MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 43426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012815	CGTGG	2	10	233850	233859	0 %	20 %	60 %	20 %	241195666
5502	NC_012815	CGA	2	6	233874	233879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195666
5503	NC_012815	GC	3	6	233888	233893	0 %	0 %	50 %	50 %	241195666
5504	NC_012815	CTC	2	6	233967	233972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_012815	A	6	6	233976	233981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_012815	TCG	2	6	234115	234120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195667
5507	NC_012815	CGC	2	6	234122	234127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195667
5508	NC_012815	CGA	2	6	234170	234175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195667
5509	NC_012815	GCG	2	6	234193	234198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195667
5510	NC_012815	ATG	2	6	234199	234204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195667
5511	NC_012815	GCC	2	6	234267	234272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195667
5512	NC_012815	GGC	2	6	234305	234310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195667
5513	NC_012815	GA	3	6	234313	234318	50 %	0 %	50 %	0 %	241195667
5514	NC_012815	CTG	2	6	234348	234353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195667
5515	NC_012815	CTC	2	6	234363	234368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195667
5516	NC_012815	CAT	2	6	234408	234413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195667
5517	NC_012815	GC	3	6	234445	234450	0 %	0 %	50 %	50 %	241195667
5518	NC_012815	GAT	2	6	234462	234467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195667
5519	NC_012815	GGA	2	6	234603	234608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195667
5520	NC_012815	TTGT	2	8	234698	234705	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_012815	A	6	6	234824	234829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_012815	GT	3	6	234888	234893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_012815	GC	3	6	234903	234908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_012815	CGA	2	6	235040	235045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_012815	GC	3	6	235084	235089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_012815	CCGG	2	8	235098	235105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_012815	CGC	2	6	235175	235180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195668
5528	NC_012815	GCA	2	6	235186	235191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195668
5529	NC_012815	TGCG	2	8	235203	235210	0 %	25 %	50 %	25 %	241195668
5530	NC_012815	TGCTC	2	10	235219	235228	0 %	40 %	20 %	40 %	241195668
5531	NC_012815	GGC	2	6	235229	235234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195668
5532	NC_012815	CTG	2	6	235259	235264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195668
5533	NC_012815	CG	3	6	235273	235278	0 %	0 %	50 %	50 %	241195668
5534	NC_012815	CGA	2	6	235300	235305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195668
5535	NC_012815	GC	3	6	235323	235328	0 %	0 %	50 %	50 %	241195668
5536	NC_012815	GC	3	6	235385	235390	0 %	0 %	50 %	50 %	241195668
5537	NC_012815	CGGAGG	2	12	235432	235443	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	241195668
5538	NC_012815	GCT	2	6	235489	235494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195668
5539	NC_012815	GCA	2	6	235510	235515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195668
5540	NC_012815	CCA	2	6	235600	235605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195668
5541	NC_012815	GTC	2	6	235634	235639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195668
5542	NC_012815	CAG	2	6	235658	235663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195668
5543	NC_012815	GC	3	6	235757	235762	0 %	0 %	50 %	50 %	241195668
5544	NC_012815	GGGGC	2	10	235763	235772	0 %	0 %	80 %	20 %	241195668
5545	NC_012815	GAGCCG	2	12	235812	235823	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241195668
5546	NC_012815	TAG	2	6	235837	235842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195669
5547	NC_012815	GAT	2	6	235869	235874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195669
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5549	NC_012815	ACC	2	6	236004	236009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195669
5550	NC_012815	TGCA	2	8	236023	236030	25 %	25 %	25 %	25 %	241195669
5551	NC_012815	GCC	2	6	236092	236097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195669
5552	NC_012815	CCT	2	6	236117	236122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195669
5553	NC_012815	GCG	2	6	236129	236134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195669
5554	NC_012815	GCG	2	6	236142	236147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195669
5555	NC_012815	CGTTT	2	10	236152	236161	0 %	60 %	20 %	20 %	241195669
5556	NC_012815	CGG	3	9	236261	236269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195669
5557	NC_012815	AGC	2	6	236347	236352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195669
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5559	NC_012815	CGGT	2	8	236413	236420	0 %	25 %	50 %	25 %	241195669
5560	NC_012815	GC	3	6	236439	236444	0 %	0 %	50 %	50 %	241195669
5561	NC_012815	CGAG	2	8	236450	236457	25 %	0 %	50 %	25 %	241195669
5562	NC_012815	CTCAC	2	10	236473	236482	20 %	20 %	0 %	60 %	241195669
5563	NC_012815	CGG	2	6	236518	236523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195669
5564	NC_012815	GTC	3	9	236532	236540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195669
5565	NC_012815	GGA	2	6	236628	236633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195669
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5570	NC_012815	GCC	2	6	236862	236867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195669
5571	NC_012815	A	6	6	236924	236929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_012815	GGC	2	6	237007	237012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_012815	CTT	2	6	237028	237033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195670
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5578	NC_012815	CGG	2	6	237255	237260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195670
5579	NC_012815	TCCGG	2	10	237275	237284	0 %	20 %	40 %	40 %	241195670
5580	NC_012815	CGA	2	6	237432	237437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195670
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5582	NC_012815	TCT	2	6	237486	237491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195670
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5593	NC_012815	TCG	2	6	237896	237901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195670
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5595	NC_012815	CGA	2	6	237918	237923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195670
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5601	NC_012815	CTCGA	2	10	238142	238151	20 %	20 %	20 %	40 %	241195670
5602	NC_012815	GCC	2	6	238216	238221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195670
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5610	NC_012815	GAAC	2	8	238453	238460	50 %	0 %	25 %	25 %	241195670
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5622	NC_012815	CTG	2	6	238906	238911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195670
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5747	NC_012815	GGT	2	6	243694	243699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195674
5748	NC_012815	CGA	2	6	243702	243707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195674
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5750	NC_012815	GGC	2	6	243828	243833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5751	NC_012815	ATC	2	6	243845	243850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5784	NC_012815	CG	4	8	244992	244999	0 %	0 %	50 %	50 %	241195677
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5856	NC_012815	GAG	2	6	247778	247783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5857	NC_012815	TGGCAT	2	12	247790	247801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241195679
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5860	NC_012815	TCG	2	6	247922	247927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195679
5861	NC_012815	TG	3	6	247980	247985	0 %	50 %	50 %	0 %	241195679
5862	NC_012815	AGC	2	6	247990	247995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195679
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5865	NC_012815	GAG	2	6	248050	248055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195679
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5867	NC_012815	GCG	2	6	248117	248122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195679
5868	NC_012815	GCT	2	6	248172	248177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195679
5869	NC_012815	ACG	2	6	248189	248194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195679
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5875	NC_012815	CGA	2	6	248343	248348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195679
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5879	NC_012815	TCG	2	6	248542	248547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195680
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5901	NC_012815	GACA	2	8	249341	249348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5947	NC_012815	ATCG	2	8	251232	251239	25 %	25 %	25 %	25 %	241195683
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5967	NC_012815	CG	3	6	252360	252365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5968	NC_012815	AGG	2	6	252404	252409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5976	NC_012815	GC	3	6	252900	252905	0 %	0 %	50 %	50 %	241195684
5977	NC_012815	CTCCGT	2	12	252924	252935	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	241195684
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5979	NC_012815	AAG	2	6	252979	252984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195684
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5984	NC_012815	ACG	2	6	253277	253282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195684
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5987	NC_012815	TC	3	6	253437	253442	0 %	50 %	0 %	50 %	241195684
5988	NC_012815	AAG	2	6	253564	253569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195684
5989	NC_012815	CGC	2	6	253590	253595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195684
5990	NC_012815	CGTGGA	2	12	253608	253619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241195684
5991	NC_012815	GGC	2	6	253717	253722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195684
5992	NC_012815	GAA	2	6	253764	253769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195684
5993	NC_012815	GGT	2	6	253791	253796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195684
5994	NC_012815	GCA	3	9	253797	253805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195684
5995	NC_012815	GAA	2	6	253818	253823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195684
5996	NC_012815	GGT	2	6	253908	253913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195684
5997	NC_012815	GCT	2	6	253959	253964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195684
5998	NC_012815	GTC	2	6	253977	253982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195684
5999	NC_012815	CG	3	6	254063	254068	0 %	0 %	50 %	50 %	241195684
6000	NC_012815	CGC	2	6	254097	254102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195684

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