MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bl-04 chromosome

Total Repeats: 4522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012814	GGCT	2	8	236	243	0 %	25 %	50 %	25 %	241190067
2	NC_012814	GTTC	2	8	792	799	0 %	50 %	25 %	25 %	241190067
3	NC_012814	CGAG	2	8	1056	1063	25 %	0 %	50 %	25 %	241190067
4	NC_012814	ACGA	2	8	1070	1077	50 %	0 %	25 %	25 %	241190067
5	NC_012814	CATG	2	8	1780	1787	25 %	25 %	25 %	25 %	241190067
6	NC_012814	TTCG	2	8	2512	2519	0 %	50 %	25 %	25 %	241190068
7	NC_012814	ACGC	2	8	2553	2560	25 %	0 %	25 %	50 %	241190068
8	NC_012814	CGGC	2	8	3366	3373	0 %	0 %	50 %	50 %	241190068
9	NC_012814	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012814	CGTT	2	8	4094	4101	0 %	50 %	25 %	25 %	241190069
11	NC_012814	GCCG	2	8	4906	4913	0 %	0 %	50 %	50 %	241190069
12	NC_012814	GCAT	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	241190069
13	NC_012814	GCAG	2	8	4976	4983	25 %	0 %	50 %	25 %	241190069
14	NC_012814	GAGC	2	8	5085	5092	25 %	0 %	50 %	25 %	241190069
15	NC_012814	GCCG	2	8	5133	5140	0 %	0 %	50 %	50 %	241190070
16	NC_012814	CGCA	2	8	5352	5359	25 %	0 %	25 %	50 %	241190070
17	NC_012814	TGGG	2	8	5365	5372	0 %	25 %	75 %	0 %	241190070
18	NC_012814	GCAA	2	8	5543	5550	50 %	0 %	25 %	25 %	241190070
19	NC_012814	CAAC	2	8	5786	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	241190071
20	NC_012814	CGAG	2	8	7215	7222	25 %	0 %	50 %	25 %	241190071
21	NC_012814	CGGC	2	8	7536	7543	0 %	0 %	50 %	50 %	241190071
22	NC_012814	AACC	2	8	7973	7980	50 %	0 %	0 %	50 %	241190072
23	NC_012814	CGAT	2	8	8117	8124	25 %	25 %	25 %	25 %	241190072
24	NC_012814	GAGC	2	8	8179	8186	25 %	0 %	50 %	25 %	241190072
25	NC_012814	CCGC	2	8	8567	8574	0 %	0 %	25 %	75 %	241190072
26	NC_012814	TGCG	2	8	8825	8832	0 %	25 %	50 %	25 %	241190072
27	NC_012814	CATT	2	8	9143	9150	25 %	50 %	0 %	25 %	241190072
28	NC_012814	CGCC	2	8	9183	9190	0 %	0 %	25 %	75 %	241190072
29	NC_012814	GCAC	2	8	9749	9756	25 %	0 %	25 %	50 %	241190072
30	NC_012814	CGAC	2	8	10082	10089	25 %	0 %	25 %	50 %	241190072
31	NC_012814	GATG	2	8	10221	10228	25 %	25 %	50 %	0 %	241190072
32	NC_012814	ACCG	2	8	10987	10994	25 %	0 %	25 %	50 %	241190073
33	NC_012814	CGCC	2	8	11027	11034	0 %	0 %	25 %	75 %	241190073
34	NC_012814	CGGT	2	8	11158	11165	0 %	25 %	50 %	25 %	241190073
35	NC_012814	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012814	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012814	TTCA	2	8	11807	11814	25 %	50 %	0 %	25 %	241190074
38	NC_012814	TGCG	2	8	12064	12071	0 %	25 %	50 %	25 %	241190074
39	NC_012814	TTGC	2	8	12527	12534	0 %	50 %	25 %	25 %	241190074
40	NC_012814	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012814	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012814	GCGA	3	12	14744	14755	25 %	0 %	50 %	25 %	241190076
43	NC_012814	CGCC	2	8	14863	14870	0 %	0 %	25 %	75 %	241190076
44	NC_012814	GCCG	2	8	15218	15225	0 %	0 %	50 %	50 %	241190076
45	NC_012814	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_012814	TCGG	2	8	16490	16497	0 %	25 %	50 %	25 %	241190077
47	NC_012814	GCCG	2	8	16677	16684	0 %	0 %	50 %	50 %	241190077
48	NC_012814	GCCG	2	8	17097	17104	0 %	0 %	50 %	50 %	241190079
49	NC_012814	TGGC	2	8	17348	17355	0 %	25 %	50 %	25 %	241190079
50	NC_012814	GATC	2	8	17549	17556	25 %	25 %	25 %	25 %	241190079
51	NC_012814	TTCC	2	8	17722	17729	0 %	50 %	0 %	50 %	241190079
52	NC_012814	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012814	GCGT	2	8	19316	19323	0 %	25 %	50 %	25 %	241190081
54	NC_012814	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012814	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012814	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012814	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012814	TCGA	2	8	20406	20413	25 %	25 %	25 %	25 %	241190082
59	NC_012814	ACTC	2	8	20597	20604	25 %	25 %	0 %	50 %	241190082
60	NC_012814	GGAA	2	8	20668	20675	50 %	0 %	50 %	0 %	241190082
61	NC_012814	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012814	CAGT	2	8	21817	21824	25 %	25 %	25 %	25 %	241190084
63	NC_012814	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012814	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012814	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012814	GAGC	2	8	23843	23850	25 %	0 %	50 %	25 %	241190086
67	NC_012814	CGCA	2	8	24440	24447	25 %	0 %	25 %	50 %	241190086
68	NC_012814	GTGA	2	8	24924	24931	25 %	25 %	50 %	0 %	241190086
69	NC_012814	GCGA	2	8	24972	24979	25 %	0 %	50 %	25 %	241190086
70	NC_012814	GCCT	2	8	25198	25205	0 %	25 %	25 %	50 %	241190086
71	NC_012814	GGCG	2	8	25373	25380	0 %	0 %	75 %	25 %	241190086
72	NC_012814	GAGT	2	8	26034	26041	25 %	25 %	50 %	0 %	241190086
73	NC_012814	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012814	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012814	CATT	2	8	27401	27408	25 %	50 %	0 %	25 %	241190088
76	NC_012814	GACG	2	8	27804	27811	25 %	0 %	50 %	25 %	241190088
77	NC_012814	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012814	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012814	GTCG	2	8	28651	28658	0 %	25 %	50 %	25 %	241190089
80	NC_012814	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012814	GCAG	2	8	29438	29445	25 %	0 %	50 %	25 %	241190090
82	NC_012814	AATC	2	8	29572	29579	50 %	25 %	0 %	25 %	241190090
83	NC_012814	GACT	2	8	29949	29956	25 %	25 %	25 %	25 %	241190090
84	NC_012814	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012814	GCTT	2	8	31989	31996	0 %	50 %	25 %	25 %	241190094
86	NC_012814	TGGC	2	8	32674	32681	0 %	25 %	50 %	25 %	241190096
87	NC_012814	TTTC	2	8	32914	32921	0 %	75 %	0 %	25 %	241190096
88	NC_012814	ATTT	2	8	33195	33202	25 %	75 %	0 %	0 %	241190096
89	NC_012814	ACGA	2	8	33211	33218	50 %	0 %	25 %	25 %	241190096
90	NC_012814	CTTG	2	8	33368	33375	0 %	50 %	25 %	25 %	241190096
91	NC_012814	TTTA	2	8	33384	33391	25 %	75 %	0 %	0 %	241190096
92	NC_012814	ATTC	2	8	33666	33673	25 %	50 %	0 %	25 %	241190096
93	NC_012814	TGAT	2	8	34097	34104	25 %	50 %	25 %	0 %	241190097
94	NC_012814	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012814	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012814	GAGC	2	8	34870	34877	25 %	0 %	50 %	25 %	241190098
97	NC_012814	GCCA	2	8	35688	35695	25 %	0 %	25 %	50 %	241190098
98	NC_012814	CTCG	2	8	36208	36215	0 %	25 %	25 %	50 %	241190099
99	NC_012814	TGTC	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012814	TGCT	2	8	37689	37696	0 %	50 %	25 %	25 %	241190100
101	NC_012814	TGGG	2	8	37736	37743	0 %	25 %	75 %	0 %	241190100
102	NC_012814	AGCG	2	8	37778	37785	25 %	0 %	50 %	25 %	241190100
103	NC_012814	GAAA	2	8	38316	38323	75 %	0 %	25 %	0 %	241190100
104	NC_012814	CTTG	2	8	41618	41625	0 %	50 %	25 %	25 %	241190102
105	NC_012814	GCTT	2	8	41659	41666	0 %	50 %	25 %	25 %	241190102
106	NC_012814	TGAT	2	8	42022	42029	25 %	50 %	25 %	0 %	241190102
107	NC_012814	CAAT	2	8	42259	42266	50 %	25 %	0 %	25 %	241190102
108	NC_012814	CGCA	2	8	42911	42918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012814	AGTG	2	8	43586	43593	25 %	25 %	50 %	0 %	241190104
110	NC_012814	GGTC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012814	GATT	2	8	44113	44120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012814	GTCG	2	8	44332	44339	0 %	25 %	50 %	25 %	241190105
113	NC_012814	AGAA	2	8	44644	44651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012814	TTTG	2	8	44880	44887	0 %	75 %	25 %	0 %	241190106
115	NC_012814	AAGG	2	8	45092	45099	50 %	0 %	50 %	0 %	241190107
116	NC_012814	GGAT	2	8	45700	45707	25 %	25 %	50 %	0 %	241190109
117	NC_012814	TGCT	2	8	45948	45955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012814	CGGT	2	8	46492	46499	0 %	25 %	50 %	25 %	241190110
119	NC_012814	GTGA	2	8	46759	46766	25 %	25 %	50 %	0 %	241190110
120	NC_012814	CGGT	2	8	47241	47248	0 %	25 %	50 %	25 %	241190111
121	NC_012814	GCTG	2	8	47728	47735	0 %	25 %	50 %	25 %	241190112
122	NC_012814	CGGC	2	8	48080	48087	0 %	0 %	50 %	50 %	241190113
123	NC_012814	GGGC	2	8	48486	48493	0 %	0 %	75 %	25 %	241190113
124	NC_012814	CCTG	2	8	48669	48676	0 %	25 %	25 %	50 %	241190113
125	NC_012814	CCCT	2	8	49234	49241	0 %	25 %	0 %	75 %	241190113
126	NC_012814	GTGC	2	8	49253	49260	0 %	25 %	50 %	25 %	241190113
127	NC_012814	CGGT	2	8	49796	49803	0 %	25 %	50 %	25 %	241190113
128	NC_012814	CGAA	2	8	49920	49927	50 %	0 %	25 %	25 %	241190113
129	NC_012814	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012814	CAAT	2	8	50520	50527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012814	GGTA	2	8	51056	51063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012814	TGGC	2	8	51772	51779	0 %	25 %	50 %	25 %	241190114
133	NC_012814	GAGG	2	8	52507	52514	25 %	0 %	75 %	0 %	241190115
134	NC_012814	GCTC	2	8	53889	53896	0 %	25 %	25 %	50 %	241190116
135	NC_012814	CAGG	2	8	54913	54920	25 %	0 %	50 %	25 %	241190116
136	NC_012814	GCAC	2	8	55205	55212	25 %	0 %	25 %	50 %	241190116
137	NC_012814	ATCG	2	8	55313	55320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012814	GCCG	2	8	55383	55390	0 %	0 %	50 %	50 %	241190117
139	NC_012814	AGGT	2	8	55553	55560	25 %	25 %	50 %	0 %	241190117
140	NC_012814	CCCA	2	8	55697	55704	25 %	0 %	0 %	75 %	241190117
141	NC_012814	CGAA	2	8	56409	56416	50 %	0 %	25 %	25 %	241190117
142	NC_012814	CTCG	2	8	56620	56627	0 %	25 %	25 %	50 %	241190117
143	NC_012814	GCGG	2	8	56662	56669	0 %	0 %	75 %	25 %	241190117
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