MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_3p

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012720	AG	3	6	591	596	50 %	0 %	50 %	0 %	238023395
2	NC_012720	GC	3	6	1247	1252	0 %	0 %	50 %	50 %	238023396
3	NC_012720	CG	3	6	2945	2950	0 %	0 %	50 %	50 %	238023397
4	NC_012720	GC	3	6	3477	3482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012720	AG	3	6	3606	3611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012720	GC	3	6	4141	4146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012720	CG	4	8	4150	4157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012720	GA	3	6	4579	4584	50 %	0 %	50 %	0 %	238023398
9	NC_012720	CG	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
10	NC_012720	GC	3	6	4668	4673	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
11	NC_012720	CG	3	6	4711	4716	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
12	NC_012720	GC	4	8	4846	4853	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
13	NC_012720	GC	3	6	4994	4999	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
14	NC_012720	CG	3	6	5018	5023	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
15	NC_012720	GC	3	6	5028	5033	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
16	NC_012720	CG	3	6	5361	5366	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
17	NC_012720	GT	3	6	5626	5631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012720	CA	3	6	5652	5657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012720	TC	4	8	5789	5796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012720	GC	3	6	6514	6519	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
21	NC_012720	GC	3	6	6589	6594	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
22	NC_012720	CG	3	6	6604	6609	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
23	NC_012720	CG	3	6	7262	7267	0 %	0 %	50 %	50 %	238023400
24	NC_012720	GC	3	6	7280	7285	0 %	0 %	50 %	50 %	238023400
25	NC_012720	CG	3	6	7343	7348	0 %	0 %	50 %	50 %	238023400
26	NC_012720	CG	3	6	7581	7586	0 %	0 %	50 %	50 %	238023400
27	NC_012720	CG	3	6	7687	7692	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
28	NC_012720	TG	3	6	7808	7813	0 %	50 %	50 %	0 %	238023401
29	NC_012720	CG	3	6	7922	7927	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
30	NC_012720	GA	3	6	8018	8023	50 %	0 %	50 %	0 %	238023401
31	NC_012720	CG	3	6	8131	8136	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
32	NC_012720	GC	3	6	8156	8161	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
33	NC_012720	TG	3	6	8302	8307	0 %	50 %	50 %	0 %	238023401
34	NC_012720	CG	3	6	8360	8365	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
35	NC_012720	GA	3	6	8805	8810	50 %	0 %	50 %	0 %	238023402
36	NC_012720	GC	3	6	9077	9082	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
37	NC_012720	CG	3	6	9527	9532	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
38	NC_012720	CG	3	6	9661	9666	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
39	NC_012720	GA	3	6	9840	9845	50 %	0 %	50 %	0 %	238023402
40	NC_012720	GC	3	6	10307	10312	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
41	NC_012720	GC	3	6	10868	10873	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
42	NC_012720	CG	3	6	11969	11974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012720	CG	3	6	12198	12203	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
44	NC_012720	GC	3	6	12227	12232	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
45	NC_012720	GC	4	8	12337	12344	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
46	NC_012720	CG	3	6	12406	12411	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
47	NC_012720	CG	3	6	12496	12501	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
48	NC_012720	CG	4	8	12590	12597	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
49	NC_012720	GC	3	6	12620	12625	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
50	NC_012720	CG	4	8	12854	12861	0 %	0 %	50 %	50 %	238023404
51	NC_012720	GA	3	6	12956	12961	50 %	0 %	50 %	0 %	238023404
52	NC_012720	CG	3	6	14499	14504	0 %	0 %	50 %	50 %	238023407
53	NC_012720	GC	5	10	14820	14829	0 %	0 %	50 %	50 %	238023407
54	NC_012720	CG	3	6	14876	14881	0 %	0 %	50 %	50 %	238023407
55	NC_012720	GA	3	6	15048	15053	50 %	0 %	50 %	0 %	238023408
56	NC_012720	CG	3	6	15060	15065	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
57	NC_012720	CG	4	8	15183	15190	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
58	NC_012720	CG	3	6	15237	15242	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
59	NC_012720	GC	3	6	15361	15366	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
60	NC_012720	GC	4	8	15449	15456	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
61	NC_012720	GC	3	6	15587	15592	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
62	NC_012720	CG	4	8	15742	15749	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
63	NC_012720	CG	4	8	15981	15988	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
64	NC_012720	CG	3	6	16026	16031	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
65	NC_012720	GC	3	6	16049	16054	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
66	NC_012720	GC	4	8	16071	16078	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
67	NC_012720	CG	4	8	16233	16240	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
68	NC_012720	CG	3	6	16689	16694	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
69	NC_012720	CG	4	8	16915	16922	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
70	NC_012720	CG	4	8	16965	16972	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
71	NC_012720	GC	4	8	17690	17697	0 %	0 %	50 %	50 %	238023410
72	NC_012720	GA	3	6	17796	17801	50 %	0 %	50 %	0 %	238023410
73	NC_012720	AG	3	6	18903	18908	50 %	0 %	50 %	0 %	238023412
74	NC_012720	GC	3	6	19059	19064	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
75	NC_012720	CG	4	8	19613	19620	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
76	NC_012720	GC	3	6	20111	20116	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
77	NC_012720	GT	3	6	20196	20201	0 %	50 %	50 %	0 %	238023412
78	NC_012720	GC	3	6	20479	20484	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
79	NC_012720	CG	3	6	22228	22233	0 %	0 %	50 %	50 %	238023413
80	NC_012720	GC	3	6	22316	22321	0 %	0 %	50 %	50 %	238023413
81	NC_012720	CG	3	6	22325	22330	0 %	0 %	50 %	50 %	238023413
82	NC_012720	CG	3	6	23386	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	238023413
83	NC_012720	AG	3	6	23637	23642	50 %	0 %	50 %	0 %	238023414
84	NC_012720	GA	3	6	23725	23730	50 %	0 %	50 %	0 %	238023414
85	NC_012720	GC	4	8	23847	23854	0 %	0 %	50 %	50 %	238023414
86	NC_012720	CG	3	6	23877	23882	0 %	0 %	50 %	50 %	238023414
87	NC_012720	CG	3	6	24085	24090	0 %	0 %	50 %	50 %	238023414
88	NC_012720	GC	3	6	24255	24260	0 %	0 %	50 %	50 %	238023414
89	NC_012720	GC	3	6	24435	24440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012720	CG	4	8	24923	24930	0 %	0 %	50 %	50 %	238023415
91	NC_012720	GC	3	6	25018	25023	0 %	0 %	50 %	50 %	238023415
92	NC_012720	GC	3	6	26031	26036	0 %	0 %	50 %	50 %	238023416
93	NC_012720	AC	3	6	26703	26708	50 %	0 %	0 %	50 %	238023417
94	NC_012720	GC	3	6	27681	27686	0 %	0 %	50 %	50 %	238023417
95	NC_012720	GC	3	6	27724	27729	0 %	0 %	50 %	50 %	238023418
96	NC_012720	CG	3	6	27904	27909	0 %	0 %	50 %	50 %	238023418
97	NC_012720	GC	3	6	28280	28285	0 %	0 %	50 %	50 %	238023418
98	NC_012720	GC	3	6	28331	28336	0 %	0 %	50 %	50 %	238023418
99	NC_012720	AG	3	6	28602	28607	50 %	0 %	50 %	0 %	238023419
100	NC_012720	CG	3	6	29955	29960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012720	TC	3	6	30007	30012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012720	GA	3	6	30385	30390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012720	CG	3	6	30714	30719	0 %	0 %	50 %	50 %	238023420
104	NC_012720	CG	3	6	30945	30950	0 %	0 %	50 %	50 %	238023420
105	NC_012720	CG	4	8	30955	30962	0 %	0 %	50 %	50 %	238023420
106	NC_012720	GC	3	6	32426	32431	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
107	NC_012720	GC	3	6	32888	32893	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
108	NC_012720	CG	3	6	33424	33429	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
109	NC_012720	GC	3	6	33779	33784	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
110	NC_012720	CG	4	8	33853	33860	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
111	NC_012720	GC	4	8	34589	34596	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
112	NC_012720	GC	3	6	34848	34853	0 %	0 %	50 %	50 %	238023424
113	NC_012720	CG	3	6	34964	34969	0 %	0 %	50 %	50 %	238023424
114	NC_012720	CG	3	6	35067	35072	0 %	0 %	50 %	50 %	238023424
115	NC_012720	CG	3	6	35503	35508	0 %	0 %	50 %	50 %	238023425
116	NC_012720	CG	4	8	36110	36117	0 %	0 %	50 %	50 %	238023425
117	NC_012720	CG	4	8	36594	36601	0 %	0 %	50 %	50 %	238023426
118	NC_012720	CG	3	6	36931	36936	0 %	0 %	50 %	50 %	238023426
119	NC_012720	AC	3	6	37179	37184	50 %	0 %	0 %	50 %	238023426
120	NC_012720	CG	3	6	37556	37561	0 %	0 %	50 %	50 %	238023427
121	NC_012720	GT	3	6	37640	37645	0 %	50 %	50 %	0 %	238023427
122	NC_012720	CG	3	6	37819	37824	0 %	0 %	50 %	50 %	238023427
123	NC_012720	CG	3	6	38220	38225	0 %	0 %	50 %	50 %	238023427
124	NC_012720	GC	3	6	38470	38475	0 %	0 %	50 %	50 %	238023427
125	NC_012720	CG	3	6	39466	39471	0 %	0 %	50 %	50 %	238023428
126	NC_012720	GC	3	6	39548	39553	0 %	0 %	50 %	50 %	238023428
127	NC_012720	GC	3	6	40253	40258	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
128	NC_012720	GC	3	6	40260	40265	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
129	NC_012720	CG	3	6	40634	40639	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
130	NC_012720	GC	3	6	41091	41096	0 %	0 %	50 %	50 %	238023430
131	NC_012720	GT	3	6	41359	41364	0 %	50 %	50 %	0 %	238023431
132	NC_012720	CG	3	6	41810	41815	0 %	0 %	50 %	50 %	238023432
133	NC_012720	CG	3	6	41979	41984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012720	GC	3	6	42454	42459	0 %	0 %	50 %	50 %	238023433
135	NC_012720	GA	4	8	43216	43223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012720	GA	3	6	43236	43241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012720	GC	3	6	43300	43305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012720	TC	4	8	43471	43478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012720	AC	3	6	43564	43569	50 %	0 %	0 %	50 %	238023435
140	NC_012720	AG	3	6	44031	44036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012720	CG	3	6	44038	44043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012720	CG	3	6	44181	44186	0 %	0 %	50 %	50 %	238023436
143	NC_012720	TC	3	6	44283	44288	0 %	50 %	0 %	50 %	238023436
144	NC_012720	GA	3	6	44325	44330	50 %	0 %	50 %	0 %	238023436
145	NC_012720	GT	3	6	44641	44646	0 %	50 %	50 %	0 %	238023436
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438	NC_012720	CG	3	6	140907	140912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.