MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_012225	TAATA	2	10	31186	31195	60 %	40 %	0 %	0 %	225618983
1003	NC_012225	ATATT	2	10	31218	31227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012225	T	6	6	31226	31231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012225	ATA	2	6	31232	31237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012225	TGAT	2	8	31238	31245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012225	T	8	8	31306	31313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012225	GAAT	2	8	31330	31337	50 %	25 %	25 %	0 %	225618984
1009	NC_012225	TAAT	2	8	31450	31457	50 %	50 %	0 %	0 %	225618984
1010	NC_012225	ATA	2	6	31525	31530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618984
1011	NC_012225	A	7	7	31530	31536	100 %	0 %	0 %	0 %	225618984
1012	NC_012225	TTA	2	6	31537	31542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618984
1013	NC_012225	TAT	2	6	31590	31595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618984
1014	NC_012225	A	6	6	31601	31606	100 %	0 %	0 %	0 %	225618984
1015	NC_012225	AAATGA	2	12	31622	31633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	225618984
1016	NC_012225	ATT	2	6	31644	31649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618984
1017	NC_012225	ATG	2	6	31747	31752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618984
1018	NC_012225	ATT	2	6	31764	31769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618984
1019	NC_012225	ATA	2	6	31779	31784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618984
1020	NC_012225	AAT	2	6	31812	31817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618984
1021	NC_012225	AAATA	2	10	31841	31850	80 %	20 %	0 %	0 %	225618984
1022	NC_012225	T	6	6	31866	31871	0 %	100 %	0 %	0 %	225618984
1023	NC_012225	GAA	2	6	31968	31973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618984
1024	NC_012225	AGA	2	6	32042	32047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618984
1025	NC_012225	AAG	2	6	32056	32061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618984
1026	NC_012225	AAG	2	6	32068	32073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618984
1027	NC_012225	AGA	2	6	32165	32170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618984
1028	NC_012225	A	6	6	32174	32179	100 %	0 %	0 %	0 %	225618984
1029	NC_012225	TTA	2	6	32216	32221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012225	T	6	6	32231	32236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012225	ATA	2	6	32247	32252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012225	TATAA	2	10	32264	32273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012225	A	6	6	32276	32281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012225	T	6	6	32349	32354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012225	TAAA	2	8	32360	32367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012225	TAA	2	6	32376	32381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012225	ATT	2	6	32396	32401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012225	AAT	3	9	32402	32410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1039	NC_012225	TAT	2	6	32417	32422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618985
1040	NC_012225	T	7	7	32455	32461	0 %	100 %	0 %	0 %	225618985
1041	NC_012225	TTA	2	6	32464	32469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618985
1042	NC_012225	ATA	3	9	32485	32493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1043	NC_012225	A	8	8	32493	32500	100 %	0 %	0 %	0 %	225618985
1044	NC_012225	ATA	2	6	32509	32514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1045	NC_012225	TAA	2	6	32516	32521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1046	NC_012225	AAG	2	6	32527	32532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618985
1047	NC_012225	TAT	2	6	32540	32545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618985
1048	NC_012225	ATTA	2	8	32570	32577	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
1049	NC_012225	ATA	2	6	32580	32585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1050	NC_012225	TAA	2	6	32611	32616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1051	NC_012225	TGA	2	6	32621	32626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618985
1052	NC_012225	TGA	2	6	32636	32641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618985
1053	NC_012225	TA	3	6	32766	32771	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
1054	NC_012225	GA	4	8	32773	32780	50 %	0 %	50 %	0 %	225618985
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1056	NC_012225	ATTAAA	2	12	32822	32833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1057	NC_012225	AT	3	6	32908	32913	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
1058	NC_012225	TA	3	6	32945	32950	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
1059	NC_012225	ATG	3	9	33016	33024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618985
1060	NC_012225	TA	4	8	33028	33035	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
1061	NC_012225	AT	3	6	33061	33066	50 %	50 %	0 %	0 %	225618985
1062	NC_012225	ATA	2	6	33070	33075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1063	NC_012225	TTA	2	6	33163	33168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618985
1064	NC_012225	ATA	2	6	33214	33219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1065	NC_012225	ATT	2	6	33259	33264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618985
1066	NC_012225	AAT	2	6	33297	33302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1067	NC_012225	TAA	2	6	33346	33351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618985
1068	NC_012225	A	7	7	33350	33356	100 %	0 %	0 %	0 %	225618985
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1070	NC_012225	ATT	3	9	33388	33396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618986
1071	NC_012225	GAA	2	6	33431	33436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618986
1072	NC_012225	AT	3	6	33442	33447	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
1073	NC_012225	A	7	7	33457	33463	100 %	0 %	0 %	0 %	225618986
1074	NC_012225	TA	3	6	33485	33490	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
1075	NC_012225	A	6	6	33512	33517	100 %	0 %	0 %	0 %	225618986
1076	NC_012225	GA	3	6	33518	33523	50 %	0 %	50 %	0 %	225618986
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1080	NC_012225	A	7	7	33652	33658	100 %	0 %	0 %	0 %	225618986
1081	NC_012225	AGGA	2	8	33714	33721	50 %	0 %	50 %	0 %	225618986
1082	NC_012225	AT	3	6	33759	33764	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
1083	NC_012225	A	6	6	33769	33774	100 %	0 %	0 %	0 %	225618986
1084	NC_012225	AT	5	10	33901	33910	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
1085	NC_012225	AG	3	6	33975	33980	50 %	0 %	50 %	0 %	225618986
1086	NC_012225	TAA	2	6	33990	33995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618986
1087	NC_012225	CTG	2	6	34029	34034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225618986
1088	NC_012225	TAG	2	6	34143	34148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618986
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1091	NC_012225	ATA	2	6	34173	34178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618986
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1093	NC_012225	TTA	2	6	34248	34253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618986
1094	NC_012225	GAT	2	6	34256	34261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618986
1095	NC_012225	AT	3	6	34339	34344	50 %	50 %	0 %	0 %	225618986
1096	NC_012225	ATT	2	6	34384	34389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618986
1097	NC_012225	AAT	2	6	34393	34398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618986
1098	NC_012225	ATC	2	6	34431	34436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_012225	CTT	2	6	34453	34458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618987
1100	NC_012225	T	6	6	34457	34462	0 %	100 %	0 %	0 %	225618987
1101	NC_012225	TAA	2	6	34527	34532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618987
1102	NC_012225	ACA	2	6	34538	34543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225618987
1103	NC_012225	GTAA	2	8	34549	34556	50 %	25 %	25 %	0 %	225618987
1104	NC_012225	TTTTC	2	10	34599	34608	0 %	80 %	0 %	20 %	225618987
1105	NC_012225	TCCT	2	8	34657	34664	0 %	50 %	0 %	50 %	225618987
1106	NC_012225	TAA	2	6	34668	34673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618987
1107	NC_012225	T	6	6	34683	34688	0 %	100 %	0 %	0 %	225618987
1108	NC_012225	GTT	2	6	34724	34729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012225	CCT	2	6	34743	34748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_012225	TAAC	2	8	34765	34772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_012225	AT	3	6	34831	34836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012225	A	6	6	34849	34854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012225	AAT	2	6	34884	34889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012225	AT	3	6	34893	34898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012225	AT	4	8	34909	34916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012225	TTG	2	6	34928	34933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_012225	ATA	2	6	34950	34955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012225	A	6	6	34975	34980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012225	A	6	6	35000	35005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012225	ATA	2	6	35042	35047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012225	ATT	3	9	35051	35059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012225	TTA	2	6	35060	35065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618988
1123	NC_012225	ATA	3	9	35074	35082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618988
1124	NC_012225	ATT	2	6	35105	35110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618988
1125	NC_012225	TATT	2	8	35137	35144	25 %	75 %	0 %	0 %	225618988
1126	NC_012225	TAT	2	6	35149	35154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618988
1127	NC_012225	ATC	2	6	35165	35170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618988
1128	NC_012225	AAC	2	6	35258	35263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225618988
1129	NC_012225	A	6	6	35294	35299	100 %	0 %	0 %	0 %	225618988
1130	NC_012225	T	6	6	35351	35356	0 %	100 %	0 %	0 %	225618988
1131	NC_012225	TCT	3	9	35394	35402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618988
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