 %	25 %	241195494
636	NC_012815	TGA	2	6	27815	27820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195494
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638	NC_012815	CGA	2	6	27924	27929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195494
639	NC_012815	CTG	2	6	27931	27936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195494
640	NC_012815	GTC	3	9	27946	27954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195494
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642	NC_012815	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
643	NC_012815	AGAGA	2	10	28163	28172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
644	NC_012815	GAA	3	9	28175	28183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
645	NC_012815	CGGTT	2	10	28212	28221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
646	NC_012815	CGC	2	6	28227	28232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
647	NC_012815	CG	3	6	28262	28267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
648	NC_012815	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
649	NC_012815	ACA	2	6	28396	28401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_012815	AGG	2	6	28428	28433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
651	NC_012815	ACG	2	6	28476	28481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195495
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653	NC_012815	TCG	2	6	28506	28511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195495
654	NC_012815	CAA	2	6	28534	28539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195495
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657	NC_012815	GC	3	6	28664	28669	0 %	0 %	50 %	50 %	241195495
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663	NC_012815	TTC	2	6	29151	29156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_012815	TA	5	10	29303	29312	50 %	50 %	0 %	0 %	241195496
665	NC_012815	GGCGAT	2	12	29390	29401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241195496
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669	NC_012815	AATC	2	8	29572	29579	50 %	25 %	0 %	25 %	241195496
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671	NC_012815	AGC	2	6	29859	29864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195496
672	NC_012815	CGA	2	6	29918	29923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195496
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675	NC_012815	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
676	NC_012815	ATT	2	6	30026	30031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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678	NC_012815	GGC	2	6	30194	30199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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682	NC_012815	TGG	2	6	30453	30458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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684	NC_012815	GAC	2	6	30525	30530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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754	NC_012815	TA	3	6	33688	33693	50 %	50 %	0 %	0 %	241195502
755	NC_012815	AT	3	6	33710	33715	50 %	50 %	0 %	0 %	241195502
756	NC_012815	TGG	2	6	33743	33748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195502
757	NC_012815	GGT	2	6	33790	33795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
758	NC_012815	GTT	2	6	33828	33833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
759	NC_012815	GTG	2	6	33838	33843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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