MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 95432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_012225	ATT	2	6	196644	196649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619123
6003	NC_012225	TA	3	6	196707	196712	50 %	50 %	0 %	0 %	225619123
6004	NC_012225	GTA	2	6	196716	196721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619123
6005	NC_012225	ATA	2	6	196734	196739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619123
6006	NC_012225	GAA	2	6	196755	196760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619123
6007	NC_012225	GAA	2	6	196766	196771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619123
6008	NC_012225	TAAT	2	8	196814	196821	50 %	50 %	0 %	0 %	225619123
6009	NC_012225	ATT	2	6	196824	196829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_012225	ATA	2	6	196833	196838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6012	NC_012225	ATT	3	9	196854	196862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_012225	AGC	2	6	196863	196868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_012225	T	7	7	196871	196877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_012225	TAA	2	6	196891	196896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_012225	ATTA	2	8	196915	196922	50 %	50 %	0 %	0 %	225619124
6017	NC_012225	T	7	7	197069	197075	0 %	100 %	0 %	0 %	225619124
6018	NC_012225	TCT	2	6	197091	197096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619124
6019	NC_012225	TA	3	6	197111	197116	50 %	50 %	0 %	0 %	225619124
6020	NC_012225	TTA	2	6	197140	197145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619124
6021	NC_012225	CTG	2	6	197173	197178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619124
6022	NC_012225	TTG	2	6	197224	197229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619124
6023	NC_012225	GAA	2	6	197240	197245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619124
6024	NC_012225	TATC	2	8	197266	197273	25 %	50 %	0 %	25 %	225619124
6025	NC_012225	TCT	3	9	197309	197317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619124
6026	NC_012225	ATT	2	6	197340	197345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_012225	TA	3	6	197397	197402	50 %	50 %	0 %	0 %	225619125
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6031	NC_012225	TATG	2	8	197500	197507	25 %	50 %	25 %	0 %	225619125
6032	NC_012225	CAT	2	6	197514	197519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619125
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6048	NC_012225	TA	3	6	198150	198155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_012225	A	6	6	198186	198191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6051	NC_012225	ATA	2	6	198213	198218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_012225	T	7	7	198222	198228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_012225	T	7	7	198236	198242	0 %	100 %	0 %	0 %	225619126
6054	NC_012225	ATT	2	6	198271	198276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619126
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6058	NC_012225	A	6	6	198355	198360	100 %	0 %	0 %	0 %	225619126
6059	NC_012225	TAAAG	2	10	198411	198420	60 %	20 %	20 %	0 %	225619126
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6062	NC_012225	TA	3	6	198508	198513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_012225	T	6	6	198552	198557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_012225	TTAT	2	8	198568	198575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6100	NC_012225	TAG	2	6	199876	199881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6103	NC_012225	ATAATT	2	12	199929	199940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6500	NC_012225	TTAAA	2	10	212709	212718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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