MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia glumae BGR1 chromosome 2

Total Repeats: 3492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012721	GAAAG	2	10	189	198	60 %	0 %	40 %	0 %	238023502
2	NC_012721	AGGGC	2	10	1634	1643	20 %	0 %	60 %	20 %	238023503
3	NC_012721	CCGGC	2	10	1995	2004	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_012721	CAAAA	2	10	2096	2105	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012721	TCGAG	2	10	2300	2309	20 %	20 %	40 %	20 %	238023504
6	NC_012721	CGAGC	2	10	2340	2349	20 %	0 %	40 %	40 %	238023504
7	NC_012721	GTCGG	2	10	3575	3584	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012721	CGCCT	2	10	4672	4681	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_012721	GCCCC	2	10	5300	5309	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_012721	GCCAG	2	10	8122	8131	20 %	0 %	40 %	40 %	238023506
11	NC_012721	GATCG	2	10	8578	8587	20 %	20 %	40 %	20 %	238023507
12	NC_012721	CGTGC	2	10	8646	8655	0 %	20 %	40 %	40 %	238023507
13	NC_012721	TGTAC	2	10	8841	8850	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012721	TCGCC	2	10	8962	8971	0 %	20 %	20 %	60 %	238023508
15	NC_012721	CGATG	2	10	11661	11670	20 %	20 %	40 %	20 %	238023510
16	NC_012721	GGCGC	2	10	12052	12061	0 %	0 %	60 %	40 %	238023511
17	NC_012721	CAGCG	2	10	12243	12252	20 %	0 %	40 %	40 %	238023511
18	NC_012721	GATCG	2	10	12293	12302	20 %	20 %	40 %	20 %	238023511
19	NC_012721	CGTGC	2	10	12903	12912	0 %	20 %	40 %	40 %	238023512
20	NC_012721	CCGGG	2	10	13485	13494	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012721	TCGAA	2	10	13764	13773	40 %	20 %	20 %	20 %	238023513
22	NC_012721	CGCGG	2	10	14759	14768	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_012721	GCGCC	2	10	17128	17137	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_012721	CGTGC	2	10	17254	17263	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012721	TCGTG	2	10	17438	17447	0 %	40 %	40 %	20 %	238023517
26	NC_012721	GCGCG	2	10	17919	17928	0 %	0 %	60 %	40 %	238023517
27	NC_012721	CCACG	2	10	20876	20885	20 %	0 %	20 %	60 %	238023519
28	NC_012721	CATGC	2	10	21480	21489	20 %	20 %	20 %	40 %	238023520
29	NC_012721	GTCGC	2	10	22204	22213	0 %	20 %	40 %	40 %	238023521
30	NC_012721	GGCCG	2	10	23947	23956	0 %	0 %	60 %	40 %	238023523
31	NC_012721	GCCGC	2	10	24872	24881	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_012721	GCGCC	2	10	25223	25232	0 %	0 %	40 %	60 %	238023524
33	NC_012721	CGCGG	2	10	25321	25330	0 %	0 %	60 %	40 %	238023524
34	NC_012721	GCCCG	2	10	25612	25621	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_012721	GCGAG	2	10	26008	26017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012721	CGCGC	2	10	26207	26216	0 %	0 %	40 %	60 %	238023526
37	NC_012721	CGGCG	2	10	26718	26727	0 %	0 %	60 %	40 %	238023526
38	NC_012721	CGTCG	2	10	27968	27977	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012721	CCTGA	2	10	28167	28176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012721	GCGGT	2	10	29537	29546	0 %	20 %	60 %	20 %	238023528
41	NC_012721	GCCGG	2	10	29700	29709	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012721	GGTCG	2	10	30834	30843	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012721	CGCGC	3	15	31139	31153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_012721	GGCGC	2	10	31793	31802	0 %	0 %	60 %	40 %	238023529
45	NC_012721	GCCGC	2	10	32043	32052	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_012721	TGCCG	2	10	32068	32077	0 %	20 %	40 %	40 %	238023530
47	NC_012721	TCCGG	2	10	32290	32299	0 %	20 %	40 %	40 %	238023530
48	NC_012721	GCCGC	2	10	32648	32657	0 %	0 %	40 %	60 %	238023530
49	NC_012721	GCGCG	2	10	33550	33559	0 %	0 %	60 %	40 %	238023530
50	NC_012721	CGTCG	2	10	34113	34122	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_012721	CTGGT	2	10	34819	34828	0 %	40 %	40 %	20 %	238023531
52	NC_012721	GCTCG	2	10	35445	35454	0 %	20 %	40 %	40 %	238023531
53	NC_012721	CGCGC	2	10	35870	35879	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_012721	GGCCG	2	10	37667	37676	0 %	0 %	60 %	40 %	238023533
55	NC_012721	GCGCC	2	10	37684	37693	0 %	0 %	40 %	60 %	238023533
56	NC_012721	CGCGC	2	10	38361	38370	0 %	0 %	40 %	60 %	238023533
57	NC_012721	GCGCC	2	10	38609	38618	0 %	0 %	40 %	60 %	238023533
58	NC_012721	CGCGC	2	10	38926	38935	0 %	0 %	40 %	60 %	238023533
59	NC_012721	ATCGC	2	10	39980	39989	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_012721	CGAGC	2	10	40017	40026	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_012721	CCCGG	2	10	40538	40547	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_012721	GGCCG	2	10	40686	40695	0 %	0 %	60 %	40 %	238023535
63	NC_012721	CACGG	2	10	40912	40921	20 %	0 %	40 %	40 %	238023535
64	NC_012721	GCCGG	2	10	41320	41329	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_012721	GCCAC	2	10	42947	42956	20 %	0 %	20 %	60 %	238023537
66	NC_012721	GAGCT	2	10	43258	43267	20 %	20 %	40 %	20 %	238023537
67	NC_012721	CGGCT	2	10	43498	43507	0 %	20 %	40 %	40 %	238023537
68	NC_012721	CGAAT	2	10	44655	44664	40 %	20 %	20 %	20 %	238023538
69	NC_012721	TGCCG	2	10	45609	45618	0 %	20 %	40 %	40 %	238023539
70	NC_012721	CGTGC	2	10	45778	45787	0 %	20 %	40 %	40 %	238023539
71	NC_012721	GCCGT	2	10	45884	45893	0 %	20 %	40 %	40 %	238023539
72	NC_012721	GGCGA	2	10	46179	46188	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012721	CGGCG	2	10	46201	46210	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_012721	GCATG	2	10	46417	46426	20 %	20 %	40 %	20 %	238023540
75	NC_012721	GCCGC	2	10	46530	46539	0 %	0 %	40 %	60 %	238023540
76	NC_012721	GCGCG	2	10	46935	46944	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_012721	CGGCG	2	10	47398	47407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_012721	GACCG	2	10	47544	47553	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012721	CATGC	2	10	48990	48999	20 %	20 %	20 %	40 %	238023544
80	NC_012721	GCGCC	2	10	49694	49703	0 %	0 %	40 %	60 %	238023544
81	NC_012721	CGCGC	2	10	50407	50416	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_012721	CGCGG	2	10	50511	50520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_012721	CGGCG	2	10	50957	50966	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_012721	GAAAC	2	10	51963	51972	60 %	0 %	20 %	20 %	238023547
85	NC_012721	GCCGT	2	10	52763	52772	0 %	20 %	40 %	40 %	238023548
86	NC_012721	ACGCG	2	10	53087	53096	20 %	0 %	40 %	40 %	238023548
87	NC_012721	GGGCC	2	10	53341	53350	0 %	0 %	60 %	40 %	238023549
88	NC_012721	AGCGC	2	10	53952	53961	20 %	0 %	40 %	40 %	238023549
89	NC_012721	AGGCC	2	10	55135	55144	20 %	0 %	40 %	40 %	238023550
90	NC_012721	GCCGA	2	10	55926	55935	20 %	0 %	40 %	40 %	238023551
91	NC_012721	CGTTT	2	10	58343	58352	0 %	60 %	20 %	20 %	238023553
92	NC_012721	GCGCC	2	10	59068	59077	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_012721	CGGCG	2	10	59145	59154	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_012721	CTGCT	2	10	60058	60067	0 %	40 %	20 %	40 %	238023555
95	NC_012721	CGGCG	2	10	61598	61607	0 %	0 %	60 %	40 %	238023556
96	NC_012721	CGTGC	2	10	61630	61639	0 %	20 %	40 %	40 %	238023556
97	NC_012721	CGCGC	2	10	62833	62842	0 %	0 %	40 %	60 %	238023558
98	NC_012721	GGGCG	2	10	65993	66002	0 %	0 %	80 %	20 %	238023561
99	NC_012721	CGGCG	2	10	66317	66326	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_012721	CGCGC	2	10	66342	66351	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_012721	GCCGC	2	10	67077	67086	0 %	0 %	40 %	60 %	238023562
102	NC_012721	CCGCG	2	10	67879	67888	0 %	0 %	40 %	60 %	238023563
103	NC_012721	CGGGC	2	10	69028	69037	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_012721	GCGCG	2	10	69262	69271	0 %	0 %	60 %	40 %	238023565
105	NC_012721	CGGGC	2	10	70100	70109	0 %	0 %	60 %	40 %	238023566
106	NC_012721	CGTGC	2	10	70362	70371	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_012721	CGCGC	2	10	72296	72305	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_012721	GGCGC	2	10	72497	72506	0 %	0 %	60 %	40 %	238023568
109	NC_012721	CTGCG	2	10	72731	72740	0 %	20 %	40 %	40 %	238023568
110	NC_012721	GCCGC	2	10	72749	72758	0 %	0 %	40 %	60 %	238023568
111	NC_012721	GGGCA	2	10	73202	73211	20 %	0 %	60 %	20 %	238023569
112	NC_012721	CGGCC	2	10	74040	74049	0 %	0 %	40 %	60 %	238023569
113	NC_012721	GTTCC	2	10	74086	74095	0 %	40 %	20 %	40 %	238023569
114	NC_012721	GAGCG	2	10	74208	74217	20 %	0 %	60 %	20 %	238023569
115	NC_012721	GCCGA	2	10	75116	75125	20 %	0 %	40 %	40 %	238023571
116	NC_012721	TCGGC	2	10	75758	75767	0 %	20 %	40 %	40 %	238023572
117	NC_012721	GCACC	2	10	76320	76329	20 %	0 %	20 %	60 %	238023573
118	NC_012721	GCGAT	2	10	77613	77622	20 %	20 %	40 %	20 %	238023573
119	NC_012721	GCGCC	2	10	78562	78571	0 %	0 %	40 %	60 %	238023575
120	NC_012721	GTCGT	2	10	78659	78668	0 %	40 %	40 %	20 %	238023575
121	NC_012721	CCGCG	2	10	79147	79156	0 %	0 %	40 %	60 %	238023575
122	NC_012721	GGGCG	2	10	79402	79411	0 %	0 %	80 %	20 %	238023575
123	NC_012721	GCCCG	2	10	79458	79467	0 %	0 %	40 %	60 %	238023575
124	NC_012721	CCGTG	2	10	79856	79865	0 %	20 %	40 %	40 %	238023576
125	NC_012721	CGGCG	2	10	79976	79985	0 %	0 %	60 %	40 %	238023576
126	NC_012721	GAAGA	2	10	80520	80529	60 %	0 %	40 %	0 %	238023576
127	NC_012721	CGGCA	2	10	80632	80641	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_012721	GCCGC	2	10	80813	80822	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_012721	CATGC	2	10	84267	84276	20 %	20 %	20 %	40 %	238023579
130	NC_012721	CGGGC	2	10	84700	84709	0 %	0 %	60 %	40 %	238023579
131	NC_012721	GCGCG	2	10	84749	84758	0 %	0 %	60 %	40 %	238023579
132	NC_012721	CGGCA	2	10	85131	85140	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_012721	AGCGC	2	10	85209	85218	20 %	0 %	40 %	40 %	238023580
134	NC_012721	ATCCG	2	10	85282	85291	20 %	20 %	20 %	40 %	238023580
135	NC_012721	CGAGC	2	10	85951	85960	20 %	0 %	40 %	40 %	238023580
136	NC_012721	GCTCA	2	10	86885	86894	20 %	20 %	20 %	40 %	238023581
137	NC_012721	GGCGT	2	10	86895	86904	0 %	20 %	60 %	20 %	238023581
138	NC_012721	AATCG	2	10	88078	88087	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012721	AGGCG	2	10	88582	88591	20 %	0 %	60 %	20 %	238023582
140	NC_012721	GAATG	2	10	88745	88754	40 %	20 %	40 %	0 %	238023582
141	NC_012721	TGCGC	2	10	88873	88882	0 %	20 %	40 %	40 %	238023582
142	NC_012721	GGCGC	2	10	89946	89955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
143	NC_012721	GCCGC	2	10	90370	90379	0 %	0 %	40 %	60 %	238023583
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270	NC_012721	CGGCG	2	10	216537	216546	0 %	0 %	60 %	40 %	238023668
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274	NC_012721	GACGC	2	10	219623	219632	20 %	0 %	40 %	40 %	238023670
275	NC_012721	GCGCG	2	10	221298	221307	0 %	0 %	60 %	40 %	238023672
276	NC_012721	GAGGC	2	10	223196	223205	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
277	NC_012721	CCCGG	2	10	223369	223378	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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279	NC_012721	GCCGA	2	10	227889	227898	20 %	0 %	40 %	40 %	238023676
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281	NC_012721	CGCAG	2	10	228173	228182	20 %	0 %	40 %	40 %	238023676
282	NC_012721	GCGCT	2	10	228693	228702	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
283	NC_012721	TCGCA	2	10	229933	229942	20 %	20 %	20 %	40 %	238023677
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285	NC_012721	TGGAG	2	10	230558	230567	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_012721	GCGGT	2	10	231980	231989	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
288	NC_012721	GAAAA	2	10	231998	232007	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_012721	CGGCG	2	10	238692	238701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
293	NC_012721	GCGCC	2	10	239958	239967	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
294	NC_012721	CATGG	2	10	241148	241157	20 %	20 %	40 %	20 %	238023685
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