MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CG	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	238028979
2	NC_012725	CT	3	6	1474	1479	0 %	50 %	0 %	50 %	238028979
3	NC_012725	GC	3	6	1968	1973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012725	AT	3	6	2042	2047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012725	GC	3	6	3623	3628	0 %	0 %	50 %	50 %	238028980
6	NC_012725	GC	3	6	4155	4160	0 %	0 %	50 %	50 %	238028981
7	NC_012725	GC	3	6	4734	4739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012725	CG	4	8	4743	4750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012725	GC	3	6	5106	5111	0 %	0 %	50 %	50 %	238028982
10	NC_012725	CA	3	6	5144	5149	50 %	0 %	0 %	50 %	238028982
11	NC_012725	CA	3	6	5550	5555	50 %	0 %	0 %	50 %	238028982
12	NC_012725	GC	4	8	5780	5787	0 %	0 %	50 %	50 %	238028982
13	NC_012725	CG	3	6	6149	6154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012725	TC	3	6	6219	6224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012725	GA	3	6	6731	6736	50 %	0 %	50 %	0 %	238028983
16	NC_012725	CG	3	6	6745	6750	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
17	NC_012725	CG	3	6	6819	6824	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
18	NC_012725	CG	3	6	6863	6868	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
19	NC_012725	GC	4	8	6998	7005	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
20	NC_012725	GC	3	6	7146	7151	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
21	NC_012725	CG	3	6	7170	7175	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
22	NC_012725	GC	3	6	7180	7185	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
23	NC_012725	CG	3	6	7513	7518	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
24	NC_012725	GC	3	6	7631	7636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012725	GT	3	6	7781	7786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012725	CA	3	6	7807	7812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012725	TC	4	8	7946	7953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012725	GC	3	6	8671	8676	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
29	NC_012725	GC	3	6	8746	8751	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
30	NC_012725	CG	3	6	8761	8766	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
31	NC_012725	CG	3	6	9419	9424	0 %	0 %	50 %	50 %	238028985
32	NC_012725	GC	3	6	9437	9442	0 %	0 %	50 %	50 %	238028985
33	NC_012725	CG	3	6	9500	9505	0 %	0 %	50 %	50 %	238028985
34	NC_012725	CG	3	6	9738	9743	0 %	0 %	50 %	50 %	238028985
35	NC_012725	CG	4	8	9845	9852	0 %	0 %	50 %	50 %	238028986
36	NC_012725	CG	3	6	10531	10536	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
37	NC_012725	GA	3	6	10976	10981	50 %	0 %	50 %	0 %	238028987
38	NC_012725	GC	3	6	11248	11253	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
39	NC_012725	AG	3	6	11501	11506	50 %	0 %	50 %	0 %	238028987
40	NC_012725	CG	3	6	11698	11703	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
41	NC_012725	CG	3	6	11832	11837	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
42	NC_012725	GA	3	6	12011	12016	50 %	0 %	50 %	0 %	238028987
43	NC_012725	GC	3	6	12718	12723	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
44	NC_012725	GC	3	6	13279	13284	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
45	NC_012725	GC	3	6	13600	13605	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
46	NC_012725	GC	3	6	13840	13845	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
47	NC_012725	GC	3	6	14161	14166	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
48	NC_012725	CG	3	6	15262	15267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012725	CG	3	6	15491	15496	0 %	0 %	50 %	50 %	238028988
50	NC_012725	GC	3	6	15520	15525	0 %	0 %	50 %	50 %	238028988
51	NC_012725	GC	4	8	15630	15637	0 %	0 %	50 %	50 %	238028988
52	NC_012725	CG	3	6	15789	15794	0 %	0 %	50 %	50 %	238028988
53	NC_012725	CG	4	8	16147	16154	0 %	0 %	50 %	50 %	238028989
54	NC_012725	CG	3	6	16222	16227	0 %	0 %	50 %	50 %	238028989
55	NC_012725	GA	3	6	16249	16254	50 %	0 %	50 %	0 %	238028989
56	NC_012725	GC	3	6	17310	17315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012725	CG	3	6	17791	17796	0 %	0 %	50 %	50 %	238028992
58	NC_012725	GC	5	10	18112	18121	0 %	0 %	50 %	50 %	238028992
59	NC_012725	CG	3	6	18168	18173	0 %	0 %	50 %	50 %	238028992
60	NC_012725	GA	3	6	18340	18345	50 %	0 %	50 %	0 %	238028993
61	NC_012725	CG	3	6	18352	18357	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
62	NC_012725	CG	4	8	18475	18482	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
63	NC_012725	CG	3	6	18529	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
64	NC_012725	GC	3	6	18653	18658	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
65	NC_012725	GC	3	6	18741	18746	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
66	NC_012725	GC	3	6	18879	18884	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
67	NC_012725	CG	4	8	19034	19041	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
68	NC_012725	CG	3	6	19275	19280	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
69	NC_012725	GC	3	6	19341	19346	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
70	NC_012725	GC	4	8	19363	19370	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
71	NC_012725	CG	3	6	19530	19535	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
72	NC_012725	CG	3	6	19984	19989	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
73	NC_012725	GC	3	6	20162	20167	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
74	NC_012725	CG	4	8	20210	20217	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
75	NC_012725	CG	4	8	20260	20267	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
76	NC_012725	GC	3	6	20987	20992	0 %	0 %	50 %	50 %	238028995
77	NC_012725	GC	3	6	21074	21079	0 %	0 %	50 %	50 %	238028995
78	NC_012725	GA	3	6	21091	21096	50 %	0 %	50 %	0 %	238028995
79	NC_012725	CA	3	6	21344	21349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012725	GC	3	6	21566	21571	0 %	0 %	50 %	50 %	238028996
81	NC_012725	CG	3	6	22929	22934	0 %	0 %	50 %	50 %	238028997
82	NC_012725	GC	3	6	23789	23794	0 %	0 %	50 %	50 %	238028997
83	NC_012725	CG	3	6	25538	25543	0 %	0 %	50 %	50 %	238028998
84	NC_012725	GC	3	6	25626	25631	0 %	0 %	50 %	50 %	238028998
85	NC_012725	CG	3	6	25635	25640	0 %	0 %	50 %	50 %	238028998
86	NC_012725	CG	3	6	26696	26701	0 %	0 %	50 %	50 %	238028998
87	NC_012725	GC	4	8	28197	28204	0 %	0 %	50 %	50 %	238029000
88	NC_012725	CG	3	6	28227	28232	0 %	0 %	50 %	50 %	238029000
89	NC_012725	GC	3	6	28717	28722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012725	TG	3	6	29088	29093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012725	GC	3	6	29143	29148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012725	CG	4	8	29470	29477	0 %	0 %	50 %	50 %	238029001
93	NC_012725	GC	3	6	29565	29570	0 %	0 %	50 %	50 %	238029001
94	NC_012725	AC	3	6	31250	31255	50 %	0 %	0 %	50 %	238029003
95	NC_012725	GC	3	6	32228	32233	0 %	0 %	50 %	50 %	238029003
96	NC_012725	GC	3	6	32271	32276	0 %	0 %	50 %	50 %	238029004
97	NC_012725	CG	3	6	32451	32456	0 %	0 %	50 %	50 %	238029004
98	NC_012725	GC	3	6	32827	32832	0 %	0 %	50 %	50 %	238029004
99	NC_012725	GC	3	6	32878	32883	0 %	0 %	50 %	50 %	238029004
100	NC_012725	CG	3	6	34532	34537	0 %	0 %	50 %	50 %	238029006
101	NC_012725	TC	3	6	34584	34589	0 %	50 %	0 %	50 %	238029006
102	NC_012725	CG	3	6	35288	35293	0 %	0 %	50 %	50 %	238029007
103	NC_012725	CG	3	6	35519	35524	0 %	0 %	50 %	50 %	238029007
104	NC_012725	CG	4	8	35529	35536	0 %	0 %	50 %	50 %	238029007
105	NC_012725	GC	3	6	36627	36632	0 %	0 %	50 %	50 %	238029010
106	NC_012725	AC	3	6	37254	37259	50 %	0 %	0 %	50 %	238029010
107	NC_012725	CG	3	6	37998	38003	0 %	0 %	50 %	50 %	238029010
108	NC_012725	CG	3	6	38180	38185	0 %	0 %	50 %	50 %	238029010
109	NC_012725	CG	3	6	38199	38204	0 %	0 %	50 %	50 %	238029010
110	NC_012725	CG	3	6	38429	38434	0 %	0 %	50 %	50 %	238029010
111	NC_012725	GC	4	8	39163	39170	0 %	0 %	50 %	50 %	238029010
112	NC_012725	GC	3	6	39422	39427	0 %	0 %	50 %	50 %	238029011
113	NC_012725	CG	3	6	39538	39543	0 %	0 %	50 %	50 %	238029011
114	NC_012725	CG	3	6	39641	39646	0 %	0 %	50 %	50 %	238029011
115	NC_012725	CG	3	6	40077	40082	0 %	0 %	50 %	50 %	238029012
116	NC_012725	CG	4	8	40684	40691	0 %	0 %	50 %	50 %	238029012
117	NC_012725	CG	4	8	41168	41175	0 %	0 %	50 %	50 %	238029013
118	NC_012725	CG	3	6	41505	41510	0 %	0 %	50 %	50 %	238029013
119	NC_012725	AC	3	6	41753	41758	50 %	0 %	0 %	50 %	238029013
120	NC_012725	CG	3	6	42130	42135	0 %	0 %	50 %	50 %	238029014
121	NC_012725	GT	3	6	42214	42219	0 %	50 %	50 %	0 %	238029014
122	NC_012725	CG	3	6	42393	42398	0 %	0 %	50 %	50 %	238029014
123	NC_012725	CG	3	6	42794	42799	0 %	0 %	50 %	50 %	238029014
124	NC_012725	GC	3	6	43044	43049	0 %	0 %	50 %	50 %	238029014
125	NC_012725	CG	3	6	44040	44045	0 %	0 %	50 %	50 %	238029015
126	NC_012725	GC	3	6	44122	44127	0 %	0 %	50 %	50 %	238029015
127	NC_012725	GC	3	6	44827	44832	0 %	0 %	50 %	50 %	238029016
128	NC_012725	GC	3	6	44834	44839	0 %	0 %	50 %	50 %	238029016
129	NC_012725	CG	3	6	45208	45213	0 %	0 %	50 %	50 %	238029016
130	NC_012725	GT	3	6	45933	45938	0 %	50 %	50 %	0 %	238029018
131	NC_012725	CG	3	6	46384	46389	0 %	0 %	50 %	50 %	238029019
132	NC_012725	CG	3	6	46553	46558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012725	GC	3	6	47028	47033	0 %	0 %	50 %	50 %	238029020
134	NC_012725	GA	4	8	47790	47797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012725	GA	3	6	47810	47815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012725	GC	3	6	47874	47879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012725	TC	4	8	48045	48052	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012725	TC	3	6	48243	48248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012725	GC	3	6	48259	48264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012725	CT	3	6	48265	48270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012725	CA	3	6	48324	48329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012725	GA	3	6	49377	49382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012725	AC	3	6	49583	49588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012725	CG	3	6	49802	49807	0 %	0 %	50 %	50 %	238029023
145	NC_012725	GC	3	6	50037	50042	0 %	0 %	50 %	50 %	238029023
146	NC_012725	CG	4	8	50082	50089	0 %	0 %	50 %	50 %	238029023
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.