MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012225	T	6	6	15851	15856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012225	AT	3	6	15869	15874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012225	A	6	6	15885	15890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012225	ATA	2	6	15943	15948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012225	A	6	6	15948	15953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012225	A	6	6	15985	15990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012225	TTC	2	6	16000	16005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618965
508	NC_012225	TAT	2	6	16015	16020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618965
509	NC_012225	TTC	2	6	16051	16056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618965
510	NC_012225	ATC	2	6	16057	16062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618965
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512	NC_012225	TAA	2	6	16093	16098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618965
513	NC_012225	T	6	6	16118	16123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012225	ATAA	2	8	16129	16136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012225	T	6	6	16161	16166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012225	TAT	2	6	16178	16183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012225	TAA	2	6	16196	16201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012225	TAA	2	6	16204	16209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012225	TA	3	6	16215	16220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012225	T	6	6	16232	16237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012225	TAA	2	6	16248	16253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012225	ATAA	2	8	16268	16275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012225	AAT	2	6	16277	16282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012225	A	6	6	16283	16288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012225	TA	3	6	16339	16344	50 %	50 %	0 %	0 %	225618966
526	NC_012225	TCA	2	6	16347	16352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618966
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529	NC_012225	TCA	2	6	16391	16396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618966
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531	NC_012225	CATT	2	8	16409	16416	25 %	50 %	0 %	25 %	225618966
532	NC_012225	AAT	2	6	16430	16435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618966
533	NC_012225	ATA	2	6	16442	16447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618966
534	NC_012225	CCT	2	6	16450	16455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_012225	TCA	2	6	16459	16464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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537	NC_012225	T	7	7	16477	16483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012225	TGA	2	6	16487	16492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012225	TAAT	2	8	16508	16515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012225	AT	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012225	TAA	2	6	16532	16537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012225	TAA	2	6	16540	16545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012225	T	6	6	16568	16573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012225	TAAAA	2	10	16582	16591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012225	TTTATA	2	12	16635	16646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012225	AAT	2	6	16658	16663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012225	AAG	2	6	16668	16673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_012225	ATTTT	2	10	16711	16720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012225	TTTA	2	8	16729	16736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012225	ATTA	2	8	16737	16744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012225	TCC	2	6	16791	16796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225618967
553	NC_012225	ATT	2	6	16806	16811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618967
554	NC_012225	ATT	2	6	16837	16842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618967
555	NC_012225	TA	3	6	16983	16988	50 %	50 %	0 %	0 %	225618967
556	NC_012225	TAA	2	6	17028	17033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618967
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563	NC_012225	ATT	2	6	17271	17276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618967
564	NC_012225	TAA	2	6	17328	17333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618967
565	NC_012225	TAG	2	6	17392	17397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618967
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568	NC_012225	TA	3	6	17513	17518	50 %	50 %	0 %	0 %	225618967
569	NC_012225	A	6	6	17578	17583	100 %	0 %	0 %	0 %	225618967
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573	NC_012225	AT	3	6	17700	17705	50 %	50 %	0 %	0 %	225618967
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579	NC_012225	T	7	7	17837	17843	0 %	100 %	0 %	0 %	225618967
580	NC_012225	T	6	6	17846	17851	0 %	100 %	0 %	0 %	225618967
581	NC_012225	TTA	3	9	17858	17866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012225	ATT	2	6	17889	17894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012225	TAA	2	6	17895	17900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012225	TAATT	2	10	17918	17927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012225	TAT	2	6	17954	17959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_012225	AGA	2	6	18173	18178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618968
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601	NC_012225	TA	3	6	18561	18566	50 %	50 %	0 %	0 %	225618968
602	NC_012225	ATA	2	6	18587	18592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618968
603	NC_012225	A	6	6	18592	18597	100 %	0 %	0 %	0 %	225618968
604	NC_012225	TTC	2	6	18610	18615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618968
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609	NC_012225	ATA	2	6	18863	18868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618968
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611	NC_012225	T	6	6	18880	18885	0 %	100 %	0 %	0 %	225618968
612	NC_012225	AT	3	6	18892	18897	50 %	50 %	0 %	0 %	225618968
613	NC_012225	TTAAT	2	10	18912	18921	40 %	60 %	0 %	0 %	225618968
614	NC_012225	A	6	6	18922	18927	100 %	0 %	0 %	0 %	225618968
615	NC_012225	ATT	2	6	18972	18977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012225	TAAT	2	8	18997	19004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012225	A	6	6	19026	19031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012225	ATT	2	6	19036	19041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012225	ATT	2	6	19044	19049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618969
620	NC_012225	T	6	6	19051	19056	0 %	100 %	0 %	0 %	225618969
621	NC_012225	ATTT	2	8	19062	19069	25 %	75 %	0 %	0 %	225618969
622	NC_012225	CAG	2	6	19101	19106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225618969
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625	NC_012225	CTT	2	6	19155	19160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618969
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631	NC_012225	TCT	2	6	19342	19347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618970
632	NC_012225	ATT	2	6	19509	19514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618970
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